蔣介石在廣州籌建軍校工作全面展開的時(shí)候，又以“環(huán)境惡劣，辦事多遭掣肘”為理由，向國(guó)民黨中央提出辭呈，并讓他的英文秘書王登云召售籌備人員說(shuō)：
“蔣先生已決定黃埔軍校不辦了，籌備處馬上解散。馬上就發(fā)給每人遣散費(fèi)?！?br/>
鄧演達(dá)和葉劍英堅(jiān)決反對(duì)散伙，還有一些人表示懷疑。鄧演達(dá)和葉劍英去請(qǐng)示廖仲愷，廖說(shuō)：
“應(yīng)該了解，辦黃埔軍校是黨要辦的，而且一定要辦成。你們應(yīng)以君子愛(ài)人以德的態(tài)度幫助蔣先生。如果黨要辦，蔣先生不要辦，或因此辦不成約定論一種相對(duì)主義的真理觀。奠基人之一是法國(guó)數(shù)學(xué)，蔣先生要開罪于黨，將來(lái)他如果想回來(lái)再參加革命，怕也很困難了。所以籌備工作要照常進(jìn)行?！?br/>
蔣介石還是擅自離開廣州，悄悄地去了上海。
孫中山對(duì)蔣辭職一事批示：“務(wù)須任勞任怨，勉為其難，從難苦中去奮斗，百折不回，以貫徹革命黨犧牲之主張，所請(qǐng)辭職，礙難照準(zhǔn)?！?br/>
蔣介石辭呈中所說(shuō)“辦事多遭掣肘”，實(shí)際上是他反對(duì)聯(lián)俄聯(lián)共，反對(duì)革命。蘇聯(lián)顧問(wèn)為革命說(shuō)了幾句話，他就不高興，拂袖跑到上海去了。蔣介石到上海后給廖仲愷寫信說(shuō)：
以弟觀察，俄黨殊無(wú)誠(chéng)意可言，即弟對(duì)兄言俄人之言只有三分可信者，亦以兄過(guò)信俄人，而不能盡掃兄之興趣也。至其對(duì)孫先生個(gè)人致崇仰之意者，非俄國(guó)共產(chǎn)黨，而乃國(guó)際共產(chǎn)黨員也。至我國(guó)黨員在俄國(guó)者，對(duì)于孫先生惟有詆毀與懷疑而已。俄黨對(duì)中國(guó)之唯一方針，乃在造成中國(guó)共產(chǎn)黨為其正統(tǒng)，決不信吾黨可與始終合作，以互策成功者也。……其故在于中國(guó)人只崇拜外人，而抹殺本國(guó)人之人格，如中國(guó)共產(chǎn)黨員之在俄者，但罵他人為美奴、英奴與日奴，而不知其本身已完全成為一俄奴矣。吾兄如仍以弟言力不足信，而毫不省察，則將來(lái)恐亦不免墮落耳?！茉诙硇袆?dòng)，自覺(jué)無(wú)可為人誹謗之處，亦無(wú)失卻黨體之點(diǎn)，因入共產(chǎn)黨問(wèn)題，而弟以須請(qǐng)命孫先生一語(yǔ)，即以弟為個(gè)人忠臣相譏刺，弟自知個(gè)性如此，殊不能免他人之笑。然而忠臣報(bào)君，不失其報(bào)國(guó)愛(ài)民之心，至于漢奸、漢奴，則賣國(guó)害民而已也。吾愿負(fù)忠臣卑鄙之名，而不愿帶洋奴光榮之銜，竊愿與兄共勉之！
蔣介石的離去引起眾人議論，蘇聯(lián)顧問(wèn)切列潘諾夫則說(shuō)：“蔣介石擔(dān)心，在廣州的軍閥，其中包括滇系軍閥，不贊成創(chuàng)辦黃埔軍校，因而會(huì)解除軍校學(xué)生的武裝，最后會(huì)跟他算賬?！?br/>
方鼎英說(shuō)：“滇軍第3軍軍長(zhǎng)范石生，曾當(dāng)面奚落蔣介石曰：你在黃埔辦什么鳥學(xué)校，你那幾根‘吹火筒’，我只派一營(yíng)人就可完全繳你的械?！?br/>
廣州公安局長(zhǎng)吳鐵城說(shuō)：“這個(gè)膽小鬼是靠不住的。一有風(fēng)吹草動(dòng)，蔣介石為了躲避風(fēng)險(xiǎn)，總是逃跑，躲到一個(gè)安全地方。這次他逃跑了，下次他還照樣逃跑。不能依靠他。”
蔣介石逃跑后，孫中山命廖仲愷代理軍?；I備委員會(huì)委員長(zhǎng)。
經(jīng)廖仲愷的一再催促，經(jīng)孫中山派去的許崇清的勸說(shuō)，蔣介石終于在4月下旬返回廣州。
1924年5月，孫中山任命蔣介石為黃埔軍官學(xué)校校長(zhǎng)兼粵軍總司令部參謀長(zhǎng)，命廖仲愷為軍校黨代表，命王柏齡為軍校教授部主任、葉劍英為副主任、戴季陶為政治部主任、張申府為副主任、李濟(jì)深為教練部主任、鄧演達(dá)為副主任、周駿彥為軍需部主任、俞飛鵬為副主任、林振雄為管理部主任、陳適為副主任、何應(yīng)欽為總教官。
不久，戴季陶、張申府相繼離職，邵元沖繼任政治部主任。邵元沖隨孫中山北上后，便由周恩來(lái)繼任。周恩來(lái)于當(dāng)年8月初自法國(guó)返回，到達(dá)廣州擔(dān)任中共廣東區(qū)委員會(huì)委員長(zhǎng)。還在黃埔軍?；I備期間，廖仲愷、戴季陶就希望張申府能夠推薦一些在國(guó)外學(xué)習(xí)的優(yōu)秀學(xué)生到黃埔軍校來(lái)。張申府是由李大釗介紹，來(lái)廣州擬擔(dān)任廣東大學(xué)圖書館長(zhǎng)的。他一次就開了周恩來(lái)、周佛海等12人的名單給廖仲愷。廖先是聘請(qǐng)周恩來(lái)任黃埔軍校政治教官，后任命為政治部主任。周恩來(lái)精力充沛，學(xué)識(shí)淵博，態(tài)度和藹熱情，工作細(xì)致周詳。
從黃埔軍校于1924年10月建立教導(dǎo)團(tuán)開始，蔣介石逐漸培植自己的軍事力量。蔣介石委托陳果夫等在江、浙、滬招募新兵。又在廣州招考學(xué)兵隊(duì)，培養(yǎng)教導(dǎo)團(tuán)下級(jí)干部。教導(dǎo)團(tuán)1團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)為何應(yīng)欽，2團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)為王柏齡。不久，教導(dǎo)團(tuán)改編為黨軍第一旅，歸蔣介石節(jié)制調(diào)遣。
在軍校教導(dǎo)團(tuán)成立的同時(shí)，又以黃埔軍校學(xué)生為骨干，建立了另一支革命武裝——鐵甲車隊(duì)。這支革命武裝是由周恩來(lái)領(lǐng)導(dǎo)建立起來(lái)的，全隊(duì)150人左右，正副隊(duì)長(zhǎng)徐成章、周士第、以及軍事教官趙自選，黨代表廖乾五、政治教官曹汝謙均為共產(chǎn)黨員。后來(lái)鐵甲車隊(duì)再擴(kuò)充一部分黃埔軍校學(xué)員，建成葉挺獨(dú)立團(tuán)。葉挺曾擔(dān)任孫中山衛(wèi)隊(duì)團(tuán)營(yíng)長(zhǎng)。孫中山派他到蘇聯(lián)學(xué)習(xí)一年多，他在那里加入了共產(chǎn)黨，回國(guó)后便擔(dān)任團(tuán)長(zhǎng)。
廣州是革命力量同反動(dòng)力量決斗的中心。廣州商團(tuán)在英帝國(guó)主義的支持下，從1924年5月開始醞釀叛亂。英帝國(guó)主義分子對(duì)商團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)陳廉伯說(shuō)：“如果你能夠運(yùn)動(dòng)商團(tuán)，反對(duì)政府，我們英國(guó)便幫助你組織商人政府，你陳廉伯就是中國(guó)的華盛頓?！?br/>
陳廉伯于5月27日主持召開“商團(tuán)鄉(xiāng)團(tuán)會(huì)議”，宣布要在8月14日推翻大元帥府取而代之。
孫中山得知這一消息，立即采取措施。8月9日晚，孫中山命長(zhǎng)洲要塞司令蔣介石扣留商團(tuán)購(gòu)買的長(zhǎng)短槍9800支，子彈300多萬(wàn)發(fā)。廣州政府下令通緝陳廉伯。
8月12日，商團(tuán)1000多人列隊(duì)到大元帥府請(qǐng)?jiān)?，要求發(fā)還扣留的槍械，并以罷市相威脅。孫中山揭露了陳廉伯運(yùn)動(dòng)商團(tuán)策劃叛亂的陰謀，要求商團(tuán)自行檢舉陳廉伯的罪行。商團(tuán)竟不服從，25日，廣州商人總罷市。
孫中山、廖仲愷一面派出湘、滇、桂、豫各軍1000多人，進(jìn)駐佛山市區(qū)和鐵路沿線，預(yù)為防范；一面電告各地商會(huì)，曉以大義，明以利害，勸其復(fù)業(yè)，不要附逆作亂。
不料，那些掛著國(guó)民黨招牌的軍閥頭目暗中同商團(tuán)相互勾結(jié)，狼狽為奸。滇軍總司令楊希閔、桂軍總司令劉震寰、湘軍總司令譚延闿、粵軍總司令許崇清、豫軍總司令樊鐘秀、福軍總司令李福林等，以調(diào)停為名，向商團(tuán)暗通款曲，給孫中山施加壓力。尤其是滇軍范石生、廖行超等，竟以“不欲駐地糜爛”為借口，要孫中山緩行軍事處分，他們私下同商團(tuán)密議，提出6項(xiàng)條件，要孫中山接受，即：政府交出所扣槍械；商團(tuán)交納軍費(fèi)50萬(wàn)元；陳廉伯、陳恭受發(fā)表通電擁護(hù)孫中山政府。孫中山幾次向范石生、廖行超曉以大義，明以利害，要他們站在政府立場(chǎng)上，一致對(duì)付商團(tuán)。
范、廖本性難移，就是不聽。孫中山大怒，他召集商團(tuán)頭目和范、廖等人座談，范、廖2人分座在孫中山左右兩側(cè)。孫中山指著范、廖道：“我不怕商團(tuán)聯(lián)合左右兩只老虎向我反噬。”
范威脅孫道：“市面危機(jī)四伏，險(xiǎn)象環(huán)生，萬(wàn)一變故發(fā)生，全局皆壞，所謂小不忍，則亂大謀。在此兩三日內(nèi)，無(wú)論若何，必要解決，否則，我撒手不理，將全軍調(diào)回。”
孫中山聞言，顏色立變，但身受扼制，也無(wú)可如何。范石生還以撤廖仲愷職為條件，要廖仲愷去職。
在右派的壓力下，廖仲愷辭去了廣東省長(zhǎng)職務(wù)，由胡漢民繼任，廣州市長(zhǎng)和公安局長(zhǎng)也換成了同情商團(tuán)的人，并交還了所扣槍械，廣東的人事發(fā)生了變化，商團(tuán)的反動(dòng)氣焰重趨高漲。
10月10日，廣州各界舉行慶祝雙十節(jié)大會(huì)。30多個(gè)愛(ài)國(guó)團(tuán)體和學(xué)生、市民三四萬(wàn)人舉行游行示威，高喊“打倒帝國(guó)主義”、“推翻反動(dòng)軍閥”、“打倒一切反革命派”、“實(shí)行國(guó)民革命”、“復(fù)活辛亥革命精神”等口號(hào)。游行隊(duì)伍在太平路至西豪口之間，與全副武裝的商團(tuán)軍相遇，商團(tuán)團(tuán)丁先是不準(zhǔn)游行隊(duì)伍通過(guò)，繼而開槍，當(dāng)場(chǎng)打死20多人，受傷10多人，被捕10多人。團(tuán)丁將打死的，刨肝剖肺、割頭斷腳，把死尸分成無(wú)數(shù)部分，拿到沿街示眾。次日，商團(tuán)軍封鎖市區(qū)，迫令商店罷市，張貼“打倒孫政府”、“請(qǐng)孫文下野”的反動(dòng)標(biāo)語(yǔ)。
廣東政府立即成立革命委員會(huì)，孫中山為會(huì)長(zhǎng)，廖仲愷、許崇清、汪精衛(wèi)、蔣介石、譚平山、陳友仁為委員，作為平定叛亂的最高指揮機(jī)關(guān)。
孫中山又任命蔣介石為指揮，廖仲愷、譚平山為正副監(jiān)察，負(fù)責(zé)平亂。孫中山限令在24小時(shí)內(nèi)，務(wù)必解除商團(tuán)武裝。孫中山下令由黃埔軍校、鐵甲車隊(duì)、工團(tuán)軍、飛機(jī)隊(duì)、農(nóng)民自衛(wèi)軍、陸軍講武學(xué)校、滇軍干部學(xué)校、兵工廠、吳鐵城的警察部隊(duì)參加平叛戰(zhàn)斗。
10月14日黃昏時(shí)分，政府軍向商團(tuán)軍發(fā)起進(jìn)攻，商團(tuán)軍在西關(guān)一帶架設(shè)天橋、炮臺(tái)、構(gòu)筑街壘，厚建竹木柵，進(jìn)行頑抗。政府軍采用火攻，由消防隊(duì)救火車載煤油噴射連接各馬路的竹柵，引火燃燒。頓時(shí)烈焰沖天，西關(guān)一帶化為火海，街壘路堡，立成灰燼，有1000多家商店也悉數(shù)被焚，商團(tuán)軍不堪火攻，迅即潰散，或繳械投誠(chéng)，或棄甲而走。
陳廉伯在沙面租界內(nèi)指揮，眼看大勢(shì)已去，竄上了英艦，商團(tuán)副團(tuán)長(zhǎng)李頌韶納械請(qǐng)降。另一商團(tuán)頭目陳恭受用巨款收買滇軍，逃往香港。至此，商團(tuán)叛亂被平息。
北京政變后，孫中山感到曹吳倒臺(tái)，廢帝被逐，確實(shí)發(fā)生了有利于革命的變化。他本著和平統(tǒng)一全國(guó)的初衷，認(rèn)為，根本之圖，尤在速謀統(tǒng)一，以從事建設(shè)，庶幾分崩離析之局，得以收拾，長(zhǎng)治久安之策得以實(shí)施。因此，他權(quán)衡輕重，決定即日北上，共籌統(tǒng)一建設(shè)之方略。他任命胡漢民留守廣州代行大元帥職權(quán)，以譚延闿為北伐聯(lián)軍總司令，主持北伐。
11月13日，孫中山偕宋慶齡以及隨行人員汪精衛(wèi)、李烈鈞、陳友仁、邵元沖等30多人，乘永豐艦離粵北上。抵香港后，改乘日本郵船春陽(yáng)丸號(hào)赴上海。
孫中山一行抵達(dá)上海，受到各界群眾1萬(wàn)多人的熱烈歡迎。但當(dāng)上海群眾涌上街頭歡迎孫中山時(shí)，法租界當(dāng)局竟出動(dòng)巡捕驅(qū)散群眾，捕去指揮者數(shù)人，對(duì)于帝國(guó)主義者的挑釁，孫中山發(fā)表聲明說(shuō)：“上海為中國(guó)之領(lǐng)土，吾人分明居主人之地位。住在上海的那些外國(guó)人，都是客人，主人在自己的領(lǐng)土之內(nèi)，無(wú)論干什么，客人完全不能干涉。中國(guó)人民早已不能忍耐外國(guó)僑民在中國(guó)領(lǐng)土上飛揚(yáng)跋扈，要不惜一切努力收回租界?！?br/>
孫中山等離滬繼續(xù)北上，因津浦路受戰(zhàn)爭(zhēng)影響不通車，上海至天津的客輪頭等艙客票已售完，他們便取道日本乘日輪赴天津。在途經(jīng)日本的長(zhǎng)崎、神戶、門司等地時(shí)，受到日本各界人士、旅日華僑和中國(guó)留學(xué)生的歡迎，孫中山多次發(fā)表演說(shuō)和談話，宣傳對(duì)時(shí)局的主張。
孫中山一行抵達(dá)天津時(shí)，國(guó)民黨舉行歡迎孫中山的活動(dòng)受到外國(guó)帝國(guó)主義者的阻撓，法捕房拘捕了國(guó)民黨發(fā)傳單的人，國(guó)民黨的直隸省黨部和天津市黨部被法捕房查抄，禁止孫中山出席在國(guó)民飯店的宴會(huì)，但天津人民熱烈歡迎孫中山的來(lái)臨。共產(chǎn)黨北方黨組織派趙世炎專程赴天津迎接。中共天津地委聯(lián)絡(luò)天津各團(tuán)體，發(fā)起成立天津市民歡迎孫中山籌備會(huì)，孫中山抵達(dá)天津碼頭時(shí)，50多個(gè)團(tuán)體2萬(wàn)多群眾前往歡迎。市民自動(dòng)張燈結(jié)彩，燃放鞭炮。當(dāng)晚又舉行了歡迎孫中山的茶會(huì)，孫中山因病不能赴會(huì)，派代表出席。馬千里、鄧穎超等赴孫中山住所張家花園向?qū)O表示慰問(wèn)。
孫中山抵津，首先對(duì)張作霖作禮貌上的訪問(wèn)。次日，張作霖到張家花園回拜，孫中山正在靜臥中，孫科表示謝絕客人。張作霖一面昂然而入，一面回答說(shuō)：
“今天我來(lái)向?qū)O先生說(shuō)話，孫先生可以睡在床上，不必開口回答?！?br/>
張作霖關(guān)起門來(lái)同孫中山密談，勸孫放棄聯(lián)俄、聯(lián)共政策，說(shuō)這是外國(guó)公使反對(duì)的，而外國(guó)人是不好惹的；他愿代孫疏通外國(guó)人的感情，又保證說(shuō)：
“這事包在我張作霖一人身上，一定可以成功?！?br/>
孫中山聽了，又好氣，又好笑。
段祺瑞派葉恭綽、許世英來(lái)天津名為歡迎孫中山，實(shí)則要?jiǎng)裾f(shuō)孫中山不要“過(guò)于激烈”，以免引起“列強(qiáng)干涉”。孫中山在病榻上接見了葉、許。許世英向?qū)O中山報(bào)告了段祺瑞所謂“外崇國(guó)信”的聲明和善后會(huì)議條例。孫中山大怒，厲聲問(wèn)道：
“我在外面要廢除那些不平等條約，你們?cè)诒本┢匾鹬啬切┎黄降葪l約，這是什么道理？你們要升官發(fā)財(cái)，怕那些外國(guó)人，要尊重他們，為什么還來(lái)歡迎我？假如不打倒帝國(guó)主義，我就不革命了！”
孫中山這次震怒，使他的肝病加劇。孫中山因?yàn)橹毕弟婇y還在興風(fēng)作浪，不愿授人以隙，所以仍然扶病入京，打算采取政治斗爭(zhēng)的方式，以改變直系倒臺(tái)后的“換湯不換藥”的局面。
北京前門車站10余萬(wàn)群眾熱烈歡迎孫中山。中共北京地委在孫中山下榻的北京飯店門前，組織群眾舉行歡迎會(huì)，表達(dá)北京人民對(duì)孫中山的歡迎和愛(ài)戴之忱。孫中山因病情沉重，無(wú)法直接向群眾講演，發(fā)表了書面談話和《入京宣言》。
馮玉祥讓夫人李德全持親筆信去看望孫中山。孫將6000本《三民主義》、1000本《建國(guó)大綱》和《建國(guó)方略》，贈(zèng)送給馮，由李德全帶回，馮將這些書作為國(guó)民軍官兵的教材。
孫中山患的是不治之癥——肝癌。他在重病中仍然領(lǐng)導(dǎo)國(guó)民黨抵制段祺瑞的“善后會(huì)議”，籌劃召開國(guó)民會(huì)議。當(dāng)時(shí)，國(guó)民黨中央政治委員會(huì)委員僅汪精衛(wèi)一人在京，孫中山?jīng)Q定加派于右任、李大釗、陳友仁、吳稚暉、李石曾5人為委員，并手諭設(shè)立北京政治委員會(huì)，負(fù)責(zé)處理日常事務(wù)。
1925年2月24日，孫中山口授遺囑及家事遺囑，由汪精衛(wèi)筆記，并以英語(yǔ)口授致蘇聯(lián)遺書，由鮑羅廷、陳友仁、宋子文、孫科等筆記。
3月11日，孫中山在遺囑及遺書上簽字，隨后又對(duì)周圍的人說(shuō)：
“我死了，四面都是敵人，你們是很危險(xiǎn)的，希望你們不要為敵人軟化?！?br/>
孫中山在彌留之際，用微弱的聲音呼喊：“和平、奮斗、救中國(guó)?！?br/>
3月12日9時(shí)30分，孫中山與世長(zhǎng)辭，終年59歲。
孫中山的《遺囑》是：
余致力于國(guó)民革命凡40年，其目的在求中國(guó)之自由平等，積40年之經(jīng)驗(yàn)，深知欲達(dá)到此目的，必須喚起民眾及聯(lián)合世界上以平等待我之民族，共同奮斗。
現(xiàn)在革命尚未成功。凡我同志，務(wù)須依照余所著《建國(guó)方略》、《建國(guó)大綱》、《三民主義》及《第一次全國(guó)代表大會(huì)宣言》，繼續(xù)努力，以求貫徹，最近主張開國(guó)民會(huì)議及廢除不平等條約，尤須于最短期間促其實(shí)現(xiàn)。是所至囑！
北京75萬(wàn)人先后在孫中山靈堂前致祭。共產(chǎn)黨人李大釗、林伯渠等參加了守靈和執(zhí)拂。
4月2日，孫中山靈柩移奉西山碧云寺，參加送靈的達(dá)30余萬(wàn)人，并有2萬(wàn)多名學(xué)生。學(xué)生、軍人和工人等沿途散發(fā)宣傳孫中山關(guān)于召開國(guó)民會(huì)議和廢除不平等條約的傳單，并高呼“打倒軍閥”、“打倒帝國(guó)主義”、“中山主義萬(wàn)歲”、“國(guó)民革命萬(wàn)歲”等口號(hào)。北京和全國(guó)各地群眾悼念孫中山的活動(dòng)，形成了一次廣泛強(qiáng)大的政治宣傳運(yùn)動(dòng)。
廣東革命政府在平定商團(tuán)叛亂后，陳炯明乘孫中山北上之機(jī)自封為“粵軍總司令”，下令進(jìn)攻廣州，在陳炯明的指揮下，葉舉、洪兆麟部集中惠陽(yáng)、平山，向石灘進(jìn)犯，謀窺廣州；林虎一部向龍門、增城北面進(jìn)擾，以策應(yīng)葉舉部而夾擊廣州；林虎另一部則向贛邊之南聚集，企圖切斷北伐軍之后路。
1925年1月25日，廣東革命政府決定討伐陳炯明，遂將許崇清的建國(guó)粵軍、楊希閔的建國(guó)滇軍、劉震寰的建國(guó)桂軍、譚延的建國(guó)湘軍及黃埔軍校學(xué)生隊(duì)、兩個(gè)教導(dǎo)團(tuán)，組成東征聯(lián)軍，以楊希閔為聯(lián)軍總司令。
東征聯(lián)軍分左、中、右3路。根據(jù)蘇聯(lián)軍事顧問(wèn)加倫的建議，右路軍由粵軍和黃埔軍校組成，由許崇清統(tǒng)率，肅清廣九鐵路沿線的敵軍，然后向淡水、平山、海豐、汕頭一線進(jìn)攻；左路軍由楊希閔的滇軍擔(dān)任，向河源、五華、興華一線推進(jìn)；中路軍由劉震寰的桂軍擔(dān)任，攻占惠州城并策應(yīng)兩翼。
2月10日前，右路軍完全占領(lǐng)廣九鐵路，接著便攻取淡水。右路軍決心采取速戰(zhàn)速?zèng)Q的戰(zhàn)法，爭(zhēng)取惠州敵援軍尚未趕到之前占領(lǐng)淡水，并以黃埔教導(dǎo)團(tuán)為攻城主力，攻淡水之東南，粵軍第2師攻城之西北，攔截北面增援之?dāng)?，粵軍?dú)立第7旅攻城之東北。
黃埔校軍由蔣介石以粵軍總司令部參謀長(zhǎng)和黃埔軍校校長(zhǎng)名義統(tǒng)率，黨代表廖仲愷、政治部主任周恩來(lái)、蘇聯(lián)顧問(wèn)斯捷潘諾夫、什涅伊杰爾參加指揮作戰(zhàn)。周恩來(lái)指示鐵甲車隊(duì)一部參加?xùn)|征。周恩來(lái)還組織了由共產(chǎn)黨員參加的宣傳隊(duì)，將50萬(wàn)份致士兵的傳單、10萬(wàn)份致農(nóng)民的傳單，5萬(wàn)份革命歌曲帶到前線散發(fā)?；涇姀埫襁_(dá)的第2師以及第7獨(dú)立旅，亦納入校軍。
2月14日，校軍教導(dǎo)團(tuán)組織敢死隊(duì)，由8名共產(chǎn)黨員學(xué)員和2名國(guó)民黨員軍官及100名士兵組成。次日清晨，在炮兵及步機(jī)槍猛烈火力掩護(hù)下，用云梯攀登入城，進(jìn)入淡水城內(nèi)和敵軍巷戰(zhàn)肉搏，全殲守?cái)场?br/>
敵援軍洪兆麟部趕到，在淡水城東北同粵軍第7獨(dú)立旅、教導(dǎo)團(tuán)一部展開激戰(zhàn)，教導(dǎo)二團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)王柏齡臨陣走脫，共產(chǎn)黨員陳賡等主動(dòng)率學(xué)生軍迎擊敵人。師長(zhǎng)張民達(dá)、參謀長(zhǎng)葉劍英率粵軍第2師及第7獨(dú)立旅配合作戰(zhàn)，激戰(zhàn)至傍晚，敵援軍退去。戰(zhàn)役結(jié)束后，蔣介石免去王柏齡團(tuán)長(zhǎng)職務(wù)，由沈應(yīng)時(shí)接任，沈負(fù)傷后，由錢大鈞代理。
右路軍兵分兩路攻擊海豐。共產(chǎn)黨員彭湃領(lǐng)導(dǎo)農(nóng)民群眾，立即將過(guò)去埋藏地下的土槍、土炮等武器挖出來(lái)加以修理。農(nóng)民群眾踴躍擔(dān)任運(yùn)輸、向?qū)А商揭灾翈椭谥?zhàn)壕，襲擊小股敵軍，直接參戰(zhàn)。
3月1日，右路軍在農(nóng)民群眾的配合下，順利拿下海豐，又在以后的幾天內(nèi)控制了整個(gè)潮汕地區(qū)。
由于滇桂軍閥劉震寰、楊希閔同陳炯明、林虎早有密約，東征聯(lián)軍之左路軍和中路軍始終按兵不動(dòng)，致使林虎得以從容集中其主力2萬(wàn)多人，從興寧、梅縣等地南下，陰謀一舉將右路軍殲滅于揭陽(yáng)、潮汕之間。林虎軍素以強(qiáng)悍著稱，是陳明炯主力。3月13日，雙方在棉湖遭遇，展開一場(chǎng)激戰(zhàn)。參加右路軍作戰(zhàn)的，除粵軍許濟(jì)旅、黃埔教導(dǎo)團(tuán)外，還有陳銘樞旅、吳鐵城旅。張民達(dá)師留守潮汕。
這是一場(chǎng)惡戰(zhàn)。黃埔教導(dǎo)團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)何應(yīng)欽親自率領(lǐng)衛(wèi)士隊(duì)手機(jī)槍排，把沖入陣地之?dāng)炒蛲耍l(wèi)士死傷多人，情勢(shì)極其危險(xiǎn)。蔣介石眼見這種情況，頗感憂慮，對(duì)何應(yīng)欽說(shuō)：
“何團(tuán)長(zhǎng)，你要堅(jiān)持，必須想辦法挽回局勢(shì)，我們不能后退一步，假如今天在此地失敗了，我們就一切都完了，再無(wú)希望返回廣州了，革命事業(yè)也得遭到嚴(yán)重挫折?！?br/>
蔣介石轉(zhuǎn)過(guò)去詢問(wèn)炮兵連長(zhǎng)陳誠(chéng)說(shuō)：“為什么6門大炮都打不響了，能不能再試一試?！?br/>
隨即，蔣介石及蘇聯(lián)顧問(wèn)跟著陳誠(chéng)來(lái)到炮兵陣地。
陳誠(chéng)把一門山炮加以調(diào)整，裝上炮彈，對(duì)準(zhǔn)正聚集在前方小河對(duì)岸的幾百敵軍，親自拉火，事有湊巧，果然一炮打響了，炮彈正落在這群敵人中間爆炸，打死了幾十個(gè)敵人，敵人一哄而散，向后奔逃。接著幾門炮都打響了，且打中目標(biāo)，幾處敵人紛紛后退。黃埔軍官兵突然士氣大振，奮勇反攻。
黃埔教導(dǎo)二團(tuán)進(jìn)擊鯉湖附近，等待蔣介石的命令，久候不得，雖然聽到一團(tuán)劇烈的槍炮聲，但團(tuán)長(zhǎng)錢大鈞不知當(dāng)機(jī)立斷，坐失良機(jī)，后來(lái)營(yíng)長(zhǎng)劉堯宸實(shí)在忍耐不住，獨(dú)自率領(lǐng)本營(yíng)前進(jìn)，同林虎的總預(yù)備隊(duì)展開戰(zhàn)斗。錢大鈞聽到劉營(yíng)戰(zhàn)斗的槍聲，才命令全團(tuán)迅速加入戰(zhàn)斗，實(shí)行猛攻。林虎沒(méi)有想到側(cè)后方會(huì)遭到如此猛烈襲擊，事出意外，手足無(wú)措，只好后退。林軍頓時(shí)陷入混亂狀態(tài)，全線潰退。
3月19日，黃埔教導(dǎo)團(tuán)二團(tuán)及陳銘樞旅經(jīng)五華冒雨進(jìn)攻興寧，首先擊敗城外守?cái)常缓蟀l(fā)起攻城，教導(dǎo)一團(tuán)亦從五華趕到，協(xié)同作戰(zhàn)。經(jīng)過(guò)激烈戰(zhàn)斗，重創(chuàng)敵軍，林虎率殘部向東逃竄，右路軍乘勝向梅縣追擊，林虎軍棄梅縣縣城落荒而逃。
陳炯明殘部先后退出東江地區(qū)，向閩贛邊境逃竄，困守惠州的陳軍楊坤如部，經(jīng)廖仲愷派員勸降，楊坤如被迫宣布下野，楊部被改編為滇軍第8、9兩師。至此，第一次東征勝利結(jié)束，陳炯明再度逃到香港。
“蔣先生已決定黃埔軍校不辦了，籌備處馬上解散。馬上就發(fā)給每人遣散費(fèi)?！?br/>
鄧演達(dá)和葉劍英堅(jiān)決反對(duì)散伙，還有一些人表示懷疑。鄧演達(dá)和葉劍英去請(qǐng)示廖仲愷，廖說(shuō)：
“應(yīng)該了解，辦黃埔軍校是黨要辦的，而且一定要辦成。你們應(yīng)以君子愛(ài)人以德的態(tài)度幫助蔣先生。如果黨要辦，蔣先生不要辦，或因此辦不成約定論一種相對(duì)主義的真理觀。奠基人之一是法國(guó)數(shù)學(xué)，蔣先生要開罪于黨，將來(lái)他如果想回來(lái)再參加革命，怕也很困難了。所以籌備工作要照常進(jìn)行?！?br/>
蔣介石還是擅自離開廣州，悄悄地去了上海。
孫中山對(duì)蔣辭職一事批示：“務(wù)須任勞任怨，勉為其難，從難苦中去奮斗，百折不回，以貫徹革命黨犧牲之主張，所請(qǐng)辭職，礙難照準(zhǔn)?！?br/>
蔣介石辭呈中所說(shuō)“辦事多遭掣肘”，實(shí)際上是他反對(duì)聯(lián)俄聯(lián)共，反對(duì)革命。蘇聯(lián)顧問(wèn)為革命說(shuō)了幾句話，他就不高興，拂袖跑到上海去了。蔣介石到上海后給廖仲愷寫信說(shuō)：
以弟觀察，俄黨殊無(wú)誠(chéng)意可言，即弟對(duì)兄言俄人之言只有三分可信者，亦以兄過(guò)信俄人，而不能盡掃兄之興趣也。至其對(duì)孫先生個(gè)人致崇仰之意者，非俄國(guó)共產(chǎn)黨，而乃國(guó)際共產(chǎn)黨員也。至我國(guó)黨員在俄國(guó)者，對(duì)于孫先生惟有詆毀與懷疑而已。俄黨對(duì)中國(guó)之唯一方針，乃在造成中國(guó)共產(chǎn)黨為其正統(tǒng)，決不信吾黨可與始終合作，以互策成功者也。……其故在于中國(guó)人只崇拜外人，而抹殺本國(guó)人之人格，如中國(guó)共產(chǎn)黨員之在俄者，但罵他人為美奴、英奴與日奴，而不知其本身已完全成為一俄奴矣。吾兄如仍以弟言力不足信，而毫不省察，則將來(lái)恐亦不免墮落耳?！茉诙硇袆?dòng)，自覺(jué)無(wú)可為人誹謗之處，亦無(wú)失卻黨體之點(diǎn)，因入共產(chǎn)黨問(wèn)題，而弟以須請(qǐng)命孫先生一語(yǔ)，即以弟為個(gè)人忠臣相譏刺，弟自知個(gè)性如此，殊不能免他人之笑。然而忠臣報(bào)君，不失其報(bào)國(guó)愛(ài)民之心，至于漢奸、漢奴，則賣國(guó)害民而已也。吾愿負(fù)忠臣卑鄙之名，而不愿帶洋奴光榮之銜，竊愿與兄共勉之！
蔣介石的離去引起眾人議論，蘇聯(lián)顧問(wèn)切列潘諾夫則說(shuō)：“蔣介石擔(dān)心，在廣州的軍閥，其中包括滇系軍閥，不贊成創(chuàng)辦黃埔軍校，因而會(huì)解除軍校學(xué)生的武裝，最后會(huì)跟他算賬?！?br/>
方鼎英說(shuō)：“滇軍第3軍軍長(zhǎng)范石生，曾當(dāng)面奚落蔣介石曰：你在黃埔辦什么鳥學(xué)校，你那幾根‘吹火筒’，我只派一營(yíng)人就可完全繳你的械?！?br/>
廣州公安局長(zhǎng)吳鐵城說(shuō)：“這個(gè)膽小鬼是靠不住的。一有風(fēng)吹草動(dòng)，蔣介石為了躲避風(fēng)險(xiǎn)，總是逃跑，躲到一個(gè)安全地方。這次他逃跑了，下次他還照樣逃跑。不能依靠他。”
蔣介石逃跑后，孫中山命廖仲愷代理軍?；I備委員會(huì)委員長(zhǎng)。
經(jīng)廖仲愷的一再催促，經(jīng)孫中山派去的許崇清的勸說(shuō)，蔣介石終于在4月下旬返回廣州。
1924年5月，孫中山任命蔣介石為黃埔軍官學(xué)校校長(zhǎng)兼粵軍總司令部參謀長(zhǎng)，命廖仲愷為軍校黨代表，命王柏齡為軍校教授部主任、葉劍英為副主任、戴季陶為政治部主任、張申府為副主任、李濟(jì)深為教練部主任、鄧演達(dá)為副主任、周駿彥為軍需部主任、俞飛鵬為副主任、林振雄為管理部主任、陳適為副主任、何應(yīng)欽為總教官。
不久，戴季陶、張申府相繼離職，邵元沖繼任政治部主任。邵元沖隨孫中山北上后，便由周恩來(lái)繼任。周恩來(lái)于當(dāng)年8月初自法國(guó)返回，到達(dá)廣州擔(dān)任中共廣東區(qū)委員會(huì)委員長(zhǎng)。還在黃埔軍?；I備期間，廖仲愷、戴季陶就希望張申府能夠推薦一些在國(guó)外學(xué)習(xí)的優(yōu)秀學(xué)生到黃埔軍校來(lái)。張申府是由李大釗介紹，來(lái)廣州擬擔(dān)任廣東大學(xué)圖書館長(zhǎng)的。他一次就開了周恩來(lái)、周佛海等12人的名單給廖仲愷。廖先是聘請(qǐng)周恩來(lái)任黃埔軍校政治教官，后任命為政治部主任。周恩來(lái)精力充沛，學(xué)識(shí)淵博，態(tài)度和藹熱情，工作細(xì)致周詳。
從黃埔軍校于1924年10月建立教導(dǎo)團(tuán)開始，蔣介石逐漸培植自己的軍事力量。蔣介石委托陳果夫等在江、浙、滬招募新兵。又在廣州招考學(xué)兵隊(duì)，培養(yǎng)教導(dǎo)團(tuán)下級(jí)干部。教導(dǎo)團(tuán)1團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)為何應(yīng)欽，2團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)為王柏齡。不久，教導(dǎo)團(tuán)改編為黨軍第一旅，歸蔣介石節(jié)制調(diào)遣。
在軍校教導(dǎo)團(tuán)成立的同時(shí)，又以黃埔軍校學(xué)生為骨干，建立了另一支革命武裝——鐵甲車隊(duì)。這支革命武裝是由周恩來(lái)領(lǐng)導(dǎo)建立起來(lái)的，全隊(duì)150人左右，正副隊(duì)長(zhǎng)徐成章、周士第、以及軍事教官趙自選，黨代表廖乾五、政治教官曹汝謙均為共產(chǎn)黨員。后來(lái)鐵甲車隊(duì)再擴(kuò)充一部分黃埔軍校學(xué)員，建成葉挺獨(dú)立團(tuán)。葉挺曾擔(dān)任孫中山衛(wèi)隊(duì)團(tuán)營(yíng)長(zhǎng)。孫中山派他到蘇聯(lián)學(xué)習(xí)一年多，他在那里加入了共產(chǎn)黨，回國(guó)后便擔(dān)任團(tuán)長(zhǎng)。
廣州是革命力量同反動(dòng)力量決斗的中心。廣州商團(tuán)在英帝國(guó)主義的支持下，從1924年5月開始醞釀叛亂。英帝國(guó)主義分子對(duì)商團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)陳廉伯說(shuō)：“如果你能夠運(yùn)動(dòng)商團(tuán)，反對(duì)政府，我們英國(guó)便幫助你組織商人政府，你陳廉伯就是中國(guó)的華盛頓?！?br/>
陳廉伯于5月27日主持召開“商團(tuán)鄉(xiāng)團(tuán)會(huì)議”，宣布要在8月14日推翻大元帥府取而代之。
孫中山得知這一消息，立即采取措施。8月9日晚，孫中山命長(zhǎng)洲要塞司令蔣介石扣留商團(tuán)購(gòu)買的長(zhǎng)短槍9800支，子彈300多萬(wàn)發(fā)。廣州政府下令通緝陳廉伯。
8月12日，商團(tuán)1000多人列隊(duì)到大元帥府請(qǐng)?jiān)?，要求發(fā)還扣留的槍械，并以罷市相威脅。孫中山揭露了陳廉伯運(yùn)動(dòng)商團(tuán)策劃叛亂的陰謀，要求商團(tuán)自行檢舉陳廉伯的罪行。商團(tuán)竟不服從，25日，廣州商人總罷市。
孫中山、廖仲愷一面派出湘、滇、桂、豫各軍1000多人，進(jìn)駐佛山市區(qū)和鐵路沿線，預(yù)為防范；一面電告各地商會(huì)，曉以大義，明以利害，勸其復(fù)業(yè)，不要附逆作亂。
不料，那些掛著國(guó)民黨招牌的軍閥頭目暗中同商團(tuán)相互勾結(jié)，狼狽為奸。滇軍總司令楊希閔、桂軍總司令劉震寰、湘軍總司令譚延闿、粵軍總司令許崇清、豫軍總司令樊鐘秀、福軍總司令李福林等，以調(diào)停為名，向商團(tuán)暗通款曲，給孫中山施加壓力。尤其是滇軍范石生、廖行超等，竟以“不欲駐地糜爛”為借口，要孫中山緩行軍事處分，他們私下同商團(tuán)密議，提出6項(xiàng)條件，要孫中山接受，即：政府交出所扣槍械；商團(tuán)交納軍費(fèi)50萬(wàn)元；陳廉伯、陳恭受發(fā)表通電擁護(hù)孫中山政府。孫中山幾次向范石生、廖行超曉以大義，明以利害，要他們站在政府立場(chǎng)上，一致對(duì)付商團(tuán)。
范、廖本性難移，就是不聽。孫中山大怒，他召集商團(tuán)頭目和范、廖等人座談，范、廖2人分座在孫中山左右兩側(cè)。孫中山指著范、廖道：“我不怕商團(tuán)聯(lián)合左右兩只老虎向我反噬。”
范威脅孫道：“市面危機(jī)四伏，險(xiǎn)象環(huán)生，萬(wàn)一變故發(fā)生，全局皆壞，所謂小不忍，則亂大謀。在此兩三日內(nèi)，無(wú)論若何，必要解決，否則，我撒手不理，將全軍調(diào)回。”
孫中山聞言，顏色立變，但身受扼制，也無(wú)可如何。范石生還以撤廖仲愷職為條件，要廖仲愷去職。
在右派的壓力下，廖仲愷辭去了廣東省長(zhǎng)職務(wù)，由胡漢民繼任，廣州市長(zhǎng)和公安局長(zhǎng)也換成了同情商團(tuán)的人，并交還了所扣槍械，廣東的人事發(fā)生了變化，商團(tuán)的反動(dòng)氣焰重趨高漲。
10月10日，廣州各界舉行慶祝雙十節(jié)大會(huì)。30多個(gè)愛(ài)國(guó)團(tuán)體和學(xué)生、市民三四萬(wàn)人舉行游行示威，高喊“打倒帝國(guó)主義”、“推翻反動(dòng)軍閥”、“打倒一切反革命派”、“實(shí)行國(guó)民革命”、“復(fù)活辛亥革命精神”等口號(hào)。游行隊(duì)伍在太平路至西豪口之間，與全副武裝的商團(tuán)軍相遇，商團(tuán)團(tuán)丁先是不準(zhǔn)游行隊(duì)伍通過(guò)，繼而開槍，當(dāng)場(chǎng)打死20多人，受傷10多人，被捕10多人。團(tuán)丁將打死的，刨肝剖肺、割頭斷腳，把死尸分成無(wú)數(shù)部分，拿到沿街示眾。次日，商團(tuán)軍封鎖市區(qū)，迫令商店罷市，張貼“打倒孫政府”、“請(qǐng)孫文下野”的反動(dòng)標(biāo)語(yǔ)。
廣東政府立即成立革命委員會(huì)，孫中山為會(huì)長(zhǎng)，廖仲愷、許崇清、汪精衛(wèi)、蔣介石、譚平山、陳友仁為委員，作為平定叛亂的最高指揮機(jī)關(guān)。
孫中山又任命蔣介石為指揮，廖仲愷、譚平山為正副監(jiān)察，負(fù)責(zé)平亂。孫中山限令在24小時(shí)內(nèi)，務(wù)必解除商團(tuán)武裝。孫中山下令由黃埔軍校、鐵甲車隊(duì)、工團(tuán)軍、飛機(jī)隊(duì)、農(nóng)民自衛(wèi)軍、陸軍講武學(xué)校、滇軍干部學(xué)校、兵工廠、吳鐵城的警察部隊(duì)參加平叛戰(zhàn)斗。
10月14日黃昏時(shí)分，政府軍向商團(tuán)軍發(fā)起進(jìn)攻，商團(tuán)軍在西關(guān)一帶架設(shè)天橋、炮臺(tái)、構(gòu)筑街壘，厚建竹木柵，進(jìn)行頑抗。政府軍采用火攻，由消防隊(duì)救火車載煤油噴射連接各馬路的竹柵，引火燃燒。頓時(shí)烈焰沖天，西關(guān)一帶化為火海，街壘路堡，立成灰燼，有1000多家商店也悉數(shù)被焚，商團(tuán)軍不堪火攻，迅即潰散，或繳械投誠(chéng)，或棄甲而走。
陳廉伯在沙面租界內(nèi)指揮，眼看大勢(shì)已去，竄上了英艦，商團(tuán)副團(tuán)長(zhǎng)李頌韶納械請(qǐng)降。另一商團(tuán)頭目陳恭受用巨款收買滇軍，逃往香港。至此，商團(tuán)叛亂被平息。
北京政變后，孫中山感到曹吳倒臺(tái)，廢帝被逐，確實(shí)發(fā)生了有利于革命的變化。他本著和平統(tǒng)一全國(guó)的初衷，認(rèn)為，根本之圖，尤在速謀統(tǒng)一，以從事建設(shè)，庶幾分崩離析之局，得以收拾，長(zhǎng)治久安之策得以實(shí)施。因此，他權(quán)衡輕重，決定即日北上，共籌統(tǒng)一建設(shè)之方略。他任命胡漢民留守廣州代行大元帥職權(quán)，以譚延闿為北伐聯(lián)軍總司令，主持北伐。
11月13日，孫中山偕宋慶齡以及隨行人員汪精衛(wèi)、李烈鈞、陳友仁、邵元沖等30多人，乘永豐艦離粵北上。抵香港后，改乘日本郵船春陽(yáng)丸號(hào)赴上海。
孫中山一行抵達(dá)上海，受到各界群眾1萬(wàn)多人的熱烈歡迎。但當(dāng)上海群眾涌上街頭歡迎孫中山時(shí)，法租界當(dāng)局竟出動(dòng)巡捕驅(qū)散群眾，捕去指揮者數(shù)人，對(duì)于帝國(guó)主義者的挑釁，孫中山發(fā)表聲明說(shuō)：“上海為中國(guó)之領(lǐng)土，吾人分明居主人之地位。住在上海的那些外國(guó)人，都是客人，主人在自己的領(lǐng)土之內(nèi)，無(wú)論干什么，客人完全不能干涉。中國(guó)人民早已不能忍耐外國(guó)僑民在中國(guó)領(lǐng)土上飛揚(yáng)跋扈，要不惜一切努力收回租界?！?br/>
孫中山等離滬繼續(xù)北上，因津浦路受戰(zhàn)爭(zhēng)影響不通車，上海至天津的客輪頭等艙客票已售完，他們便取道日本乘日輪赴天津。在途經(jīng)日本的長(zhǎng)崎、神戶、門司等地時(shí)，受到日本各界人士、旅日華僑和中國(guó)留學(xué)生的歡迎，孫中山多次發(fā)表演說(shuō)和談話，宣傳對(duì)時(shí)局的主張。
孫中山一行抵達(dá)天津時(shí)，國(guó)民黨舉行歡迎孫中山的活動(dòng)受到外國(guó)帝國(guó)主義者的阻撓，法捕房拘捕了國(guó)民黨發(fā)傳單的人，國(guó)民黨的直隸省黨部和天津市黨部被法捕房查抄，禁止孫中山出席在國(guó)民飯店的宴會(huì)，但天津人民熱烈歡迎孫中山的來(lái)臨。共產(chǎn)黨北方黨組織派趙世炎專程赴天津迎接。中共天津地委聯(lián)絡(luò)天津各團(tuán)體，發(fā)起成立天津市民歡迎孫中山籌備會(huì)，孫中山抵達(dá)天津碼頭時(shí)，50多個(gè)團(tuán)體2萬(wàn)多群眾前往歡迎。市民自動(dòng)張燈結(jié)彩，燃放鞭炮。當(dāng)晚又舉行了歡迎孫中山的茶會(huì)，孫中山因病不能赴會(huì)，派代表出席。馬千里、鄧穎超等赴孫中山住所張家花園向?qū)O表示慰問(wèn)。
孫中山抵津，首先對(duì)張作霖作禮貌上的訪問(wèn)。次日，張作霖到張家花園回拜，孫中山正在靜臥中，孫科表示謝絕客人。張作霖一面昂然而入，一面回答說(shuō)：
“今天我來(lái)向?qū)O先生說(shuō)話，孫先生可以睡在床上，不必開口回答?！?br/>
張作霖關(guān)起門來(lái)同孫中山密談，勸孫放棄聯(lián)俄、聯(lián)共政策，說(shuō)這是外國(guó)公使反對(duì)的，而外國(guó)人是不好惹的；他愿代孫疏通外國(guó)人的感情，又保證說(shuō)：
“這事包在我張作霖一人身上，一定可以成功?！?br/>
孫中山聽了，又好氣，又好笑。
段祺瑞派葉恭綽、許世英來(lái)天津名為歡迎孫中山，實(shí)則要?jiǎng)裾f(shuō)孫中山不要“過(guò)于激烈”，以免引起“列強(qiáng)干涉”。孫中山在病榻上接見了葉、許。許世英向?qū)O中山報(bào)告了段祺瑞所謂“外崇國(guó)信”的聲明和善后會(huì)議條例。孫中山大怒，厲聲問(wèn)道：
“我在外面要廢除那些不平等條約，你們?cè)诒本┢匾鹬啬切┎黄降葪l約，這是什么道理？你們要升官發(fā)財(cái)，怕那些外國(guó)人，要尊重他們，為什么還來(lái)歡迎我？假如不打倒帝國(guó)主義，我就不革命了！”
孫中山這次震怒，使他的肝病加劇。孫中山因?yàn)橹毕弟婇y還在興風(fēng)作浪，不愿授人以隙，所以仍然扶病入京，打算采取政治斗爭(zhēng)的方式，以改變直系倒臺(tái)后的“換湯不換藥”的局面。
北京前門車站10余萬(wàn)群眾熱烈歡迎孫中山。中共北京地委在孫中山下榻的北京飯店門前，組織群眾舉行歡迎會(huì)，表達(dá)北京人民對(duì)孫中山的歡迎和愛(ài)戴之忱。孫中山因病情沉重，無(wú)法直接向群眾講演，發(fā)表了書面談話和《入京宣言》。
馮玉祥讓夫人李德全持親筆信去看望孫中山。孫將6000本《三民主義》、1000本《建國(guó)大綱》和《建國(guó)方略》，贈(zèng)送給馮，由李德全帶回，馮將這些書作為國(guó)民軍官兵的教材。
孫中山患的是不治之癥——肝癌。他在重病中仍然領(lǐng)導(dǎo)國(guó)民黨抵制段祺瑞的“善后會(huì)議”，籌劃召開國(guó)民會(huì)議。當(dāng)時(shí)，國(guó)民黨中央政治委員會(huì)委員僅汪精衛(wèi)一人在京，孫中山?jīng)Q定加派于右任、李大釗、陳友仁、吳稚暉、李石曾5人為委員，并手諭設(shè)立北京政治委員會(huì)，負(fù)責(zé)處理日常事務(wù)。
1925年2月24日，孫中山口授遺囑及家事遺囑，由汪精衛(wèi)筆記，并以英語(yǔ)口授致蘇聯(lián)遺書，由鮑羅廷、陳友仁、宋子文、孫科等筆記。
3月11日，孫中山在遺囑及遺書上簽字，隨后又對(duì)周圍的人說(shuō)：
“我死了，四面都是敵人，你們是很危險(xiǎn)的，希望你們不要為敵人軟化?！?br/>
孫中山在彌留之際，用微弱的聲音呼喊：“和平、奮斗、救中國(guó)?！?br/>
3月12日9時(shí)30分，孫中山與世長(zhǎng)辭，終年59歲。
孫中山的《遺囑》是：
余致力于國(guó)民革命凡40年，其目的在求中國(guó)之自由平等，積40年之經(jīng)驗(yàn)，深知欲達(dá)到此目的，必須喚起民眾及聯(lián)合世界上以平等待我之民族，共同奮斗。
現(xiàn)在革命尚未成功。凡我同志，務(wù)須依照余所著《建國(guó)方略》、《建國(guó)大綱》、《三民主義》及《第一次全國(guó)代表大會(huì)宣言》，繼續(xù)努力，以求貫徹，最近主張開國(guó)民會(huì)議及廢除不平等條約，尤須于最短期間促其實(shí)現(xiàn)。是所至囑！
北京75萬(wàn)人先后在孫中山靈堂前致祭。共產(chǎn)黨人李大釗、林伯渠等參加了守靈和執(zhí)拂。
4月2日，孫中山靈柩移奉西山碧云寺，參加送靈的達(dá)30余萬(wàn)人，并有2萬(wàn)多名學(xué)生。學(xué)生、軍人和工人等沿途散發(fā)宣傳孫中山關(guān)于召開國(guó)民會(huì)議和廢除不平等條約的傳單，并高呼“打倒軍閥”、“打倒帝國(guó)主義”、“中山主義萬(wàn)歲”、“國(guó)民革命萬(wàn)歲”等口號(hào)。北京和全國(guó)各地群眾悼念孫中山的活動(dòng)，形成了一次廣泛強(qiáng)大的政治宣傳運(yùn)動(dòng)。
廣東革命政府在平定商團(tuán)叛亂后，陳炯明乘孫中山北上之機(jī)自封為“粵軍總司令”，下令進(jìn)攻廣州，在陳炯明的指揮下，葉舉、洪兆麟部集中惠陽(yáng)、平山，向石灘進(jìn)犯，謀窺廣州；林虎一部向龍門、增城北面進(jìn)擾，以策應(yīng)葉舉部而夾擊廣州；林虎另一部則向贛邊之南聚集，企圖切斷北伐軍之后路。
1925年1月25日，廣東革命政府決定討伐陳炯明，遂將許崇清的建國(guó)粵軍、楊希閔的建國(guó)滇軍、劉震寰的建國(guó)桂軍、譚延的建國(guó)湘軍及黃埔軍校學(xué)生隊(duì)、兩個(gè)教導(dǎo)團(tuán)，組成東征聯(lián)軍，以楊希閔為聯(lián)軍總司令。
東征聯(lián)軍分左、中、右3路。根據(jù)蘇聯(lián)軍事顧問(wèn)加倫的建議，右路軍由粵軍和黃埔軍校組成，由許崇清統(tǒng)率，肅清廣九鐵路沿線的敵軍，然后向淡水、平山、海豐、汕頭一線進(jìn)攻；左路軍由楊希閔的滇軍擔(dān)任，向河源、五華、興華一線推進(jìn)；中路軍由劉震寰的桂軍擔(dān)任，攻占惠州城并策應(yīng)兩翼。
2月10日前，右路軍完全占領(lǐng)廣九鐵路，接著便攻取淡水。右路軍決心采取速戰(zhàn)速?zèng)Q的戰(zhàn)法，爭(zhēng)取惠州敵援軍尚未趕到之前占領(lǐng)淡水，并以黃埔教導(dǎo)團(tuán)為攻城主力，攻淡水之東南，粵軍第2師攻城之西北，攔截北面增援之?dāng)?，粵軍?dú)立第7旅攻城之東北。
黃埔校軍由蔣介石以粵軍總司令部參謀長(zhǎng)和黃埔軍校校長(zhǎng)名義統(tǒng)率，黨代表廖仲愷、政治部主任周恩來(lái)、蘇聯(lián)顧問(wèn)斯捷潘諾夫、什涅伊杰爾參加指揮作戰(zhàn)。周恩來(lái)指示鐵甲車隊(duì)一部參加?xùn)|征。周恩來(lái)還組織了由共產(chǎn)黨員參加的宣傳隊(duì)，將50萬(wàn)份致士兵的傳單、10萬(wàn)份致農(nóng)民的傳單，5萬(wàn)份革命歌曲帶到前線散發(fā)?；涇姀埫襁_(dá)的第2師以及第7獨(dú)立旅，亦納入校軍。
2月14日，校軍教導(dǎo)團(tuán)組織敢死隊(duì)，由8名共產(chǎn)黨員學(xué)員和2名國(guó)民黨員軍官及100名士兵組成。次日清晨，在炮兵及步機(jī)槍猛烈火力掩護(hù)下，用云梯攀登入城，進(jìn)入淡水城內(nèi)和敵軍巷戰(zhàn)肉搏，全殲守?cái)场?br/>
敵援軍洪兆麟部趕到，在淡水城東北同粵軍第7獨(dú)立旅、教導(dǎo)團(tuán)一部展開激戰(zhàn)，教導(dǎo)二團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)王柏齡臨陣走脫，共產(chǎn)黨員陳賡等主動(dòng)率學(xué)生軍迎擊敵人。師長(zhǎng)張民達(dá)、參謀長(zhǎng)葉劍英率粵軍第2師及第7獨(dú)立旅配合作戰(zhàn)，激戰(zhàn)至傍晚，敵援軍退去。戰(zhàn)役結(jié)束后，蔣介石免去王柏齡團(tuán)長(zhǎng)職務(wù)，由沈應(yīng)時(shí)接任，沈負(fù)傷后，由錢大鈞代理。
右路軍兵分兩路攻擊海豐。共產(chǎn)黨員彭湃領(lǐng)導(dǎo)農(nóng)民群眾，立即將過(guò)去埋藏地下的土槍、土炮等武器挖出來(lái)加以修理。農(nóng)民群眾踴躍擔(dān)任運(yùn)輸、向?qū)А商揭灾翈椭谥?zhàn)壕，襲擊小股敵軍，直接參戰(zhàn)。
3月1日，右路軍在農(nóng)民群眾的配合下，順利拿下海豐，又在以后的幾天內(nèi)控制了整個(gè)潮汕地區(qū)。
由于滇桂軍閥劉震寰、楊希閔同陳炯明、林虎早有密約，東征聯(lián)軍之左路軍和中路軍始終按兵不動(dòng)，致使林虎得以從容集中其主力2萬(wàn)多人，從興寧、梅縣等地南下，陰謀一舉將右路軍殲滅于揭陽(yáng)、潮汕之間。林虎軍素以強(qiáng)悍著稱，是陳明炯主力。3月13日，雙方在棉湖遭遇，展開一場(chǎng)激戰(zhàn)。參加右路軍作戰(zhàn)的，除粵軍許濟(jì)旅、黃埔教導(dǎo)團(tuán)外，還有陳銘樞旅、吳鐵城旅。張民達(dá)師留守潮汕。
這是一場(chǎng)惡戰(zhàn)。黃埔教導(dǎo)團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)何應(yīng)欽親自率領(lǐng)衛(wèi)士隊(duì)手機(jī)槍排，把沖入陣地之?dāng)炒蛲耍l(wèi)士死傷多人，情勢(shì)極其危險(xiǎn)。蔣介石眼見這種情況，頗感憂慮，對(duì)何應(yīng)欽說(shuō)：
“何團(tuán)長(zhǎng)，你要堅(jiān)持，必須想辦法挽回局勢(shì)，我們不能后退一步，假如今天在此地失敗了，我們就一切都完了，再無(wú)希望返回廣州了，革命事業(yè)也得遭到嚴(yán)重挫折?！?br/>
蔣介石轉(zhuǎn)過(guò)去詢問(wèn)炮兵連長(zhǎng)陳誠(chéng)說(shuō)：“為什么6門大炮都打不響了，能不能再試一試?！?br/>
隨即，蔣介石及蘇聯(lián)顧問(wèn)跟著陳誠(chéng)來(lái)到炮兵陣地。
陳誠(chéng)把一門山炮加以調(diào)整，裝上炮彈，對(duì)準(zhǔn)正聚集在前方小河對(duì)岸的幾百敵軍，親自拉火，事有湊巧，果然一炮打響了，炮彈正落在這群敵人中間爆炸，打死了幾十個(gè)敵人，敵人一哄而散，向后奔逃。接著幾門炮都打響了，且打中目標(biāo)，幾處敵人紛紛后退。黃埔軍官兵突然士氣大振，奮勇反攻。
黃埔教導(dǎo)二團(tuán)進(jìn)擊鯉湖附近，等待蔣介石的命令，久候不得，雖然聽到一團(tuán)劇烈的槍炮聲，但團(tuán)長(zhǎng)錢大鈞不知當(dāng)機(jī)立斷，坐失良機(jī)，后來(lái)營(yíng)長(zhǎng)劉堯宸實(shí)在忍耐不住，獨(dú)自率領(lǐng)本營(yíng)前進(jìn)，同林虎的總預(yù)備隊(duì)展開戰(zhàn)斗。錢大鈞聽到劉營(yíng)戰(zhàn)斗的槍聲，才命令全團(tuán)迅速加入戰(zhàn)斗，實(shí)行猛攻。林虎沒(méi)有想到側(cè)后方會(huì)遭到如此猛烈襲擊，事出意外，手足無(wú)措，只好后退。林軍頓時(shí)陷入混亂狀態(tài)，全線潰退。
3月19日，黃埔教導(dǎo)團(tuán)二團(tuán)及陳銘樞旅經(jīng)五華冒雨進(jìn)攻興寧，首先擊敗城外守?cái)常缓蟀l(fā)起攻城，教導(dǎo)一團(tuán)亦從五華趕到，協(xié)同作戰(zhàn)。經(jīng)過(guò)激烈戰(zhàn)斗，重創(chuàng)敵軍，林虎率殘部向東逃竄，右路軍乘勝向梅縣追擊，林虎軍棄梅縣縣城落荒而逃。
陳炯明殘部先后退出東江地區(qū)，向閩贛邊境逃竄，困守惠州的陳軍楊坤如部，經(jīng)廖仲愷派員勸降，楊坤如被迫宣布下野，楊部被改編為滇軍第8、9兩師。至此，第一次東征勝利結(jié)束，陳炯明再度逃到香港。
鄂公網(wǎng)安備 42010302001612號(hào)