政治腐敗的另一個重要問題是“冤獄太多，民氣難伸”。這是曾國藩在其《備陳民間疾苦疏》反映的又一重大社會問題。他署理刑部侍郎期間處理了一批案件，他發(fā)現(xiàn)每一案件都有一個共同特點，最后的判決令人啼笑皆非，一律以原告虛告、誣告結(jié)案，原告或被杖打，或被流放，而被告都是沒有錯的。老百姓到京城告狀，叫做“京控”，往往是發(fā)還原省處理。省里的處理方式極其簡單，“首府為同寅彌縫，不問事之輕重，一概磨折恫嚇，必使原告認(rèn)誣而后已?！笔±飺?dān)心京城指責(zé)，不問事情輕重，一律采取肉體折磨與精神恫嚇的辦法，直到原告承認(rèn)是誣告，才結(jié)案。這是一種非常普遍的現(xiàn)象。曾國藩說：

風(fēng)氣所趨，各省皆然，一家久訟，十家破產(chǎn)，一人沉冤，百人含痛，往往有纖小之案，累年不結(jié)，顛倒黑白，老死囹圄，令人聞之發(fā)指者。臣所謂民間之疾苦，此又其一也。

與此同時，很多案件積累起來不辦，政事荒蕪。例如，曾國藩接任直隸總督時，清理歷年積累起來的案件，全省居然有13000多件沒有辦理。對這樣的政府，老百姓還有什么指望呢！

軍隊腐敗不堪入目。清朝國家軍隊，叫做經(jīng)制兵，包括八旗、綠營，總數(shù)當(dāng)有九十多萬人，每年消耗餉銀二千萬兩以上，但卻是一群腐朽不堪一擊的廢物。軍隊貪污腐敗成風(fēng)，各級軍官由地方督撫負(fù)責(zé)，買賣官員現(xiàn)象嚴(yán)重。軍隊管理散亂，吃空餉現(xiàn)象十分嚴(yán)重，上自提督、總兵，下至千總、把總、外委，層層吃空餉，官職越大空餉吃得越大；一般的士兵沒有空餉吃就自己開實業(yè)做買賣，請人代為訓(xùn)練，臨上戰(zhàn)場，則請一些叫花子、流浪漢充數(shù)。軍官無不吞餉肥私，花天酒地。許多武官夜間不到營房，外宿娼妓。軍隊中賭博、嫖娼比比皆是。更甚者，軍隊吃鴉片成風(fēng)，軍隊意志完全喪失。城中柵欄朽壞、倉房倒塌，無人過問；子彈庫被盜，也屢見不鮮；水師戰(zhàn)船破損，維修費落入貪官腰包；炮兵則大炮生銹不可用；火藥大量造假，摻雜沙石。一到打仗，拼湊部隊，東一百西一千，“將不知兵，兵不用命”，見敵就逃，敗不相救，勝利了則互相奪功。對敵不行，擾民則非常積極。曾國藩批評說：

蓋近世之兵，孱怯極矣，而偏善妒功忌能，懦于御賊而勇于擾民，仁心以媚殺己之逆賊，而狠心以仇勝己之兵勇。其仇勇也，又更勝于仇兵。

這樣的軍隊，根本沒有什么用處。雖然數(shù)量眾多，但只是空耗國家糧餉。1851年太平軍在廣西起義后，向榮、勝保率領(lǐng)的清朝經(jīng)制兵一路尾追，從廣西到湖南、到湖北、到江西、到安徽，最后到達(dá)江蘇的南京，沒有打過一次勝仗。太平軍一路奪關(guān)斬將，所向披靡，全賴這支不堪一擊的經(jīng)制兵的腐朽。

對于清朝政治的這種黑暗、腐敗現(xiàn)象，曾國藩是看得清清楚楚的。不僅看得清楚，而且積極思考革除弊政的措施。他的政治理想、早期的一些政治主張，以及擔(dān)任兩江總督、直隸總督后的一些治理措施，他治理湘軍的方式方法與理念，莫不與其對當(dāng)時現(xiàn)實的認(rèn)識、思考有關(guān)。