1938年4月，與蔣介石時(shí)合時(shí)分的桂系將領(lǐng)李宗仁，率部在山東第一次讓日軍吃了敗仗（譯按：即臺(tái)兒莊大捷)。然而，這并不能阻止日軍推進(jìn)，蔣下令破壞黃河河堤。黃河決堤之后，大水阻滯日軍好幾個(gè)月，但是也沖走四千個(gè)村莊，使黃河改道，出?？诒緛碓谏綎|半島北方，變成在山東半島南方。夏末，日軍沿長(zhǎng)江流域深入，進(jìn)襲武漢。蘇聯(lián)軍機(jī)猛轟武漢周圍日軍陣地，火力薄弱的國(guó)軍亦英勇展開保衛(wèi)戰(zhàn)。7月，日本要求蘇聯(lián)部隊(duì)撤出中、蘇、朝鮮邊區(qū)，聲稱這塊地區(qū)屬于滿洲國(guó)領(lǐng)土。日本皇軍開進(jìn)這片爭(zhēng)議地區(qū)，不料蘇聯(lián)遠(yuǎn)東地區(qū)紅軍部隊(duì)告捷，擊敗日軍，這也算是日、俄交戰(zhàn)中俄國(guó)備嘗敗績(jī)的一個(gè)歷史轉(zhuǎn)折。

10月25日，日軍終于占領(lǐng)斷垣殘壁的武漢，蔣委員長(zhǎng)已在長(zhǎng)江三峽上游的重慶，建立抗日陪都。同樣在10月間，日軍占領(lǐng)廣州，切斷國(guó)民政府的海上通路。蔣介石繼續(xù)對(duì)散布在各地的部隊(duì)實(shí)施統(tǒng)帥權(quán)，可是派系斗爭(zhēng)已經(jīng)使得國(guó)民政府旗下三百多個(gè)實(shí)力不足的師級(jí)部隊(duì)，不能有任何重大整合。戰(zhàn)爭(zhēng)進(jìn)行了一年，日本已屠殺兩百萬(wàn)中國(guó)軍民；北起東北、南迄中、越邊境、占領(lǐng)一百五十萬(wàn)平方公里土地，破壞許多城市，也摧毀中國(guó)的工業(yè)和基礎(chǔ)建設(shè)。

1939年3月中旬，日軍第一○一師已推進(jìn)到距南昌數(shù)英里的城郊。難民及政府公務(wù)員眷屬開始往南疏散。熊式輝下令保安司令部的新兵督練處遷到南邊的贛州。南昌在3月27日棄守，幾天前，經(jīng)國(guó)一家人坐上軍車南撤，一路上盡是流離逃難的長(zhǎng)龍。方良緊緊抱住襁褓中的孝章以及三歲的孝文。

江西南部山區(qū)的章水、貢水合流，成為贛江，就在兩河匯合處有一塊平原，贛州城在此矗立。經(jīng)國(guó)一家抵達(dá)時(shí)，贛縣人口大約十萬(wàn)人，城里一條大馬路南市街，兩旁是經(jīng)年累月炊煙熏黑了的磚房。黃包車在石子路上顛簸，街上還有一座九層寶塔。

蔣家住到俯瞰贛州城一座小山上的西式洋房。蔣經(jīng)國(guó)的新職是第四區(qū)行政專員兼保安司令；這塊統(tǒng)稱贛南的第四區(qū)，涵蓋整個(gè)江西南部十一個(gè)縣，人口約兩百萬(wàn)。這塊地區(qū)長(zhǎng)久以來受到桂系軍閥和地方土匪的控制，非常貧困落后。12

蔣經(jīng)國(guó)邀請(qǐng)幾位過去在莫斯科中山大學(xué)的同學(xué)，到贛南專員公署幫忙。其中之一是黃中美，中大同學(xué)認(rèn)為他曾經(jīng)替蘇聯(lián)特務(wù)機(jī)關(guān)當(dāng)內(nèi)線。黃中美出任經(jīng)國(guó)的主任秘書，兼負(fù)成立情報(bào)網(wǎng)的任務(wù)。周百皆和俞季虞兩個(gè)中大同學(xué)，出任科長(zhǎng)，另一位同學(xué)徐季元?jiǎng)t擔(dān)任緝煙科科長(zhǎng)。13自稱曾被下放到西伯利亞勞改營(yíng)的舊托派分子屈武，也到贛州任職。14同時(shí)，蔣介石命令他在黃埔軍校的得意門生胡軌，也到贛州輔佐經(jīng)國(guó)。蔣經(jīng)國(guó)指派胡軌擔(dān)任三民主義青年團(tuán)江西支團(tuán)干事長(zhǎng)，日后胡成為小蔣親信股肱。

蔣經(jīng)國(guó)奉派行政專員新職之后，立刻有系統(tǒng)地遍訪轄區(qū)各個(gè)角落。他每天走八十公里，不久就走遍一千五百公里，到處與農(nóng)民、商人、公務(wù)員、文藝人士和難民交談?？墒牵街幉⒉皇侨巳硕?xì)g迎他。傲慢的地方士紳難掩輕蔑之意，對(duì)他疑心十足。奸商不理他，照樣經(jīng)營(yíng)賭場(chǎng)、鴉片館，深信已經(jīng)打點(diǎn)好的貪官污吏會(huì)保護(hù)他們。鄉(xiāng)間強(qiáng)盜攔路行搶，各姓宗族不時(shí)互相械斗，老百姓久經(jīng)欺凌，已經(jīng)心如死水、漠不關(guān)心。

蔣經(jīng)國(guó)認(rèn)為恢復(fù)地方治安是第一要?jiǎng)?wù)，定下為期一年的“掃蕩行動(dòng)”。熊式輝應(yīng)他之請(qǐng)，把贛南已有三千兵力的保安隊(duì)再擴(kuò)編；經(jīng)國(guó)另外又成立一個(gè)有六百名兵勇的自衛(wèi)隊(duì)。不過，他對(duì)付土匪是剿撫并用。有一天，他率領(lǐng)幾個(gè)隨從，不攜武器，只帶幾瓶好酒，親到崇義山區(qū)找土匪頭子周盛連。周某有如水滸中人，以攔路搶來的錢賑濟(jì)地方窮人。周某告訴蔣經(jīng)國(guó)，是地方上的貪官逼得他走上梁山，落草為寇。酒過數(shù)巡之后，蔣經(jīng)國(guó)提出過去一切罪行既往不咎，請(qǐng)周放棄不法行為，跟隨他一起做好事。周某大受感動(dòng)，同意只要經(jīng)國(guó)在贛南做行政專員，他一定不為非作歹。總共有三十四名土匪頭子接受招安。15據(jù)報(bào)道說，到了當(dāng)年年底，共有五百四十一名土匪自首，經(jīng)國(guó)指揮的各路警力也逮捕了兩千兩百四十六名盜匪，處死若干重犯。