2002年，石油業(yè)全面重組。尤科斯作為最具潛力的合作伙伴，得到了英國巨頭英國石油公司的青睞。英國石油公司和霍多爾科夫斯基、普拉東·列別捷夫多次會談，但最終英國石油公司放棄了這場聯(lián)姻。后來，英國石油公司投資75億美元，與俄羅斯秋明石油公司（TNK）合作，這是俄有史以來得到的最大一筆外資。這筆交易使得秋明石油公司的老板彼得·伊文和米哈伊爾·弗里德曼富甲天下，秋明-英國聯(lián)合石油公司成為世界石油業(yè)的新生力量。

察覺到尤科斯的失望情緒，羅曼·阿布拉莫維奇適時(shí)鼓動霍多爾科夫斯基重拾五年前的規(guī)劃。2003年3月，霍多爾科夫斯基在克里姆林宮反腐會議上與普京發(fā)生沖突的兩周之后，阿布拉莫維奇正式接觸霍多爾科夫斯基。當(dāng)時(shí)，霍多爾科夫斯基已被普京列入黑名單，加之阿布拉莫維奇和普京的親密關(guān)系，導(dǎo)致外界出現(xiàn)種種推測。一些時(shí)事評論員認(rèn)為，阿布拉莫維奇和普京為尤科斯老板設(shè)下了陷阱，并秘密籌劃打擊霍多爾科夫斯基的具體行動。在整個(gè)反對尤科斯的事件中，類似的說法流傳不息，諸多核心人物都認(rèn)為阿布拉莫維奇扮演了不太光彩的角色。

在霍多爾科夫斯基看來，西伯利亞石油公司的確具有吸引力。因?yàn)榘⒉祭S奇也同樣采用了西方化的公開性財(cái)務(wù)制度和透明運(yùn)作的公司制度。兩家公司的愿景一致、志趣相投、規(guī)模相當(dāng)、采油和冶煉能力相近，能夠彼此配合。交易很快達(dá)成，兩家公司一經(jīng)合并就成為擁有3?500億美元資產(chǎn)的聯(lián)合企業(yè)集團(tuán)，生產(chǎn)全俄三分之一的石油。4月22日，協(xié)議生效，同時(shí)雙方發(fā)表聯(lián)合聲明，以示慶祝：

尤科斯和西伯利亞石油公司的核心持股人今天宣布，他們原則上同意將兩家企業(yè)合并為全俄最大的企業(yè)。合并后的石油和天然氣集團(tuán)，不僅是俄羅斯最大的集團(tuán)，同時(shí)也是世界第四大私營石油制造商。該集團(tuán)擁有1?940億桶石油和天然氣的儲備量，日產(chǎn)原油接近2?300萬桶。合并后的企業(yè)命名為尤科斯-西伯利亞石油公司。尤科斯公司的米哈伊爾·霍多爾科夫斯基就任新集團(tuán)執(zhí)行總裁，西伯利亞石油公司的葉夫根尼·什維德勒被任命為董事會董事長。

顯然，霍多爾科夫斯基出任新聯(lián)合公司的老板，阿布拉莫維奇得到實(shí)惠后急流勇退，什維德勒——阿布拉莫維奇的主要副職——依然留在董事會，擔(dān)任合并后的西伯利亞石油公司的代表?；舳酄柨品蛩够J(rèn)為，這筆交易是尤科斯登上國際舞臺的重大舉措：

通過與西伯利亞石油公司的合并，我們將擁有協(xié)同合作的杰出管理團(tuán)隊(duì)、高度職業(yè)化的勞動力和豐厚的資產(chǎn)，借此將競爭優(yōu)勢最大化。新的產(chǎn)業(yè)巨人將擁有更多的資產(chǎn)和更強(qiáng)的資金潛力，從而為企業(yè)帶來更高的效益，迅速達(dá)到戰(zhàn)略性目標(biāo)，使聯(lián)合公司成為全球能源市場的領(lǐng)軍力量。

阿布拉莫維奇把公司拱手讓給尤科斯，自己也并非空手而歸。通過這筆交易，作為20%持股權(quán)的報(bào)酬，阿布拉莫維奇獲利30億美元，同時(shí)，他依舊在新公司中持有股份。隨后，他又耗資23.5億英鎊購買英國切爾西足球俱樂部，這幾乎傾其所有。