另一方面，生產(chǎn)和銷售理順之后，劉漢元全力以赴加大了科研力度。1986年他就將工作重點轉(zhuǎn)移到了對飼料轉(zhuǎn)化率的研究和對動物生物化學(xué)的研究上。1987年開始更是加大了時間精力和財力的投入，全力以赴就四川地區(qū)的養(yǎng)魚問題針對性地尋找解決方案。這就引出了當時長期困擾劉漢元和更多養(yǎng)殖戶集約化養(yǎng)魚的三大問題：

一是養(yǎng)出的成魚脂肪過多；

二是內(nèi)臟比例過大，品質(zhì)退化；

三是體形體色與自然河魚差別太大。

搞科研，首先要解決這三大問題。劉漢元怎樣才能做到？

1986年開始，劉漢元除了發(fā)展，賺到的錢都投到了科學(xué)配方、加工工藝方面的研究和大面積試驗上。怎樣才能實現(xiàn)技術(shù)創(chuàng)新，提高餌料系數(shù)？他多方請教專家，認真學(xué)習(xí)國內(nèi)外最新技術(shù)，經(jīng)常在實驗室里通宵達旦地工作，每一項重要的試驗都要放到實際養(yǎng)殖中去檢驗，證明成功后才正式投入飼料生產(chǎn)。1987年，年僅23歲的劉漢元就成了中國整個水產(chǎn)行業(yè)最年輕的高級工程師。以這樣的年齡獲得這樣的職稱，在現(xiàn)在看來，完全不可思議。

“天才行其所必行，人才行其所能行。”那時劉漢元知道哪個方向是正確的方向，他知道哪個方向必須去走，雖然他一時半會兒看不清未來，但他一直堅持著。那時樂山水產(chǎn)站、水庫，仁壽的水庫等都是劉漢元的試驗基地，一個接一個排成一列列的網(wǎng)箱里，養(yǎng)著采用不同營養(yǎng)配比飼料分別喂養(yǎng)的魚，一群人還要定期捕撈進行觀察、解剖、分析，在生長快慢不同的季節(jié)，尤其是在不同的水溫、水質(zhì)、氣候條件下還要不停地對不同喂養(yǎng)的魚進行研究，調(diào)整配方……同時，還要著力做好養(yǎng)殖過程中魚病的防治。5年的研究，對配方的改進，最終使飼料的效率成倍提高。