這時(shí)，代表威斯康星州國(guó)會(huì)議員的約瑟夫·麥卡錫開(kāi)始插手此事。麥卡錫在1950年至1953年期間任國(guó)會(huì)常設(shè)委員會(huì)調(diào)查分委會(huì)主席時(shí)，決意進(jìn)一步增加民眾心中的“紅色恐怖”，并繼續(xù)在美國(guó)人中推行他借共產(chǎn)主義為名的政治迫害。麥卡錫所關(guān)注的不是好萊塢，而是關(guān)注共產(chǎn)主義對(duì)政府部門(mén)的所謂“滲透”。在1950年的一場(chǎng)演講中他裝腔作勢(shì)地?fù)]舞著一份所謂共產(chǎn)主義分子及其同情者名單的文件，聲稱共產(chǎn)主義滲透入美國(guó)的國(guó)務(wù)院。美國(guó)國(guó)會(huì)為此專門(mén)成立一個(gè)特別委員會(huì)，調(diào)查麥卡錫的指控，但是發(fā)現(xiàn)這些指控都是無(wú)中生有。但是他還是不知悔改，利用自己的地位和權(quán)力，繼續(xù)推動(dòng)歇斯底里的反共運(yùn)動(dòng)。他毫無(wú)根據(jù)地胡亂譴責(zé)任何他懷疑可能是共產(chǎn)主義者的公務(wù)員和政府官員，并在國(guó)會(huì)主持一系列的完全公開(kāi)的聽(tīng)證會(huì)。這些被指控的個(gè)人必須在這樣的聽(tīng)證會(huì)上證明自己的清白。該委員會(huì)的狂熱、無(wú)中生有的指控經(jīng)常毀了人們的生活卻毫無(wú)悔意，任憑受害者在政治迫害的漩渦中苦苦支撐。

愛(ài)因斯坦建議許多被麥卡錫瞄上的人拒絕與這些非法聽(tīng)證會(huì)合作，包括由國(guó)內(nèi)安全委員會(huì)和國(guó)會(huì)類似于眾議院非美活動(dòng)調(diào)查委員會(huì)主持的聽(tīng)證會(huì)。他認(rèn)為這些調(diào)查活動(dòng)有違憲法規(guī)定的個(gè)人權(quán)益，并在1953寫(xiě)信給紐約布魯克林的一位教師威廉·弗勞恩格拉斯，建議他說(shuō)：“我覺(jué)得用甘地的非暴力不合作的方法最合適……拒絕作證的同時(shí)還應(yīng)該聲明這種拒絕是基于這樣的認(rèn)識(shí)，即讓清白的美國(guó)公民接受這樣的調(diào)查是讓民主和人權(quán)蒙羞的，也是違反美國(guó)憲法精神的?！苯o另外一個(gè)類似的受害者的信中，他寫(xiě)道，在美國(guó)這樣標(biāo)榜自由的國(guó)家，公民不應(yīng)該因?yàn)槠鋵儆谔囟ǖ恼h而被國(guó)家清算。

1953年，麥卡錫決定將清除共產(chǎn)黨的運(yùn)動(dòng)推廣到軍隊(duì)。他聲稱軍隊(duì)里也被共產(chǎn)主義滲透，并命令在軍隊(duì)里廣泛開(kāi)展調(diào)查。在各種各樣的聽(tīng)證會(huì)里，軍隊(duì)的法律代表覺(jué)得麥卡錫信口開(kāi)河的指控太過(guò)分了，氣憤地朝他咆哮：“你能稍微有點(diǎn)羞恥感，行嗎，先生？你這個(gè)人能留下點(diǎn)羞恥感嗎？”麥卡錫的影響力開(kāi)始消退，特別是1954年一場(chǎng)通過(guò)電視向全國(guó)直播的聽(tīng)證會(huì)過(guò)后。那場(chǎng)聽(tīng)證會(huì)讓全國(guó)數(shù)百萬(wàn)人首次領(lǐng)教了麥卡錫那套政治迫害的方法，也使他的瘋狂做法更加失去人心。1954年底，國(guó)會(huì)通過(guò)一項(xiàng)議案，一致投票通過(guò)批評(píng)麥卡錫參議員“引領(lǐng)一種負(fù)面的潮流，導(dǎo)致國(guó)會(huì)陷于不名譽(yù)、不光彩的尷尬境地”。從那時(shí)起，“麥卡錫主義”成為政府任意懲罰懷有不同看法、進(jìn)行政治迫害的代名詞。麥卡錫身敗名裂兩年半以后，死于過(guò)度酗酒導(dǎo)致的肝硬化。

由于麥卡錫主義大行其道，愛(ài)因斯坦大感失望之余，以前曾對(duì)政客抱有的幻想徹底破滅了。他號(hào)召人們將無(wú)德政客拒之于科學(xué)發(fā)展的決策之外。他在1952年寫(xiě)道，既不能讓這些政客控制科學(xué)，也不能讓其阻止國(guó)與國(guó)之間自由的科學(xué)交流活動(dòng)。他不相信政客，認(rèn)為他們的不可信是注定的，特別是在和平時(shí)期。不過(guò)他認(rèn)為在戰(zhàn)時(shí)，政治家倒是可以通過(guò)政治動(dòng)員將人們組織起來(lái)準(zhǔn)備戰(zhàn)斗，將工作朝向贏得戰(zhàn)爭(zhēng)方面努力。

1953年，愛(ài)因斯坦在物理學(xué)方面的活動(dòng)還是很少。他的身體狀況不斷走下坡路，身體上的不適讓他感覺(jué)到年歲不饒人的無(wú)奈。這年夏天，甚至連他在普林斯頓大街上蹣跚而行的情景都很少見(jiàn)了。當(dāng)他聽(tīng)著樹(shù)陰里陪伴了他十七年的知了的清鳴，想必總在問(wèn)自己，這次是否最后一次看到這些景象；那些吃著冰淇淋、逗小狗和鄰居們閑聊的平淡而祥和的日子可能很快就要隨他而去了。他在這年還是設(shè)法寫(xiě)了一篇關(guān)于統(tǒng)一場(chǎng)論的短文章，這是他關(guān)于這個(gè)題目的最后一篇文章。在文章中，人們?nèi)阅芨杏X(jué)到他始終如一的樂(lè)觀和自信。

1954年，愛(ài)因斯坦患上溶血性貧血癥，即他的骨髓不能產(chǎn)生足夠的血液紅細(xì)胞來(lái)補(bǔ)充正常代謝損失的數(shù)量，但依然堅(jiān)持寫(xiě)作他的最后一篇科學(xué)論文。這篇文章的合作者是女物理學(xué)家布魯里婭·考夫曼。她是一位生于巴勒斯坦，在美國(guó)接受教育的年輕物理學(xué)家。這一整年，考夫曼到了愛(ài)因斯坦家數(shù)次，向他報(bào)告論文的進(jìn)展情況。他們將在下一年完成整篇論文并最后發(fā)表。

1954年，正當(dāng)麥卡錫和非美活動(dòng)調(diào)查委員會(huì)的政治迫害甚囂塵上的時(shí)候，美國(guó)有關(guān)部門(mén)稱前洛斯阿拉莫斯國(guó)家實(shí)驗(yàn)室主任、“原子彈之父”羅伯特·奧本海默是共產(chǎn)主義同情者。奧本海默的兄弟弗蘭克20世紀(jì)30年代加入了共產(chǎn)黨。這個(gè)家庭聯(lián)系使得他更加為神經(jīng)過(guò)敏的美國(guó)政府所猜疑。政府人事安全委員會(huì)為此召開(kāi)聽(tīng)證會(huì)，認(rèn)為奧本海默行為不可預(yù)測(cè)、不能信任，宣布收回對(duì)他的忠誠(chéng)調(diào)查的肯定。他們還解除了他在原子能委員會(huì)的職務(wù)，并大力消除奧本海默在該委員會(huì)決策和學(xué)術(shù)界的影響力。委員會(huì)所作出的結(jié)論部分基于備受后人詬病的“氫彈之父”愛(ài)德華·特勒的證詞。他在證詞中也對(duì)奧本海默持有相同指控，可能因?yàn)閵W本海默在位時(shí)曾極力反對(duì)制造氫彈，成為他推動(dòng)氫彈制造的絆腳石（巧合的是，第二顆氫彈同一年在比基尼環(huán)礁試爆，將其中三個(gè)小島夷為平地）。