年初，王子云為團長的西北藝術(shù)考察團在重慶舉行敦煌藝術(shù)展覽會，引起轟動。這導(dǎo)致畢業(yè)生董希文、盧是、李浴、段文杰、凌春德、李承仙等先后奔赴敦煌，參加常書鴻為所長的研究所工作。

7月，呂鳳子辭職，隨后用鄧白的說法：“正在這艱危動亂的時候，教育部對陳之佛先生施加壓力，強迫他出任國立藝專校長。使這位純厚的學(xué)者經(jīng)受了一場嚴峻的考驗?！?/p>

陳本非好事之徒，如何肯上鉤？

說起來，這中間還有段故事。陳之佛素不愿意涉足行政工作，無奈經(jīng)不住教育部長陳立夫一再勸說，于是借口回去考慮考慮再作答復(fù)。當時陳之佛與傅抱石來往較多，就找他商量如何方能推辭。傅抱石說，不妨提出苛刻的條件，不答應(yīng)正好推掉。于是兩人經(jīng)過商議，提出3個他們認為教育部難以解決的要求：遷校到重慶沙坪壩磐溪，增加經(jīng)費，改藝專為學(xué)院。不料陳立夫竟一口答應(yīng)，7月份發(fā)來聘書。陳之佛騎虎難下，只好走馬上任。

所以才有了又一次搬遷，看起來，這像是僅僅為了陳之佛本人的方便，因為磐溪就在沙坪壩對面。借用了龍脊山麓的果家園，學(xué)校本部就設(shè)在那個叫“黑院墻”的大四合院，正房作禮堂和圖書館，另外在半山坡刨出一塊平地，蓋幾棟草房作為教室與食堂。

當年的學(xué)生孫鼎銘后來回憶，大家稱“粗竹扎架，竹篾編墻，抹泥刷灰，稻草蓋頂，再按明瓦”而成的素描畫室為“抗戰(zhàn)畫室”。

素描老師張宗禹先生深厚的輕聲細語不時被試炮聲打斷。足證“抗戰(zhàn)教室”名實相符。靶場跟畫室相距多遠呢？不遠，只隔一層竹篾泥巴墻。其實，畫室就搭在靶場上。不過炮彈從不打中教室，炮彈落地也不開花。試炮用的是空心彈。起初有點緊張，炮彈從高空栽下，鉆進黃土地“卟”“卟”有聲，近在咫尺。萬一瞄準出現(xiàn)誤差，稻草頂當然擋不了駕，全班24顆腦袋說不定哪顆挨砸。李林說：“放心，別擔憂。兵工廠就歸咱們班小張爸爸管。他送兒子來這兒學(xué)畫，不就是給咱上了保險。放炮的哪敢疏忽。”于是大家跟小張開玩笑，要他轉(zhuǎn)告兵工廠“炮下留情”。有一天小張沒來上課（他不住校），李林悄聲跟我說：“今天可得當心！一定是試炮的換了新手，炮打不準，所以小張不來啦。不夠義氣，也不打招呼?！闭f完就去畫他的素描，李林開玩笑有“言若非是，說是若非”的俳優(yōu)之風(fēng)，往往讓人真假難辨。畫畫中間想松懈一下的時候，就跳到山坡?lián)炱葥襞诳諒棜ね?。晚飯之后更是大膽地去撿。已考?jù)不出是哪位聰明的同學(xué)第一個將彈殼倒過來變成漂亮的花瓶。不久只要信步課堂、寢室，到處可見擺著的炮彈殼花瓶，也有炮彈筆筒。

當時日常生活相當艱苦，大家管吃的叫“八寶飯”（霉米里面有谷子、紕子、砂子等雜物），早餐一碗咸菜，中晚餐三碗素菜而已。至于繪畫材料，像顏料、木炭紙等都只能靠代用品。當年學(xué)生徐煥如回憶他參加勤工儉學(xué)：給沙坪壩消費合作社畫廣告、圖表，還到鄰近田野上一座暴露在地面上的漢墓中去，拓墓室壁上的石刻，由呂霞光老師托他在法國大使館工作的妻子賣給同事，以得到一些收入，作為購買繪畫材料的費用。

陳之佛請好友豐子愷出任教務(wù)長，由傅抱石任校長秘書兼中國畫史、畫論教授，黃君璧任國畫科主任，王道平任應(yīng)用美術(shù)科主任，秦宣夫任西畫科主任，實力也還雄厚，藝專舊班底則所剩無幾。

這時校內(nèi)矛盾與前些年合并引發(fā)的沖突已不是一回事兒，滲進了新的內(nèi)容，更多與政治相關(guān)。這一年，重慶發(fā)生了“校場口事件”，郭沫若等人被國民黨特務(wù)毆打?！缎氯A日報》發(fā)表了《文藝界對時局的進言》，陳之佛毅然簽名，于是種種麻煩接踵而來。有關(guān)方面三番五次威脅他，要他登報聲明“退出”。后來，當局又在《中央日報》上發(fā)起一個反簽名運動，也來找他簽名，卻被嚴詞拒絕。

而教育部答應(yīng)的三項條件，除搬遷得以實施，其余都遲遲得不到兌現(xiàn)，下?lián)芙?jīng)費還是不足，陳之佛不得不把自己賣畫的收入全部貼進去。

情況既是這樣，請來的豐子愷又一走了之，于是陳之佛提出辭職。但教育部卻遲遲沒有回應(yīng)，于是第二次、第三次……陳之佛接連遞了6次辭呈，仍無消息，正值痔瘡大量出血，身心俱疲，他于是在家治療，不再到校辦公。這樣教育部才不得不于1944年4月同意他辭去藝專校長職務(wù)。