藏傳佛教教派眾多，其形成與發(fā)展史，就是一部各種教派和政治勢力的斗爭史。與漢地佛教一脈傳承、融會貫通的發(fā)展歷史不同，佛教進(jìn)入西藏，首先是與本地原始宗教苯教長期斗爭，取代其傳統(tǒng)地位后，格魯派（黃教）又先后經(jīng)歷了與寧瑪派（紅教）、噶當(dāng)派（黑教）、噶舉派（白教）、薩迦派（花教）等各個教派的反復(fù)斗爭。

十七世紀(jì)初，在青海、蒙古一帶，格魯派的主導(dǎo)地位已經(jīng)確立。但是西藏尚處于噶舉派得勢的時期，噶舉派得到了管理地方政事的藏巴汗的支持，對正在蓬勃興起的黃教采取壓迫摧殘的政策，格魯教派與地方政治勢力的斗爭日趨激烈。

來自蒙古的四世達(dá)賴?yán)镌频ぜ未胗诙藲q盛年猝死。他死后，按照藏傳佛教傳統(tǒng)，應(yīng)當(dāng)立即尋找他的轉(zhuǎn)世靈童。奇怪的是，藏巴汗竟不允許尋找四世達(dá)賴的轉(zhuǎn)世靈童。有人傳說，那是因為四世達(dá)賴?yán)镌频ぜ未肱c藏巴汗不睦，暗中對藏巴汗下了詛咒，導(dǎo)致他常年纏綿病榻，時常頭痛難耐，幾乎一命嗚呼。藏巴汗察覺后，勃然大怒，遂派出刺客，殺死了云丹嘉措，并且余怒未消，明令不允許尋找達(dá)賴的轉(zhuǎn)世靈童。此時藏巴汗權(quán)傾前后藏，因此對于這樣可笑的政治干預(yù)，拉薩上層的格魯派僧人雖覺憤怒，卻也無可奈何，一籌莫展。

好在天佑黃教。此時，四世班禪羅桑卻吉卻為達(dá)賴世系的傳承立下了一樁大功。

在西藏，達(dá)賴系統(tǒng)與班禪系統(tǒng)是藏傳佛教格魯派的兩大地位最高的體系，達(dá)賴系統(tǒng)以拉薩為中心統(tǒng)領(lǐng)前藏，班禪系統(tǒng)以日喀則為中心統(tǒng)領(lǐng)后藏。兩個系統(tǒng)互相制約，也互相補(bǔ)位。歷代班禪與達(dá)賴互為師徒，就是為了在轉(zhuǎn)世靈童的十八年培養(yǎng)期間，遏制攝政王第巴權(quán)力過大的問題，同時也共同對付駐藏政治勢力的干擾，維護(hù)格魯教派統(tǒng)治地位的穩(wěn)定。

四世班禪羅桑卻吉是一位仁厚長者，在前后藏享有很高的威望。羅桑卻吉精通醫(yī)術(shù)，為藏巴汗治好了他的頭痛痼疾。藏巴汗感激萬分，提出要捐獻(xiàn)一個莊園給扎什倫布寺作為酬謝，羅桑卻吉堅辭不受，藏巴汗便讓班禪自己提一個要求，他都予以應(yīng)允。羅桑卻吉趁機(jī)請求藏巴汗允許尋找四世達(dá)賴的轉(zhuǎn)世靈童。藏巴汗無法自食其言，只好答應(yīng)了。

在四世班禪羅桑卻吉的主持下，尋找轉(zhuǎn)世靈童的高僧在藏北的熱振寺，文殊菩薩佛像前，以陳設(shè)糌粑丸抽簽的方式，選中了山南瓊結(jié)地方的世襲貴族家族幼子阿旺羅桑嘉措為四世達(dá)賴的轉(zhuǎn)世靈童。

五世達(dá)賴?yán)锇⑼_桑嘉措一六一七年出生于山南世家。他天資聰穎，又接受了很好的教育，自小便極富思想與個性，與眾不同，有遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出他年齡的智慧、才識和見地。成年后的他，更是有著強(qiáng)大的個人意志，和異常清醒的政治頭腦。放在任何一段歷史中，他都是一個能夠建功立業(yè)的英雄。何況此時的西藏，正處于一段迷茫的亂世。

他是藏傳佛教史上舉足重輕的人物，對格魯派確立在西藏統(tǒng)治地位的貢獻(xiàn)無人可及。在他的老師四世班禪羅桑卻吉的幫助下，他在拉薩一步一步推動和實現(xiàn)自己的政治理想。

羅桑嘉措作為轉(zhuǎn)世靈童在哲蚌寺接受教育期間，也是藏巴汗政權(quán)加緊對黃教迫害的時期。一六三零年左右，藏巴汗政權(quán)利用地方勢力內(nèi)訌的機(jī)會，借機(jī)發(fā)動對黃教的洗劫性打擊。不滿十四歲的羅桑嘉措不得不避往山南，尋求家族勢力的庇護(hù)。這更加堅定了他要為西藏宗教爭取獨立政治地位的決心。為了擺脫西藏宗教長年來對藏巴汗政權(quán)的從屬地位，達(dá)賴與班禪謀劃，利用藏巴汗政權(quán)與蒙古軍隊的矛盾，派人進(jìn)入青海，與駐青海的蒙古軍隊統(tǒng)帥固始汗達(dá)成協(xié)議。蒙古軍隊遂進(jìn)入西藏，推翻了統(tǒng)治西藏多年的噶瑪?shù)胤秸?quán)，擁立五世達(dá)賴?yán)锝⒘烁恋ゎH章政權(quán)。