此時的形勢對于梁啟超和進步黨極為有利。民國二年（1913年）3月20日晚10時，國民黨內(nèi)力主內(nèi)閣制的宋教仁在上海滬寧火車站被刺，至22日身亡。梁啟超因此少了一個政治上的強大對手。有人曾懷疑梁啟超是宋案的幕后黑手，就是看到了他與宋教仁在政治上的競爭關(guān)系，以及政見方面的沖突。他馬上寫了《暗殺之罪惡》一文，發(fā)表在《庸言報》上，開篇就說：“吾與宋君，所持政見時有異同，然固確信宋君為我國現(xiàn)代第一流政治家，奸此良人，實貽國家以不可規(guī)復之損失，匪直為宋君哀，實為國家前途哀也?！保ā讹嫳液霞の募分?，7頁）

不過，國民黨內(nèi)及社會輿論很快將目光聚焦于國務(wù)院秘書洪述祖和內(nèi)閣總理趙秉鈞，由此又牽涉到袁世凱。于是，袁世凱與國民黨的矛盾日趨激化。7月12日，江西都督李烈鈞在湖口宣布起兵，自稱討袁軍，二次革命由此爆發(fā)。至9月1日，隨著政府軍克復南京，短命的二次革命則歸于失敗。討袁軍的導火索是宋案，宋案的導火索則是國民黨在第一次正式國會選舉中獨占優(yōu)勢。不過，自宋案發(fā)生之后，國會也于4月8日開幕。至此，國會內(nèi)部的黨派力量對比則發(fā)生了戲劇性的變化。共和黨、統(tǒng)一黨、民主黨迫于國民黨的壓力，合并為進步黨，在國民黨議員張繼被選舉為參議院議長、王正廷被選舉為副議長后，民主黨的湯化龍也被選舉為眾議院議長。進步黨與袁世凱的聯(lián)盟開始發(fā)揮效力，國民黨內(nèi)部卻由于種種原因陷入了四分五裂的困境。國民黨的前身—同盟會本就不是一個思想理念非常一致的組織，宋案之前，有主張內(nèi)閣制的，如宋本人，也有主張總統(tǒng)制的；宋案發(fā)生后，又分成了法律派和非法律派；直到討袁軍與北洋軍開戰(zhàn)之后，國民黨中的溫和派仍然堅持放棄武力對抗的主張，以為利用國會就能迫使袁世凱退位。而此時國會中的國民黨議員，也早已分化為不同的派別或組織，其中有人是被袁世凱威逼利誘收買的，也有自動倒向進步黨一邊的。國民黨的勢力至此已被大大地削弱，而進步黨卻由于其主張溫和、行動謹慎，處處與被人視為暴民的國民黨表現(xiàn)不同，頗為當時的輿論所重，袁世凱也不得不暫時借重他們以影響輿論。即使國民黨中的溫和派，這時也希望能與進步黨聯(lián)手對付袁世凱，他們迫于環(huán)境的險惡，不能不向進步黨示好。

這是進步黨最得意的時候。7月末，袁世凱決意改組內(nèi)閣，以熊希齡為國務(wù)總理。進步黨抓住這個機會，以為可以組織一個進步黨內(nèi)閣，所有閣員除陸海軍兩部外，全部由進步黨領(lǐng)袖擔任。但熊希齡卻不積極，遲遲不肯來京就任。直到梁啟超再三催促，才勉強于8月28日接受了國會的任命。袁世凱自然不肯把權(quán)力全部交給進步黨，他在熊希齡進京之前，已將重要閣員安排妥當，只留下教育、司法、農(nóng)商幾個閑位，待熊來配置。這當然與熊希齡所希望的相差太遠。熊希齡是梁啟超在湖南時務(wù)學堂時的老搭檔，他很想讓梁啟超擔任財政總長，梁本意也是要做財政總長的，以便發(fā)揮他整理財政的計劃。但袁世凱不同意，他提出的財政總長的人選是周自齊，梁啟超只能去做教育或司法總長。熊希齡則以總理自兼財政總長的辦法抵制袁的干涉，并希望梁啟超屈就教育司法等閑位。然而，梁啟超卻不肯接受，借口黨內(nèi)事務(wù)繁忙，百般推辭。而梁若不出，張謇、汪大燮也不肯出，第一流人才內(nèi)閣可就泡湯了。最后，經(jīng)熊和袁再三勸誘，熊甚至以辭職相威脅，梁啟超才勉強接受了司法總長的位子。9月11日，熊希齡內(nèi)閣正式發(fā)表，以梁啟超為司法總長，孫寶琦為外交總長，朱啟鈐為內(nèi)務(wù)總長，汪大燮為教育總長，張謇為工商兼農(nóng)林總長，周自齊為交通總長，段祺瑞為陸軍總長，劉冠雄為海軍總長，熊氏自兼財政總長。當時人稱這屆內(nèi)閣為“人才內(nèi)閣”，由于九位閣員中梁、熊、汪、張、周均為進步黨黨員，所以又稱進步黨內(nèi)閣。