這樣的奏疏確乎是史無前例的。往常臣下向皇帝作諍諫，只是批評一種或幾種政策或措施，這種指斥皇帝的性格和否定他所做的一切，等于說他這幾十年的天子生涯完全是尸位素餐，而且連為人夫及為人父的責任也沒有盡到，其唐突之處真的是古今罕有。

所以，在嘉靖皇帝讀罷這篇奏疏，其震怒的情狀自然可想而知。據(jù)說，他當時把奏折往地上一摔，嘴里喊叫：“抓住這個人，不要讓他跑了！”旁邊一個宦官為了平息皇帝的怒氣，就不慌不忙地跪奏：“萬歲不必動怒。這個人向來就有癡名，聽說他已自知必死無疑，所以他在遞上奏本以前就買好一口棺材，召集家人訣別，仆從已經嚇得統(tǒng)統(tǒng)逃散。這個人是不會逃跑的。” 皇帝聽了默默無言，過了一會又讀海瑞上疏，說道：“這個人可和比干相比，但朕不是商紂王！”

在逮捕海瑞關進詔獄后，嘉靖又下令追究主使的人。獄詞送上后，嘉靖卻留在宮中不發(fā)布，整日嘆息，因為他不能忘記這一奏疏，其中有那么多的事實無可回避，可從來沒有人敢在他面前哪怕是提到其中的一丁點！皇帝的情緒顯得很矛盾。

正遇上皇帝的健康欠佳，心情郁悶，便召來閣臣徐階議論禪讓帝位給皇太子的事，便說：“海瑞所說的都對。朕現(xiàn)在病了很長時間，怎能臨朝聽政?！庇终f：“朕確實不自謹，導致現(xiàn)在身體多病。如果朕能夠在偏殿議政，豈能遭受這個人的責備辱罵呢？”

徐階連忙予以緩沖，說：“海瑞這個人，說話一貫愚憨，但其心還是可以原諒的，請陛下對他法外開恩。”

過了兩個月，嘉靖皇帝死，明穆宗繼位，海瑞被釋放出獄。

終于擺平了海瑞的事情，徐階又開始忙于內閣的人事調整，這可是關系到他將來能否順利、體面地退休的大事，所以慎之又慎。這時候，張居正的機會也就來了。

徐階對張居正的器重，是始終如一的。他有意保護張居正不卷入任何正面的政治斗爭中，只留在幕后。張居正自然明白老師的苦心，也決心有朝一日大干一場。

他對張居正的栽培，處處都有心機。當年，他提拔張居正擔任國子監(jiān)司業(yè)，使張居正在眾多監(jiān)生中有了威望，這是在為張居正積蓄做大事的資本。明代由監(jiān)生入仕而擔任各級干部的，有一定的比例。在他們中間，醞釀出一種“誰人不識張江陵”的氣氛來，對日后的發(fā)展必會有用。

嘉靖三十六年（1557年），張居正仍回翰林院供職。這時的他在苦悶思索中漸已成熟，在政治的風浪中，他模仿老師徐階“內抱不群，外欲渾跡”，相機而動。

嘉靖四十二年（1563年），也就是嚴嵩罷相的第二年，徐階又把張居正的位置挪了一挪，推薦他去參與重?！队罉反蟮洹罚肿屗麚涡拮杜d都志》的副總裁，實際上就是主持全盤工作。這是一次精心的安排，目的是為了能讓張居正給嘉靖皇帝留下一個深刻的印象?！杜d都志》不是一般的地方志，由于嘉靖是從外藩入嗣，出生在湖廣的興都（即安陸），這是他父親興獻王的封藩之地，也是他的故鄉(xiāng)。在他繼位后，興都即更名為承天。所以，《興都志》又稱為《承天大志》，這是國史也是皇帝的家史，能夠參與編著這個不一般的志，也算是很有面子的差事了。