對于選拔人才，袁世凱也提出了建議：

各省督撫保薦人才，業(yè)經(jīng)恭奉諭旨。至今省學(xué)政，雖專司文柄，而軒所及，周遍通省，接見官吏，考試諸生，此中才智杰出者，當(dāng)不乏人。乃三年屆滿所保者，或有一二敦品績學(xué)之士，而經(jīng)濟(jì)才藝能收實(shí)用者，從未破例上陳。此外，更有乞體遺老，關(guān)心風(fēng)化，籍本土著，人性熟悉，較之督撫深居簡出，寄耳目于人者，見聞尤為確鑿，似宜并令周咨，俾闡幽發(fā)隱，廣搜巖穴之瑰寶。惟濫保之咎，既有專條，而得人之賞，亦須審定。其規(guī)避處分，不肯訪舉人才者，尤須懲警，似宜詳細(xì)審酌，另立舉才款限，專條刊發(fā)各省，嚴(yán)切曉欲諭，俾各省遵守以期持久。

如京都國立館院，凡各省選舉人才，必飭令赴館院，由督率之王大臣及提調(diào)等詳加察核，并令同業(yè)者與之考較，如此則事皆實(shí)際，舉盡真材，較之一紙送入，即畀以重任者，其疑信奚啻霄壤。

袁世凱對以前薦舉人才存在的缺陷提出了批評，“而經(jīng)濟(jì)才藝能收實(shí)用者，從未破例上陳”。“經(jīng)濟(jì)才藝能收實(shí)用者”在當(dāng)時，可能是處于社會末流，自然不會得到“破例上陳”，但袁世凱顯然看到了“經(jīng)濟(jì)才藝能收實(shí)用者”對于國家建設(shè)的意義，遂專門點(diǎn)出，以示重視。另外，袁世凱建議設(shè)立館院集中學(xué)習(xí)、談?wù)?，這就類似后來設(shè)立大學(xué)集中培養(yǎng)人才。

科舉制度對于“經(jīng)濟(jì)才藝能收實(shí)用者”最是不公，而這些人才，恰是當(dāng)時國家富強(qiáng)的根本，于是袁世凱在萬言書中進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了實(shí)學(xué)：

詞章之學(xué)，不能大俾實(shí)用……嗣后應(yīng)請簡派學(xué)政典試各差時，慎擇講究學(xué)時事者充其任，務(wù)飭特重實(shí)學(xué)。如所選之士，實(shí)學(xué)較多者，應(yīng)請酌加褒獎，以示鼓勵；其謹(jǐn)取章句者，亦略加申斥，庶本源既易，而天下向風(fēng)，士氣文運(yùn)，自必隨之更新，且從此一轉(zhuǎn)移間，則尋章摘句之舉，盡變?yōu)榻?jīng)濟(jì)應(yīng)世之才，其得失所關(guān)，殊非淺鮮。

為了切實(shí)選拔好人才，讓一些精通西學(xué)的人才脫穎而出，袁世凱還建議采用新的選拔方式：

沿海一帶，如閩粵江浙等省，聰俊子弟中，素習(xí)洋務(wù)西律，足以參贊交涉，及肄習(xí)格致化學(xué)，足以分任制造，又諳練陸軍水師。足以教習(xí)管帶者，誠不乏人。惟此等人素習(xí)簡率，不諳官場儀節(jié)，故從不與長官來往，大吏知者甚少，即間有一二進(jìn)謁者，亦因其質(zhì)而無文，置之不論。似宜速訂條規(guī)，刊行沿海各省，早定年限，令南北兩洋、兩廣、浙閩大吏，妥議試規(guī)，擇適中之海關(guān)道經(jīng)辦試場，廷聘名師，分西律、技藝、軍務(wù)為三途，照童試?yán)?，取鄰保甘結(jié)，擇期開試，其身家不清，素有劣跡者，概不準(zhǔn)入；得取者，亦列為生員，擇正科之次年，由四省大吏延師秋試，次春會試。由生員而舉人，而進(jìn)士，均仿照文學(xué)鄉(xiāng)會條規(guī)各色辦理，但考取以進(jìn)士為止。每次定額若干名，隨時再酌量增加，均交新設(shè)館院，分司學(xué)習(xí)，俾得量才授職，庶所事皆所學(xué)，漸收用人實(shí)效。至考試經(jīng)費(fèi)，亦由沿海各省大吏關(guān)道籌辦，其閱試各師，先由承試官精擇聘請，迨所取之士依次造成，即由新設(shè)館院中擇派督試，藉可鼓勵后進(jìn)，廣拔真材。