孔祀問題極大地刺激了保守派。各地一時間興起了“孔教會”及“孔道會”等團(tuán)體的尊孔運(yùn)動。

對于一直以來都在策劃復(fù)辟的大總統(tǒng)袁世凱而言，尊孔運(yùn)動的興起正合他的心意。儒教在被體制所收編后兩千多年以來，一直效力于歷代王朝，其體質(zhì)是完全符合帝制的?？涤袨樽鳛闊嵝牡淖鹂渍撜?，甚至自發(fā)性地組織了一些運(yùn)動，這與狡猾的袁世凱在背后煽動尊孔運(yùn)動是分不開的。

教育會議的第二年（ 1913）6月18日，四川都督尹昌衡向袁世凱發(fā)送電報(bào)，建議恢復(fù)“祀孔典禮”（祭祀孔子的典禮）。四天之后， 6月22日，袁世凱發(fā)布了大總統(tǒng)令，即“尊崇孔子令”，號稱尊崇孔子，“以正人心，以立民極”，并斷定“以不服從為平等，以無忌憚為自由，民德如斯，國何以立”。強(qiáng)制國民必須履行此令，不可擅自發(fā)表看法。

這便是袁世凱復(fù)辟帝制的步驟之一，他將臣民絕對服從的希望寄托于“孔子”身上。要求絕對服從他“袁世凱”為時尚早，于是便把孔子抬了出來，然后再偷梁換柱。袁世凱的目的在于，讓溜須拍馬的人歌頌他與孔子的德性一樣。歷史上曾有類似的先例。明末把持朝政的宦官魏忠賢（？— 1627）下令修建自己的生祠（祭祀活著的人的祠堂），并配祀孔子?；实郾环Q為“萬歲”，魏忠賢要求人們稱之為“九千歲”。當(dāng)時的皇帝——天啟帝（ 1621—1627年在位）死后，魏忠賢縊死。假如天啟帝再多活些時日，魏忠賢或許便會篡權(quán)。

頒布大總統(tǒng)令那一年的 9月1日，“孔教會”再次發(fā)送電報(bào)請求將孔教國教化。曾留學(xué)于英國的嚴(yán)復(fù)（ 1853—1921）、清末進(jìn)士出身并作為考察大臣隨員外游的夏曾佑（ 1863—1924）以及梁啟超（ 1873—1929）成為孔教會的成員，康有為被推薦為會長。他們在北京的國子監(jiān)舉行了祀孔典禮。如果將此作為個人活動自然無可厚非，然而他們卻將此作為了國家活動的演練。 

1914年1月末，在政治會議上通過了“祭天祀孔”案，并定于 2月7日開始執(zhí)行。

“祀孔”是對偉人的緬懷，還是一種宗教儀式？——這是一個極為微妙的問題。被稱為真正儒者的蔡元培認(rèn)為，孔子學(xué)說不同于后世的儒家，他承認(rèn)了儒中的宗教性。如果僅僅是緬懷儀式的話，那么與“祭天”結(jié)合在一起就會令人產(chǎn)生疑惑。在天壇祭天乃專制皇帝的特權(quán)，袁世凱身為共和國的大總統(tǒng)，其位置與皇帝極為接近，這么做便有改朝換代之嫌。因此，孔儒極容易被野心家利用。

當(dāng)時許多人對“共和制”缺乏了解，畢竟共和政體是新生事物。有人認(rèn)為，所謂的共和政體是由于當(dāng)下皇帝不存在，便組織了臨時的共和政治，等皇帝出現(xiàn)了，共和政體便會被廢止。

周厲王（前 878—前 827）暴虐，遭國人驅(qū)逐，不在位期間由兩位大臣暫理國政，“共和”一詞便由此而來。厲王客死他鄉(xiāng)后，兩位大臣共同輔佐王子靜即位，并將大政奉還。據(jù)《史記》記載，共和持續(xù)了十四年。王子靜便是宣王（前 827—前 782年在位）。“共和”一詞源于此，便有一時之意。

袁世凱統(tǒng)治時期發(fā)布的憲法草案中，提到“國民教育以孔子之道為修身之大本”，雖未將之國教化，但差別甚微。

在通往近代之門之際，康有為等人通過《孔子改制考》將孔子稱為創(chuàng)始者，舉起了創(chuàng)始、改制的大旗。然而一旦進(jìn)入了近代，孔子及儒教的粉飾便被剝落了。