盡管政變的混亂局面很快得到了控制，但在政黨和國家領(lǐng)導(dǎo)層中，不同的政治立場卻讓蘇聯(lián)政局暗波洶涌。俄羅斯的最高蘇維埃成員大部分是蘇共黨員，他們對葉利欽的政策已經(jīng)越來越不滿。軍人出身的副總統(tǒng)魯茨科伊也轉(zhuǎn)而反對葉利欽大權(quán)獨攬，并和車臣最高蘇維埃主席斯蘭·哈斯布拉托夫結(jié)成了統(tǒng)一戰(zhàn)線，對葉利欽構(gòu)成了巨大的威脅。

雙方在俄羅斯應(yīng)該建立怎樣的政體這個關(guān)鍵問題上發(fā)生了尖銳的對立。葉利欽主張建立總統(tǒng)制共和國，哈斯布拉托夫主張建立議會制共和國。

1993年9月21日，俄聯(lián)邦總統(tǒng)葉利欽宣布解散人代會和最高蘇維埃，并決定在當(dāng)年年底舉行新的立法機(jī)構(gòu)——聯(lián)邦議會的選舉。而人代會則針鋒相對，不僅通過了彈劾總統(tǒng)的決議，而且還占據(jù)了白宮。

眼看事態(tài)沒有和平解決的希望，葉利欽決心通過武力迫使議會向其低頭。

10月3日葉利欽宣布莫斯科進(jìn)入緊急狀態(tài)，并調(diào)遣軍隊進(jìn)入莫斯科。４日凌晨，俄聯(lián)邦軍隊開始向議會所在地白宮發(fā)起炮轟，以特種兵部隊打頭，強(qiáng)行攻占議會大樓白宮，大批白宮武裝守衛(wèi)者傷亡，哈斯布拉托夫、魯茨科伊淪為俘虜。這就是俄羅斯當(dāng)代史上著名的“炮打白宮”事件。

而在處理這一事件過程中，普京又與索布恰克堅定地站在了一起，繼續(xù)支持葉利欽的決定，而且成功地控制住了圣彼得堡的秩序。

在經(jīng)歷了上述兩場生與死的考驗后，普京的忠誠讓索布恰克深受感動，普京的沉著鎮(zhèn)定和處變不驚的能力讓他對普京更為器重。他堅定地認(rèn)為普京是自己人。他甚至公開表示，普京是絕對可以信賴的人。

1992年，普京出任主管對外經(jīng)濟(jì)聯(lián)系的副市長，負(fù)責(zé)管理外國代表機(jī)構(gòu)、旅館、賭場、社會團(tuán)體以及強(qiáng)力部門，同時還負(fù)責(zé)大型投資項目。1994年3月，索布恰克將普京提升為圣彼得堡市第一副市長并兼任對外聯(lián)絡(luò)委員會主席。這時，普京對索布恰克的影響已相當(dāng)深。無論是在任市政府對外聯(lián)絡(luò)委員會主席期間，還是在副市長的工作崗位上，普京都取得了突出的工作成績。尤其是圣彼得堡市的經(jīng)濟(jì)工作在他的領(lǐng)導(dǎo)下得到了很大的發(fā)展。

在他的直接領(lǐng)導(dǎo)下，圣彼得堡市迅速建立起了外匯市場，并成功地與其他許多國外銀行和大企業(yè)簽署了引進(jìn)外資、合資、合作建廠的協(xié)議書。特別是在國外工作期間結(jié)識的老朋友幫助下，使得包括德累斯頓銀行在內(nèi)的許多的德國知名大公司、大企業(yè)源源不斷地進(jìn)入圣彼得堡，設(shè)立辦事處或分支機(jī)構(gòu)。

聯(lián)邦副總理丘拜斯在領(lǐng)導(dǎo)實施私有化改革時，多次和負(fù)責(zé)圣彼得堡經(jīng)濟(jì)的普京打交道。丘拜斯后來回憶說，普京雖然不是學(xué)經(jīng)濟(jì)的，但是對復(fù)雜的經(jīng)濟(jì)問題領(lǐng)悟得很快。

普京的政績也引來反對派的攻擊，他們以普京為克格勃工作過為由，企圖將他從索布恰克身邊趕走。但索布恰克公開批駁了這些要求，他說：“首先，普京不是‘克格勃的人’，他是我的學(xué)生。其次，普京曾從事對外情報工作，是在保衛(wèi)國家利益。他沒有什么可為自己的工作感到羞愧的。”可以說，索布恰克的這些告白完全發(fā)自內(nèi)心，對普京的心理幫助很大，同時更加激發(fā)了他對工作的熱情和對索布恰克的忠心。