然而，真正的夢(mèng)境卻給他帶來(lái)了前所未有的震撼—他在夢(mèng)中變成蛇并襲擊了韋斯萊先生，盡管韋斯萊先生因他而獲救，但他的心里開(kāi)始發(fā)憷，他懷疑自己是否就是小天狼星口中的“武器”。伴隨著傷疤的劇疼，他越來(lái)越頻密地夢(mèng)到一條長(zhǎng)長(zhǎng)的走廊和一道似乎永遠(yuǎn)無(wú)法開(kāi)啟的門。斯內(nèi)普被鄧布利多派來(lái)單獨(dú)教他大腦封閉術(shù)，他被斯內(nèi)普折磨得腦子麻痹、筋疲力盡。在霍格莫德村，剛剛交往的秋也因?yàn)樗缓蠒r(shí)宜的話而哭泣著扔下他跑開(kāi)，他與秋短暫的戀情也似乎就此破滅。緊接著，D.A.聚會(huì)遭到出賣，鄧布利多為保護(hù)哈利不得不自動(dòng)解職，烏姆里奇被魔法部成功任命為霍格沃茨校長(zhǎng)，事情已經(jīng)發(fā)展到不可收拾的地步了，而這一切似乎都是因?yàn)樗沤吁喟l(fā)生的。更令他難過(guò)的是，他從斯內(nèi)普的記憶里看到了其學(xué)生時(shí)代被當(dāng)眾受辱的痛苦回憶，他發(fā)現(xiàn)詹姆不過(guò)是個(gè)“傲慢無(wú)禮、欺負(fù)弱小的下三濫”，甚至連莉莉當(dāng)年對(duì)詹姆也不屑一顧，哈利覺(jué)得他的世界似乎顛倒了。而他長(zhǎng)久以來(lái)篤定的信念也發(fā)生了可怕的偏移，他覺(jué)得“那么恐懼、難過(guò)”，他從來(lái)沒(méi)想到“自己會(huì)為斯內(nèi)普感到難過(guò)”。

自小天狼星在壁爐里向他解釋詹姆當(dāng)年傻頭傻腦的行為后，他夢(mèng)中那道長(zhǎng)久以來(lái)無(wú)法打開(kāi)的門終于在傷疤尖銳的疼痛中開(kāi)啟，在夢(mèng)中他借由伏地魔的眼睛清楚看到小天狼星在布滿玻璃球的神秘事務(wù)司里備受折磨、生命垂危。盡管赫敏一再認(rèn)為這有可能是陷阱，但他無(wú)法理智地把小天狼星那張痛苦的面孔忽視，他不顧一切地與羅恩、赫敏連帶納威、金妮與盧娜一同騎夜騏趕往神秘事務(wù)司。當(dāng)他發(fā)現(xiàn)第九十七排架子盡頭什么也沒(méi)有時(shí)，他把一個(gè)標(biāo)著自己名字的玻璃球從高高的架子上取下。

哈利立刻被以盧修斯·馬爾福為首的食死徒包圍了，他被告知受折磨的小天狼星不過(guò)是伏地魔為引誘他前來(lái)而誤導(dǎo)的幻象。他與朋友們?cè)谏衩厥聞?wù)司與食死徒展開(kāi)了一場(chǎng)殊死搏斗。哈利看著朋友們由于寡不敵眾而備受重傷，絕望地感到是他“把自己的朋友引向無(wú)謂的死亡”。鳳凰社成員在這關(guān)鍵時(shí)刻闖進(jìn)屋內(nèi)，哈利與他們并肩作戰(zhàn)，用他熟悉的每一道咒語(yǔ)進(jìn)行著攻擊和防御，他與小天狼星站到了一起，他們默契十足地配合作戰(zhàn)，他聽(tīng)見(jiàn)小天狼星對(duì)他大喊“干得漂亮”，然而，在他還來(lái)不及反應(yīng)的一瞬間，一道光束擊中了小天狼星的前胸，他的教父“身體向后彎曲著”倒進(jìn)了古老的拱門里。他聽(tīng)到了貝拉特里克斯得意的尖叫，他被告知小天狼星已經(jīng)死了，深愛(ài)的教父不會(huì)再回來(lái)了。他帶著強(qiáng)烈的憎恨和殺戮的決心把貝拉特里克斯追至魔法部大廳，他對(duì)一切都不在乎了，他只想讓那個(gè)殺死小天狼星的兇手痛苦、生不如死，他沒(méi)有意識(shí)到伏地魔已經(jīng)突然出現(xiàn)在魔法部，也沒(méi)有意識(shí)到當(dāng)伏地魔與鄧布利多大戰(zhàn)不敵后接著打算干什么，他感到自己被一個(gè)紅眼睛的怪物緊緊纏住，而那只怪物用他的嘴命令鄧布利多把他殺死。他被纏得太緊，動(dòng)彈不得，但他迫切地希望鄧布利多能殺死自己，他要與身體里的伏地魔同歸于盡，結(jié)束一切，然后或許他還可以在世界的盡頭看見(jiàn)剛剛離去的小天狼星。

身受重傷的伏地魔還是潛逃了。福吉帶著眾多魔法部官員紛沓而至，哈利的朋友們和鳳凰社成員也得以全身而退。當(dāng)他回到鄧布利多的辦公室后，鄧布利多告訴哈利由于小天狼星從不善待老克利切，于是他遭到了這個(gè)長(zhǎng)期處在鳳凰社總部的小精靈的報(bào)復(fù)，而伏地魔正是利用哈利與小天狼星互相珍為生命的弱點(diǎn)達(dá)到了目的。激憤的哈利當(dāng)著鄧布利多的面摔壞了一切可以摔壞的東西，這是他第一次發(fā)這么大的脾氣，因?yàn)樗麅?nèi)心深處有一個(gè)小小的聲音告訴他：小天狼星在對(duì)待克利切的問(wèn)題上確實(shí)有做得不妥的地方。但他不想去考慮這個(gè)問(wèn)題，此刻他比所有人都憎恨克利切“豬嘴一樣的鼻子和布滿血絲的大眼睛”，他沖著鄧布利多憤怒地大喊大叫，聽(tīng)著這位年邁老人對(duì)這五年來(lái)的苦心經(jīng)營(yíng)懺悔，從哈利必須留在德思禮家的秘密，到伏地魔極力想得到的預(yù)言，他聽(tīng)到了特里勞妮教授關(guān)于“兩個(gè)人不能都活著，只有一個(gè)生存下來(lái)”的可怕預(yù)言，他得知納威與自己一樣也是預(yù)言中可以打敗伏地魔的男孩，但伏地魔最終選擇了與自己有著驚人相似之處的哈利，并在他額頭上留下勁敵的標(biāo)記。他的命運(yùn)自被標(biāo)記的一刻起已被鎖定，他明白自己無(wú)處可藏，擺在他眼前的路要么是死，要么便是奮起與歷史上最強(qiáng)大的黑魔法巫師決斗，哪怕是粉身碎骨、同歸于盡。

福吉在眾多的謾罵聲中轟然倒臺(tái)，一時(shí)之間，他成了魔法界人盡皆知的“救世之星”，連一向嚴(yán)厲的隆巴頓夫人都認(rèn)為“那個(gè)哈利·波特比整個(gè)魔法部的人加在一起還有骨氣”。他從小天狼星處繼承了格里莫廣場(chǎng)12號(hào)和老克利切，鄧布利多帶著他在霍拉斯·斯拉格霍恩的住所輾轉(zhuǎn)后，他們很快便來(lái)到了陋居并獲悉自己被選為格蘭芬多魁地奇球隊(duì)的隊(duì)長(zhǎng)。當(dāng)他與朋友們前往對(duì)角巷購(gòu)買新學(xué)年的物品時(shí)，他無(wú)意中發(fā)現(xiàn)德拉科·馬爾福鬼鬼祟祟地潛入博金—博克店要挾店主博金為其修理一件東西，盡管羅恩與赫敏對(duì)此不感興趣，但哈利認(rèn)為“能讓馬爾福顯得那么高興的準(zhǔn)不是什么好事”。他懷疑馬爾福已經(jīng)像其父母一樣成了食死徒，并且計(jì)劃用博金修好的黑魔法物件做見(jiàn)不得人的勾當(dāng)。

斯拉格霍恩應(yīng)約坐上了霍格沃茨特快前往魔法學(xué)校教書，這時(shí)候的哈利并不知道鄧布利多再三懇請(qǐng)斯拉格霍恩復(fù)出的用意，也不知道眼前這個(gè)大蜘蛛一樣的人物即將變成魔藥課的老師。由于他沒(méi)買魔藥課本，斯拉格霍恩從儲(chǔ)存柜里借給他一本屬于“混血王子”的破破爛爛的舊教科書，他根據(jù)這本書筆記的指導(dǎo)意外變成魔藥課堂上連赫敏也無(wú)法超越的、最拔尖的學(xué)生。但在他最引以為傲的黑魔法防御術(shù)課里，他被斯內(nèi)普盡情地諷刺打擊，面對(duì)斯內(nèi)普蠻不講理的懲罰，他變得越來(lái)越暴躁，他已無(wú)法保持對(duì)斯內(nèi)普所作所為感到怯生生、為莫名其妙被扣分感到委屈的十一歲小男孩的心態(tài)了，他對(duì)斯內(nèi)普反唇相譏，哪怕?lián)Q來(lái)的只是斯內(nèi)普用惡狠狠的語(yǔ)氣沒(méi)完沒(méi)了地對(duì)他說(shuō)“關(guān)禁閉”，哈利已不在乎違反校規(guī)、扣分和關(guān)禁閉了，這些懲罰從一年級(jí)開(kāi)始便沒(méi)打算離開(kāi)他，更別提他非法成立D.A.，在全校師生的眼皮底下干著魔法部最害怕的事。

當(dāng)鄧布利多提出要單獨(dú)給他上課后，他滿心期待地來(lái)到鄧布利多辦公室，他發(fā)現(xiàn)鄧布利多所謂的“上課”是帶他重游所有與伏地魔有關(guān)的記憶。鄧布利多希望與他一起“離開(kāi)堅(jiān)實(shí)的事實(shí)基礎(chǔ)，共同穿越昏暗模糊的記憶沼澤，進(jìn)入錯(cuò)綜復(fù)雜的大膽猜測(cè)”，并希望他從那些零碎的記憶里更多地了解伏地魔。在一次不太愉快的霍格莫德之旅中，一條被施了魔咒的異常華麗的蛋白石項(xiàng)鏈?zhǔn)箘P蒂·貝爾進(jìn)了圣芒戈魔法傷病醫(yī)院，這似乎與后來(lái)羅恩在生日當(dāng)天中毒的事件有著微妙聯(lián)系，盡管疑點(diǎn)重重，但這些都不如在他看到了金妮與迪安接吻時(shí)剎那的震撼，他感到“似乎有個(gè)全身長(zhǎng)鱗的大家伙在哈利心頭突然活了起來(lái)，并用爪子抓撓著他的五臟六腑”，一股強(qiáng)烈的沖動(dòng)令他“只想用惡咒把迪安變成一堆果子凍”。一切都變得不對(duì)勁，有些事情似乎出乎意料地脫了軌，比如說(shuō)長(zhǎng)久以來(lái)他對(duì)金妮的兄長(zhǎng)之情。

圣誕節(jié)前夕，哈利被迫參加“鼻涕蟲(chóng)俱樂(lè)部”的聚會(huì)，他意外發(fā)現(xiàn)斯內(nèi)普與馬爾福間有個(gè)決不能違背的“牢不可破的誓言”，并且馬爾福在這學(xué)期總是在城堡里消失得無(wú)影無(wú)蹤，連活點(diǎn)地圖也無(wú)法標(biāo)出其所在位置，這更加重了他肯定馬爾福在秘密策劃大陰謀的想法。探尋年輕時(shí)代伏地魔的過(guò)程被斯拉格霍恩虛假的記憶絞進(jìn)了死胡同，哈利奉命獲取那段重要記憶。在福靈劑的幫助下，他利用斯拉格霍恩喜歡莉莉的弱點(diǎn)取得了這段寶貴的記憶，當(dāng)他把它交給鄧布利多后，他們發(fā)現(xiàn)伏地魔不死的秘密是因?yàn)樗麖乃估窕舳骺谥械弥至鸯`魂能使人獲得永生，這才導(dǎo)致伏地魔不惜用殺人來(lái)分裂靈魂，并把它們藏在有代表意義的器皿里，還稱之為“魂器”。鄧布利多告訴哈利“愛(ài)”這件伏地魔永遠(yuǎn)看不起卻唯一能把他打敗工具便是哈利最強(qiáng)勁的武器，伏地魔被預(yù)言操控著選擇了哈利，但他，哈利，可以跳出預(yù)言、自己選擇與之對(duì)抗的方式。

此后，哈利與馬爾福大吵大鬧，他用“混血王子”筆記里的咒語(yǔ)致使馬爾福身受重傷，斯內(nèi)普陰郁地要求他交出這本書，他不得不把這本能令他魔藥學(xué)出類拔萃的書收藏在有求必應(yīng)屋里。由于再次被關(guān)禁閉，哈利無(wú)法參加本學(xué)期魁地奇的決賽，當(dāng)金妮替格蘭芬多奪得魁地奇杯后，他“沒(méi)有想，沒(méi)有準(zhǔn)備，沒(méi)有擔(dān)心有五十個(gè)人在看著”便與金妮接吻了。他們交往的事情也迅速傳遍了校園，他與金妮愉快地頻繁約會(huì)，他覺(jué)得這段美好的日子都“像是從別人那里偷來(lái)的”。但當(dāng)鄧布利多告訴他十六年前是斯內(nèi)普偷聽(tīng)了預(yù)言并立刻轉(zhuǎn)告伏地魔后，他不得不馬上起程與鄧布利多趕赴巖洞銷毀魂器。