侯瑱，字伯玉，是巴西充國人。父親侯弘遠(yuǎn)，幾世都是西蜀的豪強(qiáng)。西蜀的賊徒張文萼占據(jù)白崖山，有部眾萬人，梁益州刺史鄱陽王蕭范命令弘遠(yuǎn)征討，侯弘遠(yuǎn)戰(zhàn)死于戰(zhàn)場。侯瑱堅(jiān)決要求替父親報(bào)仇，每次作戰(zhàn)都當(dāng)先鋒，終于斬了文萼，從此遠(yuǎn)近知名。他便侍奉蕭范，蕭范委任他為將帥。山中的夷族、獠族不肯歸附的，都派
侯瑱征討。他因多次立功而被任命為輕車府中兵參軍、晉康太守。蕭范任雍州刺史時(shí)，侯瑱被任命為馮翊太守。蕭范改為鎮(zhèn)守合肥時(shí)，
侯瑱又跟隨他。

　　侯景包圍臺(tái)城后，蕭范便派侯瑱輔佐他的世子蕭嗣入京都救援。當(dāng)臺(tái)城陷沒后，侯瑱和蕭嗣一起退回合肥，并隨著蕭范轉(zhuǎn)去鎮(zhèn)守盆城。不久，蕭范和蕭嗣都死去，
侯瑱就率領(lǐng)了他的部眾，去依靠豫章太守莊鐵。莊鐵對侯瑱有疑心，侯瑱驚恐不安，假裝請莊鐵商量事情，用刀殺了他，占了豫章。

　　后來
侯瑱投降了侯景的部將于慶。于慶把侯瑱送到侯景那里，侯景因?yàn)楹瞵櫤妥约和?，就認(rèn)為同宗族人，對待他很好。侯景將侯瑱的妻子和弟弟留下當(dāng)人質(zhì)，派
侯瑱跟隨于慶去討平蠡南各郡。當(dāng)侯景在巴陵失敗時(shí)，侯景的將領(lǐng)宋子仙、任約等都被西軍俘虜，侯瑱便殺了侯景的同黨以接應(yīng)義軍，侯景也殺了
侯瑱的妻子和弟弟。梁元帝任命侯瑱為南兗州刺史、郫縣侯。并隨都督王僧辯討伐侯景，每次都充當(dāng)先鋒。收復(fù)了臺(tái)城以后，侯景逃往吳郡，王僧辯派
侯瑱追趕侯景，在吳松江將他打得大敗。因功侯瑱被任命為南豫州刺史，鎮(zhèn)守姑孰。

　　當(dāng)齊國派郭元建從濡須出兵時(shí)，王僧辯派
侯瑱去抵御，大敗郭元建。魏進(jìn)攻荊州時(shí)，王僧辯派侯瑱為前軍前去救援，但還未到達(dá)而魏已攻克荊州。侯瑱鎮(zhèn)守九江，并護(hù)衛(wèi)晉安王回京都。晉安王承制，任命
侯瑱為侍中、江州刺史，加都督，改封為康樂縣公。當(dāng)司徒陸法和占據(jù)郢州，領(lǐng)齊兵來侵犯時(shí)，又派侯瑱西征，還未到達(dá)而陸法和已經(jīng)到齊國了。齊派慕容恃德鎮(zhèn)守夏首，
侯瑱進(jìn)攻他，慕容恃德糧盡而請和，侯瑱回來鎮(zhèn)守豫章。王僧辯派他的弟弟王僧忄音和侯瑱共同討伐蕭勃，當(dāng)陳武帝殺了王僧辯后，王僧忄音陰謀殺死
侯瑱以奪取他的部隊(duì)。侯瑱知道了，抓了王僧忄音的全部黨徒，王僧忄音逃到齊國。

　　當(dāng)時(shí)侯瑱占據(jù)中游地區(qū)，實(shí)力強(qiáng)盛，又因他原先侍奉王僧辯，所以雖然對朝廷仍以臣子禮節(jié)自稱，卻不肯進(jìn)朝去。以前，余孝頃當(dāng)豫章太守，當(dāng)
侯瑱鎮(zhèn)守豫章時(shí)，余孝頃便在新吳縣另外設(shè)立了防城的柵欄，和侯瑱對抗。侯瑱將軍人的妻子留在豫章，讓他的堂弟侯大淵在豫章處理留下的事務(wù)，帶領(lǐng)全部人馬攻打余孝頃，從夏天打到冬天還不能攻下。侯大淵和他的部下侯方兒不和，侯方兒進(jìn)攻侯大淵，收了
侯瑱軍府中的妓妾和金玉財(cái)寶前去歸附陳武帝。侯瑱既已失去根本，輕騎回歸豫章，豫章人拒絕讓他入城，他便前往盆城，投到他的部將焦僧度那里。焦僧度勸
侯瑱投奔齊國，侯瑱認(rèn)為陳武帝有大器量，必定能夠容納自己，便到朝廷請罪，陳武帝恢復(fù)了他的爵位。永定二年(558)，晉位為司空。文帝即位，又進(jìn)任太尉。王琳到柵口時(shí)，朝廷又任命
侯瑱為都督，侯安都等都隸屬于他。

　　天嘉元年(560)二月，王琳率領(lǐng)他在合肥、巢湖的部眾，乘船依次而下。
侯瑱領(lǐng)軍隊(duì)進(jìn)至獸檻洲。第二天兩軍交戰(zhàn)，王琳軍隊(duì)略略后退。晚上，東北風(fēng)將王琳的船只全都刮壞了。夜里有流星墜入敵人營壘中。當(dāng)天亮后風(fēng)停了，王琳進(jìn)到江邊，用鹿角圍在岸上，不敢再出戰(zhàn)。當(dāng)時(shí)西魏的將領(lǐng)史寧占據(jù)上游地區(qū)，
侯瑱得知后，知道王琳難以維持很久，便把軍隊(duì)收回?fù)?jù)守湖邊，等待對方自敗。史寧到后，包圍了郢州。王琳害怕眾人潰散，便帶領(lǐng)船只東下，在離蕪湖十里的地方停泊。第二天，齊人派兵援救王琳。
侯瑱讓軍中燒早飯并在寢席上吃飯，船停在蕪湖的洲尾等待王琳。準(zhǔn)備交戰(zhàn)時(shí)，有微風(fēng)從東南而來，眾軍施放火種，定州刺史章昭達(dá)乘坐平虜大艦從江中進(jìn)擊，王琳軍隊(duì)大敗，逃走而幸免死亡的只有十分之二三，王琳因此跑到齊國去了。

　　當(dāng)年，詔令
侯瑱為都督五州諸軍事，鎮(zhèn)守盆城。周將賀若敦、獨(dú)孤盛等來攻巴、湘時(shí)，又任命侯瑱為西討都督，大敗獨(dú)孤盛的軍隊(duì)。他因功被任命為湘州刺史，改封零陵郡公。天嘉二年去世，追贈(zèng)為大司馬，謚為“壯肅”，配享于陳武帝的廟中。他的兒子侯凈藏繼嗣，娶了陳文帝的女兒富陽公主。