2009年，維基解密涉及的揭秘事件主要還有以下幾起。1月 28日，維基解密公布了截獲的涉及 2008年秘魯石油丑聞的秘魯政客同商人之間的 86段電話錄音，泄密的內(nèi)容占據(jù)了五家秘魯報紙的頭版。這導(dǎo)致了由工人、教師、建筑工人和醫(yī)生等社會各階層的街頭示威游行，要求內(nèi)閣辭職。丑聞最終導(dǎo)致總理霍爾格 ·德爾 ·卡斯蒂洛的下臺，并任命耶胡德 ·西蒙為總理的新一屆內(nèi)閣。

自從 2009年 5月起，維基解密連續(xù)在其網(wǎng)站上公布比爾德伯格集團（Bilderberg Group）歷史上幾次會議的報告，年份分別是 1955年、1956年、1957年、1958年、1960年、1962年、1963年和 1980年。該集團發(fā)起于 1954年，因在荷蘭的比爾德伯格飯店舉行定期的秘密會議而得名，集團成員包括跨大西洋的各國政要、軍方要人、商界巨子、銀行財閥、王室成員和其他各類精英，據(jù)稱這些會議旨在操控整個世界的局勢。2009年 8月，在一系列揭秘網(wǎng)帖中，維基解密網(wǎng)站將考普辛銀行（Kaupthing Bank）的內(nèi)部文件公布。文件顯示該銀行涉嫌將大筆資金借貸給銀行的所有者，最后將大量壞賬一筆勾銷。該行的律師威脅要引用銀行保密法對維基解密采取法律措施，然而，揭秘文件引發(fā)的冰島國內(nèi)的騷動迫使銀行不得不采取補救措施。此舉恰在冰島銀行業(yè)的倒閉之前，倒閉最終造成了 2008年至 2010年的冰島金融危機。 

2009年10月，英軍的第 440號聯(lián)合服役條例（Joint Services Protocol 440），一份長達(dá) 2400頁由英國國防部 2001年制訂的保密文件，被維基解密泄露。該文件包含安全保衛(wèi)的條例，例如如何避免信息泄露給黑客、記者和外國間諜。 

2009年 11月，維基解密公布了氣候門（Climategate）的一系列電子郵件和檔案。2009年 11月，某黑客入侵英國的隸屬東安格里亞大學(xué)的氣候研究小組的服務(wù)器，將存儲在上面的個人檔案以及發(fā)現(xiàn)的電子郵件發(fā)布于網(wǎng)絡(luò)上（亦有人認(rèn)為并非黑客所為，而是內(nèi)部告發(fā)）。1996年以后的 1000封以上的電子郵件以及 3000份以上的內(nèi)部文件被盜取。有關(guān)部門正在對此進(jìn)行調(diào)查。對溫室效應(yīng)持反對意見的團體認(rèn)為，那些電子郵件通信是為了將氣候變遷歸咎于人類活動，而對數(shù)據(jù)進(jìn)行篡改的密謀。

作為一家非營利媒體機構(gòu)，維基解密網(wǎng)站的運營資金主要來自團體和個人的捐助，或者團隊成員自掏腰包。數(shù)十萬美元的合法捐贈來自于媒體機構(gòu)，包括美聯(lián)社、《洛杉磯時報》和全國報紙出版協(xié)會。由于沒有從事任何商業(yè)項目，資金來源并不穩(wěn)定，資金短缺一直是困擾維基解密網(wǎng)站的一個棘手問題。與其公布機密文件時的透明度形成鮮明對比，維基解密在自身財政問題上則極端謹(jǐn)慎。阿桑奇表示 5位所謂 “全職 ”編輯，也都是不計報酬的，他們都是通過某種其他事情掙錢維持開銷。維基解密在德國的代表、曾經(jīng)作為該組織發(fā)言人的丹尼爾 ·施密特（Daniel Schmitt，真名叫丹尼爾 ·多姆施特 -貝格，Daniel Domscheit-Berg，后離開維基解密）曾經(jīng)對電視媒體表示，所有維基解密成員都是自愿工作的，甚至他們的發(fā)言人也沒有工資。維基解密每年（2009年以前）的運營開支大約為 15萬歐元，主要是網(wǎng)絡(luò)費用、網(wǎng)站服務(wù)器的租用和儲存成本、一些硬件和旅行費用。據(jù)阿桑奇稱，維基解密在其他國家也注冊了類似的機構(gòu)：澳大利亞的一個圖書館、法國的一家基金會、瑞典的一份報紙，以及在美國的兩個免稅慈善組織。但阿桑奇并沒有透露這些機構(gòu)的名稱，因為他擔(dān)心政治因素可能會導(dǎo)致捐款流失。 

2009年12月 24日，維基解密宣布它正遭受資金短缺，除了提交新材料的形式外，該網(wǎng)站已經(jīng)取消了所有資料的外部鏈接。所有登陸該網(wǎng)站的用戶看到的是維基解密的籌款聲明：“我們保衛(wèi)世界，但誰來保護我們？”先前所公布的材料也無法登陸，盡管一些人仍能通過非官方的鏡像進(jìn)入。維基解密宣布一旦運行成本籌措到，就立刻恢復(fù)網(wǎng)站全部運行。該網(wǎng)站將其看做是一種罷工，“為的是保證所涉及的每個人都停下手中的工作，切實地花時間去籌款 ”。在 2010年 1月 4日所做的一次訪談中，當(dāng)被問及維基解密的運作成本時，阿桑奇說：“迄今為止，最大的成本是人。當(dāng)然，隨著運行規(guī)模的增加也會有一個成本。我們經(jīng)手的材料越多，就會發(fā)生越來越大的管理和人力成本。員工需要寫材料的概要并核實它的真?zhèn)?。目前每個人都是自愿服務(wù)，但那種狀況將永遠(yuǎn)持續(xù)下去?！惫芾沓杀竞途W(wǎng)站維持的費用一直在上升，2009年，至少需要 20萬歐元，如果計算人員工資的話，則至少需要 60萬歐元。對于維基解密這樣一個非營利機構(gòu)而言是難以負(fù)荷的。阿桑奇表示暫時關(guān)閉網(wǎng)站就是為了讓公眾再一次意識到，維基解密存在的價值和意義。

經(jīng)過十幾天的努力，到 1月 6日，該網(wǎng)站的最低籌款計劃達(dá)成，網(wǎng)站重新開放。在 2009年 12月之前，他們每個月收到的捐款平均不到 3000歐元。維基解密網(wǎng)站因資金問題被迫關(guān)閉后的數(shù)個月內(nèi)，捐款額一下子增加了 20倍。在募集到約 75萬歐元之后，網(wǎng)站于 2010年5月又恢復(fù)了運行。事實上，“維基解密每一次發(fā)布新的文件都會引起一陣捐款高潮?！备栠_(dá)表示，“通過貝寶方式支付給維基解密的捐款一周就超過了 8萬歐元?！比欢?，不久之后，由于受到了某種壓力，貝寶宣布凍結(jié)維基解密的賬號。

阿桑奇曾經(jīng)表示，維基解密發(fā)布機密文件的行為已經(jīng)招致了部分政府和企業(yè)的封殺和起訴，他們擔(dān)心機構(gòu)的資金和設(shè)施將成為下一階段的攻擊目標(biāo)。這種擔(dān)心很快就成為了現(xiàn)實。2010年 7月，在維基解密公布了大量美軍機密文件以后，網(wǎng)站已經(jīng)遭受到了一系列的網(wǎng)絡(luò)攻擊。出于政治考量，原來同維基解密合作的不少公司——包括網(wǎng)絡(luò)巨人亞馬遜公司 ——已經(jīng)終止了托管網(wǎng)站及為其提供服務(wù)。此外，一些金融機構(gòu) ——包括萬事達(dá)（Mastercard）、維薩（Visa）和貝寶 ——都已經(jīng)撤出了允許人們對該網(wǎng)站捐款的服務(wù)。網(wǎng)站在瑞士的銀行賬戶也被關(guān)閉。因此，該網(wǎng)站已經(jīng)建立了一個復(fù)雜的匯總和撥付系統(tǒng)，以保護捐款的來源和用途?！斑\作一個機構(gòu)非常困難，更別說一個不斷被監(jiān)視和起訴的機構(gòu)?！卑⑸Ｆ嬲f，“司法裁決會對一個機構(gòu)的運營產(chǎn)生影響，我們不能讓現(xiàn)金流被完全約束住?！钡聡?nbsp;WauHolland基金會是維基解密的金融網(wǎng)絡(luò)中的一個關(guān)鍵。維基解密鼓勵捐助者通過它在該基金會的賬號捐款。這樣做有兩點好處。首先，根據(jù)德國法律，基金會不能公開披露捐贈者的姓名；其次，由于基金會沒有涉及維基解密的運作，它也不可能被起訴，因此捐款也能得到保護。從 WauHolland基金會取錢的程序并不簡單。