日偽對蔣介石的反革命罪行拍手稱快。汪精衛(wèi)在南京開了慶祝大會，他說：“蔣介石盲目抗戰(zhàn)數(shù)年，只做了皖南事變一件大好事！”偽國民政府宣傳部發(fā)表談話說：“救國必須和平，和平必須反共”，并呼吁重慶方面“明智之士”能同汪偽“同立于統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)、統(tǒng)一國策之下，共同奮斗，使全面和平得以早日實現(xiàn)”?？梢?，皖南事變是日、偽、蔣勾結(jié)，共同反共的鐵證。
蘇聯(lián)政府對蔣介石發(fā)動皖南事變，十分不滿。蘇聯(lián)外交部副部長對國民黨駐蘇大使邵力子說：“蘇聯(lián)人決不做可使敵人快心的事。請問大使閣下，日本人對此高興否？請轉(zhuǎn)告貴國政府勿做敵人快心之事?！贝蘅煞蛟谥貞c向何應(yīng)欽、白崇禧提出質(zhì)問：“是否在和新四軍的沖突中使用了蘇聯(lián)提供的武器？何以要打自己人，要屠殺自己的士兵和軍官呢？”蘇聯(lián)駐華大使潘友新對蔣介石說：“對中國來說，內(nèi)戰(zhàn)將意味著滅亡。”
美國總統(tǒng)特使居里在重慶對蔣介石說：“美國在國共糾紛未獲解決前，無法大量援助中國，中美之經(jīng)濟財政問題不可能有任何進展。”英國發(fā)表評論說：“解散皖南新四軍事件，只有日本最為興奮?！?br/>
局勢發(fā)展出乎蔣介石的意料之外。蔣介石在國內(nèi)外一片責難聲中和英、美、蘇3國政府的外交壓力下，突然發(fā)現(xiàn)，自己在政治上已陷入異常孤立和被動的境地。
1月20日，中共中央革命軍事委員會發(fā)布命令，重建新四軍，任命陳毅為新四軍代理軍長，劉少奇為政委，張云逸為副軍長，賴傳珠為參謀長，鄧子恢為政治部主任。新四軍軍部即在蘇北鹽城成立。全軍7個師1個獨立旅，9萬余人。第一師由蘇北指揮部所屬部隊編成，師長粟裕，政委劉炎；第二師師長張云逸兼，政委鄭位三，副師長羅炳輝；第三師由八路軍第五縱隊編成，師長兼政委黃克誠；第四師由八路軍第四縱隊編成，師長兼政委彭雪楓；第五師由豫鄂挺進縱隊編成，師長兼政委李先念；第六師由江南指揮部所屬部隊及江南人民抗日救國軍編成，師長兼政委譚震林；第七師由無為游擊縱隊、第三支隊挺進團、皖南突圍部隊編成，師長張鼎丞、政委曾希圣；獨立旅旅長梁興初，政委羅華生。
同時，毛澤東代表中共中央革命軍事委員會發(fā)表談話，提出關(guān)于解決時局的12條辦法：
第一、懸崖勒馬，停止挑釁。
第二、取消1月17日的反動命令，并宣布自己是完全錯了。
第三、懲辦皖南事變的禍首何應(yīng)欽、顧祝同、上官云相3人。
第四、恢復(fù)葉挺自由，繼續(xù)當新四軍軍長。
第五、交還皖南新四軍全部人槍。
第六、撫恤皖南新四軍全部傷亡將士。
第七、撤退華中的“剿共”軍。
第八、平毀西北的封鎖線。
第九、釋放全國一切被捕的愛國政治犯。
第十、廢止一黨專政，實行民主政治。
第十一、實行三民主義，服從《總理遺囑》。
第十二、逮捕各親日派首領(lǐng)，交付國法審判。
毛澤東又說：“如能實行以上12條，則事態(tài)自然平復(fù)，我們共產(chǎn)黨和全國人民，必不過為己甚。否則，‘吾恐季孫之憂，不在顓臾，而在蕭墻之內(nèi)’，反動派必然是搬起石頭打他們自己的腳。那時我們就愛莫能助了。我們是珍重合作的，但必須他們也珍重合作。老實說，我說的讓步是有限度的，我們讓步的階段已完結(jié)了。他們已經(jīng)殺了第一刀，這個傷痕是很深重的。他們?nèi)绻€為前途著想，他們就應(yīng)該自己出來醫(yī)治這個傷痕，‘亡羊補牢，猶未為晚’。這是他們自己性命交關(guān)的大問題，我們不得不盡最后的忠告。如若他們怙惡不悛，繼續(xù)胡鬧，那時，全國人民忍無可忍，把他們拋到茅廁里去，那就悔之無及了。”
蔣介石陷入了空前孤立的境地，他不得不在第二屆國民參政會上保證說：“以后亦絕無剿共的軍事?！眹顸h發(fā)動的第二次反共高潮宣告破產(chǎn)。
中共中央對皖南事變作了檢查總結(jié)，作出《中央關(guān)于項、袁錯誤的決定》，指出：
三年以來，項英、袁國平對于中央的指示，一貫地陽奉陰違，一切遷就國民黨，反對向北發(fā)展與向敵后發(fā)展，反對擴大新四軍。反對建立抗日根據(jù)地，堅持其自己的機會主義路線。……此次皖南部隊北移，本可避免損失，乃項、袁先則猶豫動搖，繼而自尋絕路，投入蔣介石反共軍之包圍羅網(wǎng)，……由于項、袁領(lǐng)導(dǎo)錯誤，事先既少精神上之準備，臨時復(fù)無機動作戰(zhàn)之指揮與決心，遂至陷于失敗，此次失敗，乃項、袁一貫機會主義領(lǐng)導(dǎo)的結(jié)果，非尋常偶然的戰(zhàn)斗失敗可比。
皖南事變不能不使毛澤東深思，實踐證明，革命力量的發(fā)展，與客觀條件有關(guān)，但主要取決于正確路線，取決于正確路線的貫徹執(zhí)行，黨內(nèi)存在的“左”右傾錯誤，影響了革命的發(fā)展。項英、袁國平領(lǐng)導(dǎo)的新四軍，部隊力量的發(fā)展比八路軍慢得多，八路軍發(fā)展了5倍，新四軍才發(fā)展1倍，項英不聽從中央指示，最后在皖南事變中，投入蔣介石的羅網(wǎng)。在黨內(nèi)，王明的機會主義錯誤還沒有徹底清除，共產(chǎn)國際關(guān)于中國革命的錯誤指揮，通過王明等人還在起作用。王明在1940年3月公然再版了他在1930年11月寫的《兩條路線》（再版時改為《為中共更加布爾什維克而斗爭》）的小冊子，主觀主義、宗派主義和黨八股還在毒害一些人。抗戰(zhàn)以來，黨吸收了70萬新黨員，他們大部分出身于農(nóng)民和小資產(chǎn)階級，雖然有革命熱情和愿意接受教育的愿望，但其中不少人把個人主義、自由主義等非無產(chǎn)階級思想帶到黨內(nèi)，組織上入了黨，思想上并沒有完全入黨。這常常成為不正之風(fēng)滋長和蔓延的條件。為了解決這方面的問題，毛澤東考慮有必要進行一次大規(guī)模的整風(fēng)運動。
1941年5月19日，毛澤東在延安干部會議上作了《改造我們的學(xué)習(xí)》演講，為整風(fēng)運動作了思想動員和理論準備。9月10日至10月22日，中共中央政治局召開擴大會議，討論黨的歷史，特別是土地革命戰(zhàn)爭時期的歷史問題。
毛澤東在9月10日的發(fā)言中，詳細分析了王明“左”傾冒險主義的錯誤及其根源，指出，過去黨內(nèi)很長時期為主觀主義所統(tǒng)治，立三路線和土地革命戰(zhàn)爭后期的“左”傾機會主義都是主觀主義。土地革命戰(zhàn)爭后期的主觀主義表現(xiàn)更嚴重，它的形態(tài)更完備，統(tǒng)治時間更久，結(jié)果更悲慘。這是因為這些主觀主義者自稱為“國際路線”，穿上馬克思主義的外衣，是假馬克思主義。
會議確認在土地革命后期，王明、博古等人領(lǐng)導(dǎo)黨的中央所犯的“左”傾錯誤是“路線錯誤”，一些受王明影響而犯過錯誤的同志作了自我批評，但王明卻千方百計地推卸責任，拒不承認錯誤。
毛澤東4次找王明談話，任弼時、王稼祥參加了前兩次談話，陳云和康生參加了后兩次談話。他們同毛澤東一起對王明進行了嚴肅的批評，并希望王明檢查和改正自己的錯誤。
毛澤東在同王明談話中，批評了王明以下幾個問題上的錯誤：
（1）在形勢估計問題上表現(xiàn)盲目樂觀。
（2）在國共關(guān)系問題上，忽視在統(tǒng)一戰(zhàn)線下的獨立性與斗爭性。
?。?）在軍事策略問題上，王明助長了反對獨立自主的山地游擊戰(zhàn)的方針。
（4）在組織問題上，王明在擔任中共長江局書記時，常用個人名義打帶有指示性通電給中央與前總，擅自用中央名義發(fā)表許多文件。
王明沒有接受毛澤東對他的批評。他解釋說，他的路線是對的，個別問題有錯誤。王明在10月12日突然宣布有病，從此便長期不參加中央會議和整風(fēng)運動。
中共中央政治局會議確認王明有以下路線錯誤：
?。?）第二次國內(nèi)革命戰(zhàn)爭后期的“左”傾錯誤，從中共六屆四中全會就開始了，從“九一八”以后則發(fā)展為路線錯誤。
?。?）以博古為首的臨時中央的組成，王明負有重要責任。
（3）王明到蘇聯(lián)后，雖然一些具體政策問題上和博古為首的臨時中央有不同看法，但在形勢的分析和政治路線上是完全同意的，并且一直給予了很大的支持。
?。?）抗日戰(zhàn)爭期間，王明在負責中共長江局工作期間，在組織上鬧獨立性的錯誤。
中共中央成立了高級學(xué)習(xí)組，主要任務(wù)是研究馬克思列寧主義理論和總結(jié)黨的歷史經(jīng)驗，以克服主觀主義、形式主義等錯誤思想。
全黨整風(fēng)從1942年初開始。2月1日，毛澤東在中央黨校開學(xué)典禮上作了題為《整頓黨的作風(fēng)》的講演，向全黨發(fā)出“反對主觀主義以整頓學(xué)風(fēng)，反對宗派主義以整頓黨風(fēng)，反對黨八股以整頓文風(fēng)，這就是我們的任務(wù)”的號召。
2月8日，毛澤東又在延安干部會議上作《反對黨八股》的演說。爾后中共中央成立了以毛澤東為首的“總學(xué)習(xí)委員會”作為整風(fēng)運動的領(lǐng)導(dǎo)機關(guān)。
整風(fēng)運動共分發(fā)動、學(xué)風(fēng)學(xué)習(xí)、黨風(fēng)學(xué)習(xí)、文風(fēng)學(xué)習(xí)，總結(jié)黨的歷史經(jīng)驗5個階段，歷時3年多，至1945年夏才結(jié)束。毛澤東提出，整風(fēng)運動的方針是“懲前毖后，治病救人”。這個方針同王明“左”傾機會主義的“殘酷斗爭，無情打擊”有根本的區(qū)別。毛澤東是用解決黨內(nèi)矛盾的方法，用開展批評與自我批評的方法和弄清思想路線是非的方法，幫助犯錯誤的同志，改正錯誤，達到團結(jié)同志的目的?！白蟆眱A機會主義是用解決敵我矛盾的方法，對待黨內(nèi)持有不同意見的同志，那是宗派主義的表現(xiàn)。
1942年5月，毛澤東又發(fā)表了《在延安文藝座談會上的講話》，提出了革命文藝的根本方向，革命文藝的創(chuàng)作理論和文藝批評的標準，對文藝界進行了思想上和組織上的整頓。
中共中央西北局在1942年10月19日到1943年1月14日，召開了高級干部會議，著重檢討了陜甘寧邊區(qū)黨的歷史，批評了在王明“左”傾冒險主義影響下陜北黨內(nèi)一些同志所犯的錯誤，特別是肅反擴大化的錯誤，對鬧獨立性和官僚主義等傾向，開展了批評和自我批評。加強了黨的領(lǐng)導(dǎo)，對邊區(qū)政府工作、經(jīng)濟工作和財政工作進行了討論。毛澤東在會上作了《抗日時期的經(jīng)濟問題和財政問題》的演說，提出了“發(fā)展經(jīng)濟，保障供給”方針，號召開展全邊的軍民大生產(chǎn)運動，把大生產(chǎn)運動當作鞏固根據(jù)地的重要措施。毛澤東要求黨政工作人員在財政問題上，應(yīng)以90％的精力幫助農(nóng)民增加生產(chǎn)，然后以10％的精力從農(nóng)民取得稅收。他說凡是不注重研究生產(chǎn)，不用主要精力幫助農(nóng)民解決“救民私糧”，只顧向農(nóng)民要“救國公糧”的，就是沾染了國民黨的作風(fēng)，沾染了官僚主義的灰塵，就不是好領(lǐng)導(dǎo)者。凡是不注意生產(chǎn)反而好吃懶做的，不算好軍人，好公民。
當時，日偽軍對根據(jù)地的“掃蕩”、國民黨對根據(jù)地的封鎖，再加上連續(xù)遭到水、旱、蟲等自然災(zāi)害，根據(jù)地幾乎到了沒有飯吃，沒有衣穿，沒有紙、沒有菜，戰(zhàn)士無鞋襪，工作人員冬天無被蓋的境地，人民群眾的生活很貧苦。
1942年8月的一天，陜甘寧邊區(qū)政府小禮堂召開由各縣縣長參加的征糧會議，天下著大雨，突然一聲巨雷，把禮堂的一根木柱子劈斷，有一位縣長當場被雷電觸死。這件事很快傳出去了，有個別群眾說：“為什么雷沒有劈毛主席？”
話傳到毛澤東的耳里，毛澤東沒有追問是誰說的，更不準別人去抓什么“反革命”，而只是向干部了解說這話的原因。通過了解才知道，政府下達的征糧任務(wù)太重，群眾有意見，便借“雷劈”發(fā)泄不滿情緒。這引起了毛澤東的重視，他指示有關(guān)部門將征收20萬擔公糧的任務(wù)，減至16萬擔。毛澤東這樣處理和解決問題，使黨群關(guān)系更加親近了，毛澤東在群眾中的威信更高了。
毛澤東發(fā)動部隊，機關(guān)、學(xué)校開荒種地。他召集延安的各單位負責人開會，非常簡單明確地說：“國民黨不發(fā)軍餉了，我們怎么辦？等著餓死嗎？我想大家都不會同意的。解散回家嗎？我想大家也不會同意。那么怎么辦呢？只有大家動手，開荒種地，解決困難?！?br/>
眾人贊同毛澤東的意見。毛澤東當場表示，他自己也參加開荒種地。多數(shù)人認為，毛澤東的工作太忙，不必參加開荒。有人提出為毛澤東代耕，毛澤東說：
“我一定參加開荒。地點就選在我門口。只開一畝地，不多也不少。我還能自己動手，堅決不要人代耕?！?br/>
毛澤東果然在自己門前選了一塊空地。他白天工作一會，去那里勞動一會，夜間還要通宵工作，沒過多久，他根據(jù)少年在家種田的經(jīng)驗，認為差不多了，讓人認真丈量，果是一畝多地。他在那里種了蔬菜和莊稼，長得很好。
中央其他領(lǐng)導(dǎo)人都親自參加大生產(chǎn)運動。王震率領(lǐng)八路軍359旅，開赴荊棘叢生、野狼成群的南泥灣，開荒26萬畝，把荒無人煙的南泥灣，變成平川稻谷香，遍地是牛羊的“陜北江南”。全旅的經(jīng)濟、物資不僅能全部自給，而且達到了“耕一余一”，向政府交了1萬石公糧。
在大生產(chǎn)運動中農(nóng)民積極參加“變工隊”、“扎工隊”，提高了勞動生產(chǎn)率。到1942年底，全邊區(qū)共開荒180萬畝，增產(chǎn)細糧47萬石。學(xué)校、機關(guān)、部隊做到糧食、經(jīng)費自給或半自給。與此同時，邊區(qū)的工業(yè)、手工業(yè)也有了很大發(fā)展。全邊區(qū)有62個公營工廠，職工近4000人，年產(chǎn)土布10萬匹，這些工廠不僅能煉油、煉鐵，而且能修理機械、制造軍火。全邊區(qū)的公糧任務(wù)，由1942年的16萬擔，到1945年減至12萬擔。群眾增加了生產(chǎn)，又減輕了負擔，生活得到了改善和提高。毛澤東總結(jié)了大生產(chǎn)運動的經(jīng)驗，題了八個大字：“自己動手，豐衣足食?！?br/>
1943年3月16日到20日，中共中央召開政治局會議，討論通過了《中央關(guān)于中央機構(gòu)調(diào)整及精簡的決定》。會議推選毛澤東為中央政治局主席；中央書記處由毛澤東、劉少奇、任弼時3人組成，毛澤東任中央書記處主席。主席有最后決定之權(quán)。中央成立宣傳委員會和組織委員會，毛澤東任宣傳委員會書記，王稼祥任副書記，劉少奇任組織委員會書記。中央任命毛澤東為中央黨校校長，彭真為副校長，任命劉少奇為中央研究局局長，楊尚昆為副局長。
毛澤東身居顯位，能夠保持著謙虛謹慎的作風(fēng)。他說：“群眾是真正的英雄，而我們自己則往往是幼稚可笑的，沒有滿腔的熱忱，沒有眼睛向下的決心，沒有求知的渴望，沒有放下臭架子，甘當小學(xué)生的精神，就不能得到起碼的知識。共產(chǎn)黨員要傾聽人民群眾的意見，要聯(lián)系人民群眾，而不要脫離人民群眾，應(yīng)該站在民眾之中，而決不應(yīng)該站在民眾之上?！?br/>
王明曾在延安“澤東青年干部學(xué)?！遍_學(xué)典禮作《學(xué)習(xí)毛澤東》的演講，說：“青年干部學(xué)校既然以毛澤東同志的光輝名字來命名，那就要名符其實，就是要學(xué)習(xí)毛澤東同志的生平事業(yè)和理論?！薄懊珴蓶|同志則如鶴立雞群一樣英勇堅決地繼續(xù)革命工作?！蓖趺饔终f，要從5個方面學(xué)習(xí)毛澤東，即學(xué)習(xí)毛澤東始終一貫忠于革命的精神，勤于學(xué)習(xí)的精神，勇于創(chuàng)造的精神，長于工作的精神，善于團結(jié)的精神，王明把他的《學(xué)習(xí)毛澤東》的講演稿拿給毛澤東看。毛澤東看后說：
“我的理論一點也不好，不要發(fā)表。”
毛澤東在致中央宣傳部副部長何凱豐的信中說：“我的思想（馬列）自覺沒有成熟，還是學(xué)習(xí)時候，不是鼓吹時候；要鼓吹只宜以某些片斷去鼓吹（例如整風(fēng)文件中的幾件），不宜當作體系去鼓吹，因為我的體系還沒有成熟?！?br/>
毛澤東在寫給延安大學(xué)校長、延安魯迅藝術(shù)學(xué)院院長周揚的信中說：“把我那篇講話配在馬、恩、列、斯……之林，覺得不稱，我的話是不能這樣配的?！?br/>
1943年4月，中共中央開始普遍的審查干部。在審查干部運動中曾一度出現(xiàn)了偏差，對敵情作了過分的估計?？倢W(xué)習(xí)委員會副主任、中共中央社會部長、情報部長康生，在延安干部會議上作《搶救失足者》報告，搞起“逼、供、信”的過火斗爭，在10多天內(nèi)便弄出大批冤假錯案來，還在報紙上公布了一個所謂的大特務(wù)案，案件中的“主犯”已判死刑，即將槍斃。
毛澤東很快發(fā)現(xiàn)了錯誤，即批評道：“簡直是風(fēng)聲鶴唳，草木皆兵，特務(wù)如麻，鬧得人人自危。我們黨的歷史上，在王明、張國燾錯誤路線下，搞審干肅反，傷害了很多好同志。特別是隨便殺人，殺戒一開就難以收住，錯殺了很多好同志，有血的教訓(xùn)。只要有人在，錯了好糾正；人殺了，頭是不能再長出來的，真正的特務(wù)也一個不殺?！?br/>
延安行政學(xué)院被審查的人很多，他們不服，說道：“毛主席、周副主席知道了，一定會給我們平反?！辈簧偃藢懶沤o毛澤東申訴，說他們不是特務(wù)，不是國民黨，不是三青團，但挨了整，被戴上特務(wù)、國民黨、三青團的帽子，要求黨給他們作出實事求是的結(jié)論。
毛澤東看了申訴信，親自到行政學(xué)院，在教職員工和學(xué)員大會上講話，說：“在審干中傷害了不少好同志、冤枉了好人，這像洗澡，為了消毒，在水里放些灰錳氧，但放多了燒壞了皮膚，這很快會好的。有些好同志被錯戴了帽子，我們黨是實事求是的，帽子戴錯了就要把它摘下來，有反必肅，有錯必糾，這就叫做實事求是?！?br/>
毛澤東提出，審干運動必須堅持一個不殺，大部不抓，反對逼供信，重證據(jù)，不重口供的原則，中共中央又發(fā)出一系列甄別平反的指示。
蘇聯(lián)政府對蔣介石發(fā)動皖南事變，十分不滿。蘇聯(lián)外交部副部長對國民黨駐蘇大使邵力子說：“蘇聯(lián)人決不做可使敵人快心的事。請問大使閣下，日本人對此高興否？請轉(zhuǎn)告貴國政府勿做敵人快心之事?！贝蘅煞蛟谥貞c向何應(yīng)欽、白崇禧提出質(zhì)問：“是否在和新四軍的沖突中使用了蘇聯(lián)提供的武器？何以要打自己人，要屠殺自己的士兵和軍官呢？”蘇聯(lián)駐華大使潘友新對蔣介石說：“對中國來說，內(nèi)戰(zhàn)將意味著滅亡。”
美國總統(tǒng)特使居里在重慶對蔣介石說：“美國在國共糾紛未獲解決前，無法大量援助中國，中美之經(jīng)濟財政問題不可能有任何進展。”英國發(fā)表評論說：“解散皖南新四軍事件，只有日本最為興奮?！?br/>
局勢發(fā)展出乎蔣介石的意料之外。蔣介石在國內(nèi)外一片責難聲中和英、美、蘇3國政府的外交壓力下，突然發(fā)現(xiàn)，自己在政治上已陷入異常孤立和被動的境地。
1月20日，中共中央革命軍事委員會發(fā)布命令，重建新四軍，任命陳毅為新四軍代理軍長，劉少奇為政委，張云逸為副軍長，賴傳珠為參謀長，鄧子恢為政治部主任。新四軍軍部即在蘇北鹽城成立。全軍7個師1個獨立旅，9萬余人。第一師由蘇北指揮部所屬部隊編成，師長粟裕，政委劉炎；第二師師長張云逸兼，政委鄭位三，副師長羅炳輝；第三師由八路軍第五縱隊編成，師長兼政委黃克誠；第四師由八路軍第四縱隊編成，師長兼政委彭雪楓；第五師由豫鄂挺進縱隊編成，師長兼政委李先念；第六師由江南指揮部所屬部隊及江南人民抗日救國軍編成，師長兼政委譚震林；第七師由無為游擊縱隊、第三支隊挺進團、皖南突圍部隊編成，師長張鼎丞、政委曾希圣；獨立旅旅長梁興初，政委羅華生。
同時，毛澤東代表中共中央革命軍事委員會發(fā)表談話，提出關(guān)于解決時局的12條辦法：
第一、懸崖勒馬，停止挑釁。
第二、取消1月17日的反動命令，并宣布自己是完全錯了。
第三、懲辦皖南事變的禍首何應(yīng)欽、顧祝同、上官云相3人。
第四、恢復(fù)葉挺自由，繼續(xù)當新四軍軍長。
第五、交還皖南新四軍全部人槍。
第六、撫恤皖南新四軍全部傷亡將士。
第七、撤退華中的“剿共”軍。
第八、平毀西北的封鎖線。
第九、釋放全國一切被捕的愛國政治犯。
第十、廢止一黨專政，實行民主政治。
第十一、實行三民主義，服從《總理遺囑》。
第十二、逮捕各親日派首領(lǐng)，交付國法審判。
毛澤東又說：“如能實行以上12條，則事態(tài)自然平復(fù)，我們共產(chǎn)黨和全國人民，必不過為己甚。否則，‘吾恐季孫之憂，不在顓臾，而在蕭墻之內(nèi)’，反動派必然是搬起石頭打他們自己的腳。那時我們就愛莫能助了。我們是珍重合作的，但必須他們也珍重合作。老實說，我說的讓步是有限度的，我們讓步的階段已完結(jié)了。他們已經(jīng)殺了第一刀，這個傷痕是很深重的。他們?nèi)绻€為前途著想，他們就應(yīng)該自己出來醫(yī)治這個傷痕，‘亡羊補牢，猶未為晚’。這是他們自己性命交關(guān)的大問題，我們不得不盡最后的忠告。如若他們怙惡不悛，繼續(xù)胡鬧，那時，全國人民忍無可忍，把他們拋到茅廁里去，那就悔之無及了。”
蔣介石陷入了空前孤立的境地，他不得不在第二屆國民參政會上保證說：“以后亦絕無剿共的軍事?！眹顸h發(fā)動的第二次反共高潮宣告破產(chǎn)。
中共中央對皖南事變作了檢查總結(jié)，作出《中央關(guān)于項、袁錯誤的決定》，指出：
三年以來，項英、袁國平對于中央的指示，一貫地陽奉陰違，一切遷就國民黨，反對向北發(fā)展與向敵后發(fā)展，反對擴大新四軍。反對建立抗日根據(jù)地，堅持其自己的機會主義路線。……此次皖南部隊北移，本可避免損失，乃項、袁先則猶豫動搖，繼而自尋絕路，投入蔣介石反共軍之包圍羅網(wǎng)，……由于項、袁領(lǐng)導(dǎo)錯誤，事先既少精神上之準備，臨時復(fù)無機動作戰(zhàn)之指揮與決心，遂至陷于失敗，此次失敗，乃項、袁一貫機會主義領(lǐng)導(dǎo)的結(jié)果，非尋常偶然的戰(zhàn)斗失敗可比。
皖南事變不能不使毛澤東深思，實踐證明，革命力量的發(fā)展，與客觀條件有關(guān)，但主要取決于正確路線，取決于正確路線的貫徹執(zhí)行，黨內(nèi)存在的“左”右傾錯誤，影響了革命的發(fā)展。項英、袁國平領(lǐng)導(dǎo)的新四軍，部隊力量的發(fā)展比八路軍慢得多，八路軍發(fā)展了5倍，新四軍才發(fā)展1倍，項英不聽從中央指示，最后在皖南事變中，投入蔣介石的羅網(wǎng)。在黨內(nèi)，王明的機會主義錯誤還沒有徹底清除，共產(chǎn)國際關(guān)于中國革命的錯誤指揮，通過王明等人還在起作用。王明在1940年3月公然再版了他在1930年11月寫的《兩條路線》（再版時改為《為中共更加布爾什維克而斗爭》）的小冊子，主觀主義、宗派主義和黨八股還在毒害一些人。抗戰(zhàn)以來，黨吸收了70萬新黨員，他們大部分出身于農(nóng)民和小資產(chǎn)階級，雖然有革命熱情和愿意接受教育的愿望，但其中不少人把個人主義、自由主義等非無產(chǎn)階級思想帶到黨內(nèi)，組織上入了黨，思想上并沒有完全入黨。這常常成為不正之風(fēng)滋長和蔓延的條件。為了解決這方面的問題，毛澤東考慮有必要進行一次大規(guī)模的整風(fēng)運動。
1941年5月19日，毛澤東在延安干部會議上作了《改造我們的學(xué)習(xí)》演講，為整風(fēng)運動作了思想動員和理論準備。9月10日至10月22日，中共中央政治局召開擴大會議，討論黨的歷史，特別是土地革命戰(zhàn)爭時期的歷史問題。
毛澤東在9月10日的發(fā)言中，詳細分析了王明“左”傾冒險主義的錯誤及其根源，指出，過去黨內(nèi)很長時期為主觀主義所統(tǒng)治，立三路線和土地革命戰(zhàn)爭后期的“左”傾機會主義都是主觀主義。土地革命戰(zhàn)爭后期的主觀主義表現(xiàn)更嚴重，它的形態(tài)更完備，統(tǒng)治時間更久，結(jié)果更悲慘。這是因為這些主觀主義者自稱為“國際路線”，穿上馬克思主義的外衣，是假馬克思主義。
會議確認在土地革命后期，王明、博古等人領(lǐng)導(dǎo)黨的中央所犯的“左”傾錯誤是“路線錯誤”，一些受王明影響而犯過錯誤的同志作了自我批評，但王明卻千方百計地推卸責任，拒不承認錯誤。
毛澤東4次找王明談話，任弼時、王稼祥參加了前兩次談話，陳云和康生參加了后兩次談話。他們同毛澤東一起對王明進行了嚴肅的批評，并希望王明檢查和改正自己的錯誤。
毛澤東在同王明談話中，批評了王明以下幾個問題上的錯誤：
（1）在形勢估計問題上表現(xiàn)盲目樂觀。
（2）在國共關(guān)系問題上，忽視在統(tǒng)一戰(zhàn)線下的獨立性與斗爭性。
?。?）在軍事策略問題上，王明助長了反對獨立自主的山地游擊戰(zhàn)的方針。
（4）在組織問題上，王明在擔任中共長江局書記時，常用個人名義打帶有指示性通電給中央與前總，擅自用中央名義發(fā)表許多文件。
王明沒有接受毛澤東對他的批評。他解釋說，他的路線是對的，個別問題有錯誤。王明在10月12日突然宣布有病，從此便長期不參加中央會議和整風(fēng)運動。
中共中央政治局會議確認王明有以下路線錯誤：
?。?）第二次國內(nèi)革命戰(zhàn)爭后期的“左”傾錯誤，從中共六屆四中全會就開始了，從“九一八”以后則發(fā)展為路線錯誤。
?。?）以博古為首的臨時中央的組成，王明負有重要責任。
（3）王明到蘇聯(lián)后，雖然一些具體政策問題上和博古為首的臨時中央有不同看法，但在形勢的分析和政治路線上是完全同意的，并且一直給予了很大的支持。
?。?）抗日戰(zhàn)爭期間，王明在負責中共長江局工作期間，在組織上鬧獨立性的錯誤。
中共中央成立了高級學(xué)習(xí)組，主要任務(wù)是研究馬克思列寧主義理論和總結(jié)黨的歷史經(jīng)驗，以克服主觀主義、形式主義等錯誤思想。
全黨整風(fēng)從1942年初開始。2月1日，毛澤東在中央黨校開學(xué)典禮上作了題為《整頓黨的作風(fēng)》的講演，向全黨發(fā)出“反對主觀主義以整頓學(xué)風(fēng)，反對宗派主義以整頓黨風(fēng)，反對黨八股以整頓文風(fēng)，這就是我們的任務(wù)”的號召。
2月8日，毛澤東又在延安干部會議上作《反對黨八股》的演說。爾后中共中央成立了以毛澤東為首的“總學(xué)習(xí)委員會”作為整風(fēng)運動的領(lǐng)導(dǎo)機關(guān)。
整風(fēng)運動共分發(fā)動、學(xué)風(fēng)學(xué)習(xí)、黨風(fēng)學(xué)習(xí)、文風(fēng)學(xué)習(xí)，總結(jié)黨的歷史經(jīng)驗5個階段，歷時3年多，至1945年夏才結(jié)束。毛澤東提出，整風(fēng)運動的方針是“懲前毖后，治病救人”。這個方針同王明“左”傾機會主義的“殘酷斗爭，無情打擊”有根本的區(qū)別。毛澤東是用解決黨內(nèi)矛盾的方法，用開展批評與自我批評的方法和弄清思想路線是非的方法，幫助犯錯誤的同志，改正錯誤，達到團結(jié)同志的目的?！白蟆眱A機會主義是用解決敵我矛盾的方法，對待黨內(nèi)持有不同意見的同志，那是宗派主義的表現(xiàn)。
1942年5月，毛澤東又發(fā)表了《在延安文藝座談會上的講話》，提出了革命文藝的根本方向，革命文藝的創(chuàng)作理論和文藝批評的標準，對文藝界進行了思想上和組織上的整頓。
中共中央西北局在1942年10月19日到1943年1月14日，召開了高級干部會議，著重檢討了陜甘寧邊區(qū)黨的歷史，批評了在王明“左”傾冒險主義影響下陜北黨內(nèi)一些同志所犯的錯誤，特別是肅反擴大化的錯誤，對鬧獨立性和官僚主義等傾向，開展了批評和自我批評。加強了黨的領(lǐng)導(dǎo)，對邊區(qū)政府工作、經(jīng)濟工作和財政工作進行了討論。毛澤東在會上作了《抗日時期的經(jīng)濟問題和財政問題》的演說，提出了“發(fā)展經(jīng)濟，保障供給”方針，號召開展全邊的軍民大生產(chǎn)運動，把大生產(chǎn)運動當作鞏固根據(jù)地的重要措施。毛澤東要求黨政工作人員在財政問題上，應(yīng)以90％的精力幫助農(nóng)民增加生產(chǎn)，然后以10％的精力從農(nóng)民取得稅收。他說凡是不注重研究生產(chǎn)，不用主要精力幫助農(nóng)民解決“救民私糧”，只顧向農(nóng)民要“救國公糧”的，就是沾染了國民黨的作風(fēng)，沾染了官僚主義的灰塵，就不是好領(lǐng)導(dǎo)者。凡是不注意生產(chǎn)反而好吃懶做的，不算好軍人，好公民。
當時，日偽軍對根據(jù)地的“掃蕩”、國民黨對根據(jù)地的封鎖，再加上連續(xù)遭到水、旱、蟲等自然災(zāi)害，根據(jù)地幾乎到了沒有飯吃，沒有衣穿，沒有紙、沒有菜，戰(zhàn)士無鞋襪，工作人員冬天無被蓋的境地，人民群眾的生活很貧苦。
1942年8月的一天，陜甘寧邊區(qū)政府小禮堂召開由各縣縣長參加的征糧會議，天下著大雨，突然一聲巨雷，把禮堂的一根木柱子劈斷，有一位縣長當場被雷電觸死。這件事很快傳出去了，有個別群眾說：“為什么雷沒有劈毛主席？”
話傳到毛澤東的耳里，毛澤東沒有追問是誰說的，更不準別人去抓什么“反革命”，而只是向干部了解說這話的原因。通過了解才知道，政府下達的征糧任務(wù)太重，群眾有意見，便借“雷劈”發(fā)泄不滿情緒。這引起了毛澤東的重視，他指示有關(guān)部門將征收20萬擔公糧的任務(wù)，減至16萬擔。毛澤東這樣處理和解決問題，使黨群關(guān)系更加親近了，毛澤東在群眾中的威信更高了。
毛澤東發(fā)動部隊，機關(guān)、學(xué)校開荒種地。他召集延安的各單位負責人開會，非常簡單明確地說：“國民黨不發(fā)軍餉了，我們怎么辦？等著餓死嗎？我想大家都不會同意的。解散回家嗎？我想大家也不會同意。那么怎么辦呢？只有大家動手，開荒種地，解決困難?！?br/>
眾人贊同毛澤東的意見。毛澤東當場表示，他自己也參加開荒種地。多數(shù)人認為，毛澤東的工作太忙，不必參加開荒。有人提出為毛澤東代耕，毛澤東說：
“我一定參加開荒。地點就選在我門口。只開一畝地，不多也不少。我還能自己動手，堅決不要人代耕?！?br/>
毛澤東果然在自己門前選了一塊空地。他白天工作一會，去那里勞動一會，夜間還要通宵工作，沒過多久，他根據(jù)少年在家種田的經(jīng)驗，認為差不多了，讓人認真丈量，果是一畝多地。他在那里種了蔬菜和莊稼，長得很好。
中央其他領(lǐng)導(dǎo)人都親自參加大生產(chǎn)運動。王震率領(lǐng)八路軍359旅，開赴荊棘叢生、野狼成群的南泥灣，開荒26萬畝，把荒無人煙的南泥灣，變成平川稻谷香，遍地是牛羊的“陜北江南”。全旅的經(jīng)濟、物資不僅能全部自給，而且達到了“耕一余一”，向政府交了1萬石公糧。
在大生產(chǎn)運動中農(nóng)民積極參加“變工隊”、“扎工隊”，提高了勞動生產(chǎn)率。到1942年底，全邊區(qū)共開荒180萬畝，增產(chǎn)細糧47萬石。學(xué)校、機關(guān)、部隊做到糧食、經(jīng)費自給或半自給。與此同時，邊區(qū)的工業(yè)、手工業(yè)也有了很大發(fā)展。全邊區(qū)有62個公營工廠，職工近4000人，年產(chǎn)土布10萬匹，這些工廠不僅能煉油、煉鐵，而且能修理機械、制造軍火。全邊區(qū)的公糧任務(wù)，由1942年的16萬擔，到1945年減至12萬擔。群眾增加了生產(chǎn)，又減輕了負擔，生活得到了改善和提高。毛澤東總結(jié)了大生產(chǎn)運動的經(jīng)驗，題了八個大字：“自己動手，豐衣足食?！?br/>
1943年3月16日到20日，中共中央召開政治局會議，討論通過了《中央關(guān)于中央機構(gòu)調(diào)整及精簡的決定》。會議推選毛澤東為中央政治局主席；中央書記處由毛澤東、劉少奇、任弼時3人組成，毛澤東任中央書記處主席。主席有最后決定之權(quán)。中央成立宣傳委員會和組織委員會，毛澤東任宣傳委員會書記，王稼祥任副書記，劉少奇任組織委員會書記。中央任命毛澤東為中央黨校校長，彭真為副校長，任命劉少奇為中央研究局局長，楊尚昆為副局長。
毛澤東身居顯位，能夠保持著謙虛謹慎的作風(fēng)。他說：“群眾是真正的英雄，而我們自己則往往是幼稚可笑的，沒有滿腔的熱忱，沒有眼睛向下的決心，沒有求知的渴望，沒有放下臭架子，甘當小學(xué)生的精神，就不能得到起碼的知識。共產(chǎn)黨員要傾聽人民群眾的意見，要聯(lián)系人民群眾，而不要脫離人民群眾，應(yīng)該站在民眾之中，而決不應(yīng)該站在民眾之上?！?br/>
王明曾在延安“澤東青年干部學(xué)?！遍_學(xué)典禮作《學(xué)習(xí)毛澤東》的演講，說：“青年干部學(xué)校既然以毛澤東同志的光輝名字來命名，那就要名符其實，就是要學(xué)習(xí)毛澤東同志的生平事業(yè)和理論?！薄懊珴蓶|同志則如鶴立雞群一樣英勇堅決地繼續(xù)革命工作?！蓖趺饔终f，要從5個方面學(xué)習(xí)毛澤東，即學(xué)習(xí)毛澤東始終一貫忠于革命的精神，勤于學(xué)習(xí)的精神，勇于創(chuàng)造的精神，長于工作的精神，善于團結(jié)的精神，王明把他的《學(xué)習(xí)毛澤東》的講演稿拿給毛澤東看。毛澤東看后說：
“我的理論一點也不好，不要發(fā)表。”
毛澤東在致中央宣傳部副部長何凱豐的信中說：“我的思想（馬列）自覺沒有成熟，還是學(xué)習(xí)時候，不是鼓吹時候；要鼓吹只宜以某些片斷去鼓吹（例如整風(fēng)文件中的幾件），不宜當作體系去鼓吹，因為我的體系還沒有成熟?！?br/>
毛澤東在寫給延安大學(xué)校長、延安魯迅藝術(shù)學(xué)院院長周揚的信中說：“把我那篇講話配在馬、恩、列、斯……之林，覺得不稱，我的話是不能這樣配的?！?br/>
1943年4月，中共中央開始普遍的審查干部。在審查干部運動中曾一度出現(xiàn)了偏差，對敵情作了過分的估計?？倢W(xué)習(xí)委員會副主任、中共中央社會部長、情報部長康生，在延安干部會議上作《搶救失足者》報告，搞起“逼、供、信”的過火斗爭，在10多天內(nèi)便弄出大批冤假錯案來，還在報紙上公布了一個所謂的大特務(wù)案，案件中的“主犯”已判死刑，即將槍斃。
毛澤東很快發(fā)現(xiàn)了錯誤，即批評道：“簡直是風(fēng)聲鶴唳，草木皆兵，特務(wù)如麻，鬧得人人自危。我們黨的歷史上，在王明、張國燾錯誤路線下，搞審干肅反，傷害了很多好同志。特別是隨便殺人，殺戒一開就難以收住，錯殺了很多好同志，有血的教訓(xùn)。只要有人在，錯了好糾正；人殺了，頭是不能再長出來的，真正的特務(wù)也一個不殺?！?br/>
延安行政學(xué)院被審查的人很多，他們不服，說道：“毛主席、周副主席知道了，一定會給我們平反?！辈簧偃藢懶沤o毛澤東申訴，說他們不是特務(wù)，不是國民黨，不是三青團，但挨了整，被戴上特務(wù)、國民黨、三青團的帽子，要求黨給他們作出實事求是的結(jié)論。
毛澤東看了申訴信，親自到行政學(xué)院，在教職員工和學(xué)員大會上講話，說：“在審干中傷害了不少好同志、冤枉了好人，這像洗澡，為了消毒，在水里放些灰錳氧，但放多了燒壞了皮膚，這很快會好的。有些好同志被錯戴了帽子，我們黨是實事求是的，帽子戴錯了就要把它摘下來，有反必肅，有錯必糾，這就叫做實事求是?！?br/>
毛澤東提出，審干運動必須堅持一個不殺，大部不抓，反對逼供信，重證據(jù)，不重口供的原則，中共中央又發(fā)出一系列甄別平反的指示。
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