在北京的后幾年，王國維對戲曲產(chǎn)生了濃厚的興趣。這時又發(fā)生了看似平常，但卻對王國維今后的學(xué)術(shù)研究方向具有重要意義的兩件大事：一是1908年，被清政府流放到新疆的劉鄂病逝，他和羅振玉是親家，所以他所藏的一部分龜甲在其死后為羅振玉所有，拓印為《鐵云藏龜之余》。二是1909年秋，從敦煌滿載而歸的法國人伯希和路過北京，羅振玉攜王國維等人一起去觀看，大為驚奇，對其中一部分拍照影印，至此敦煌才為國內(nèi)學(xué)界所知。之后在羅振玉等人的奔走下，清政府將剩余的敦煌遺書全部運到北京，放在京師圖書館。

1911年，武昌起義爆發(fā)，作為清朝遺老的羅振玉害怕被清算，決定前往日本避難，王國維也攜帶家眷，隨同羅振玉奔赴日本。京都四年，王國維因為沒有收入，一家老小都是仰仗羅振玉的資助，但這也是王國維一生中最能隨心所欲，遠(yuǎn)離紛擾，醉心于學(xué)術(shù)的時期。由于羅振玉事先經(jīng)過周密安排，將其擁有的大量私人藏書和龜甲平安運到了日本，在日本又擁有大量閑暇時間，王國維得以看遍了羅氏所藏的古籍、古彝器和其他古器物拓片，羅、王二人于是在學(xué)術(shù)上互相切磋，齊頭并進(jìn)，共同創(chuàng)作了《流沙墜簡》一書。魯迅曾說：“中國有一部《流沙墜簡》……要談國學(xué)，那才可以算一種研究國學(xué)的書。開首有一篇長序，是王國維先生做的，要談國學(xué)，他才可以算一個研究國學(xué)的人物?！蓖瑫r，羅、王二人又對羅振玉收藏的甲骨文進(jìn)行考證與釋析，由此開創(chuàng)了為后世稱道的“羅王之學(xué)”。王國維的學(xué)術(shù)方向也由此轉(zhuǎn)向史學(xué)。對于京都四年，王國維后來自己總結(jié)為：“生活最為簡單，而學(xué)問則變化滋甚。成書之多，為一生冠?！?/p>

而羅振玉當(dāng)時在經(jīng)濟(jì)上不僅要資助王國維一家，還要接濟(jì)自己的女婿和弟弟，時間一長，羅氏自己也捉襟見肘。于是1915年，王國維接受英籍猶太人哈同的聘請，先期回國，前往上海，擔(dān)任《學(xué)術(shù)叢編》的主筆。這一時期是王國維學(xué)術(shù)上的又一個高峰，先后撰寫了《毛公鼎考釋》、《殷卜辭中所見先公先王考》、《殷周制度論》等文章，徹底確立了自己在史學(xué)領(lǐng)域的大師地位，并受到梁啟超、郭沫若等人的激賞。北京大學(xué)先后于1917年秋、1918年夏、1920年底三次邀請王國維到北大任教，但王國維說自己“有懷土之意，以遷地為畏事”，沒有答應(yīng)。直到1922年初，求賢若渴的北京大學(xué)派人送來了第一筆薪水，王國維才終于答應(yīng)任北京大學(xué)研究所國學(xué)門通訊導(dǎo)師。

1919年，羅振玉回國，在羅的朋友升允的引薦下，王國維被清朝的末代皇帝溥儀任命為南書房行走。同年5月，羅、王二家聯(lián)姻，羅振玉將自己的三女兒羅孝純嫁給王國維的長子王潛明。

1924年1月溥儀降旨，“著（王國維）在紫禁城騎馬”。王國維說滿清一朝，能夠以布衣身份享受紫禁城騎馬待遇的，除了朱彝尊，就是他了，這實在是“異遇”，并為之非常感動。魯迅曾評價王國維“老實到像火腿一般”。幾個月后，北京政變，溥儀被馮玉祥驅(qū)逐出宮，兩旁兵士持刀荷彈而立，王國維一直隨侍其左右，不曾稍離，事后更是終日憂憤不已，好幾次想跳神武門御河自殺，因家人監(jiān)視而未果，由此的確可見王國維的忠厚篤實。

不過在王國維任職南書房行走期間，溥儀身邊派系復(fù)雜，朋黨之風(fēng)甚烈，一心只想為皇上盡忠竭力的王國維素來不喜歡黨派之爭，不想蹚這趟渾水，但由于他和羅振玉的特殊關(guān)系，連溥儀都認(rèn)為他是羅放在自己身邊的一枚棋子，而王國維刻意避嫌的兩次行為，則又引起了羅振玉的不滿。

一件是1923年5月，王國維入小朝廷不久，書告羅氏：自己的《觀堂集林》已在滬裝訂，打算將其中的精印本“進(jìn)呈”溥儀。羅亦趁此將他自己的《殷虛書契前、后編》及《殷虛書契考釋》從天津寄到北京，請王托書店做黃綾套代為“奏呈”。這使初入“南書房”的王國維頗感為難，他知道羅振玉和另一位遺老鄭孝胥矛盾很深，便復(fù)信表示：為避嫌，擬待“數(shù)月以后”再辦。羅很生氣，當(dāng)即回信，要王不必做書套代呈了，將原書交人送還。