國民黨改組后，確曾有過一段“黨權(quán)高于一切”和“以黨制軍”的時光。但這局面未能維持多久。北伐打到長江流域以后，軍權(quán)迅速竄升，最終形成蔣介石藉“黨軍”坐大的格局。南昌與武漢“遷都之爭”以及“提高黨權(quán)運動”，實際仍是文武之爭。四一二事件發(fā)生后，當(dāng)時尚站在武漢一方的宋子文，最初的反應(yīng)就是覺得文人被武人制裁了。他親口對當(dāng)時一位來華的美國哈佛大學(xué)教授說：“國民革命的主旨是以黨治軍，就是以文人制裁武人?，F(xiàn)在都完了！文人制裁武人的局面全被推翻了?！?/p>

當(dāng)蔣介石籌劃清黨時，上海西山派曾表示愿意與之合作清黨。但當(dāng)時蔣介石鑒于西山派之“反革命”名聲，認為尚不宜取消“打倒西山會議派”口號。故四一二上海清黨時，西山派在上海環(huán)龍路44號之中央黨部亦被查封。直至6月7日，南京中央常務(wù)委員及各部部長聯(lián)席會議，才決議恢復(fù)西山派諸人的國民黨黨籍。

三 蔣胡合作，重老輕青

1927年8月12日，蔣介石被迫辭職下野。寧、漢、滬三方試圖合作。

寧、漢、滬三方合作，黨統(tǒng)上有一大障礙，即以何種名義來統(tǒng)合？汪精衛(wèi)堅持在南京召開二屆四中全會來解決黨內(nèi)一切糾紛。而寧、滬兩方均反對。因?qū)幏椒裾J1927年3月間在武漢召開的二屆三中全會，認為此會是在中共“劫持”下召開的，自無繼此而開四中全會之理。滬方西山派則不僅否認二屆三中全會，連廣州“二大”和二屆中委亦不愿承認，最低限度亦須粵二屆與滬二屆各舉同等人數(shù)合開國民黨“三大”。如照汪之提議開二屆四中全會，則西山派諸人均非武漢方面所承認的二屆中委，勢將被摒除于外。為了打開僵局，孫科提議，暫時由三方共同組織一個過渡性的中央最高機構(gòu)，代行中央執(zhí)監(jiān)委員會的職權(quán)，負責(zé)籌備第三次全國代表大會，以解決黨統(tǒng)上的困局。這個過渡性的機構(gòu)，取名為“中央特別委員會”。

1927年9月16日中央特別委員會在南京成立后，西山派分據(jù)要津，聲勢大張。而原來希望在蔣介石下野后便可重掌黨權(quán)的汪精衛(wèi)則大失所望，又轉(zhuǎn)而通電反對中央特委會。

蔣介石決意復(fù)出，也必須推翻特委會，有意與汪聯(lián)手。11月，蔣邀汪赴滬共商召開二屆四中全會事宜。恰當(dāng)此時，擁護汪精衛(wèi)的粵系軍隊張發(fā)奎、黃琪翔部，發(fā)動兵變，圍攻支持特委會的桂系李濟深、黃紹竑。隨后中共趁機發(fā)動廣州起義。事變發(fā)生后，胡漢民、吳稚暉、李石曾、蔡元培、張靜江等留居上海的一批元老派中委以及西山派、桂系等紛紛指責(zé)汪精衛(wèi)與陳公博，認為張、黃兵變與中共暴動均為汪等所促成。汪精衛(wèi)難以在國內(nèi)立足，遂發(fā)表辭職引退通電，乘輪去國。

11月22日，南京發(fā)生群眾示威游行集會，請蔣介石復(fù)職，被軍警鎮(zhèn)壓，死傷多人。慘案發(fā)生后，蔣介石要求追究查辦，借此打壓西山派。 時在中央特委會負責(zé)的西山派人士在南京無法立足，紛紛他往。胡漢民與孫科亦出洋考察。

在這場斗爭中，蔣介石采取左右逢源之術(shù)，一方利用粵變之后西山派等元老對汪派之譴責(zé)與彈劾，將汪逼走海外；一方又利用汪派促開二屆四中全會，搞垮西山派及中央特委會，從而坐收漁利。1927年12月28日中央特委會宣告結(jié)束。1928年1月9日，蔣介石在南京通電復(fù)職。

2月2－7日，蔣介石主持召開二屆四中全會。是次全會是國共分家、南京國府成立后舉行的首次中央全會。大會改變了聯(lián)俄容共時期的路線方針，從思想理論，到政策制度，全面由激進轉(zhuǎn)向保守。

1928年8月召開二屆五中全會，胡漢民、孫科等從法國致電南京，倡議開始訓(xùn)政，設(shè)立五院。10月，國民黨中央接納胡漢民草擬的《訓(xùn)政大綱》和“五院制”提議，以此為契機，蔣介石與胡漢民合作，蔣擔(dān)任政府主席，胡擔(dān)任立法院長。