經(jīng)由傅斯年的組織籌劃，史語所考古組還與山東省有關(guān)部門聯(lián)合組成山東古跡研究會，先后在章丘縣龍山鎮(zhèn)城子崖發(fā)掘2次，在滕縣安上村、曹王墓、王墳峪，日照縣王屋村、大孤堆發(fā)掘各一次。其中以龍山鎮(zhèn)城子崖的發(fā)掘最為引人注目。城子崖考古遺址的發(fā)現(xiàn)，與傅斯年對于中國上古史的研究有直接的關(guān)系。傅斯年認為，中國古代文化是多元的，它并非起源于一處而向周邊擴展，而是起源于多處并相互影響。直到周秦時期，北方沿海地區(qū)的文化與中原文化尚有明顯的差異。他一方面用文獻資料說明自己的觀點，另一方面則想通過田野考古，為這種觀點找到直接的、可靠的史料證據(jù)。他說：

我們認為中國考古學如大成就，決不能僅憑一個路線的工作，也決不能但以外來的物品為建設此土考古年代之基礎(chǔ)，因為中國的史前史原文化本不是一面的，而是多面相互混合反映以成立在這個文化的富土上的。憑借現(xiàn)有的文籍及器物知識，我們不能自禁的假定海邊及其鄰近地域有一種固有文化，這文化正是組成周秦時代中國文化之一大分子。于是想，沿渤海黃海省分當在考古學上有重要的地位，于是有平陵臨淄的調(diào)查（近年又有沿山東海岸的調(diào)查），于是有城子崖的發(fā)掘。這個發(fā)掘之動機，第一是想在彩陶區(qū)域以外作一試驗，第二是想看看中國古代文化之海濱性，第三是探比殷墟——有絕對年代知識的遺跡——更早的東方遺址。［1］龍山鎮(zhèn)城子崖是中國國家學術(shù)機構(gòu)按照預定目的，由中國的考古學家們獨自調(diào)查發(fā)現(xiàn)的、獨自組織發(fā)掘的第一處史前文化遺址。雖然傅斯年沒有親自參加這兩次發(fā)掘，但是他的決策、規(guī)劃之功不可泯滅。他對中國史前時期田野考古的貢獻是不應該被淡忘的。

歷史語言研究所考古組還曾與河南省有關(guān)部門合作，組成河南省古跡研究會，發(fā)掘過?？h劉莊、大賚店，輝縣琉璃閣、氈匠片，鞏縣塌坡、馬峪溝等多處文化遺址，采掘到有關(guān)河南彩陶文化、拍紋陶器和春秋衛(wèi)國墓葬等大量文物資料。此外，他們還在云南、四川、甘肅、陜西、山西、察哈爾、綏遠、西康、安徽等地做了許多考古工作。所有這些工作，不僅為中國的田野考古學奠定了基礎(chǔ)，而且為中國上古史的研究提供了最為可靠的材料。

［1］　傅斯年：《城子崖序》，《傅斯年全集》第三冊，（臺）聯(lián)經(jīng)出版事業(yè)公司1980年版，第207～208頁。

傅斯年對中國現(xiàn)代科學考古事業(yè)的發(fā)展作出了巨大的貢獻。主要表現(xiàn)在以下兩個方面：

首先，他結(jié)合中國的實際，闡釋了科學的考古學理論，對于中國科學考古事業(yè)的建立和發(fā)展起到重要的推進作用。其一，傅斯年極力提倡從事科學的田野考古，以此取代中國傳統(tǒng)的金石學。他指出，金石學家們的古器物是從別人手里征集來的，這些器物一旦脫離了原來埋藏它們的地層，其科學性和可靠性便隨之減低。而且金石學家所注意的只是刻辭銘文，限制了考古學研究的范圍?，F(xiàn)代考古學不是收購古物，而是到古遺址去實地采集發(fā)掘；不是只研究有文字的器物，而是把古人活動的所有遺存均囊括于研究的范圍之中。這種思想觀念的宣傳普及，促使中國現(xiàn)代考古學度過了童年階段，逐漸地成熟了起來。其二，關(guān)于考古學與歷史學的關(guān)系，傅斯年認為，考古學是歷史學的一個分支學科，二者密切相關(guān)，不可分離。但是考古學從內(nèi)容到方法上都有自己的特點，因而它又是一門相對獨立的學科，不可與一般意義上的歷史學混為一談。歷史學的進步有賴于新史料的發(fā)現(xiàn)，科學考古發(fā)掘出的彝器、明器、甲骨及人們生活的一切遺存，都是寶貴的新史料，因而田野考古是發(fā)現(xiàn)新史料的重要途徑。他指出，科學考古服務于歷史研究。歷史學的進步離不開現(xiàn)代考古學，而科學的考古的發(fā)展亦依賴于史學的進步。這種思想對現(xiàn)代考古學的健康發(fā)展起了有益的作用。其三，傅斯年一再強調(diào)田野考古要借用地質(zhì)學方面的知識，分清地層，厘清古器物的分布年代。據(jù)羅家倫說，傅斯年在德國留學時，曾閱讀三大本一部的地質(zhì)學書，由此推測當時他便有將地質(zhì)學知識用于考古學的想法。1929年殷墟發(fā)掘之初，他作了《考古學的新方法》的學術(shù)講演，對殷墟的地層結(jié)構(gòu)進行了分析，指出其最深者為殷，其余三層為隋、唐、明。兩年后參加殷墟發(fā)掘的梁思永進一步提出按土質(zhì)、土色劃分地層以區(qū)別史前各種考古文化的方法，這對于中國田野考古事業(yè)的發(fā)展曾起到過重要的推動作用。

其次，他倡導、組織和領(lǐng)導了中國現(xiàn)代大規(guī)模的考古發(fā)掘，揭開了中國田野考古的輝煌畫卷。其一，傅斯年在先秦史方面造詣頗深，對于現(xiàn)代考古學的基本理論也十分精通，所以他能夠為史語所考古組選定一些具有重要發(fā)掘價值的田野考古基地，使考古組在短時期內(nèi)取得震驚中外的成績。殷墟、城子崖等重大考古遺址的發(fā)掘，首功當推傅斯年。其二，傅斯年重視人才，愛惜人才，知人而善用。他聘請選拔考古方面的人才，給他們提供良好的工作條件，使之充分發(fā)揮個人的聰明才智。馳譽中外的考古學家李濟曾說，他是因為受傅斯年之聘主持殷墟考古發(fā)掘而得以施展抱負的，如果沒有傅斯年的幫助，他自己在考古學方面的成績肯定要小得多。梁思永、郭寶鈞、石璋如等都是因為被傅斯年選拔參加殷墟考古發(fā)掘而得到鍛煉，后來才成為著名的考古學家的。董作賓、胡厚宣等則致力于殷墟甲骨文字的研究，成績卓著。歷史語言研究所選拔培養(yǎng)的年輕的考古工作人員、古文字研究人員，以后大都成為該學科的領(lǐng)袖人物。從這個意義上講，傅斯年對中國現(xiàn)代考古學的貢獻，是遠遠超過考古發(fā)掘本身的。其三，傅斯年以超眾的社交、組織能力，多方奔走，精心籌劃，為史語所考古工作的順利進行提供了基本的保證。上個世紀二三十年代，政局動蕩，國庫空虛，學術(shù)不受重視，研究經(jīng)費短缺。殷墟最初的幾次發(fā)損規(guī)模甚小，原因就在于費用不足。后來傅斯年多方奔走，四出募集，考古經(jīng)費日漸增加。到1934年，僅殷墟每年便可得到數(shù)萬元的發(fā)掘經(jīng)費，使得田野考古工作有了可靠的物質(zhì)保障。另外，當考古組與地方當局發(fā)生沖突、糾紛時，傅斯年不避艱辛，為之排解，以其非凡的社交能力，迅速平息了風波。這些不為學界重視的組織協(xié)調(diào)工作，實乃進行科學研究的必不可少的環(huán)節(jié)。其四，傅斯年十分重視考古成果的刊布，史語所出版過多種發(fā)掘報告、考古工作報告，從這些出版物的命名、文章的撰寫方法到出版發(fā)行，傅斯年都親自過問。這些發(fā)掘成果很快就被學術(shù)界采納應用，對于推動中國考古學和古史學的發(fā)展起到重要的作用。