1755年春，乾隆派遣5萬大軍，兵分兩路進(jìn)軍伊犁，阿睦爾撒納為北路副將軍充先鋒。清軍西進(jìn)途中，準(zhǔn)噶爾部眾望風(fēng)而降。達(dá)瓦齊終日飲酒淫樂，大兵壓境才倉促應(yīng)戰(zhàn)。他率部眾退據(jù)格登山負(fù)隅頑抗，被歸順清朝的猛將阿玉錫夜襲劫營。達(dá)瓦齊狼狽逃竄途中被俘，乾隆皇帝赦免了他，軟禁在北京頤養(yǎng)天年。稱雄中亞120年的準(zhǔn)噶爾汗國滅亡。

清軍班師回朝，只留下500軍兵鎮(zhèn)守伊犁，處理善后事宜。乾隆皇帝看出阿睦爾撒納有異心，命他到承德避暑山莊朝覲。阿睦爾撒納做賊心虛，半途偷偷溜掉，潛回伊犁。他以琿臺(tái)吉的名義發(fā)號(hào)施令，集結(jié)各路人馬，圍攻清朝駐伊犁軍營。清軍寡不敵眾兵敗，主將自殺身亡。

乾隆皇帝拍案大怒，再次派兵西征圍剿，對(duì)桀驁不馴的準(zhǔn)噶爾部大肆屠殺。阿睦爾撒納聞風(fēng)而逃，后染病而亡。強(qiáng)大剽悍的準(zhǔn)噶爾部消失了，只留下準(zhǔn)噶爾盆地這個(gè)地名，讓人感慨憑吊。

平定準(zhǔn)噶爾叛亂后，乾隆又派兵討伐南疆大小和卓的叛亂。清政府統(tǒng)一了天山南北，為確保對(duì)新疆地區(qū)的行政管轄和邊防安全，鑒于伊犁河谷重要的戰(zhàn)略地位，清政府在伊犁設(shè)立了“總統(tǒng)伊犁等處將軍”，統(tǒng)轄新疆全境，是新疆的軍事和政治中心。

經(jīng)過多年的苦心經(jīng)營，伊犁惠遠(yuǎn)城成為“關(guān)外巍然一重鎮(zhèn)”，商旅云集，百貨雜陳，市場(chǎng)繁華，城內(nèi)外寺廟林立，是新疆第一大城市。

清朝政府閉關(guān)鎖國，權(quán)貴階層日益腐朽墮落。1840年鴉片戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)，大清王朝猶如一艘破船，在風(fēng)雨飄搖中掙扎，中國領(lǐng)土主權(quán)遭到西方列強(qiáng)的肆意踐踏。一直對(duì)新疆虎視眈眈的沙皇俄國開始肆無忌憚地侵吞新疆的領(lǐng)土。因嚴(yán)禁鴉片、抗擊西方列強(qiáng)侵略而被清廷流放伊犁的林則徐振聾發(fā)聵地說：“終為中國患者，其俄羅斯乎！吾老矣，君等當(dāng)見之?！?/p>

史學(xué)界稱林則徐為近代中國“開眼看世界的第一人”，冷冰冰的歷史見證了林則徐的先見之明。

1864年，受陜甘回民起義影響，新疆爆發(fā)了大規(guī)模暴亂，“中亞屠夫”阿古柏和沙俄趁機(jī)入侵新疆。阿古柏控制了整個(gè)南疆及北疆的烏魯木齊、瑪納斯和米泉一帶；沙俄占據(jù)伊犁地區(qū)。

繁華昌盛的西北重鎮(zhèn)惠遠(yuǎn)城在沙俄軍隊(duì)的禍害下，商業(yè)蕭條，城墻倒塌，橋梁渠道失修，就此衰敗。伊犁九城大半成為廢墟，黎民百姓流離失所，苦不堪言。

當(dāng)時(shí)，東南海疆和西北邊疆同時(shí)告急，清廷在“海防”和“塞防”之間搖擺不定，放棄新疆的言論甚囂塵上。左宗棠力排眾議，慷慨陳詞，力主收復(fù)新疆。權(quán)衡再三，清廷決定派左宗棠率兵西征，收復(fù)新疆。

左宗棠坐鎮(zhèn)肅州運(yùn)籌帷幄，派心腹愛將劉錦棠率湘軍入疆平亂。劉錦棠足智多謀，不畏艱險(xiǎn)，戰(zhàn)術(shù)靈活多變，攻必克，戰(zhàn)必勝，勢(shì)如破竹。清軍于1878年一月初，收復(fù)了南北疆全部失地，被沙俄侵占的伊犁地區(qū)除外。

這是晚清歷史上最揚(yáng)眉吐氣的大事，是晚清回光返照最絢麗的一筆。