抓住政局穩(wěn)定的大好時機，門羅政府加大了經(jīng)濟發(fā)展的步伐。政府繼續(xù)實行保護關(guān)稅政策，大力發(fā)展工商業(yè)和交通運輸業(yè)，推動農(nóng)業(yè)的改良和農(nóng)業(yè)機械的使用，政府對公共事業(yè)也給以大力資助。由于在國內(nèi)建設(shè)方面取得了較好的成績，所以在1820年的大選中，門羅幾乎以全票連任總統(tǒng)，就連老聯(lián)邦黨人，第2任總統(tǒng)約翰·亞當斯也投了他的票。唯一的一張反對票來自于新罕布什爾州州長威廉·普盧默。有人認為，普盧默此舉僅僅是為了把全體一致通過的榮譽保留給華盛頓一人。

門羅拒絕政黨政治，尊重立法權(quán)的獨立，主張對憲法進行嚴格解釋。但他主張推進國內(nèi)改革，所以簽署了幾項改善國內(nèi)事業(yè)的議案，其中比較重要的是建立海岸防務(wù)體系的計劃和一項旨在推進公共設(shè)備建設(shè)的憲法修正案。他還批準了《規(guī)劃法案》，以便將來加強市政建設(shè)事業(yè)，等等。

但“和睦時代”并未持久，奴隸制度和保護主義成為制造不和的兩大因素，很快使全國陷入動蕩不安之中。1819～1821年，又爆發(fā)了美國歷史上第一次經(jīng)濟大蕭條，致使稅收銳減，經(jīng)濟凋敝。為了緩和經(jīng)濟危機，門羅倡導(dǎo)厲行節(jié)約，并采取措施穩(wěn)定財政，但由于他的經(jīng)濟思想比較保守，所以成效不夠顯著。這次蕭條無疑使人們感到失望，加劇了社會分裂。

密蘇里危機加速了社會分裂的過程。1819年2月，密蘇里要求作為新州加入聯(lián)邦。在該州是否保留奴隸制的問題上，政壇上發(fā)生了嚴重的分歧，并引發(fā)了一場全國性的大辯論。門羅對此仍然堅持中間路線，盡量不直接對國會施加影響。1820年1月，“妥協(xié)大師”亨利·克萊提出著名的《密蘇里妥協(xié)案》，主張密蘇里作為蓄奴州加入聯(lián)邦，從馬薩諸塞州中分離出緬因作為自由州加入聯(lián)邦，旨在維持南北雙方的平衡，避免任何一方采取極端行為。門羅對該妥協(xié)案持猶疑態(tài)度，其原因，一是他同情南方，二是不愿直接干預(yù)這一棘手的問題。但后來他仍簽署了該法案，因為他擔心否決可能導(dǎo)致南北分裂和聯(lián)邦的解體。

門羅主義 作為行政首腦，門羅在各方面都展示出了卓越的管理才能，尤其是在外交領(lǐng)域。他雖然很少直接參與外交談判，但十分注意就重大事務(wù)征求閣員們的意見，并牢牢地把握著決策大權(quán)。

門羅上任不久，就遇到了棘手的佛羅里達問題。長期以來，西屬佛羅里達的塞米諾爾印第安人不斷越過邊界，與美國邊民發(fā)生糾紛。由于此事有英國人插手，西班牙當局無意介入，門羅政府便派安德魯·杰克遜率三千軍隊入侵佛羅里達。杰克遜將軍強悍魯莽，搗毀了塞米諾爾人的村莊，不經(jīng)審判就絞死了兩個親英的印第安人酋長，并對兩個挑起事端的英國人（羅伯特·安布里斯特和亞歷山大·阿巴斯諾特）執(zhí)行了死刑，然后繼續(xù)深入，驅(qū)逐了西班牙總督，占領(lǐng)了彭薩科拉要塞，并派軍駐防。這一事件在內(nèi)閣中掀起軒然大波，幾乎所有的人都譴責杰克遜的行為越權(quán)，國際輿論對美國也很不利。只有亞當斯一個人堅持杰克遜的行為是正當?shù)?。門羅審時度勢做出定奪：杰克遜的做法是正當?shù)?，同時把奪占的要塞歸還西班牙。塞米諾爾戰(zhàn)役使西班牙確信，美國人奪取佛羅里達猶如探囊取物，由此產(chǎn)生了出售佛羅里達的想法。門羅抓住這一時機，于1819年與西班牙簽訂了《亞當斯-奧尼斯條約》，規(guī)定：美國從西班牙手中獲得佛羅里達并劃定雙方邊界，美國為此向西班牙支付五百萬美元。