“甲申事變”之后，中法戰(zhàn)爭(zhēng)結(jié)束，清廷得以將目光轉(zhuǎn)向朝鮮。在袁世凱的積極努力下，日本在朝鮮的氣焰被打壓，朝鮮親日勢(shì)力也受到了重創(chuàng)。

正當(dāng)日本收縮在朝鮮勢(shì)力的空當(dāng)，俄國(guó)開(kāi)始了在朝鮮的滲透。當(dāng)時(shí)朝鮮親俄的主要頭目為穆麟德，他是由清朝廷任命的朝鮮海關(guān)總稅務(wù)司大臣，因?yàn)楣唇Y(jié)俄國(guó)駐朝鮮參贊、放任俄國(guó)在朝鮮練兵而被清廷罷免，只能擔(dān)任朝鮮的小官。事后，懷恨在心的穆麟德開(kāi)始更加猖獗地與俄國(guó)勢(shì)力來(lái)往，企圖幫助俄國(guó)勢(shì)力控制朝鮮，很快，在朝鮮國(guó)王李熙身邊就集結(jié)了不少親俄勢(shì)力。早在1885年，袁世凱就注意到穆麟德心懷不軌。穆麟德曾經(jīng)是李鴻章親自舉薦的，袁世凱并無(wú)避諱，而是四處游說(shuō)清廷及朝鮮大臣，揭露穆麟德的不軌之心。袁世凱還曾多次向朝鮮國(guó)王游說(shuō)，勸說(shuō)李熙免去穆麟德在朝鮮的職務(wù)。在袁世凱的努力下，穆麟德在朝鮮的所有職務(wù)被免除，并被驅(qū)逐出境。

袁世凱兩次進(jìn)入朝鮮，都是以維護(hù)中國(guó)在朝鮮的宗主地位為最終目的的。作為駐朝鮮使臣，袁世凱也意識(shí)到朝鮮作為中國(guó)的鄰國(guó)，在國(guó)防方面具有很重要的地位。除了驅(qū)逐外國(guó)勢(shì)力、穩(wěn)定朝鮮局勢(shì)之外，袁世凱還鼓勵(lì)國(guó)人到朝鮮經(jīng)商，并對(duì)其進(jìn)行最大程度的保護(hù)，一時(shí)間，中國(guó)在朝鮮商會(huì)林立，貿(mào)易往來(lái)較以往更為頻繁。

袁世凱在朝鮮期間，日本、俄國(guó)勢(shì)力都受到很大的打擊，二者在朝鮮的經(jīng)濟(jì)利益也受到嚴(yán)重的擠壓，在日本人眼里，袁世凱成了其擴(kuò)大勢(shì)力最大的絆腳石。1894年，朝鮮東學(xué)黨起義，日本趁機(jī)出兵朝鮮，7月，朝鮮局勢(shì)已經(jīng)基本到了日本的掌控中。袁世凱曾向朝廷請(qǐng)求派兵救援，朝廷始終沒(méi)有給出答復(fù)，清政府設(shè)在朝鮮的大使館宛如孤島，而另一邊，日本正極其周密地計(jì)劃著對(duì)袁世凱的暗殺行動(dòng)。

日本的暗殺計(jì)劃進(jìn)行得十分保密，在計(jì)劃實(shí)施的一個(gè)多月里，袁世凱沒(méi)有聽(tīng)到過(guò)絲毫風(fēng)聲。直到7月19日這天，一名朝鮮官員偶然間得知日本當(dāng)晚要暗殺袁世凱，經(jīng)過(guò)一番思想斗爭(zhēng)，他終于決定把這件事告訴自己的好友唐紹儀。

唐紹儀當(dāng)時(shí)也在朝鮮任職，暗殺時(shí)間是這天晚上，當(dāng)他聽(tīng)說(shuō)這件事時(shí)，下午已經(jīng)過(guò)去了一多半。他來(lái)不及多想，趕快找到英國(guó)領(lǐng)事求助。這天晚上，袁世凱喬裝成當(dāng)?shù)剞r(nóng)夫，唐紹儀在一旁持雙槍護(hù)衛(wèi)，兩人穿過(guò)小巷來(lái)到碼頭，英國(guó)軍船已經(jīng)等候多時(shí)。來(lái)不及向英國(guó)領(lǐng)事言謝，袁世凱登上了軍船，這時(shí)，殺手剛剛追趕到碼頭，發(fā)現(xiàn)袁世凱已經(jīng)乘船逃離了。

回國(guó)之后，袁世凱回想起當(dāng)時(shí)逃走的情景，不由得身冒冷汗。1894年7月25日，袁世凱驚魂未定，甲午戰(zhàn)爭(zhēng)就爆發(fā)了。在接下來(lái)的一年當(dāng)中，清廷高層為究竟作戰(zhàn)到底還是議和發(fā)生了分歧。1895年，袁世凱向朝廷提交了一份的報(bào)告，報(bào)告以自己幾年來(lái)在軍中所見(jiàn)為基礎(chǔ)，詳實(shí)地記錄了清軍紀(jì)律渙散、裝備落后、軍官怠職等現(xiàn)象，論述清軍與剛剛經(jīng)過(guò)明治維新的日本相比實(shí)力懸殊，根據(jù)袁世凱的推斷，如果不早日與日本議和，天津、北京都將有失守的可能。

這份報(bào)告著實(shí)令沉醉于“天朝大國(guó)”美夢(mèng)中的慈禧和光緒震驚。為了盡早結(jié)束戰(zhàn)事，1895年3月，朝廷派李鴻章等人前往日本進(jìn)行談判，日本倚仗美國(guó)的支持對(duì)李鴻章一行施壓，迫使中國(guó)簽訂了不平等的《馬關(guān)條約》。

《馬關(guān)條約》簽訂之后，日本在朝鮮的利益得到承認(rèn)，遼東半島、臺(tái)灣的割讓以及巨額的賠款，使清朝多數(shù)知識(shí)分子瞬間覺(jué)醒，他們意識(shí)到中國(guó)已經(jīng)到了非變不可的大時(shí)代，紛紛登上政治舞臺(tái)，尋求救國(guó)良方。針對(duì)清軍戰(zhàn)斗力低下的現(xiàn)狀，以袁世凱、徐世昌為代表的開(kāi)明官僚開(kāi)始呼吁朝廷整頓軍隊(duì)，興練新軍。

當(dāng)時(shí)，朝廷當(dāng)中不少大臣都早已感到軍隊(duì)的日益腐朽，清軍軍制處于想改而不知如何改的尷尬境地，甲午一戰(zhàn)之后，清廷終于痛下決心，下令對(duì)軍隊(duì)進(jìn)行改革。