抗戰(zhàn)開始以來，何應(yīng)欽對國民黨正面戰(zhàn)場的作戰(zhàn)，也做了不少雖不盡如人意，也不如計劃上所列，但卻不乏實績的工作。如在國統(tǒng)區(qū)普遍實施了義務(wù)兵役制和“國民兵役”方案，都稱得上中國軍事史上的首創(chuàng)。到1938年底，全國共征得壯丁270余萬人，直接補充到各部隊的達201萬人。一定程度緩解了兵員缺乏的矛盾。不少地方由縣長負責(zé)，對居民實施不脫產(chǎn)的150小時軍事訓(xùn)練，也多少增強了人們的抗戰(zhàn)意識。從抗戰(zhàn)開始到1939年，國民黨軍的戰(zhàn)時補充辦法也大有改進。在武漢會戰(zhàn)時期，逐步建立起正規(guī)的兵員補充制度，有的師能一次兩次地撤到后方去補充兵員，然后重新參戰(zhàn)。這也是會戰(zhàn)能較長時間堅持下來的原因之一。到1939年7月，全國共建立550個補充團和70個補充營，經(jīng)過訓(xùn)練的兵員數(shù)將近100萬。在民眾武裝和壯丁訓(xùn)練工作中，雖為部隊補充提供了一定基礎(chǔ)，但由于國民黨統(tǒng)治機器全是舊的，真正實行起來，往往面目全非，形成了“用武裝民眾來消滅民眾武裝，用工作來取消工作”的狀況。至于抽壯丁和壯丁訓(xùn)練中的種種弊端，更令人毛發(fā)直豎。1938年4月，何應(yīng)欽主持擬訂了各戰(zhàn)區(qū)糧食管理大綱。這也算是中國戰(zhàn)時糧食管理法規(guī)的首創(chuàng)。至于何應(yīng)欽主持實施的整軍備戰(zhàn)的五年計劃中，有建設(shè)各級各類軍事學(xué)校的內(nèi)容。到1938年底，已有參謀總部軍事學(xué)院、陸軍大學(xué)及工兵、炮兵、通訊兵、裝甲坦克兵、高炮、騎兵、空軍、以及軍政、技術(shù)等學(xué)校開辦。預(yù)計1939年內(nèi)，各種軍校畢業(yè)的軍官總數(shù)可達四萬人，基本上可滿足國民黨軍的干部需求。同時，由于缺乏受過中等教育的軍官，軍政部不得不降低對文化程度的要求，讓一些軍士進入軍校或進修班，在客觀上又改善了國民黨軍軍官的構(gòu)成，使一批經(jīng)過實戰(zhàn)及培訓(xùn)的軍士成為中下級軍官。

此外，在抗日戰(zhàn)爭初期，何應(yīng)欽主持制定并實行了“國難薪制”；在軍隊的人事經(jīng)理及教育訓(xùn)練方面，也圍繞戰(zhàn)時特點予以改進；在加強國防工事及戰(zhàn)時交通與通訊設(shè)施，強化防空及民防力量，發(fā)展國防工業(yè)等方面，也有一定成效。