返回哈佛任教后，費(fèi)正清被牽扯進(jìn)席卷美國的反共恐慌。他被叫到政治味濃厚的麥卡錫委員會(huì)接受質(zhì)詢。這個(gè)委員會(huì)要調(diào)查為什么共產(chǎn)黨能夠奪取中國政權(quán)，還要調(diào)查哪些為美國政府工作過的官員應(yīng)當(dāng)對“失去中國”負(fù)責(zé)。1952年3月10日至11日，費(fèi)正清作了聽證。他在戰(zhàn)爭期間，曾與很多中國的知識分子和政治人物對話，當(dāng)時(shí)沒有考慮可能的政治后果。盡管他的職位在華盛頓的官僚鏈條里一度相當(dāng)重要，但沒有擔(dān)任過高級決策職位，因此不是參議院調(diào)查的主要目標(biāo)。但是，去華盛頓在麥肯錫委員會(huì)前作證的經(jīng)歷讓他很不愉快，使得他在此后十年里盡量淡出公眾視野，而把精力用于哈佛年復(fù)一年的課程教學(xué)。①

當(dāng)費(fèi)正清決定僻居哈佛校園專心任教的時(shí)候，他那部很有影響的著作《美國與中國》在1948年首次出版。1951年至1979年，這部書又由哈佛大學(xué)出版社重印了六次，出了4個(gè)修訂版，成為當(dāng)時(shí)最為暢銷的關(guān)于現(xiàn)代中國的著作。這部書一氣呵成、簡明扼要，提綱挈領(lǐng)地介紹古代中國政府、社會(huì)和歷史的主要特征，不過其重心仍在中國步入現(xiàn)代社會(huì)前的一兩百年。它圍繞著帝國主義和民族主義、十九世紀(jì)末中國人改革政府的嘗試、中國對西方影響的反應(yīng)等寬泛的主題展開，重點(diǎn)講述了中國與西方帝國主義列強(qiáng)的互動(dòng)。這本書涉獵寬廣、條理清晰，為幫助各個(gè)層次的美國人在戰(zhàn)后更好地理解中國做出了獨(dú)到的貢獻(xiàn)。它幫助他們認(rèn)真地思考中國，而不是以論戰(zhàn)的方式來對待她。費(fèi)正清開始成為為美國公眾解說中國的首席專家。②

①費(fèi)正清的自傳（Chinabound: A Fifty-Year Memoir）1982年由夏普羅出版社（Harper & Row Publishers）在紐約出版。在這本書的第四部分第173頁至312頁，他談到了自己戰(zhàn)時(shí)的服役；在331頁至351頁他描述了在華盛頓的聽證會(huì)。對費(fèi)正清的職業(yè)生涯最為徹底的研究請見伊文思的《費(fèi)正清與美國對現(xiàn)代中國的理解》（John Fairbank and the American Understanding of Modern China）一書。這本書1988年由布萊克威爾出版社（Basil Blackwell）在紐約出版。費(fèi)正清和傅高義的文件在哈佛檔案館可以找到。許多關(guān)于東亞研究中心、費(fèi)正清中心和東亞研究理事會(huì)（Council on East Asian Studies）的文件也可在哈佛檔案館找到。本書大量使用了哈佛大學(xué)檔案和費(fèi)正清中心的材料。費(fèi)正清本人認(rèn)為，他能逃過那一次反共抓巫（anti-communist witch-hunt）是因?yàn)樗€不是一個(gè)足夠大的目標(biāo)；參見費(fèi)正清自傳第157頁。【譯者按：“反共抓巫”指的是二十世紀(jì)四十至五十年代美國的第二次紅色恐慌。當(dāng)時(shí)美國部分政治人物大肆渲染共產(chǎn)主義對美國政界和文藝界的滲透，在缺乏充分證據(jù)的情況下質(zhì)疑相關(guān)人士對美國的忠誠度，令很多知名人士遭到審查起訴。這場利用公眾恐懼發(fā)起的捕風(fēng)捉影的反共政治迫害常常被比作“塞勒姆的獵巫”。“塞勒姆的獵巫”指的是1692年至1693年在美國麻省塞勒姆市發(fā)生的逮捕審判“女巫”的行動(dòng)。】據(jù)伊文思說，經(jīng)過這一次磨難，其后十幾年里，費(fèi)正清在公開演講和評論外交政策時(shí)都比以前低調(diào)多了；參見伊文思著《費(fèi)正清與對中國的理解》第161頁。這一時(shí)期，西雅圖華盛頓大學(xué)遠(yuǎn)東研究所的一些中國問題專家公開批評費(fèi)正清的“親共”傾向。這些學(xué)者以及他們的東亞研究中心被認(rèn)為是支持蔣介石和國民黨的保守派。這樣，二十世紀(jì)六十年代以及七十年代早期，在哈佛大學(xué)東亞研究中心和西雅圖華盛頓大學(xué)東亞研究中心（1964年成立）之間形成了對立。哈佛大學(xué)一派被認(rèn)為是左翼的、反對越南戰(zhàn)爭的，和西雅圖派截然不同。伊文思在《費(fèi)正清與美國對現(xiàn)代中國的理解》第159頁中對此事有一番評論。1954年費(fèi)正清在哈佛國際研究委員會(huì)（Committee on International Studies）之下設(shè)立了哈佛大學(xué)中國項(xiàng)目（Harvard University China Program），差不多從那時(shí)起他就已經(jīng)下定決心要開展明確界定的中國研究。這個(gè)項(xiàng)目當(dāng)時(shí)設(shè)在利陶爾中心（Littauer Center）127室。