然而，鄧布利多卻最終在魔藥和馬爾福的雙重打擊下變得孱弱，藏在隱身衣下動彈不得的哈利這才在馬爾?？谥械弥啬О褮⑺类嚥祭嗟娜蝿?wù)交給他，包括凱蒂中咒和羅恩中毒事件都是其謀殺鄧布利多的計劃之一，其整一年里都在有求必應(yīng)屋里盤算著謀殺及引食死徒進校的計劃。面對毫無還手之力的鄧布利多，馬爾福顫抖著遲遲未能下手，是隨后趕至的斯內(nèi)普當(dāng)著食死徒和哈利的面殺死了鄧布利多并迅速潛逃。鳳凰社與少數(shù)D.A.成員加入了這場戰(zhàn)爭，哈利在用“混血王子”的咒語對付斯內(nèi)普時才發(fā)現(xiàn)原來斯內(nèi)普才是那本書的主人。斯內(nèi)普成功逃脫了，而鄧布利多用生命換來的金掛墜盒里并沒有伏地魔的靈魂碎片，它已經(jīng)被一個簡稱為R.A.B的人偷走了，一切都只是白費力氣。

鳳凰?？怂乖诟叱旄韬篦鋈浑x去，而鄧布利多也在隆重的葬禮后與他的魔杖一起永遠地躺在了湖邊的白色墳?zāi)估?。哈利坐在熱辣辣的太陽底下，忽然發(fā)現(xiàn)所有發(fā)誓保護他、擋在他面前的人都已經(jīng)像鄧布利多一樣靜靜地躺下了，他與伏地魔中間再也沒有任何人，他有種“必須永遠拋棄那個早在一歲時就應(yīng)該丟開的幻想，不再以為某位長輩的懷抱會保護他不受任何傷害”的強烈感覺。他知道從這一刻開始“沒有人會把他從噩夢中喚醒，沒有人會在黑暗中低聲安慰他”，他必須迫使自己立刻長大，像他的父母和小天狼星一樣大大方方并且勇敢地面對隨時發(fā)生的死亡，他必須沿著鄧布利多的足跡繼續(xù)尋找和銷毀魂器，然后，他要替那些因發(fā)誓保護他而犧牲的人們完成他們未了的愿望—殺死伏地魔，使所有可愛的生靈都能因此獲得平等和幸福的生存權(quán)利。

哈利決定離開霍格沃茨。為了保證所有愛他的人不會因為他受傷害，他與金妮分手、與羅恩和赫敏話別。他按照鄧布利多的囑咐回到了女貞路4號與德思禮一家待在一起，但他明白這是他最后一次回到這里，在他滿十七歲、母親給他的保護魔法失效后，他便不得不離開這個他十七年來都稱之為“家”的地方。鄧布利多的逝世在魔法界掀起了軒然大波，《預(yù)言家日報》開始大篇幅地敘述有關(guān)鄧布利多的一切，包括他的思想、成就和成長過程，還有一些關(guān)于他家庭的、不利于他的流言。哈利這才發(fā)現(xiàn)他對鄧布利多的背景知之甚少，他只是不斷地和鄧布利多討論“哈利的過去，哈利的未來，哈利的計劃”。

為了使哈利更安全地離開女貞路4號，鳳凰社決定在7月31日前便遣開德思禮一家，提前結(jié)束哈利身上的保護魔法。在十六年相看兩厭的告別時刻，達力很困難地組織起語言對他說“你救了我的命”并向他伸出了粉紅色的大手，這多少都令哈利感到驚訝，并為德思禮一家的離去突然嘗到了些許傷感。鳳凰社和他的朋友們在穆迪率領(lǐng)下用復(fù)方湯劑偽造出六個假哈利，當(dāng)他們分組飛出女貞路4號的老房子后便立刻被“至少三十個不知從何而來”的食死徒包圍，伏地魔“像風(fēng)里的煙霧一般”向他飛來并打算殺死他，哈利與海格乘坐的摩托車失控下墜，傷疤的疼痛使他睜不開眼睛，在他以為自己就要完蛋了的同時，他意外得救了。但這場戰(zhàn)役使他們付出了沉重代價：他心愛的貓頭鷹海德薇死了，喬治失去了一只耳朵，穆迪在戰(zhàn)役中英勇犧牲，尸骨無存。

在與羅恩、赫敏做好萬全準(zhǔn)備并有了死的準(zhǔn)備后，哈利在陋居度過了一個熱鬧的十七歲生日，并且還在鄧布利多的遺囑中得到了一個舊的金色飛賊—盡管他想盡辦法也弄不清楚鄧布利多送他一個舊飛賊有什么含義。除此之外，鄧布利多的遺囑里還交待把格蘭芬多寶劍也留給哈利，但由于魔法部認為格蘭芬多劍是“一件貴重的文物”，他只能與寶劍失之交臂。比爾與芙蓉舉行了一場盛大的婚禮，婚禮上，威克多爾·克魯姆指出盧娜的父親謝諾菲留斯佩戴著一個奇怪的三角眼標(biāo)記，而這個標(biāo)記曾多次出現(xiàn)在鄧布利多留給赫敏的《吟游詩人比伯的故事》里。然而，還沒等婚禮結(jié)束，“魔法部已淪陷”的警報聲令婚禮亂作一團，他與羅恩、赫敏帶著對鄧布利多隱秘過去的懷疑在食死徒侵入陋居的瞬間幻影移形。他們躲進格里莫廣場12號，并意外發(fā)現(xiàn)偷走真掛墜盒的R.A.B竟然是小天狼星去世多年的弟弟雷古勒斯·布萊克。而哈利曾在兩年前的大掃除中把這個雷古勒斯用生命換來的金掛墜盒當(dāng)做“誰也打不開的沉甸甸的紀(jì)念品盒”與其他灰撲撲的器具一起扔進了垃圾袋里，盡管克利切及時把它搬回了老窩，但蒙頓格斯的洗劫無疑令他們遭受了極大損失，他們必須闖進守衛(wèi)森嚴(yán)的魔法部，從副部長烏姆里奇的脖子上把那個珍貴的金掛墜盒奪回來。

伏地魔的殺戮計劃終于開始行動了，邪惡統(tǒng)治的恐慌時代開始了。食死徒們出臺了一部部不合情理的法律強迫男女巫師們執(zhí)行，并通過捏造謊言惡意圍捕非純血出身的巫師與生靈，他們大肆虐待和殺戮看似完全沒有抵抗力的生命體，殺死抵抗新法律的人們。整個巫師界都開始偷偷議論，但同時又感到非常害怕，人與人之間失去了信任，就連曾經(jīng)發(fā)誓要與哈利站在一起的人都對他產(chǎn)生了懷疑和恐懼。一切仿佛又回到了十多年前伏地魔第一次掌權(quán)的白色恐怖時代。赫敏最終成功地把金掛墜盒搶回手中，哈利還連帶把穆迪的魔眼從烏姆里奇的辦公室門上摳下來，他把這只魔眼埋在了三年前舉行魁地奇世界杯的樹林里，祈禱穆迪的英靈能就此安息。接下來，他們尋找魂器的旅途陷進了僵局。六個魂器，哈利與鄧布利多摧毀了兩個，除納吉尼和他們手里的金掛墜盒外，還剩兩個。鄧布利多從沒告訴過他剩下的魂器都藏在哪兒，他只知道它們可能是拉文克勞或赫奇帕奇的某一件東西，但他甚至無法確定它們到底是什么。他的傷疤幾乎每天都在劇痛，每次他都能通過疼痛看見伏地魔的一舉一動，他看見伏地魔分別折磨或殺死了奧利凡德、格里戈維奇和格林德沃，他感到伏地魔似乎一直在努力尋找著某件東西。無法消滅魂器的挫敗感和漫無目的的旅行使他與羅恩的感情日趨破裂，在金掛墜盒的催使下，一些狂躁因子沉默蔓延于他們中間，當(dāng)他與赫敏推斷出格蘭芬多寶劍能消滅魂器后，羅恩的情緒在金掛墜盒的影響下徹底爆發(fā)了，他丟下哈利與赫敏獨自“走進了黑夜里的暴風(fēng)雪中”。

為了尋找真正的格蘭芬多寶劍，他與赫敏在圣誕節(jié)當(dāng)天決定前往戈德里克·格蘭芬多的故鄉(xiāng)—高錐克山谷。哈利終于在這座古老的城鎮(zhèn)里找到了父母的墓碑和被炸毀的房子，并且在一個風(fēng)化嚴(yán)重的墓碑上發(fā)現(xiàn)了一個熟悉的三角眼標(biāo)記。爆炸使他的魔杖折成兩段，值得欣慰的是他找到了沉睡在冰湖里的寶劍，羅恩從天而降地拔出劍并摧毀了魂器。在赫敏終于開始注意到三角眼標(biāo)記蹊蹺地反復(fù)出現(xiàn)后，他們從謝諾菲留斯口中得知那是一個關(guān)于死亡圣器的標(biāo)記，盡管赫敏對“從前有三個兄弟”的寓言童話不屑一顧，但哈利卻感覺似乎抓住了一條非常重要的線索：長老魔杖、復(fù)活石和隱身衣，如果同時擁有它們便能主宰死亡。在哈利的再三求證下，傳說與現(xiàn)實發(fā)生了驚人的交集，然而謝諾菲留斯的出賣馬上令他們被關(guān)進了馬爾福莊園的地牢里。在這兒，哈利與盧娜、迪安重逢，他還看到了魔杖制作師奧利凡德和古靈閣妖精拉環(huán)，憑空出現(xiàn)的多比幫助他們挨個兒逃獄，蟲尾巴因為“潛意識里的仁慈”使哈利獲救，但自己卻被伏地魔賜予的銀手掐死，哈利意識到當(dāng)年制造活點地圖的四人組至此已經(jīng)全部離開人世時，拯救他們的多比在逃亡的最后時刻也被貝拉特里克斯兇殘地刺殺。

他們逃到了比爾與芙蓉的貝殼小屋，巨大的悲痛使哈利無法正常思考問題，但他卻同時悟出了魂器的下落和伏地魔一心想得到的東西。拉環(huán)同意把他們帶進古靈閣，但作為交換條件他們必須交出寶劍；在與奧利凡德的談話中，哈利獲知了魔杖力量轉(zhuǎn)移的秘密，而與此同時他透過傷疤看見了伏地魔在斯內(nèi)普的迎接下回到霍格沃茨，伏地魔打開了鄧布利多的墳?zāi)?，把長老魔杖從那雙了無生氣的冰冷手中扯出。

拉環(huán)的幫助使他們從古靈閣金庫里找到了赫奇帕奇的金杯，而拉環(huán)的出賣也使伏地魔迅速得知哈利尋找魂器的計劃。借由侵入伏地魔大腦，哈利獲悉最后一個魂器藏在了霍格沃茨，他與朋友們立刻出發(fā)，在鄧布利多弟弟阿伯福思的幫助下進入守衛(wèi)森嚴(yán)的霍格沃茨。然而，在尋找拉文克勞金冕的過程，他不幸被食死徒發(fā)現(xiàn)，鳳凰社、D.A.、家養(yǎng)小精靈等學(xué)校里的所有生物與非生物們都傾巢出動，而伏地魔也憤怒地從空空如也的魂器藏匿點趕至，把食死徒瞬間召集于禁林，霍格沃茨保衛(wèi)戰(zhàn)由此爆發(fā)。哈利穿過塵土飛揚的戰(zhàn)場趕至有求必應(yīng)屋，他發(fā)現(xiàn)羅恩與赫敏也用蛇怪的毒牙又銷毀了一個魂器。在馬爾福與克拉布、高爾的極力阻撓下，他從“混血王子”魔藥課本的藏匿點找到并銷毀了金冕，接下來只要把納吉尼也殺死，伏地魔便會失去永恒的生命。