輪船鳴響著汽笛離開上海吳淞碼頭，大海蒼茫，碧水藍(lán)天，如此浩瀚壯闊的場景，是陳家兄弟生平第一次遭遇。為此，陳衡恪寫下了“生平海波未寓目，乍疑一片水蒼玉”【40】的壯麗詩句。身材瘦小、童氣未脫的陳寅恪，從此開始了長達(dá)十余年的海外游學(xué)生涯。

陳家兄弟踏上日本國土，入東京弘文學(xué)院就讀。該校是明治三十五年（1902）四月，由嘉納治五郎為中國留學(xué)生開辦的私立補(bǔ)習(xí)學(xué)校，受日本文部省委托，專門接受中國留學(xué)生預(yù)備教育，主要講授日語及普通科，如教育、心理、倫理、教授法、管理法等，修業(yè)年限由半年至三年不等，主要看學(xué)生各自的條件和造化。與陳家兄弟由上海同船赴日的留學(xué)生120余人（南按：時(shí)已在日本的中國留學(xué)生約300人左右），另有40人赴歐洲留學(xué)。在東京碼頭下船后，進(jìn)入弘文學(xué)院就讀的人數(shù)共56名，其中寄宿生22名。在這22名學(xué)生中，就有比陳寅恪年長9歲，虛歲22的紹興小個(gè)子周豫才。這一年，魯迅于南京水師學(xué)堂附設(shè)的礦路學(xué)堂畢業(yè)，和其他幾位同學(xué)將被派往日本留學(xué)。3月24日，在礦路學(xué)堂總辦俞明震的親自帶領(lǐng)下，魯迅等人乘日輪大貞丸由南京出發(fā)去日本。俞明震是個(gè)新派人物，魯迅求學(xué)時(shí)對他的印象不壞，后來在《朝花夕拾·瑣記》中對他有過這樣一段描述：“但第二年的總辦是一個(gè)新黨，他坐在馬車上的時(shí)候大抵看著《時(shí)務(wù)報(bào)》，考漢文也自己出題目，和教員出的很不同。有一次是《華盛頓論》，漢文教員反而惴惴地來問我們道：‘華盛頓是什么東西呀？……’”【41】這個(gè)新派的總辦俞明震就是陳寅恪的舅父。

其時(shí)，陳寅恪與長兄陳衡恪作為自費(fèi)留學(xué)生，于上海碼頭登上大貞丸，并在其舅父俞明震的護(hù)送下，與魯迅等學(xué)生結(jié)伴同行。陳衡恪也是礦路學(xué)堂的學(xué)生，與魯迅同學(xué)且交情甚好。到達(dá)日本進(jìn)入弘文學(xué)院后，陳衡恪與魯迅同住一舍，朝夕相處，過從甚密。陳家兄弟沒有想到這個(gè)默不做聲、嘴巴上剛剛露出毛茸茸黑須的紹興“土老兒”（蔣夢麟語），會(huì)在后來以魯迅的筆名一舉成名，并把手中的筆當(dāng)成投槍和匕首，終于成了“中國文化革命的主將”、“代表全民族的大多數(shù)，向著敵人沖鋒陷陣的最正確、最堅(jiān)決、最忠實(shí)、最熱忱的空前的民族英雄”（毛澤東語）。不過日后的陳寅恪很少向外人道及與魯迅的這段因緣際會(huì)。據(jù)他自己晚年透露，因?yàn)轸斞傅拿麣庠絹碓酱?，最后以“民族魂”的大旗覆棺蓋槨，繼爾成為“先知先覺”和“全知全覺”的圣人，他怕言及此事，被國人誤認(rèn)為自己像魯迅所指斥的“無聊之徒，謬托知己”，“既以自炫，又以賣錢，連死尸也成了他們的沽名獲利的工具?！薄?2】因而，陳氏一生留下的詩文與回憶文章，幾乎看不到他與魯迅的交往經(jīng)歷，倒是在魯迅的日記中可看到“贈(zèng)陳寅恪《域外小說》第一、第二集，《炭畫》各一冊，齊壽山《炭畫》一冊”等記載?！?3】這是陳寅恪的洞察事理與自尊之處。

光緒三十年（1904）夏，陳寅恪假期回國返南京。據(jù)當(dāng)代史家王子舟說，陳氏歸國之原因可能出于在日費(fèi)用見絀，因?yàn)楫?dāng)時(shí)留日者多富家子弟，有些日人借機(jī)刮其錢財(cái)?！?4】留日學(xué)生進(jìn)書店，圖書加價(jià)；進(jìn)商店，貨品加價(jià)，乃至“房東揩他們的油，扒手、小偷虎視眈眈；下女替代買東西要一成半的小費(fèi)；野妓打扮成女學(xué)生，以妖眼來誘惑，得病即為醫(yī)生之餌”等卑鄙行徑司空見慣，【45】中國學(xué)生深受盤剝欺騙之苦。當(dāng)然，陳寅恪歸國可能還有另外一個(gè)目的，就是爭取官費(fèi)的資助。因?yàn)闅w國未久，就與其五哥陳隆恪同時(shí)考取了官費(fèi)留日生，并于這年晚秋再度赴日，同行者有李四光、林伯渠等人。陳三立有《十月二十七日江南派送日本留學(xué)生百二十人登海舶，隆寅兩兒附焉，遂至吳淞而別。其時(shí)派送泰西留學(xué)生四十人，亦聯(lián)舟并發(fā)，悵然有作》詩，第二首云：“游隊(duì)分明雜兩兒，扶桑初日照臨之。送行余亦自涯返，海水澆胸吐與誰?！薄?6】此次赴日，寅恪重返東京弘文學(xué)院，其兄初入慶應(yīng)大學(xué)，后轉(zhuǎn)入東京帝大財(cái)商系就讀。