1918年到1923年，作為胡塞爾的助手，海德格爾除了接受胡塞爾現(xiàn)象學(xué)的指導(dǎo)和主持研究班的討論外，還先后講授了現(xiàn)象學(xué)、對(duì)亞里士多德的現(xiàn)象學(xué)解釋等課程。這一過(guò)程不僅使他真正了解了胡塞爾現(xiàn)象學(xué)的本質(zhì)內(nèi)容和根本缺陷，而且使他獲得了未來(lái)研究存在問(wèn)題的現(xiàn)象學(xué)方法。

對(duì)存在問(wèn)題的興趣的不斷增長(zhǎng)與現(xiàn)象學(xué)方法結(jié)合，促使海德格爾走上了追問(wèn)存在的道路，而在此期間人類社會(huì)發(fā)生的各種重大事件（特別是第一次世界大戰(zhàn)）對(duì)個(gè)體和人類的生存提出的尖銳深刻的疑問(wèn)，由叔本華和尼采的唯意志論、狄爾泰的生命哲學(xué)、克爾凱郭爾的個(gè)體存在哲學(xué)等構(gòu)成的現(xiàn)代早期人學(xué)大潮的涌動(dòng)，無(wú)形地規(guī)定了海德格爾的存在之思必然又是人學(xué)之思。

1922年，由于胡塞爾的再次大力推薦支持，海德格爾再次申請(qǐng)馬堡大學(xué)的副教授職位，馬堡大學(xué)的那托普和哈特曼認(rèn)為他關(guān)于亞里士多德的講稿寫(xiě)得有創(chuàng)造性，故也極力推薦他為第一候選人。1923年6月，他當(dāng)上了馬堡大學(xué)的副教授。

在馬堡大學(xué)的五年即1923年至1928年，海德格爾的收獲同樣十分巨大。馬堡大學(xué)是新康德主義馬堡學(xué)派的所在地，海德格爾與那托普、哈特曼等一流哲學(xué)家經(jīng)常進(jìn)行哲學(xué)討論，大大擴(kuò)展了他的哲學(xué)視野，同時(shí)，由于講授和研究了柏拉圖、亞里士多德的哲學(xué)以及時(shí)間觀念的歷史，使他對(duì)存在與時(shí)間的思考逐漸形成了體系。因此，1927年2月，他的《存在與時(shí)間》的第一部，作為胡塞爾主編的《哲學(xué)與現(xiàn)象學(xué)研究年鑒》的特刊公開(kāi)問(wèn)世。這使海德格爾名聲大振，很快他被認(rèn)為是德國(guó)最偉大的哲學(xué)家之一。

1928年至1946年，是海德格爾的思想與生活中一段非同尋常的時(shí)期。

1928年，在胡塞爾的推薦下，海德格爾接替年屆退休的胡塞爾的教授職位，重返弗萊堡大學(xué)。然而也只是在這之后，胡塞爾才認(rèn)真研讀了海德格爾的《存在與時(shí)間》，真正明白了他與海德格爾分歧的根本性。1931年，胡塞爾公開(kāi)表示與海德格爾決裂。

1933年，希特勒納粹上臺(tái)執(zhí)政，弗萊堡校長(zhǎng)被迫辭職，作為哲學(xué)家的海德格爾似乎第一次交上了“官運(yùn)”。原校長(zhǎng)勸說(shuō)海德格爾出來(lái)競(jìng)選校長(zhǎng)，結(jié)果海德格爾被選上。按理說(shuō)，哲學(xué)家是有著深刻智慧的人，對(duì)現(xiàn)實(shí)政治應(yīng)該有清醒的認(rèn)識(shí)，但此時(shí)的海德格爾似乎并不清醒。他在以《德國(guó)大學(xué)的自我主張》為標(biāo)題的校長(zhǎng)就職演說(shuō)以及其他講話中，把納粹的國(guó)家社會(huì)主義看做是一場(chǎng)徹底的革命，認(rèn)為它代表著人類的未來(lái)希望，說(shuō)希特勒是德國(guó)現(xiàn)在和將來(lái)的現(xiàn)實(shí)，并且自己也加入了納粹黨。雖然他可能的確沒(méi)有按照納粹的要求去迫害猶太人和燒毀猶太人寫(xiě)的著作，雖然他因教育主張與納粹的教育綱領(lǐng)不同而在1934年2月辭去大學(xué)校長(zhǎng)的職務(wù)，但這段曇花一現(xiàn)的“輝煌”，總是不斷招來(lái)后人對(duì)他的貶低和非難。

可想而知，海德格爾這時(shí)的心情是如何復(fù)雜，如何不平靜。他的思想的動(dòng)蕩和轉(zhuǎn)變也正是在此之后（1935年）開(kāi)始的。尖銳動(dòng)蕩的社會(huì)現(xiàn)實(shí)，無(wú)法預(yù)料的個(gè)人前途，使海德格爾的腦海無(wú)法不去思考現(xiàn)代人類生存的必然性問(wèn)題。從形而上學(xué)的追根到藝術(shù)作品的探源，從對(duì)哲學(xué)的探索（1936—1938年）到對(duì)人本主義的解剖，從對(duì)謝林的人類自由理論的分析到對(duì)尼采的權(quán)力意志理論的研究，從對(duì)荷爾德林的詩(shī)篇的挖掘到對(duì)赫拉克利特邏各斯學(xué)說(shuō)的探討，從對(duì)抽象的哲學(xué)理論的反思到對(duì)現(xiàn)代人類歷史的追問(wèn)，無(wú)一不浸透著他對(duì)人類前途的關(guān)懷。用他自己的話說(shuō)，他的心靈激烈震蕩了十年之久。

第二次世界大戰(zhàn)德國(guó)戰(zhàn)敗后，海德格爾因被認(rèn)為有“納粹之嫌”而被法軍禁止上課，直到1951年禁令撤銷(xiāo)。