對于這一惡行，左宗棠是否應該承擔責任呢？作為陜甘總督，左宗棠必須承擔歷史責任。這次事件與左宗棠歷來正確的民族政策嚴重不合。其主要原因在于：雙方因軍事戰(zhàn)爭殺紅了眼，肅州之戰(zhàn)長達1年9個月，清軍損失嚴重，報復之心強烈，左宗棠作為統(tǒng)帥沒有看到兵將情緒變化本身就是失職。

左宗棠1868年9月進入陜西，至1873年10月肅州被攻占歷時五年。而此前，回民起義自1862年5月開始歷時6年。前后長達11年的陜甘回民起義，因為清廷的殘暴統(tǒng)治、漢回居住地紛爭等引發(fā)的沖突沒有得到恰當處理，所以導致作為同屬中華民族的漢回同胞發(fā)生了嚴重沖突，這是任何有良知的人都不愿意看到的。

這一事件皆因雙方上層的政治和物質(zhì)利益紛爭導致，任何一個有良知的人都應該以歷史為鑒。其間，雙方中都出現(xiàn)過褊狹民族主義，結(jié)果造成誤會、仇恨越來越深。這種教訓應該為今人吸取，但愿這種事情永遠不要再出現(xiàn)，中華民族的團結(jié)高于一切。

其后，左宗棠遇到了如何安置回民和漢民難民的問題。為此，左宗棠受到了陜甘（甘包括現(xiàn)在甘肅、青海、寧夏）四省的一些滿漢官民的咒罵，但歷史證明他做得是對的。陜甘安定后，左宗棠主要面對的就是如何安置背井離鄉(xiāng)的回民。