1963年，最高人民法院做出終審判決，認(rèn)定潘漢年的所謂罪行是：1936年在國(guó)共談判中投降國(guó)民黨；1940年前后投靠日本特務(wù)機(jī)關(guān)和秘密會(huì)見(jiàn)汪精衛(wèi)；在上海解放后掩護(hù)大批反革命分子并向臺(tái)灣供給情報(bào)，引起“二六轟炸”。根據(jù)這三條罪名，認(rèn)定潘是“長(zhǎng)期暗藏在中國(guó)共產(chǎn)黨和國(guó)家機(jī)關(guān)內(nèi)部的內(nèi)奸分子”，判處有期徒刑15年，剝奪政治權(quán)利終身。

到了“文化大革命”中，潘漢年更是身心備受折磨。1970年潘漢年被改判無(wú)期徒刑，“永遠(yuǎn)開(kāi)除出黨”。1975年3月，潘漢年被下放湖南耒陽(yáng)沫江農(nóng)場(chǎng)安置，作為“特殊犯人”接受管制。兩年以后，潘漢年背著“反革命”、“內(nèi)奸”的沉重歷史包袱，在湖南長(zhǎng)沙凄然病逝。

陳云對(duì)潘漢年的所謂歷史問(wèn)題，始終是有懷疑的，但是，在那種黑白顛倒的年代，他，甚至包括周恩來(lái)那樣對(duì)潘漢年知根知底的領(lǐng)導(dǎo)人，都不可能改變潘漢年的命運(yùn)……

歷史進(jìn)入撥亂反正的年代，作為新成立的中央紀(jì)律檢查委員會(huì)第一書記，陳云終于有了為潘漢年鳴冤的機(jī)會(huì)。

中紀(jì)委成立后，陳云多次表示過(guò)：潘漢年秘密會(huì)見(jiàn)汪精衛(wèi)的所謂“內(nèi)奸嫌疑”是不存在的。如果他真心投敵，就不能解釋劉曉領(lǐng)導(dǎo)下的上海地下黨組織為什么能在整個(gè)抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期和解放戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期完整地保持下來(lái)。上?！岸Z炸”更不可能是潘漢年利用國(guó)民黨的秘密潛伏電臺(tái)提供的情況，因?yàn)閲?guó)民黨在上海統(tǒng)治多年，楊樹(shù)浦發(fā)電廠這樣的目標(biāo)早就是清清楚楚，用不著潘漢年提供情報(bào)。至于講到1936年的國(guó)共談判，陳云更是知情人，他說(shuō)過(guò)：當(dāng)時(shí)中央駐共產(chǎn)國(guó)際代表團(tuán)的代表和主管同國(guó)民黨接觸的有三個(gè)人：王明、康生和我，如今只剩我一個(gè)了。我再不說(shuō)話，沒(méi)有人知道了。

陳云著手復(fù)查潘漢年案件，先找那些了解潘漢年的知情人。他找到抗戰(zhàn)時(shí)期曾擔(dān)任上海群眾工作委員會(huì)書記和江蘇省委書記長(zhǎng)達(dá)12年之久的劉曉，請(qǐng)他寫材料。又找了廖承志、夏衍等人，讓他們將對(duì)潘漢年的了解寫出系統(tǒng)的、具體的材料交給中紀(jì)委。

正是在重新調(diào)查潘漢年案的過(guò)程中，陳云因患重癥而做手術(shù)。由于歷史過(guò)去了多年，潘漢年案也沉冤二十幾年，調(diào)查起來(lái)難度較大。要想翻過(guò)一個(gè)案子來(lái)，更是不容易。手術(shù)成功后，陳云抓緊時(shí)間督促潘漢年案的復(fù)查。

一年以后，眼看潘漢年案的復(fù)查有了一些重要進(jìn)展，陳云于1980年12月23日讓秘書打電話給公安部，要親自調(diào)閱潘漢年案最后定案的全面材料。對(duì)從公安部調(diào)來(lái)的潘案材料，陳云仔細(xì)地研究了10天。

1981年元旦剛過(guò)，陳云便于1月3日再次讓秘書給公安部打電話，請(qǐng)公安部迅速整理一份有關(guān)潘案處理過(guò)程的梗概報(bào)告，送往中紀(jì)委。1月16日，公安部遵照陳云的指示向中紀(jì)委遞交了關(guān)于潘漢年一案的材料，如實(shí)地反映了潘案的處理過(guò)程。

在收集了大量材料的基礎(chǔ)上，陳云打算正式向中央提出復(fù)查潘漢年案的建議。

1981年3月1日，陳云提筆給中共中央其他幾位領(lǐng)導(dǎo)人寫了一封信：

小平、先念、耀邦、紫陽(yáng)同志：

1979年10月，我曾寫一條子給耀邦同志，我認(rèn)為潘漢年的案件需要復(fù)查一下，我認(rèn)為他當(dāng)時(shí)并未真心投敵，否則不能解釋劉曉同志領(lǐng)導(dǎo)下的上海黨能完整地保持下來(lái)。潘漢年已于1977年死于勞改農(nóng)場(chǎng)。連潘漢年的老婆董慧同志也已平反（也是1977年死的）。我收集了一些公安部的材料和與漢年同案人的材料。這些材料，并無(wú)潘投敵的材料確證。而且對(duì)于劉曉、劉長(zhǎng)勝同志等能在上海保存下來(lái)反面提供了潘并未投敵出賣組織或某一個(gè)同志。我提議中央對(duì)潘漢年一案正式予以復(fù)查。這件事如中央同意，可交由中央紀(jì)律檢查委員會(huì)辦理。

陳云

1981年3月1日

隨信，陳云還附上了廖承志給他寫來(lái)的有關(guān)潘漢年問(wèn)題的信。