宋高祖武皇帝名叫裕，字德輿，小字寄奴，彭城縣綏輿里人，姓劉氏，是漢代楚元王劉交的第二十一代孫子。彭城是楚國的都城，所以后代子孫便以這里為家了。晉朝東遷，劉氏移居到晉陵丹徒的京口里。他的先祖劉靖，是晉朝的東安太守。他的父親劉翹，字顯宗，是郡上的功曹。武帝是晉哀帝興寧元年(363)三月十七日的夜里降生，當(dāng)時(shí)神光照得房子里一片光明，這天夜里有甘露降落在墓地的樹上。他長大后，為人雄杰，氣度宏大，身高七尺六寸，風(fēng)神奇?zhèn)ィ痪猩钚」?jié)，侍奉繼母以孝順聞名。
他曾游覽京口的竹林寺，獨(dú)自躺在講堂的前面，上面有一條五色龍顯現(xiàn)出來，眾僧人見了，驚慌地告訴了武帝，武帝獨(dú)自高興地說：“請上人不要亂講?！彼赣H的墓在丹徒的候山，那里就是秦史上所說的曲阿、丹徒之間有天子氣的地方。當(dāng)時(shí)有個(gè)叫孔恭的人，很善于占墓，武帝曾經(jīng)和他一塊經(jīng)過墓地，欺騙他說：“這片墳?zāi)乖趺礃樱俊笨坠дf：“不是一般的地方喲！”武帝從此更加自負(fù)。行動(dòng)時(shí)常常見到有兩條小龍附在兩翼，到山上砍柴或到水邊打魚，同伴們有的也曾經(jīng)看見。地位尊貴以后，龍形更大。
武帝一向貧窮，當(dāng)時(shí)的人都不能識(shí)別他的才干，只有瑯笽人王謐獨(dú)自對他深深敬重。武帝曾經(jīng)欠刁逵的社錢三萬，好長時(shí)間無法償還，被刁逵抓起來，王謐暗中用自己的錢代他還上，由此得到釋放。后來在新洲割荻草，看到了一條大蛇有幾丈長，就用箭射它，蛇受了傷。第二天又到了新洲，聽到里面有杵臼的聲音，進(jìn)去一看，見有好幾個(gè)童子都穿著青色的衣服，在草叢中搗藥。問他們是怎么回事，回答說：“我們的大王被劉寄奴射傷了，配些藥給他敷上。”武帝說：“神王怎么不把劉寄奴殺死？”回答說：“劉寄奴是個(gè)王，不會(huì)死的，所以不能殺他?！蔽涞酆沁乘麄?，都跑散了，便收起藥來回去了。又曾經(jīng)住宿在下邳的旅舍，碰到一個(gè)小和尚對武帝說：“江東將要大亂，能使這里安定下來的，恐怕就是您了吧！”武帝的手曾經(jīng)被割傷，多年不愈，和尚有一種黃散，便留給了武帝，隨后忽然不見了，武帝用黃散敷在手上，那傷口只敷一次就好了。保留剩余的黃散以及所得的童子的藥，每當(dāng)遇到刀傷，敷上都很靈驗(yàn)。
起初他擔(dān)任冠軍孫無終的司馬。晉朝隆安三年(399)十一月，妖賊孫恩在會(huì)稽作亂，朝廷派衛(wèi)將軍謝琰、前將軍劉牢之去東方討伐。劉牢之請武帝參謀府中軍事，命令他與幾十個(gè)人一道監(jiān)視賊軍，遇到了賊兵幾千人，武帝便和他們打起來，所率領(lǐng)的人大多戰(zhàn)死，而武帝揮舞著長刀，殺傷了很多賊兵。劉牢之的兒子劉敬宣懷疑武帝被賊兵圍困，就帶了一些輕騎去尋找他；不久，眾多騎兵一齊來到，于是平定了山陰，孫恩逃到了海上。
隆安四年(340)五月，孫恩又進(jìn)入了會(huì)稽，殺了謝琰。十一月，劉牢之再次東征，讓武帝守衛(wèi)句章，句章城小人少，武帝每次戰(zhàn)斗都攻陷敵方陣地，賊軍便退回浹口。當(dāng)時(shí)東伐的各個(gè)將官，手下士卒都大肆掠搶，老百姓都深受苦害，只有武帝的軍隊(duì)無所侵犯。
隆安五年(341)春天，孫恩頻繁進(jìn)攻句章，武帝屢次擊敗他，孫恩重新逃到海上。三月，孫恩向北開往海鹽，武帝在舊海鹽筑起城墻，賊軍每日都來攻城，城內(nèi)的兵少，武帝便選了一支敢死隊(duì)把賊軍趕走。當(dāng)時(shí)雖然接連勝利，武帝卻深深地憂慮著眾寡不敵，就在一個(gè)夜里把軍旗收了起來，以顯示自己方面的疲弱，看到敵方懈怠的時(shí)候，便奮力出擊，大破賊兵。孫恩知道城無法攻下，便向滬瀆進(jìn)兵，武帝棄城追趕。海鹽縣令鮑陋派遣兒子鮑嗣之率領(lǐng)吳地兵士一千作為前驅(qū)，武帝因?yàn)閰堑厝瞬皇炝?xí)打仗，命令他們排在后面，他們不答應(yīng)。這一夜武帝設(shè)了很多奇兵，同時(shí)添置旗鼓，第二天戰(zhàn)斗，伏兵殺了出來，賊兵撤退，鮑嗣之追趕逃敵，結(jié)果被消滅。武帝且退且戰(zhàn)，部下死傷將盡，便回到原來的地方停了下來，讓身邊的人們?nèi)ソ馊∷廊说囊路燥@示出閑暇的樣子。賊兵懷疑還有埋伏，便退走了。六月，孫恩渡海到了丹徒，武帝加倍趕路與他一齊到達(dá)，迅速出擊，大破賊軍。孫恩到了建鄴，知道朝廷已經(jīng)有了防備，于是逃往郁洲。八月，晉朝皇帝任命武帝為下邳太守。武帝又追擊孫恩到郁洲和海鹽，接連擊敗他們。孫恩從此以后出現(xiàn)饑荒，逃奔臨海。
元興元年(402)，荊州刺史桓玄率兵東下，驃騎將軍司馬元顯派劉牢之抵抗，武帝又參加了他的軍事行動(dòng)?；感竭_(dá)以后，武帝請求攻擊，劉牢之不許，卻派自己的兒子劉敬宣去找桓玄請求和解。武帝和東海人何無忌一齊竭力勸諫，劉牢之拒不聽從?；感タ肆私ㄠ?，朝廷任命劉牢之為會(huì)稽內(nèi)史。劉牢之恐懼，招武帝在廣陵起兵，武帝說：“人情不在了，廣陵又哪里能得到呢？”劉牢之結(jié)果在新洲自縊而死。何無忌對武帝說：“我將到哪里去呢？”武帝說：“可以隨我回京口。桓玄必定會(huì)保持對待臣子的節(jié)操，我可以和您一起侍奉他；不行的話，就和您一起對付他?！?br />
桓玄的堂兄桓修以撫軍將軍的頭銜鎮(zhèn)守丹徒，任命武帝為中兵參軍。孫恩自從兵敗以后，害怕被抓獲，便在臨海投水而死，其余的兵眾推舉孫恩的妹夫盧循為主帥?；感俅闻晌涞蹡|征。
元興二年(403)，盧循逃奔永嘉，武帝追趕并擊破了他。六月，任命武帝為彭城內(nèi)史。
十二月，桓玄篡奪了帝位，把晉朝的皇帝遷移到了尋陽。桓修調(diào)入朝廷，武帝跟隨到了建鄴，桓玄見了武帝，對司徒王謐說：“昨天見到了劉裕，風(fēng)度不凡，確是世人中的豪杰呀?！泵看斡螛费缂?，贈(zèng)送賞賜十分豐厚。桓玄的妻子劉氏，是尚書令劉耽的女兒，聰明智慧，很有見識(shí)，曾經(jīng)見到武帝，便對桓玄說：“劉裕龍行虎步，目光不凡，恐怕必定不會(huì)做別人的下屬，要對他早作安排?！被感f：“我正在蕩平中原，非劉裕不可，等關(guān)、隴地區(qū)平定，然后再作討論?！?br />
桓修不久回到京口，武帝借口說槍傷惡化，不能隨同，便與何無忌一同乘船返回，商討復(fù)興的方案，與弟弟劉道軌、沛國的劉毅、平昌的孟昶、任城的魏詠之、高平的檀憑之、瑯笽的諸葛長人、太原的王元德、隴西的辛扈興、東莞的童厚之，共同謀劃大計(jì)。當(dāng)時(shí)桓修的弟弟桓弘擔(dān)任青州刺史，鎮(zhèn)守廣陵，劉道軌擔(dān)任桓弘的中兵參軍，孟昶擔(dān)任青州主簿，于是武帝就讓劉毅到孟昶那里謀劃共同襲擊桓弘。諸葛長人擔(dān)任豫州刺史刁逵的左軍府參軍，預(yù)謀占據(jù)歷陽來相策應(yīng)，王元德、童厚之預(yù)謀在建鄴進(jìn)攻桓玄，時(shí)間一到一齊行動(dòng)。
元興三年(404)二月二十七日，武帝假托游獵，和何無忌，魏詠之，檀憑之，劉毅的堂弟劉藩，檀憑之的侄子檀韶、檀祗、檀隆、檀道濟(jì)，孟昶的族弟孟懷玉等人，聚集了義徒共二十七人，愿意隨從的一百多人。二十八日，等城門打開，何無忌等義徒身穿傳達(dá)詔書人的服裝，口稱詔書走在前面，義徒們騎馬馳入城內(nèi)齊聲大叫，官吏士兵都被驚散，隨即將桓修斬首示眾。武帝哭得十分傷心，進(jìn)行了豐厚的埋葬和撫恤。孟昶勸桓弘在這一天外出打獵，天還沒有明，打開城門放出了打獵的人，孟昶、劉道軌、劉毅等率壯士五六十人，因城門打開而直接進(jìn)入。桓弘正在喝粥，就被斬首，于是收集他的兵眾渡江。
義軍剛剛攻下京城，桓修的司馬刁弘率領(lǐng)文武官員前來攻打，武帝登上城頭對他們說：“郭江州已經(jīng)在尋陽侍奉御車撥亂反正，我們?nèi)挤盍嗣茉t誅除逆黨，現(xiàn)在逆賊桓玄的頭應(yīng)當(dāng)砍掉掛在大航的高桿上面。諸君難道不都是大晉的臣子嗎？”桓弘等人相信了他們，便退了回去。劉毅到了以后，武帝命令他殺死刁弘等人。
劉毅的哥哥劉邁原先住在建鄴，事情還沒發(fā)生的前幾天，武帝派遣同謀周安穆報(bào)告了他，讓他來作內(nèi)應(yīng)。劉邁非?？謶?，周安穆害怕事情暴露，馳馬返回。當(dāng)時(shí)桓玄讓劉邁擔(dān)任竟陵太守，劉邁便乘船而下，打算到郡上任。這天夜里，桓玄給劉邁寄信說：“北府的人情況怎么樣？您最近見劉裕說了些什么？”劉邁以為桓玄已經(jīng)知道了他們的計(jì)謀，早晨起來就把情況告訴了他。桓玄很吃驚，封劉邁為重安侯，又因?yàn)樗麤]有把周安穆抓住，所以把他殺了，又殺了王元德、辛扈興、童厚之等。于是派遣頓丘太守吳甫之、右衛(wèi)將軍皇甫敷抵御北面的義軍。
在此以前，武帝曾到游擊將軍何澹之那里去，身邊的人見武帝光耀滿室，便把這種現(xiàn)象告訴了何澹之，何澹之又說給了桓玄，桓玄并不介意，到了現(xiàn)在，聽說義兵起事了，非?？謶?。有人說：“劉裕他們非常虛弱，陛下何必過深地憂慮？”桓玄說：“劉裕足可以成為一世的雄杰，劉毅家里沒有一石糧食的儲(chǔ)蓄，而賭博時(shí)擲骰子一押百萬，何無忌，是劉牢之的外甥，酷似他的舅父，共同舉辦大事，怎么就說不能成功？”當(dāng)時(shí)眾人推舉武帝為盟主，以孟昶為長史，總管后方事務(wù)，檀憑之為司馬，愿意隨從的老百姓有一千多人。軍隊(duì)駐扎在竹里，向京城發(fā)出了檄文。
三月初一，在江乘遇到了吳甫之，武帝親自拿著大刀，大聲呼叫，隨即把吳甫之殺死。進(jìn)軍到羅落橋，遇到了皇甫敷，檀憑之戰(zhàn)敗被殺，眾人紛紛后退，武帝前進(jìn)戰(zhàn)斗更加猛烈，而且又殺了皇甫敷的頭。起初，武帝謀劃大計(jì)，有善于相面的人給武帝和何無忌等人相面，說他們近期一定會(huì)大貴，只是說檀憑之沒有貴相。到現(xiàn)在檀憑之戰(zhàn)死，武帝知道這件事必定勝利。
桓玄聽說皇甫敷等人已死，就派桓謙屯駐東陵口，卞范之屯駐覆舟山西面。三月初二，義軍進(jìn)駐覆舟山東部，布置了疑兵，用涂油的披肩蓋在樹上，布滿山谷。武帝首先馳向敵軍，將士們?nèi)歼M(jìn)行殊死的戰(zhàn)斗，無不一以當(dāng)百，呼聲震天動(dòng)地。又借著風(fēng)力放火，濃煙與火焰沖天，桓謙大敗。桓玄開始雖然派出了軍隊(duì)，但是逃走的心意已經(jīng)決定，另外派遣了領(lǐng)軍殷仲文在石頭城準(zhǔn)備好船只，聽說桓謙失敗，便乘著輕快的小船向南逃跑了。
三月初三，武帝鎮(zhèn)守石頭城，任命了留守臺(tái)閣的各級官員，在宣陽門外燒毀了供奉桓溫的牌位，在太廟中建造了晉朝的新神主。派遣各路將官追擊桓玄，命令尚書王嘏率領(lǐng)百官迎接皇帝的車駕。司徒王謐與眾人商議推舉武帝兼職掌管揚(yáng)州，武帝堅(jiān)決推辭，便以王謐擔(dān)任錄尚書事、兼任揚(yáng)州刺史，武帝擔(dān)任鎮(zhèn)軍將軍、都督八州諸軍事、徐州刺史、領(lǐng)軍將軍。
起初，晉陵人韋叟擅長相面術(shù)，桓修讓他相一相武帝是不是能當(dāng)上州官，韋叟說：“應(yīng)當(dāng)做邊遠(yuǎn)州的刺史?！被仡^又私下對武帝說：“您的面相貴不可言。”武帝笑著說：“如果說中了，一定任用您為司馬。”到了現(xiàn)在，韋叟去見武帝說：“周成王不忘桐葉之信，您也應(yīng)該不忘司馬之言?，F(xiàn)在我不敢希望做鎮(zhèn)軍司馬，只想能夠兼任一個(gè)軍佐。”于是就任用了他。
當(dāng)時(shí)諸葛長人沒有如期趕到，被刁逵抓住押送過去，還沒到達(dá)，桓玄就失敗了?；感?jīng)過尋陽，江州刺史郭昶之為他準(zhǔn)備了車子和儀仗器物。起初，荊州刺史王綏因?yàn)槭墙瓥|的顯貴世族，又是桓氏的外甥，平時(shí)對武帝十分欺侮，到了現(xiàn)在，與他的父親尚書左仆射王愉都抱有懷疑心理，一齊被殺死。
四月初一，尊奉武陵王司馬遵為大將軍，按照圣旨，實(shí)行大赦，只有桓玄祖父的后輩不予赦免?；感畚唬怯赏踔k輔佐的，是他親手解下晉安帝的玉璽。等到義旗樹立，眾人都說王謐應(yīng)該殺掉，只有武帝平時(shí)對王謐很感激，因而保護(hù)他。劉毅曾經(jīng)趁朝會(huì)的機(jī)會(huì)，問王謐玉璽在什么地方，王謐更加恐懼。等到王愉父子被殺，王謐的堂弟對王謐說：“王駒無罪而被殺死，這是鏟除勝過自己的人，兄長既是桓氏一黨的人，希求免禍能夠做到嗎？”駒，是王愉的小字。王謐恐懼，逃奔曲阿。武帝告訴大將軍把他迎接回來，恢復(fù)了他的職位。
桓玄挾持天子逃往江陵，又渡江東下，與劉毅、何無忌、劉道軌等在崢嶸洲相遇，眾軍把他打得大敗?；感狞h徒殷仲文擁戴兩位皇后回到建鄴?；感赜謷冻痔熳拥搅私辏哪抢锾油峡?，太守王騰之、荊州別駕王康產(chǎn)擁戴天子進(jìn)入南郡府。
起初，益州刺史毛璩派遣侄孫毛佑之和參軍費(fèi)恬為弟弟送喪離開州城，毛璩弟弟的兒子毛修之當(dāng)時(shí)做桓玄的屯騎校尉，引誘桓玄進(jìn)入蜀地，到了枚回洲，費(fèi)恬和毛佑之迎面用箭射他，益州督護(hù)馮遷殺死了桓玄，把人頭送往建鄴。桓玄的侄子桓振逃到華容的涌中，招集逆黨，襲擊江陵城，王騰之、王康產(chǎn)都被殺死。桓謙先前曾藏在沮川，也聚集人馬與桓振呼應(yīng)。他們?yōu)榛感e行哀悼，設(shè)立了喪庭?；钢t率領(lǐng)眾官員奉獻(xiàn)玉璽給晉安帝。劉毅、何無忌進(jìn)軍與桓振交戰(zhàn)，在靈溪戰(zhàn)敗。
十月，武帝兼任青州刺史，可以帶領(lǐng)衛(wèi)士一百人進(jìn)入宮殿。
義熙元年(405)正月，劉毅等到達(dá)江津，擊敗了桓謙、桓振，江陵平定。三月十三日，晉朝皇帝從江陵來到。十九日，詔令晉升武帝為侍中、車騎將軍、都督中外軍事、錄尚書事。武帝堅(jiān)持推辭，不久鎮(zhèn)守丹徒。九月二十七日，任命武帝兼做兗州刺史。
盧循渡海攻破廣州，俘獲了刺史吳隱之，于是便以盧循為廣州刺史，以他的同黨徐道覆為始興相。
義熙二年三月，晉升武帝督率交、廣二州。十月，評論匡復(fù)晉朝的功勛，封武帝為豫章郡公，食邑一萬戶，賜絹一萬疋。其余的人封賞各有差別。
三年十二月，司徒、錄尚書、揚(yáng)州刺史王謐去世。
四年正月，征調(diào)武帝入朝輔政，授職擔(dān)任侍中、車騎將軍、開府儀同三司、揚(yáng)州刺史、錄尚書事，徐、兗二州刺史依舊保留。武帝上表解去兗州職務(wù)。在這以前，武帝曾經(jīng)派遣冠軍劉敬宣討伐蜀地的賊寇譙縱，結(jié)果沒有成功回來了。九月，武帝因?yàn)閯⒕葱麛⊥?，請求退位，沒有批準(zhǔn)。十月，降級為中軍將軍，開府職位仍然不變。
五年二月，偽燕國國主慕容超大肆掠奪淮北。三月，武帝上表請求去北方討伐，讓丹陽尹孟昶監(jiān)管中軍留府事務(wù)。于是渡過淮水進(jìn)入泗水，五月，到達(dá)下邳，留下船只，軍隊(duì)步行前進(jìn)到了瑯笽，所經(jīng)過的地方，都筑城留人守衛(wèi)。
慕容超的大將公孫五樓請求占領(lǐng)大峴山，堅(jiān)壁清野等待對方，慕容超不肯聽從。最初謀劃這次戰(zhàn)役，參加討論的人認(rèn)為賊軍如果嚴(yán)守大峴山，軍中沒有所需物資，自己怎么能夠返回？武帝說：“并不是這樣。鮮卑人性格貪婪，謀劃事情看不到遠(yuǎn)處，既慶幸自己的勝利，又十分愛惜那些谷物，必然會(huì)引誘我們，而且會(huì)輕率交戰(zhàn)。部隊(duì)一入峴山，我們還有什么擔(dān)憂呢？”等到進(jìn)入了峴山，武帝舉手指著天說：“我們的事情成功了?！北娙嗽儐柶渲械木壒剩涞壅f：“軍隊(duì)已經(jīng)越過險(xiǎn)要地形，兵士都有必死的斗志，余糧儲(chǔ)存在田野當(dāng)中，軍隊(duì)沒有缺乏給養(yǎng)的憂慮，勝利是可以斷定的?！?br />
六月，慕容超留下老弱兵士守衛(wèi)廣固，派他手下的廣寧王賀剌盧與公孫五樓全力占據(jù)臨朐。離城四十里有個(gè)巨蔑水，慕容超告誡公孫五樓要抓緊占據(jù)它。等他趕到，已經(jīng)受到龍?bào)J將軍孟龍符的保衛(wèi)，公孫五樓只得退回。
大軍把四千輛兵車分為兩翼，兩車并排慢慢行駛，車前張掛帷幔，御手拿著長矛，以騎兵為流動(dòng)軍隊(duì)，軍令十分嚴(yán)肅。等到達(dá)臨朐，賊軍的騎兵一齊來到，武帝命令兗州刺史劉藩、并州刺史劉道憐等攻陷敵軍陣地。太陽偏西的時(shí)候，戰(zhàn)斗仍然十分激烈，武帝利用參軍胡藩的計(jì)策，襲擊攻克臨朐，賊軍于是大肆逃奔。慕容超逃回廣固，獲得了他的玉璽、豹尾、轎車等，送到都城。十九日，攻克了廣固的大城，慕容超加固了它的小城。武帝于是設(shè)下了很長的包圍圈進(jìn)行監(jiān)守，吃住都在青州，停止了長江、淮河的物資轉(zhuǎn)運(yùn)。
七月，慕容超的尚書郎張綱去向姚興請求救兵，從長安返回，泰山太守申宣把他捉住押送過來。張綱具有巧妙的構(gòu)思，先前，武帝制造攻城的器具，城上的人說：“你們得不到張綱，怎么能制成呢！”等到張綱來到，城內(nèi)的人無不大驚失色。慕容超既然求救沒有成功，張綱反被俘虜，于是便請求稱臣，割大峴山為界，獻(xiàn)馬一千匹，武帝不答應(yīng)。
當(dāng)時(shí)姚興派遣使者，聲言將要渡過淮水東下，武帝對他說：“你報(bào)告姚興，我平定了青州，將要跨過函谷關(guān)，他這賊寇若能自己送上門來，現(xiàn)在正是時(shí)候?！变浭聟④妱⒛轮鋈贿M(jìn)來說：“這話不足以威脅敵人，也許會(huì)激怒他們。如果鮮卑沒有戰(zhàn)勝，西羌又來侵?jǐn)_，您將怎么對付？”武帝于是笑著說：“這是軍事機(jī)密，不是您所能知道的。西羌如果能夠來救，不會(huì)先有聲明，這只是他們自己在故作強(qiáng)大。”
十月，張綱制成了攻城器具，設(shè)計(jì)了飛樓懸梯、木幔板屋，上面蓋上牛皮，弓箭就無法奏效了。劉毅派遣上黨太守趙恢率領(lǐng)一千余人前來援助，武帝夜間暗中派軍隊(duì)與他會(huì)合。天明后，趙恢的部隊(duì)五千人，才上路前進(jìn)，每當(dāng)晉朝使者將到的時(shí)候，就如此重復(fù)一遍。
六年二月初五，攻克了廣固進(jìn)行屠殺，慕容超越過城墻逃走，結(jié)果追上了他，在建康的街市上將他斬首。殺掉了他的王公以下官員，獲得人口一萬多、馬二千匹。
起初，武帝進(jìn)軍北方，徐道覆勸盧循乘虛而出，盧循不聽，徐道覆于是去到番禺說服盧循說：“今天的機(jī)會(huì)，萬萬不可丟失。如果你攻占了京都，劉公雖然回來，也沒有什么辦法了?！北R循聽從了他。這月，侵犯南康、盧陵、豫章等郡，郡守都逃走了。當(dāng)時(shí)武帝將要鎮(zhèn)守下邳，進(jìn)軍到了黃河、洛水，等征調(diào)的使者到后，當(dāng)天就班師還朝了。鎮(zhèn)南將軍何無忌與徐道覆交戰(zhàn)，失敗戰(zhàn)死在豫章，朝內(nèi)外都很震驚，朝中的議論想擁戴皇上向北逃走。武帝駐軍在山陽，聽說失敗，脫去盔甲與幾十個(gè)人一起到江上去調(diào)查詢問，知道賊軍還沒有到達(dá)。
四月初二，武帝到了京都。劉毅自己上表請求南征，武帝認(rèn)為賊軍剛剛打了勝仗，氣勢正盛，必須軍容嚴(yán)整，共同前進(jìn)，便讓劉藩制止他，劉毅不聽從。五月的壬午日，盧循在桑落洲打敗了劉毅。等他們得知了武帝勝利進(jìn)入，個(gè)個(gè)互相對視，大驚失色，企圖退回尋陽，平定江陵，據(jù)守二洲來對抗朝廷。徐道覆請求乘勝繼續(xù)前進(jìn)，爭論了十天，才依從了他的意見。
這時(shí)北國的軍隊(duì)剛退回去，創(chuàng)傷沒有恢復(fù)，戰(zhàn)士只有幾千人，而賊軍卻有十幾萬，戰(zhàn)船綿延千里。孟昶、諸葛長人很恐懼，打算保護(hù)天子過江，武帝說：“現(xiàn)在兵士雖然少，還足可以一戰(zhàn)，如果敵寇渡江成功，大臣、君主就會(huì)共同滅亡；如果不是這樣，不可能再在草野間求得活命，我的主意已經(jīng)定了?！逼鸪酰涞壅饔懩饺莩?，只有孟昶鼓勵(lì)行動(dòng)，四月初五，孟昶便上表給天子，引罪自責(zé)，服藥而死。
當(dāng)時(shí)的議論者企圖分兵屯守各個(gè)渡口，武帝說：“賊眾我寡，分兵以后則會(huì)有人探測到虛實(shí)，一處失利，就會(huì)破壞三軍的心態(tài)，如果在石頭城聚集各軍，則各軍的力量不會(huì)分散?！彼脑鲁跗?，武帝轉(zhuǎn)移駐地到石頭城。十四日，賊軍大規(guī)模開來，武帝說：“賊軍如果由新亭直上，就暫且回避它；如果回頭停泊在蔡洲，就會(huì)被捉住的?！毙斓栏泊蛩銖男峦龤Т唤粦?zhàn)，盧循疑慮多決斷少，常常追求萬全之策，于是便停泊在蔡洲以等待軍隊(duì)潰敗。武帝登上石頭城遠(yuǎn)望，見到了這種情形，很高興。二十九日，賊軍在南岸設(shè)下伏兵，又向白石派出疑兵。武帝率領(lǐng)劉毅、諸葛長人向北出兵抵御，留下了參軍徐赤特守衛(wèi)查浦，告誡和命令他們不準(zhǔn)交戰(zhàn)。武帝北出以后，賊軍焚燒了查浦而到達(dá)張侯橋，徐赤特與他們交戰(zhàn)，大敗，賊軍前進(jìn)屯駐在丹陽郡。武帝馳馬回到石頭城，斬了徐赤特。解去盔甲很長時(shí)間，才在南塘出陣。七月初十，盧循從蔡洲撤退，準(zhǔn)備歸回尋陽，武帝派遣輔國將軍王仲德等追擊。讓建威將軍孫處從海道上襲擊番禺，告誡他說：“我在十二月必定擊破妖寇，您也足可以到達(dá)番禺，要首先搗毀他的巢穴?！?br />
十月，武帝率領(lǐng)艦隊(duì)南伐，派劉毅監(jiān)管太尉留府。這月，徐道覆攻擊江陵，荊州刺史劉道軌把他打得大敗，徐道覆逃回湓口。十一月，孫處到了番禺，把城攻破，盧循的父親盧嘏逃奔始興，孫處安撫當(dāng)?shù)孛癖娺M(jìn)行守衛(wèi)。十二月初一，大軍駐扎在大雷。初二，賊軍沿江而下，武帝親自拿著軍旗和戰(zhàn)鼓，命令各路軍隊(duì)奮力拼殺，軍中有很多萬鈞神弓，所到之處無不摧毀。武帝自己在中流皺眉觀看，順著風(fēng)和水的走勢，賊艦全都先靠近西岸，岸上軍士事先已經(jīng)準(zhǔn)備好了火把，將他們?nèi)繜龤В瑲⒌么髷?。盧循回到尋陽，接著便逃往豫章，全力在左里建造柵欄。十八日，大軍駐扎在左里，即將開戰(zhàn)，武帝揮動(dòng)令旗，令旗的旗竿折斷，旗子沉入水中，眾人都很恐懼，武帝笑著說：“過去的覆舟戰(zhàn)役也是這樣，今日的勝利是必定無疑的了?！泵凸耻姷臇艡?，盧循單獨(dú)乘著一條船逃走，眾官兵都投降了。大軍凱旋，晉安帝派侍中黃門到營地去進(jìn)行慰勞。
義熙七年正月十二日，整頓部隊(duì)歸來，改任他為大將軍、揚(yáng)州牧，贈(zèng)給他班劍二十人，原來的官職依舊。武帝堅(jiān)持推辭。凡是南北征討戰(zhàn)死者，全都列出姓名請朝廷贈(zèng)發(fā)錢財(cái)治喪，尸體失掉沒有返回的，派遣主帥前去迎接，使歸還本土。
二月，盧循到了番禺，被孫處擊敗，收羅剩余兵眾向南逃走。劉藩、孟懷玉在始興將徐道覆殺死。
自從晉朝中興以來，朝廷的綱紀(jì)松弛紊亂，權(quán)貴之門互相兼并，老百姓流離失所，不能保持自己的產(chǎn)業(yè)?；感芟敫淖冞@種狀況，結(jié)果沒能實(shí)行。武帝做了輔佐大臣以后，大力宣傳規(guī)章制度，豪強(qiáng)謹(jǐn)慎規(guī)矩，遠(yuǎn)近遵法守紀(jì)。到現(xiàn)在，會(huì)稽余姚的虞亮又隱藏了逃亡人員一千多人。武帝殺死了虞亮，罷免了會(huì)稽內(nèi)史司馬休之。
晉安帝重申了以前的授官詔令，武帝堅(jiān)持推辭。于是改授他為太尉、中書監(jiān)，他才接受了任命，奉送了黃鉞。
交州刺史杜惠度殺死了盧循父子，將七個(gè)人頭用盒子裝了送到京城。
在這以前，各州所送的秀才、孝廉大多名不符實(shí)，武帝于是上表申明從前的規(guī)定，對他們進(jìn)行策試。
荊州刺史劉道軌患病，要求回鄉(xiāng)，義熙八年四月，改授豫州刺史，讓豫州刺史劉毅去代替他。劉毅一向具有雄才大志，與武帝一起興復(fù)晉朝，自認(rèn)為京城、廣陵的功勞足以互相抗衡，雖然暫且推舉武帝，而心中卻不服氣。他非常自傲自夸，朝士中素有威望者多去歸附他，他與尚書仆射謝混、丹陽尹郗僧施都結(jié)交很深。等他去鎮(zhèn)守江陵，豫州舊府的下屬許多人都辭職去跟隨他，他奏請讓郗僧施任南蠻校尉。武帝知道劉毅終究是一個(gè)異端人物，心里在秘密算計(jì)他。劉毅到了西部，稱言病重，上表請求讓堂弟兗州刺史劉藩作為副手，武帝假裝答應(yīng)了他。九月，劉藩入朝，武帝命令逮捕劉藩和謝混，一并賜死。自己上表請求討伐劉毅，又借掌黃鉞，率領(lǐng)各路軍隊(duì)西征。任命前鎮(zhèn)軍將軍司馬休之為平西將軍、荊州刺史，兗州刺史劉道憐鎮(zhèn)守丹徒，豫州刺史諸葛長人監(jiān)管太尉留府事務(wù)，任命太尉司馬丹陽尹劉穆之為建威將軍，給他配備實(shí)際兵力。十五日，從建鄴出發(fā)，派遣參軍王鎮(zhèn)惡、龍?bào)J將軍蒯恩前往襲擊江陵，將城攻破，劉毅及其黨羽全部被殺。
十一月，武帝到了江陵，分出荊州的十個(gè)郡成為湘州，武帝仍舊前往督察。任命西陽太守朱齡石為益州刺史，讓他討伐蜀地，晉安帝晉升武帝為太傅、揚(yáng)州牧，贈(zèng)給羽葆、樂隊(duì)，儀仗二十人。
九年二月三十日，武帝從江陵到來。起初，諸葛長人貪淫驕橫，武帝常常寬容他。劉毅處死以后，諸葛長人對他的親信說：“從前剁死彭越，今年殺死韓信，災(zāi)禍就要到了?！睖?zhǔn)備陰謀作亂。武帝按時(shí)到達(dá)都城，卻常常停留不進(jìn)。公卿以下，連日在新亭等候，諸葛長人也忽然出現(xiàn)。隨后武帝乘一只輕快小船秘密到達(dá)，已經(jīng)回到了東府。諸葛長人到了府門，被叫到面前，擯退旁人說起閑話，凡是平生所沒有說盡的話，都和他說到了，諸葛長人非常高興。武帝秘密命令身邊的武士丁日午從布幔后出來，從座位上把他拉開，殺死在床邊。用車子拉著他的尸體交給廷尉，并且處死了他的弟弟諸葛黎人。丁日午驍勇有力，當(dāng)時(shí)的人有諺語說：“勿跋扈，會(huì)丁日午?！?br />
以前，山湖川澤都被豪強(qiáng)所奪取，百姓打柴、采摘、打魚、垂釣，都要強(qiáng)迫交稅，到現(xiàn)在一律禁絕。當(dāng)時(shí)人們的居住很不統(tǒng)一，武帝上表制定了條例，于是都依劃分的土地為準(zhǔn)，只有徐、兗、青三州居住在晉陵的人不在劃分的范圍。各個(gè)流民聚集的郡縣，有許多進(jìn)行了合并。
由武帝兼任鎮(zhèn)西將軍、豫州刺史。武帝堅(jiān)持辭去太傅、揚(yáng)州牧和班劍，歸還了黃鉞。
七月，朱齡石平定了蜀地，斬了譙縱，把他的人頭傳送到建鄴。
九月，晉安帝因?yàn)槲涞燮烬R國、定盧循的功勞，封武帝的次子劉義真為桂陽縣公；并且重申以前的任命，授給武帝太傅、揚(yáng)州牧的職務(wù)，配備葆羽、樂隊(duì)，儀仗二十人。將吏百官鼓動(dòng)勸導(dǎo)，才接受了羽葆、樂隊(duì)、儀仗，其余堅(jiān)決推辭。
義熙十年，精簡勞役，讓人民得到休息，建筑東府城，修建府衙房舍。
武帝看到荊州刺史司馬休之宗室繁盛，又很得長江、漢水一帶人心，懷疑他存有異志；而司馬休之的兒子司馬文思住在京城，招聚輕捷俠客，武帝把他抓住送交給司馬休之，讓他自己去處理。司馬休之上表請求廢除司馬文思的爵位，并且給武帝寫信致謝。
義熙十一年(415)正月，武帝逮捕了司馬休之的兒子司馬文寶、他哥哥的兒子司馬文祖，一并賜命自殺。率領(lǐng)大軍西出討伐。重新借掌黃鉞，兼任荊州刺史。派中軍將軍劉道憐監(jiān)管留府的事務(wù)。司馬休之上表自我剖白，并列舉武帝罪狀。司馬休之幕府中的錄事參軍韓延之有大用之才，武帝還沒到江陵，就秘密寫信招他。韓延之回信說：“承蒙親自率領(lǐng)兵馬，遠(yuǎn)赴西部地區(qū)，全境內(nèi)的士子平民，無不惶恐驚駭。蒙您來信，知道是因?yàn)樽S王以前的事，更增添了嘆息。司馬平西忠于國家，寬宏待人，因?yàn)槟锌飶?fù)晉朝的功勛，是國家依賴的人物，推贊您的德行，向您敬獻(xiàn)誠意，常常進(jìn)行詢問請教。譙王因?yàn)橐稽c(diǎn)小事被彈劾，仍然自己上表辭位；何況有了大錯(cuò)會(huì)緘默不語么！來信說，‘懷抱虛靜，期待賢才，由來已久’?，F(xiàn)在攻打別人的君長，而以私利引誘別人，真可以說是‘懷抱虛靜，期待賢才’了呀。劉藩死在宮殿門前，諸葛亡于嘍羅之手，甜言蜜語使州官們驚詫，突然襲擊又開來輕兵，于是使得客席上沒有誠心的士人，外地區(qū)沒有自信的諸侯，自以為是得意算盤，實(shí)在是一種恥辱。我雖然粗鄙拙劣，但是卻曾經(jīng)聽君子講過人生道義。以平西將軍的高尚品德，難道會(huì)沒有能夠授官的臣子么？借著天下喪亂，九流渾濁，應(yīng)當(dāng)與臧洪在地下共同游玩。不再多說?！蔽涞劭葱藕笊钌顕@息，拿它來給將士們看說：“追隨別人就應(yīng)當(dāng)是這樣。”
三月，軍隊(duì)駐扎在江陵。起初，雍州刺史魯宗之依仗氣力喜好亂為，而且顧慮不為武帝所容，常常念叨讖語說：“魚登日，輔帝室?！迸c司馬休之互相串通。到了現(xiàn)在，率領(lǐng)他的兒子竟陵太守魯軌會(huì)聚在江陵。武帝渡過長江，司馬休之的軍隊(duì)潰敗，與魯軌等人逃奔襄陽，江陵平定。武帝兼任南蠻校尉。將授南蠻官銜時(shí)，正遇上四廢日，下屬官員鄭鮮之等人建議改換一個(gè)日子，武帝沒有答應(yīng)。下令開恩實(shí)行寬大政策。
四月，進(jìn)軍襄陽，司馬休之等人逃奔姚興。晉安帝重申先前的命令，授職武帝擔(dān)任太傅、揚(yáng)州牧，可以帶劍穿履朝見皇帝，入朝不須趨步，贊拜不須報(bào)名，加贈(zèng)前部羽葆、樂隊(duì)，設(shè)置左右長史、司馬、從事中郎四人，封第三子劉義隆為北彭城縣公。八月十三日，武帝從江陵返回，奉還黃鉞，堅(jiān)決推辭太傅、州牧、前部羽葆、樂隊(duì)，其余的接受了任命。
義熙十二年正月，晉安帝詔令武帝依舊征召士人，兼任平北將軍、兗州刺史，加上督率南秦，共二十二州。武帝因?yàn)槠奖备形奈淙瞬湃狈Γ贿m合另外設(shè)置，于是撤銷了平北府，把它并入大府。三月，任命武帝為中外大都督。
起初，武帝掃平了齊國入侵，仍然有平定關(guān)中、洛陽的意思，遇上盧循侵襲逼迫，所以放下了。等到荊州、雍州平定，于是開始謀劃外部策略。正趕上姚興死去，他的兒子姚泓剛剛繼任，兄弟互相殺戮，關(guān)中混亂。四月十八日，武帝上表討伐關(guān)中、洛陽，便戒嚴(yán)討伐北方，命令他兼任征西將軍、司豫二州刺史。任命他的世子為徐、兗二州刺史。武帝希望以自己的聲望懷柔遠(yuǎn)方，接受了瑯邪王的封號北伐。五月，廬江的霍山崩裂，獲得了六口鐘，獻(xiàn)給了天子。十七日，加職兼任北雍州刺史，前后部羽葆、樂隊(duì)，增加班劍為四十人。八月十二日，率領(lǐng)大軍進(jìn)發(fā)，以世子為中軍將軍，監(jiān)管太尉留府事務(wù)，尚書右仆射劉穆之為左仆射，兼任監(jiān)軍、中軍二府的軍司，住進(jìn)東府，總管內(nèi)外一切事務(wù)。九月，武帝到了彭城，加職兼任北徐州刺史。十月，各軍到達(dá)洛陽，包圍了金墉，迫使他們投降。修復(fù)了晉朝皇家的五陵，設(shè)置了守衛(wèi)。
十二月二十九日，晉安帝加任武帝為相國、總百揆、揚(yáng)州牧，封賞十郡為宋公，具備九錫之禮，賜給玉璽、遠(yuǎn)游冠、綠綬帶，地位在諸侯王之上。
十三年正月，武帝利用船隊(duì)前往討伐，留下彭城公劉義隆鎮(zhèn)守彭城。軍隊(duì)駐扎在陳留城，經(jīng)過張良廟，下令要定時(shí)維修裝飾廟宇和祭奠。晉安帝追贈(zèng)武帝的祖父為太常，父親為特進(jìn)、左光祿大夫，武帝辭讓不肯接受。二月，冠軍將軍檀道濟(jì)等人的軍隊(duì)駐扎在潼關(guān)。三月初八，武帝率領(lǐng)大軍進(jìn)入黃河。五月，武帝到達(dá)洛陽，拜謁晉朝的五陵。七月，到了陜州，龍?bào)J將軍王鎮(zhèn)惡的水軍從黃河進(jìn)入渭河。八月，扶風(fēng)太守沈田子在藍(lán)田大破姚泓的軍隊(duì)。起初義熙九年，木星、土星、火星、金星曾經(jīng)聚攏在井宿，到現(xiàn)在終于關(guān)中平定。九月，武帝到長安。長安豐收，國庫積滿，武帝首先收集了他們的彝器、渾天儀、土圭、記里鼓、指南車以及秦始皇玉璽送到京城；其余的珍寶珠玉，全都分別賞賜給將帥。把姚家宗族遷徙到江南，押送姚泓到建康，在街市上將他斬首。武帝拜謁了漢朝的長陵，在未央殿大會(huì)文武官員。
十月，晉安帝下詔晉升宋公為宋王，增加十郡擴(kuò)大宋國，加上以前的共二十郡。他的相國、揚(yáng)州牧、兼征西將軍、司豫北徐雍四州刺史仍舊不變。武帝打算在長安休息，經(jīng)略趙、魏兩地，十一月，前將軍劉穆之去世，于是才返回。十二月初三，從長安出發(fā)，以桂陽公劉義真為雍州刺史，鎮(zhèn)守長安，留下心腹將領(lǐng)來輔佐他。
義熙十四年(418)正月二十六日，武帝到了彭城，解除戒嚴(yán)，脫去盔甲。以輔國將軍劉遵考為并州刺史，兼河?xùn)|太守，鎮(zhèn)守蒲坂。武帝辭去了司州職務(wù)，兼領(lǐng)徐、冀二州刺史，堅(jiān)持推讓晉升爵位。當(dāng)時(shí)漢中成固縣的漢水旁邊有奇異的聲音如同打雷，不一會(huì)河岸崩裂，有十二口銅鐘，從地下暴露出來。鞏縣人宗曜在他的農(nóng)田里得到了一株好莊稼，九個(gè)穗子同在一個(gè)莖上，武帝把它獻(xiàn)給晉安帝，安帝又歸還給他，武帝謙讓，才算結(jié)束。
六月二十三日，接受了賜給相國宋公的九錫，下令赦免國內(nèi)死刑以下的罪犯。詔令尊崇豫章太夫人為宋公太妃，世子為中軍將軍副官，相國府百官都依照朝廷的建制。又詔令宋國在所封的十郡以外，都可以選人任用。
先前，安西中兵參軍沈田子殺死了安西司馬王鎮(zhèn)惡，將領(lǐng)們殺死了安西長史王修，關(guān)中混亂。十月，武帝派遣右將軍朱齡石代替安西將軍桂陽公劉義真為雍州刺史。劉義真回京，被赫連勃勃所追趕，大敗，僅僅自己一人逃脫，眾將帥和朱齡石都被殺死。
十二月，晉安帝逝世，大司馬瑯笽王登上皇帝位。
元熙元年(419)正月，晉恭帝下詔征武帝入朝輔政，又重申以前的命令，把他的爵位由公晉升為王，把徐州的海陵、北東海、北譙、北梁，豫州的新蔡，兗州的北陳留，司州的陳郡、汝南、潁川、滎陽十郡，增加為宋國屬地。七月，才接受了命令。赦免國內(nèi)五年徒刑以下的罪犯，遷都到壽陽。九月，辭去了揚(yáng)州的職務(wù)。十二月，晉恭帝命令武帝的冕冠可以有十二個(gè)玉串，建立天子的旌旗，出入警戒清道，乘坐金根車，駕車用六匹馬，具備五時(shí)副車，設(shè)置旄頭云罕，樂舞使用八佾，設(shè)置編鐘木架懸掛在宮中。晉升王太妃為太后，王妃為王后，世子為太子，王子、王孫的爵位封號，完全和舊時(shí)的規(guī)制一樣。
二年正月，武帝上表辭讓特殊禮遇。竟陵郡江濱自己裂開，露出了古銅禮器十幾枚，武帝把它們獻(xiàn)給了晉恭帝，恭帝推讓不肯接受，于是送回了各種祥瑞器物，收藏在宰相府。四月，下詔書派人敦促勉勵(lì)，兼征武帝入朝輔政。六月初一，武帝到達(dá)京城。初九，晉恭帝禪讓帝位給宋王。有關(guān)部門把詔書的草稿寫成后，請恭帝把它書寫下來，天子隨即便拿起筆來，對身邊的人說：“桓玄的時(shí)候，天命已經(jīng)改換，重又被宋公接續(xù)下來，將近二十年。今天的事情，本是我心甘情愿的?！笔蝗?，晉恭帝派遣使者送上文書，又派遣使持節(jié)、兼太保、散騎常侍、光祿大夫謝澹，兼太尉、尚書劉宣范送上璽書，轉(zhuǎn)交皇帝的玉璽，受禪的禮節(jié)，完全和唐虞、漢魏從前的辦法一樣。武帝上表進(jìn)行辭讓，晉恭帝已經(jīng)退到瑯笽王府，奏表沒有送到。于是陳留王司馬虔嗣等二百七十人和宋臺(tái)的群臣一齊上表勸武帝即皇帝位，他還是不答應(yīng)。太史令駱達(dá)陳述天文符應(yīng)說：“按晉朝的義熙元年到元熙元年，金星白天出現(xiàn)，共有七次經(jīng)過天空，占卜說：‘金星經(jīng)過天空，人間換主，異姓新興?！x熙七年，有五條虹出現(xiàn)在東方，占卜說：‘五虹出現(xiàn)，天子廢黜，圣人將出?！拍?，土星、木星、金星、火星相聚在井宿。十三年，土星進(jìn)入太微星。占卜說：‘鎮(zhèn)星(土星)守太微，有王新立，有王遷徙?！踉甓欤邶埶拇紊教焐?，《易傳》說：‘冬天，龍出現(xiàn)，天子失去國家，大人接受天命?！街莸廊酸尫ǚQ告訴他的弟子道：‘嵩山之神說，江東有一個(gè)劉將軍，是漢朝皇家的后代，應(yīng)當(dāng)承受天命，我將把玉璧三十二只、鎮(zhèn)金一餅送給他，這是劉家占卜傳國應(yīng)有的世數(shù)啊?！瘽h朝建武到建安末共一百九十六年而禪讓給魏朝，魏朝從黃初到咸熙末共四十六年而禪讓給晉朝，晉朝從泰始到現(xiàn)在共一百五十六年，三代相讓，都是到六結(jié)束。又漢光武帝在南陽建立社宮，漢末而社宮前的樹死亡，劉備建立蜀國，就是和這相應(yīng)而興起；到了晉朝末年，舊根才開始萌發(fā)，到現(xiàn)在已經(jīng)繁盛起來了?！敝T如這些共有幾十條。群臣又堅(jiān)持請求，武帝才依從了。
永初元年(420)夏季六月十四日，武帝即位于南郊，設(shè)立祭壇，燒起木柴祭天。典禮結(jié)束，備好車駕，到了建康宮，坐在太極前殿，宣布大赦，改換年號。賜給每人爵位二級。鰥寡孤獨(dú)不能自己生活的人，每人發(fā)給谷物五斛，拖欠的租稅舊債不再收取。那些因?yàn)槠吩u鄉(xiāng)里人物、發(fā)表公正言論以及隱贓、貪污、淫穢、盜竊而被判罪的，一律免除。長期刑徒，全部寬大遣返。丟官失爵、受到監(jiān)禁、強(qiáng)制勞役的，全都恢復(fù)舊時(shí)的狀況。封晉恭帝為零陵王，可以將全郡作為食邑，懸掛天子的旌旗，乘坐五時(shí)副車，實(shí)行晉朝的歷法，郊外祭祀天地，禮樂制度，都用晉朝的典制，上書不稱作表，答表不稱作詔，宮殿定在原來的秣陵。追尊皇父為孝穆皇帝，母親為穆皇后，尊王太后為皇太后。
永初三年五月，皇上病危，召來太子，告誡他說：“檀道濟(jì)雖然有才干，卻沒有遠(yuǎn)大志向，不像他的哥哥檀韶有難以駕馭的氣概。徐羨之、傅亮看來不會(huì)有異圖。謝晦屢次跟隨征伐，很善于隨機(jī)應(yīng)變，如果有異圖，必定就是這個(gè)人。要縮小他的勢力，可以在會(huì)稽、江州安置他?！庇謱懥耸衷t：“朝廷不需要再有別府，宰相掌管揚(yáng)州，可以設(shè)置鎧甲武士一千人。如果大臣擔(dān)任重要職務(wù)，應(yīng)該派自己的爪牙，以防備居心不良的人，可以把京城留守部隊(duì)交給他。有外出征討，全部撥給京城部隊(duì)，戰(zhàn)爭結(jié)束歸來恢復(fù)原狀。后世如果有幼主，朝中的政事全部委任宰相，母后不要臨朝。儀仗軍隊(duì)不許進(jìn)入宮殿門，重要人物可以多給班劍?！倍蝗眨噬显谖鞯钍攀?，當(dāng)時(shí)年齡六十歲。七月二十五日，埋葬在丹陽建康縣蔣山初寧陵。群臣上謚號為武皇帝，廟號稱高祖。
武帝清心寡欲生活簡單樸素，很少欲望，風(fēng)格嚴(yán)整，具有法度，不曾細(xì)看珠玉車馬這些物品，后庭沒有紈綺絲竹各種音樂。起初，朝廷沒有設(shè)置樂隊(duì)，長史殷仲文因此建言，武帝說：“每天都忙不過來，而且也聽不懂啊。”殷仲文說：“經(jīng)常聽自然就懂了?！蔽涞壅f：“正因?yàn)槎耍蜁?huì)愛好它，所以才不去熟悉它?！睂幹菰?jīng)貢獻(xiàn)琥珀枕，光色十分美麗，價(jià)值百金。當(dāng)時(shí)將要北伐，因?yàn)殓昕梢灾委煒寕噬戏浅８吲d，命令砸碎分別送給各位將軍。平定關(guān)中后，得了姚興的侄女，十分寵愛，因此荒廢了軍政大事，謝晦勸諫，馬上就把她送出去了。財(cái)物都在外府，內(nèi)部沒有一點(diǎn)私人積藏。宋臺(tái)建立以后，有關(guān)部門奏請東西堂中放上曲形高腳的坐榻———局腳床，用鍍金的釘子，皇上不允許。結(jié)果使用了直腳床，釘用鐵釘。廣州曾經(jīng)貢獻(xiàn)入筒細(xì)布，一匹長八丈，武帝討厭它的精美累人，于是就交給了有關(guān)部門彈劾廣州太守，把布還給他們，并且下令嶺南禁止紡織這種布。武帝平時(shí)有一種熱病，并且患有槍傷，晚年尤其厲害，坐臥常常需要冷東西，后來有人獻(xiàn)了一張石床，睡上，覺得極好，于是嘆息說：“木床尚且很費(fèi)錢，何況是石床呢?！本妥屓税阉o毀了。他下令各個(gè)公主出嫁，陪送不超過二十萬，沒有錦繡金玉。朝內(nèi)外的人供給宮中費(fèi)用，無不節(jié)約儉省。性格尤其喜歡簡易，曾經(jīng)穿一雙連齒的木屐，喜歡出來在神武門內(nèi)左右散步，隨從的不過十多人。當(dāng)時(shí)徐羨之住在西州，他曾經(jīng)很想念徐羨之，便步行走出了西掖門，儀仗人員陸續(xù)追隨上來，已經(jīng)出了西明門了。諸位兒子早晨來慰問起居情況，進(jìn)門后脫去公服，只穿戴裙子帽子，就像家庭中的禮節(jié)一樣。
當(dāng)初身份低微的時(shí)候，他曾經(jīng)在丹徒種田，接受天命以后，鋤、鍬等農(nóng)具還有一些被保存下來，他命令把它們都收藏起來，以便留給后人。后來宋文帝視察舊宮，見到后問起來，身旁的人按照實(shí)際情況作了回答，文帝臉上很羞愧。有一個(gè)貼身的侍從進(jìn)言說：“大舜曾經(jīng)住在歷山種田，大禹曾經(jīng)親自從事土木，陛下不看到各位先圣的遺物，怎么知道稼穡的艱難，怎能知道先帝的大德呢？”到了孝武帝大明年間，拆毀了武帝所住的陰暗房子，在原地筑起了玉燭殿，和群臣一起觀看，床頭有土障，墻上掛著葛草制的燈籠，麻繩制的拂塵，侍中袁靑十分稱贊皇上的儉素品德，孝武帝不作回答，獨(dú)自說道：“田舍公得到了這些，已經(jīng)是過分了?！彼运軌蛘加泻凸庹仗煜?，完成大業(yè)，真是太隆盛了！
他曾游覽京口的竹林寺，獨(dú)自躺在講堂的前面，上面有一條五色龍顯現(xiàn)出來，眾僧人見了，驚慌地告訴了武帝，武帝獨(dú)自高興地說：“請上人不要亂講?！彼赣H的墓在丹徒的候山，那里就是秦史上所說的曲阿、丹徒之間有天子氣的地方。當(dāng)時(shí)有個(gè)叫孔恭的人，很善于占墓，武帝曾經(jīng)和他一塊經(jīng)過墓地，欺騙他說：“這片墳?zāi)乖趺礃樱俊笨坠дf：“不是一般的地方喲！”武帝從此更加自負(fù)。行動(dòng)時(shí)常常見到有兩條小龍附在兩翼，到山上砍柴或到水邊打魚，同伴們有的也曾經(jīng)看見。地位尊貴以后，龍形更大。
武帝一向貧窮，當(dāng)時(shí)的人都不能識(shí)別他的才干，只有瑯笽人王謐獨(dú)自對他深深敬重。武帝曾經(jīng)欠刁逵的社錢三萬，好長時(shí)間無法償還，被刁逵抓起來，王謐暗中用自己的錢代他還上，由此得到釋放。后來在新洲割荻草，看到了一條大蛇有幾丈長，就用箭射它，蛇受了傷。第二天又到了新洲，聽到里面有杵臼的聲音，進(jìn)去一看，見有好幾個(gè)童子都穿著青色的衣服，在草叢中搗藥。問他們是怎么回事，回答說：“我們的大王被劉寄奴射傷了，配些藥給他敷上。”武帝說：“神王怎么不把劉寄奴殺死？”回答說：“劉寄奴是個(gè)王，不會(huì)死的，所以不能殺他?！蔽涞酆沁乘麄?，都跑散了，便收起藥來回去了。又曾經(jīng)住宿在下邳的旅舍，碰到一個(gè)小和尚對武帝說：“江東將要大亂，能使這里安定下來的，恐怕就是您了吧！”武帝的手曾經(jīng)被割傷，多年不愈，和尚有一種黃散，便留給了武帝，隨后忽然不見了，武帝用黃散敷在手上，那傷口只敷一次就好了。保留剩余的黃散以及所得的童子的藥，每當(dāng)遇到刀傷，敷上都很靈驗(yàn)。
起初他擔(dān)任冠軍孫無終的司馬。晉朝隆安三年(399)十一月，妖賊孫恩在會(huì)稽作亂，朝廷派衛(wèi)將軍謝琰、前將軍劉牢之去東方討伐。劉牢之請武帝參謀府中軍事，命令他與幾十個(gè)人一道監(jiān)視賊軍，遇到了賊兵幾千人，武帝便和他們打起來，所率領(lǐng)的人大多戰(zhàn)死，而武帝揮舞著長刀，殺傷了很多賊兵。劉牢之的兒子劉敬宣懷疑武帝被賊兵圍困，就帶了一些輕騎去尋找他；不久，眾多騎兵一齊來到，于是平定了山陰，孫恩逃到了海上。
隆安四年(340)五月，孫恩又進(jìn)入了會(huì)稽，殺了謝琰。十一月，劉牢之再次東征，讓武帝守衛(wèi)句章，句章城小人少，武帝每次戰(zhàn)斗都攻陷敵方陣地，賊軍便退回浹口。當(dāng)時(shí)東伐的各個(gè)將官，手下士卒都大肆掠搶，老百姓都深受苦害，只有武帝的軍隊(duì)無所侵犯。
隆安五年(341)春天，孫恩頻繁進(jìn)攻句章，武帝屢次擊敗他，孫恩重新逃到海上。三月，孫恩向北開往海鹽，武帝在舊海鹽筑起城墻，賊軍每日都來攻城，城內(nèi)的兵少，武帝便選了一支敢死隊(duì)把賊軍趕走。當(dāng)時(shí)雖然接連勝利，武帝卻深深地憂慮著眾寡不敵，就在一個(gè)夜里把軍旗收了起來，以顯示自己方面的疲弱，看到敵方懈怠的時(shí)候，便奮力出擊，大破賊兵。孫恩知道城無法攻下，便向滬瀆進(jìn)兵，武帝棄城追趕。海鹽縣令鮑陋派遣兒子鮑嗣之率領(lǐng)吳地兵士一千作為前驅(qū)，武帝因?yàn)閰堑厝瞬皇炝?xí)打仗，命令他們排在后面，他們不答應(yīng)。這一夜武帝設(shè)了很多奇兵，同時(shí)添置旗鼓，第二天戰(zhàn)斗，伏兵殺了出來，賊兵撤退，鮑嗣之追趕逃敵，結(jié)果被消滅。武帝且退且戰(zhàn)，部下死傷將盡，便回到原來的地方停了下來，讓身邊的人們?nèi)ソ馊∷廊说囊路燥@示出閑暇的樣子。賊兵懷疑還有埋伏，便退走了。六月，孫恩渡海到了丹徒，武帝加倍趕路與他一齊到達(dá)，迅速出擊，大破賊軍。孫恩到了建鄴，知道朝廷已經(jīng)有了防備，于是逃往郁洲。八月，晉朝皇帝任命武帝為下邳太守。武帝又追擊孫恩到郁洲和海鹽，接連擊敗他們。孫恩從此以后出現(xiàn)饑荒，逃奔臨海。
元興元年(402)，荊州刺史桓玄率兵東下，驃騎將軍司馬元顯派劉牢之抵抗，武帝又參加了他的軍事行動(dòng)?；感竭_(dá)以后，武帝請求攻擊，劉牢之不許，卻派自己的兒子劉敬宣去找桓玄請求和解。武帝和東海人何無忌一齊竭力勸諫，劉牢之拒不聽從?；感タ肆私ㄠ?，朝廷任命劉牢之為會(huì)稽內(nèi)史。劉牢之恐懼，招武帝在廣陵起兵，武帝說：“人情不在了，廣陵又哪里能得到呢？”劉牢之結(jié)果在新洲自縊而死。何無忌對武帝說：“我將到哪里去呢？”武帝說：“可以隨我回京口。桓玄必定會(huì)保持對待臣子的節(jié)操，我可以和您一起侍奉他；不行的話，就和您一起對付他?！?br />
桓玄的堂兄桓修以撫軍將軍的頭銜鎮(zhèn)守丹徒，任命武帝為中兵參軍。孫恩自從兵敗以后，害怕被抓獲，便在臨海投水而死，其余的兵眾推舉孫恩的妹夫盧循為主帥?；感俅闻晌涞蹡|征。
元興二年(403)，盧循逃奔永嘉，武帝追趕并擊破了他。六月，任命武帝為彭城內(nèi)史。
十二月，桓玄篡奪了帝位，把晉朝的皇帝遷移到了尋陽。桓修調(diào)入朝廷，武帝跟隨到了建鄴，桓玄見了武帝，對司徒王謐說：“昨天見到了劉裕，風(fēng)度不凡，確是世人中的豪杰呀?！泵看斡螛费缂?，贈(zèng)送賞賜十分豐厚。桓玄的妻子劉氏，是尚書令劉耽的女兒，聰明智慧，很有見識(shí)，曾經(jīng)見到武帝，便對桓玄說：“劉裕龍行虎步，目光不凡，恐怕必定不會(huì)做別人的下屬，要對他早作安排?！被感f：“我正在蕩平中原，非劉裕不可，等關(guān)、隴地區(qū)平定，然后再作討論?！?br />
桓修不久回到京口，武帝借口說槍傷惡化，不能隨同，便與何無忌一同乘船返回，商討復(fù)興的方案，與弟弟劉道軌、沛國的劉毅、平昌的孟昶、任城的魏詠之、高平的檀憑之、瑯笽的諸葛長人、太原的王元德、隴西的辛扈興、東莞的童厚之，共同謀劃大計(jì)。當(dāng)時(shí)桓修的弟弟桓弘擔(dān)任青州刺史，鎮(zhèn)守廣陵，劉道軌擔(dān)任桓弘的中兵參軍，孟昶擔(dān)任青州主簿，于是武帝就讓劉毅到孟昶那里謀劃共同襲擊桓弘。諸葛長人擔(dān)任豫州刺史刁逵的左軍府參軍，預(yù)謀占據(jù)歷陽來相策應(yīng)，王元德、童厚之預(yù)謀在建鄴進(jìn)攻桓玄，時(shí)間一到一齊行動(dòng)。
元興三年(404)二月二十七日，武帝假托游獵，和何無忌，魏詠之，檀憑之，劉毅的堂弟劉藩，檀憑之的侄子檀韶、檀祗、檀隆、檀道濟(jì)，孟昶的族弟孟懷玉等人，聚集了義徒共二十七人，愿意隨從的一百多人。二十八日，等城門打開，何無忌等義徒身穿傳達(dá)詔書人的服裝，口稱詔書走在前面，義徒們騎馬馳入城內(nèi)齊聲大叫，官吏士兵都被驚散，隨即將桓修斬首示眾。武帝哭得十分傷心，進(jìn)行了豐厚的埋葬和撫恤。孟昶勸桓弘在這一天外出打獵，天還沒有明，打開城門放出了打獵的人，孟昶、劉道軌、劉毅等率壯士五六十人，因城門打開而直接進(jìn)入。桓弘正在喝粥，就被斬首，于是收集他的兵眾渡江。
義軍剛剛攻下京城，桓修的司馬刁弘率領(lǐng)文武官員前來攻打，武帝登上城頭對他們說：“郭江州已經(jīng)在尋陽侍奉御車撥亂反正，我們?nèi)挤盍嗣茉t誅除逆黨，現(xiàn)在逆賊桓玄的頭應(yīng)當(dāng)砍掉掛在大航的高桿上面。諸君難道不都是大晉的臣子嗎？”桓弘等人相信了他們，便退了回去。劉毅到了以后，武帝命令他殺死刁弘等人。
劉毅的哥哥劉邁原先住在建鄴，事情還沒發(fā)生的前幾天，武帝派遣同謀周安穆報(bào)告了他，讓他來作內(nèi)應(yīng)。劉邁非?？謶?，周安穆害怕事情暴露，馳馬返回。當(dāng)時(shí)桓玄讓劉邁擔(dān)任竟陵太守，劉邁便乘船而下，打算到郡上任。這天夜里，桓玄給劉邁寄信說：“北府的人情況怎么樣？您最近見劉裕說了些什么？”劉邁以為桓玄已經(jīng)知道了他們的計(jì)謀，早晨起來就把情況告訴了他。桓玄很吃驚，封劉邁為重安侯，又因?yàn)樗麤]有把周安穆抓住，所以把他殺了，又殺了王元德、辛扈興、童厚之等。于是派遣頓丘太守吳甫之、右衛(wèi)將軍皇甫敷抵御北面的義軍。
在此以前，武帝曾到游擊將軍何澹之那里去，身邊的人見武帝光耀滿室，便把這種現(xiàn)象告訴了何澹之，何澹之又說給了桓玄，桓玄并不介意，到了現(xiàn)在，聽說義兵起事了，非?？謶?。有人說：“劉裕他們非常虛弱，陛下何必過深地憂慮？”桓玄說：“劉裕足可以成為一世的雄杰，劉毅家里沒有一石糧食的儲(chǔ)蓄，而賭博時(shí)擲骰子一押百萬，何無忌，是劉牢之的外甥，酷似他的舅父，共同舉辦大事，怎么就說不能成功？”當(dāng)時(shí)眾人推舉武帝為盟主，以孟昶為長史，總管后方事務(wù)，檀憑之為司馬，愿意隨從的老百姓有一千多人。軍隊(duì)駐扎在竹里，向京城發(fā)出了檄文。
三月初一，在江乘遇到了吳甫之，武帝親自拿著大刀，大聲呼叫，隨即把吳甫之殺死。進(jìn)軍到羅落橋，遇到了皇甫敷，檀憑之戰(zhàn)敗被殺，眾人紛紛后退，武帝前進(jìn)戰(zhàn)斗更加猛烈，而且又殺了皇甫敷的頭。起初，武帝謀劃大計(jì)，有善于相面的人給武帝和何無忌等人相面，說他們近期一定會(huì)大貴，只是說檀憑之沒有貴相。到現(xiàn)在檀憑之戰(zhàn)死，武帝知道這件事必定勝利。
桓玄聽說皇甫敷等人已死，就派桓謙屯駐東陵口，卞范之屯駐覆舟山西面。三月初二，義軍進(jìn)駐覆舟山東部，布置了疑兵，用涂油的披肩蓋在樹上，布滿山谷。武帝首先馳向敵軍，將士們?nèi)歼M(jìn)行殊死的戰(zhàn)斗，無不一以當(dāng)百，呼聲震天動(dòng)地。又借著風(fēng)力放火，濃煙與火焰沖天，桓謙大敗。桓玄開始雖然派出了軍隊(duì)，但是逃走的心意已經(jīng)決定，另外派遣了領(lǐng)軍殷仲文在石頭城準(zhǔn)備好船只，聽說桓謙失敗，便乘著輕快的小船向南逃跑了。
三月初三，武帝鎮(zhèn)守石頭城，任命了留守臺(tái)閣的各級官員，在宣陽門外燒毀了供奉桓溫的牌位，在太廟中建造了晉朝的新神主。派遣各路將官追擊桓玄，命令尚書王嘏率領(lǐng)百官迎接皇帝的車駕。司徒王謐與眾人商議推舉武帝兼職掌管揚(yáng)州，武帝堅(jiān)決推辭，便以王謐擔(dān)任錄尚書事、兼任揚(yáng)州刺史，武帝擔(dān)任鎮(zhèn)軍將軍、都督八州諸軍事、徐州刺史、領(lǐng)軍將軍。
起初，晉陵人韋叟擅長相面術(shù)，桓修讓他相一相武帝是不是能當(dāng)上州官，韋叟說：“應(yīng)當(dāng)做邊遠(yuǎn)州的刺史?！被仡^又私下對武帝說：“您的面相貴不可言。”武帝笑著說：“如果說中了，一定任用您為司馬。”到了現(xiàn)在，韋叟去見武帝說：“周成王不忘桐葉之信，您也應(yīng)該不忘司馬之言?，F(xiàn)在我不敢希望做鎮(zhèn)軍司馬，只想能夠兼任一個(gè)軍佐。”于是就任用了他。
當(dāng)時(shí)諸葛長人沒有如期趕到，被刁逵抓住押送過去，還沒到達(dá)，桓玄就失敗了?；感?jīng)過尋陽，江州刺史郭昶之為他準(zhǔn)備了車子和儀仗器物。起初，荊州刺史王綏因?yàn)槭墙瓥|的顯貴世族，又是桓氏的外甥，平時(shí)對武帝十分欺侮，到了現(xiàn)在，與他的父親尚書左仆射王愉都抱有懷疑心理，一齊被殺死。
四月初一，尊奉武陵王司馬遵為大將軍，按照圣旨，實(shí)行大赦，只有桓玄祖父的后輩不予赦免?；感畚唬怯赏踔k輔佐的，是他親手解下晉安帝的玉璽。等到義旗樹立，眾人都說王謐應(yīng)該殺掉，只有武帝平時(shí)對王謐很感激，因而保護(hù)他。劉毅曾經(jīng)趁朝會(huì)的機(jī)會(huì)，問王謐玉璽在什么地方，王謐更加恐懼。等到王愉父子被殺，王謐的堂弟對王謐說：“王駒無罪而被殺死，這是鏟除勝過自己的人，兄長既是桓氏一黨的人，希求免禍能夠做到嗎？”駒，是王愉的小字。王謐恐懼，逃奔曲阿。武帝告訴大將軍把他迎接回來，恢復(fù)了他的職位。
桓玄挾持天子逃往江陵，又渡江東下，與劉毅、何無忌、劉道軌等在崢嶸洲相遇，眾軍把他打得大敗?；感狞h徒殷仲文擁戴兩位皇后回到建鄴?；感赜謷冻痔熳拥搅私辏哪抢锾油峡?，太守王騰之、荊州別駕王康產(chǎn)擁戴天子進(jìn)入南郡府。
起初，益州刺史毛璩派遣侄孫毛佑之和參軍費(fèi)恬為弟弟送喪離開州城，毛璩弟弟的兒子毛修之當(dāng)時(shí)做桓玄的屯騎校尉，引誘桓玄進(jìn)入蜀地，到了枚回洲，費(fèi)恬和毛佑之迎面用箭射他，益州督護(hù)馮遷殺死了桓玄，把人頭送往建鄴。桓玄的侄子桓振逃到華容的涌中，招集逆黨，襲擊江陵城，王騰之、王康產(chǎn)都被殺死。桓謙先前曾藏在沮川，也聚集人馬與桓振呼應(yīng)。他們?yōu)榛感e行哀悼，設(shè)立了喪庭?；钢t率領(lǐng)眾官員奉獻(xiàn)玉璽給晉安帝。劉毅、何無忌進(jìn)軍與桓振交戰(zhàn)，在靈溪戰(zhàn)敗。
十月，武帝兼任青州刺史，可以帶領(lǐng)衛(wèi)士一百人進(jìn)入宮殿。
義熙元年(405)正月，劉毅等到達(dá)江津，擊敗了桓謙、桓振，江陵平定。三月十三日，晉朝皇帝從江陵來到。十九日，詔令晉升武帝為侍中、車騎將軍、都督中外軍事、錄尚書事。武帝堅(jiān)持推辭，不久鎮(zhèn)守丹徒。九月二十七日，任命武帝兼做兗州刺史。
盧循渡海攻破廣州，俘獲了刺史吳隱之，于是便以盧循為廣州刺史，以他的同黨徐道覆為始興相。
義熙二年三月，晉升武帝督率交、廣二州。十月，評論匡復(fù)晉朝的功勛，封武帝為豫章郡公，食邑一萬戶，賜絹一萬疋。其余的人封賞各有差別。
三年十二月，司徒、錄尚書、揚(yáng)州刺史王謐去世。
四年正月，征調(diào)武帝入朝輔政，授職擔(dān)任侍中、車騎將軍、開府儀同三司、揚(yáng)州刺史、錄尚書事，徐、兗二州刺史依舊保留。武帝上表解去兗州職務(wù)。在這以前，武帝曾經(jīng)派遣冠軍劉敬宣討伐蜀地的賊寇譙縱，結(jié)果沒有成功回來了。九月，武帝因?yàn)閯⒕葱麛⊥?，請求退位，沒有批準(zhǔn)。十月，降級為中軍將軍，開府職位仍然不變。
五年二月，偽燕國國主慕容超大肆掠奪淮北。三月，武帝上表請求去北方討伐，讓丹陽尹孟昶監(jiān)管中軍留府事務(wù)。于是渡過淮水進(jìn)入泗水，五月，到達(dá)下邳，留下船只，軍隊(duì)步行前進(jìn)到了瑯笽，所經(jīng)過的地方，都筑城留人守衛(wèi)。
慕容超的大將公孫五樓請求占領(lǐng)大峴山，堅(jiān)壁清野等待對方，慕容超不肯聽從。最初謀劃這次戰(zhàn)役，參加討論的人認(rèn)為賊軍如果嚴(yán)守大峴山，軍中沒有所需物資，自己怎么能夠返回？武帝說：“并不是這樣。鮮卑人性格貪婪，謀劃事情看不到遠(yuǎn)處，既慶幸自己的勝利，又十分愛惜那些谷物，必然會(huì)引誘我們，而且會(huì)輕率交戰(zhàn)。部隊(duì)一入峴山，我們還有什么擔(dān)憂呢？”等到進(jìn)入了峴山，武帝舉手指著天說：“我們的事情成功了?！北娙嗽儐柶渲械木壒剩涞壅f：“軍隊(duì)已經(jīng)越過險(xiǎn)要地形，兵士都有必死的斗志，余糧儲(chǔ)存在田野當(dāng)中，軍隊(duì)沒有缺乏給養(yǎng)的憂慮，勝利是可以斷定的?！?br />
六月，慕容超留下老弱兵士守衛(wèi)廣固，派他手下的廣寧王賀剌盧與公孫五樓全力占據(jù)臨朐。離城四十里有個(gè)巨蔑水，慕容超告誡公孫五樓要抓緊占據(jù)它。等他趕到，已經(jīng)受到龍?bào)J將軍孟龍符的保衛(wèi)，公孫五樓只得退回。
大軍把四千輛兵車分為兩翼，兩車并排慢慢行駛，車前張掛帷幔，御手拿著長矛，以騎兵為流動(dòng)軍隊(duì)，軍令十分嚴(yán)肅。等到達(dá)臨朐，賊軍的騎兵一齊來到，武帝命令兗州刺史劉藩、并州刺史劉道憐等攻陷敵軍陣地。太陽偏西的時(shí)候，戰(zhàn)斗仍然十分激烈，武帝利用參軍胡藩的計(jì)策，襲擊攻克臨朐，賊軍于是大肆逃奔。慕容超逃回廣固，獲得了他的玉璽、豹尾、轎車等，送到都城。十九日，攻克了廣固的大城，慕容超加固了它的小城。武帝于是設(shè)下了很長的包圍圈進(jìn)行監(jiān)守，吃住都在青州，停止了長江、淮河的物資轉(zhuǎn)運(yùn)。
七月，慕容超的尚書郎張綱去向姚興請求救兵，從長安返回，泰山太守申宣把他捉住押送過來。張綱具有巧妙的構(gòu)思，先前，武帝制造攻城的器具，城上的人說：“你們得不到張綱，怎么能制成呢！”等到張綱來到，城內(nèi)的人無不大驚失色。慕容超既然求救沒有成功，張綱反被俘虜，于是便請求稱臣，割大峴山為界，獻(xiàn)馬一千匹，武帝不答應(yīng)。
當(dāng)時(shí)姚興派遣使者，聲言將要渡過淮水東下，武帝對他說：“你報(bào)告姚興，我平定了青州，將要跨過函谷關(guān)，他這賊寇若能自己送上門來，現(xiàn)在正是時(shí)候?！变浭聟④妱⒛轮鋈贿M(jìn)來說：“這話不足以威脅敵人，也許會(huì)激怒他們。如果鮮卑沒有戰(zhàn)勝，西羌又來侵?jǐn)_，您將怎么對付？”武帝于是笑著說：“這是軍事機(jī)密，不是您所能知道的。西羌如果能夠來救，不會(huì)先有聲明，這只是他們自己在故作強(qiáng)大。”
十月，張綱制成了攻城器具，設(shè)計(jì)了飛樓懸梯、木幔板屋，上面蓋上牛皮，弓箭就無法奏效了。劉毅派遣上黨太守趙恢率領(lǐng)一千余人前來援助，武帝夜間暗中派軍隊(duì)與他會(huì)合。天明后，趙恢的部隊(duì)五千人，才上路前進(jìn)，每當(dāng)晉朝使者將到的時(shí)候，就如此重復(fù)一遍。
六年二月初五，攻克了廣固進(jìn)行屠殺，慕容超越過城墻逃走，結(jié)果追上了他，在建康的街市上將他斬首。殺掉了他的王公以下官員，獲得人口一萬多、馬二千匹。
起初，武帝進(jìn)軍北方，徐道覆勸盧循乘虛而出，盧循不聽，徐道覆于是去到番禺說服盧循說：“今天的機(jī)會(huì)，萬萬不可丟失。如果你攻占了京都，劉公雖然回來，也沒有什么辦法了?！北R循聽從了他。這月，侵犯南康、盧陵、豫章等郡，郡守都逃走了。當(dāng)時(shí)武帝將要鎮(zhèn)守下邳，進(jìn)軍到了黃河、洛水，等征調(diào)的使者到后，當(dāng)天就班師還朝了。鎮(zhèn)南將軍何無忌與徐道覆交戰(zhàn)，失敗戰(zhàn)死在豫章，朝內(nèi)外都很震驚，朝中的議論想擁戴皇上向北逃走。武帝駐軍在山陽，聽說失敗，脫去盔甲與幾十個(gè)人一起到江上去調(diào)查詢問，知道賊軍還沒有到達(dá)。
四月初二，武帝到了京都。劉毅自己上表請求南征，武帝認(rèn)為賊軍剛剛打了勝仗，氣勢正盛，必須軍容嚴(yán)整，共同前進(jìn)，便讓劉藩制止他，劉毅不聽從。五月的壬午日，盧循在桑落洲打敗了劉毅。等他們得知了武帝勝利進(jìn)入，個(gè)個(gè)互相對視，大驚失色，企圖退回尋陽，平定江陵，據(jù)守二洲來對抗朝廷。徐道覆請求乘勝繼續(xù)前進(jìn)，爭論了十天，才依從了他的意見。
這時(shí)北國的軍隊(duì)剛退回去，創(chuàng)傷沒有恢復(fù)，戰(zhàn)士只有幾千人，而賊軍卻有十幾萬，戰(zhàn)船綿延千里。孟昶、諸葛長人很恐懼，打算保護(hù)天子過江，武帝說：“現(xiàn)在兵士雖然少，還足可以一戰(zhàn)，如果敵寇渡江成功，大臣、君主就會(huì)共同滅亡；如果不是這樣，不可能再在草野間求得活命，我的主意已經(jīng)定了?！逼鸪酰涞壅饔懩饺莩?，只有孟昶鼓勵(lì)行動(dòng)，四月初五，孟昶便上表給天子，引罪自責(zé)，服藥而死。
當(dāng)時(shí)的議論者企圖分兵屯守各個(gè)渡口，武帝說：“賊眾我寡，分兵以后則會(huì)有人探測到虛實(shí)，一處失利，就會(huì)破壞三軍的心態(tài)，如果在石頭城聚集各軍，則各軍的力量不會(huì)分散?！彼脑鲁跗?，武帝轉(zhuǎn)移駐地到石頭城。十四日，賊軍大規(guī)模開來，武帝說：“賊軍如果由新亭直上，就暫且回避它；如果回頭停泊在蔡洲，就會(huì)被捉住的?！毙斓栏泊蛩銖男峦龤Т唤粦?zhàn)，盧循疑慮多決斷少，常常追求萬全之策，于是便停泊在蔡洲以等待軍隊(duì)潰敗。武帝登上石頭城遠(yuǎn)望，見到了這種情形，很高興。二十九日，賊軍在南岸設(shè)下伏兵，又向白石派出疑兵。武帝率領(lǐng)劉毅、諸葛長人向北出兵抵御，留下了參軍徐赤特守衛(wèi)查浦，告誡和命令他們不準(zhǔn)交戰(zhàn)。武帝北出以后，賊軍焚燒了查浦而到達(dá)張侯橋，徐赤特與他們交戰(zhàn)，大敗，賊軍前進(jìn)屯駐在丹陽郡。武帝馳馬回到石頭城，斬了徐赤特。解去盔甲很長時(shí)間，才在南塘出陣。七月初十，盧循從蔡洲撤退，準(zhǔn)備歸回尋陽，武帝派遣輔國將軍王仲德等追擊。讓建威將軍孫處從海道上襲擊番禺，告誡他說：“我在十二月必定擊破妖寇，您也足可以到達(dá)番禺，要首先搗毀他的巢穴?！?br />
十月，武帝率領(lǐng)艦隊(duì)南伐，派劉毅監(jiān)管太尉留府。這月，徐道覆攻擊江陵，荊州刺史劉道軌把他打得大敗，徐道覆逃回湓口。十一月，孫處到了番禺，把城攻破，盧循的父親盧嘏逃奔始興，孫處安撫當(dāng)?shù)孛癖娺M(jìn)行守衛(wèi)。十二月初一，大軍駐扎在大雷。初二，賊軍沿江而下，武帝親自拿著軍旗和戰(zhàn)鼓，命令各路軍隊(duì)奮力拼殺，軍中有很多萬鈞神弓，所到之處無不摧毀。武帝自己在中流皺眉觀看，順著風(fēng)和水的走勢，賊艦全都先靠近西岸，岸上軍士事先已經(jīng)準(zhǔn)備好了火把，將他們?nèi)繜龤В瑲⒌么髷?。盧循回到尋陽，接著便逃往豫章，全力在左里建造柵欄。十八日，大軍駐扎在左里，即將開戰(zhàn)，武帝揮動(dòng)令旗，令旗的旗竿折斷，旗子沉入水中，眾人都很恐懼，武帝笑著說：“過去的覆舟戰(zhàn)役也是這樣，今日的勝利是必定無疑的了?！泵凸耻姷臇艡?，盧循單獨(dú)乘著一條船逃走，眾官兵都投降了。大軍凱旋，晉安帝派侍中黃門到營地去進(jìn)行慰勞。
義熙七年正月十二日，整頓部隊(duì)歸來，改任他為大將軍、揚(yáng)州牧，贈(zèng)給他班劍二十人，原來的官職依舊。武帝堅(jiān)持推辭。凡是南北征討戰(zhàn)死者，全都列出姓名請朝廷贈(zèng)發(fā)錢財(cái)治喪，尸體失掉沒有返回的，派遣主帥前去迎接，使歸還本土。
二月，盧循到了番禺，被孫處擊敗，收羅剩余兵眾向南逃走。劉藩、孟懷玉在始興將徐道覆殺死。
自從晉朝中興以來，朝廷的綱紀(jì)松弛紊亂，權(quán)貴之門互相兼并，老百姓流離失所，不能保持自己的產(chǎn)業(yè)?；感芟敫淖冞@種狀況，結(jié)果沒能實(shí)行。武帝做了輔佐大臣以后，大力宣傳規(guī)章制度，豪強(qiáng)謹(jǐn)慎規(guī)矩，遠(yuǎn)近遵法守紀(jì)。到現(xiàn)在，會(huì)稽余姚的虞亮又隱藏了逃亡人員一千多人。武帝殺死了虞亮，罷免了會(huì)稽內(nèi)史司馬休之。
晉安帝重申了以前的授官詔令，武帝堅(jiān)持推辭。于是改授他為太尉、中書監(jiān)，他才接受了任命，奉送了黃鉞。
交州刺史杜惠度殺死了盧循父子，將七個(gè)人頭用盒子裝了送到京城。
在這以前，各州所送的秀才、孝廉大多名不符實(shí)，武帝于是上表申明從前的規(guī)定，對他們進(jìn)行策試。
荊州刺史劉道軌患病，要求回鄉(xiāng)，義熙八年四月，改授豫州刺史，讓豫州刺史劉毅去代替他。劉毅一向具有雄才大志，與武帝一起興復(fù)晉朝，自認(rèn)為京城、廣陵的功勞足以互相抗衡，雖然暫且推舉武帝，而心中卻不服氣。他非常自傲自夸，朝士中素有威望者多去歸附他，他與尚書仆射謝混、丹陽尹郗僧施都結(jié)交很深。等他去鎮(zhèn)守江陵，豫州舊府的下屬許多人都辭職去跟隨他，他奏請讓郗僧施任南蠻校尉。武帝知道劉毅終究是一個(gè)異端人物，心里在秘密算計(jì)他。劉毅到了西部，稱言病重，上表請求讓堂弟兗州刺史劉藩作為副手，武帝假裝答應(yīng)了他。九月，劉藩入朝，武帝命令逮捕劉藩和謝混，一并賜死。自己上表請求討伐劉毅，又借掌黃鉞，率領(lǐng)各路軍隊(duì)西征。任命前鎮(zhèn)軍將軍司馬休之為平西將軍、荊州刺史，兗州刺史劉道憐鎮(zhèn)守丹徒，豫州刺史諸葛長人監(jiān)管太尉留府事務(wù)，任命太尉司馬丹陽尹劉穆之為建威將軍，給他配備實(shí)際兵力。十五日，從建鄴出發(fā)，派遣參軍王鎮(zhèn)惡、龍?bào)J將軍蒯恩前往襲擊江陵，將城攻破，劉毅及其黨羽全部被殺。
十一月，武帝到了江陵，分出荊州的十個(gè)郡成為湘州，武帝仍舊前往督察。任命西陽太守朱齡石為益州刺史，讓他討伐蜀地，晉安帝晉升武帝為太傅、揚(yáng)州牧，贈(zèng)給羽葆、樂隊(duì)，儀仗二十人。
九年二月三十日，武帝從江陵到來。起初，諸葛長人貪淫驕橫，武帝常常寬容他。劉毅處死以后，諸葛長人對他的親信說：“從前剁死彭越，今年殺死韓信，災(zāi)禍就要到了?！睖?zhǔn)備陰謀作亂。武帝按時(shí)到達(dá)都城，卻常常停留不進(jìn)。公卿以下，連日在新亭等候，諸葛長人也忽然出現(xiàn)。隨后武帝乘一只輕快小船秘密到達(dá)，已經(jīng)回到了東府。諸葛長人到了府門，被叫到面前，擯退旁人說起閑話，凡是平生所沒有說盡的話，都和他說到了，諸葛長人非常高興。武帝秘密命令身邊的武士丁日午從布幔后出來，從座位上把他拉開，殺死在床邊。用車子拉著他的尸體交給廷尉，并且處死了他的弟弟諸葛黎人。丁日午驍勇有力，當(dāng)時(shí)的人有諺語說：“勿跋扈，會(huì)丁日午?！?br />
以前，山湖川澤都被豪強(qiáng)所奪取，百姓打柴、采摘、打魚、垂釣，都要強(qiáng)迫交稅，到現(xiàn)在一律禁絕。當(dāng)時(shí)人們的居住很不統(tǒng)一，武帝上表制定了條例，于是都依劃分的土地為準(zhǔn)，只有徐、兗、青三州居住在晉陵的人不在劃分的范圍。各個(gè)流民聚集的郡縣，有許多進(jìn)行了合并。
由武帝兼任鎮(zhèn)西將軍、豫州刺史。武帝堅(jiān)持辭去太傅、揚(yáng)州牧和班劍，歸還了黃鉞。
七月，朱齡石平定了蜀地，斬了譙縱，把他的人頭傳送到建鄴。
九月，晉安帝因?yàn)槲涞燮烬R國、定盧循的功勞，封武帝的次子劉義真為桂陽縣公；并且重申以前的任命，授給武帝太傅、揚(yáng)州牧的職務(wù)，配備葆羽、樂隊(duì)，儀仗二十人。將吏百官鼓動(dòng)勸導(dǎo)，才接受了羽葆、樂隊(duì)、儀仗，其余堅(jiān)決推辭。
義熙十年，精簡勞役，讓人民得到休息，建筑東府城，修建府衙房舍。
武帝看到荊州刺史司馬休之宗室繁盛，又很得長江、漢水一帶人心，懷疑他存有異志；而司馬休之的兒子司馬文思住在京城，招聚輕捷俠客，武帝把他抓住送交給司馬休之，讓他自己去處理。司馬休之上表請求廢除司馬文思的爵位，并且給武帝寫信致謝。
義熙十一年(415)正月，武帝逮捕了司馬休之的兒子司馬文寶、他哥哥的兒子司馬文祖，一并賜命自殺。率領(lǐng)大軍西出討伐。重新借掌黃鉞，兼任荊州刺史。派中軍將軍劉道憐監(jiān)管留府的事務(wù)。司馬休之上表自我剖白，并列舉武帝罪狀。司馬休之幕府中的錄事參軍韓延之有大用之才，武帝還沒到江陵，就秘密寫信招他。韓延之回信說：“承蒙親自率領(lǐng)兵馬，遠(yuǎn)赴西部地區(qū)，全境內(nèi)的士子平民，無不惶恐驚駭。蒙您來信，知道是因?yàn)樽S王以前的事，更增添了嘆息。司馬平西忠于國家，寬宏待人，因?yàn)槟锌飶?fù)晉朝的功勛，是國家依賴的人物，推贊您的德行，向您敬獻(xiàn)誠意，常常進(jìn)行詢問請教。譙王因?yàn)橐稽c(diǎn)小事被彈劾，仍然自己上表辭位；何況有了大錯(cuò)會(huì)緘默不語么！來信說，‘懷抱虛靜，期待賢才，由來已久’?，F(xiàn)在攻打別人的君長，而以私利引誘別人，真可以說是‘懷抱虛靜，期待賢才’了呀。劉藩死在宮殿門前，諸葛亡于嘍羅之手，甜言蜜語使州官們驚詫，突然襲擊又開來輕兵，于是使得客席上沒有誠心的士人，外地區(qū)沒有自信的諸侯，自以為是得意算盤，實(shí)在是一種恥辱。我雖然粗鄙拙劣，但是卻曾經(jīng)聽君子講過人生道義。以平西將軍的高尚品德，難道會(huì)沒有能夠授官的臣子么？借著天下喪亂，九流渾濁，應(yīng)當(dāng)與臧洪在地下共同游玩。不再多說?！蔽涞劭葱藕笊钌顕@息，拿它來給將士們看說：“追隨別人就應(yīng)當(dāng)是這樣。”
三月，軍隊(duì)駐扎在江陵。起初，雍州刺史魯宗之依仗氣力喜好亂為，而且顧慮不為武帝所容，常常念叨讖語說：“魚登日，輔帝室?！迸c司馬休之互相串通。到了現(xiàn)在，率領(lǐng)他的兒子竟陵太守魯軌會(huì)聚在江陵。武帝渡過長江，司馬休之的軍隊(duì)潰敗，與魯軌等人逃奔襄陽，江陵平定。武帝兼任南蠻校尉。將授南蠻官銜時(shí)，正遇上四廢日，下屬官員鄭鮮之等人建議改換一個(gè)日子，武帝沒有答應(yīng)。下令開恩實(shí)行寬大政策。
四月，進(jìn)軍襄陽，司馬休之等人逃奔姚興。晉安帝重申先前的命令，授職武帝擔(dān)任太傅、揚(yáng)州牧，可以帶劍穿履朝見皇帝，入朝不須趨步，贊拜不須報(bào)名，加贈(zèng)前部羽葆、樂隊(duì)，設(shè)置左右長史、司馬、從事中郎四人，封第三子劉義隆為北彭城縣公。八月十三日，武帝從江陵返回，奉還黃鉞，堅(jiān)決推辭太傅、州牧、前部羽葆、樂隊(duì)，其余的接受了任命。
義熙十二年正月，晉安帝詔令武帝依舊征召士人，兼任平北將軍、兗州刺史，加上督率南秦，共二十二州。武帝因?yàn)槠奖备形奈淙瞬湃狈Γ贿m合另外設(shè)置，于是撤銷了平北府，把它并入大府。三月，任命武帝為中外大都督。
起初，武帝掃平了齊國入侵，仍然有平定關(guān)中、洛陽的意思，遇上盧循侵襲逼迫，所以放下了。等到荊州、雍州平定，于是開始謀劃外部策略。正趕上姚興死去，他的兒子姚泓剛剛繼任，兄弟互相殺戮，關(guān)中混亂。四月十八日，武帝上表討伐關(guān)中、洛陽，便戒嚴(yán)討伐北方，命令他兼任征西將軍、司豫二州刺史。任命他的世子為徐、兗二州刺史。武帝希望以自己的聲望懷柔遠(yuǎn)方，接受了瑯邪王的封號北伐。五月，廬江的霍山崩裂，獲得了六口鐘，獻(xiàn)給了天子。十七日，加職兼任北雍州刺史，前后部羽葆、樂隊(duì)，增加班劍為四十人。八月十二日，率領(lǐng)大軍進(jìn)發(fā)，以世子為中軍將軍，監(jiān)管太尉留府事務(wù)，尚書右仆射劉穆之為左仆射，兼任監(jiān)軍、中軍二府的軍司，住進(jìn)東府，總管內(nèi)外一切事務(wù)。九月，武帝到了彭城，加職兼任北徐州刺史。十月，各軍到達(dá)洛陽，包圍了金墉，迫使他們投降。修復(fù)了晉朝皇家的五陵，設(shè)置了守衛(wèi)。
十二月二十九日，晉安帝加任武帝為相國、總百揆、揚(yáng)州牧，封賞十郡為宋公，具備九錫之禮，賜給玉璽、遠(yuǎn)游冠、綠綬帶，地位在諸侯王之上。
十三年正月，武帝利用船隊(duì)前往討伐，留下彭城公劉義隆鎮(zhèn)守彭城。軍隊(duì)駐扎在陳留城，經(jīng)過張良廟，下令要定時(shí)維修裝飾廟宇和祭奠。晉安帝追贈(zèng)武帝的祖父為太常，父親為特進(jìn)、左光祿大夫，武帝辭讓不肯接受。二月，冠軍將軍檀道濟(jì)等人的軍隊(duì)駐扎在潼關(guān)。三月初八，武帝率領(lǐng)大軍進(jìn)入黃河。五月，武帝到達(dá)洛陽，拜謁晉朝的五陵。七月，到了陜州，龍?bào)J將軍王鎮(zhèn)惡的水軍從黃河進(jìn)入渭河。八月，扶風(fēng)太守沈田子在藍(lán)田大破姚泓的軍隊(duì)。起初義熙九年，木星、土星、火星、金星曾經(jīng)聚攏在井宿，到現(xiàn)在終于關(guān)中平定。九月，武帝到長安。長安豐收，國庫積滿，武帝首先收集了他們的彝器、渾天儀、土圭、記里鼓、指南車以及秦始皇玉璽送到京城；其余的珍寶珠玉，全都分別賞賜給將帥。把姚家宗族遷徙到江南，押送姚泓到建康，在街市上將他斬首。武帝拜謁了漢朝的長陵，在未央殿大會(huì)文武官員。
十月，晉安帝下詔晉升宋公為宋王，增加十郡擴(kuò)大宋國，加上以前的共二十郡。他的相國、揚(yáng)州牧、兼征西將軍、司豫北徐雍四州刺史仍舊不變。武帝打算在長安休息，經(jīng)略趙、魏兩地，十一月，前將軍劉穆之去世，于是才返回。十二月初三，從長安出發(fā)，以桂陽公劉義真為雍州刺史，鎮(zhèn)守長安，留下心腹將領(lǐng)來輔佐他。
義熙十四年(418)正月二十六日，武帝到了彭城，解除戒嚴(yán)，脫去盔甲。以輔國將軍劉遵考為并州刺史，兼河?xùn)|太守，鎮(zhèn)守蒲坂。武帝辭去了司州職務(wù)，兼領(lǐng)徐、冀二州刺史，堅(jiān)持推讓晉升爵位。當(dāng)時(shí)漢中成固縣的漢水旁邊有奇異的聲音如同打雷，不一會(huì)河岸崩裂，有十二口銅鐘，從地下暴露出來。鞏縣人宗曜在他的農(nóng)田里得到了一株好莊稼，九個(gè)穗子同在一個(gè)莖上，武帝把它獻(xiàn)給晉安帝，安帝又歸還給他，武帝謙讓，才算結(jié)束。
六月二十三日，接受了賜給相國宋公的九錫，下令赦免國內(nèi)死刑以下的罪犯。詔令尊崇豫章太夫人為宋公太妃，世子為中軍將軍副官，相國府百官都依照朝廷的建制。又詔令宋國在所封的十郡以外，都可以選人任用。
先前，安西中兵參軍沈田子殺死了安西司馬王鎮(zhèn)惡，將領(lǐng)們殺死了安西長史王修，關(guān)中混亂。十月，武帝派遣右將軍朱齡石代替安西將軍桂陽公劉義真為雍州刺史。劉義真回京，被赫連勃勃所追趕，大敗，僅僅自己一人逃脫，眾將帥和朱齡石都被殺死。
十二月，晉安帝逝世，大司馬瑯笽王登上皇帝位。
元熙元年(419)正月，晉恭帝下詔征武帝入朝輔政，又重申以前的命令，把他的爵位由公晉升為王，把徐州的海陵、北東海、北譙、北梁，豫州的新蔡，兗州的北陳留，司州的陳郡、汝南、潁川、滎陽十郡，增加為宋國屬地。七月，才接受了命令。赦免國內(nèi)五年徒刑以下的罪犯，遷都到壽陽。九月，辭去了揚(yáng)州的職務(wù)。十二月，晉恭帝命令武帝的冕冠可以有十二個(gè)玉串，建立天子的旌旗，出入警戒清道，乘坐金根車，駕車用六匹馬，具備五時(shí)副車，設(shè)置旄頭云罕，樂舞使用八佾，設(shè)置編鐘木架懸掛在宮中。晉升王太妃為太后，王妃為王后，世子為太子，王子、王孫的爵位封號，完全和舊時(shí)的規(guī)制一樣。
二年正月，武帝上表辭讓特殊禮遇。竟陵郡江濱自己裂開，露出了古銅禮器十幾枚，武帝把它們獻(xiàn)給了晉恭帝，恭帝推讓不肯接受，于是送回了各種祥瑞器物，收藏在宰相府。四月，下詔書派人敦促勉勵(lì)，兼征武帝入朝輔政。六月初一，武帝到達(dá)京城。初九，晉恭帝禪讓帝位給宋王。有關(guān)部門把詔書的草稿寫成后，請恭帝把它書寫下來，天子隨即便拿起筆來，對身邊的人說：“桓玄的時(shí)候，天命已經(jīng)改換，重又被宋公接續(xù)下來，將近二十年。今天的事情，本是我心甘情愿的?！笔蝗?，晉恭帝派遣使者送上文書，又派遣使持節(jié)、兼太保、散騎常侍、光祿大夫謝澹，兼太尉、尚書劉宣范送上璽書，轉(zhuǎn)交皇帝的玉璽，受禪的禮節(jié)，完全和唐虞、漢魏從前的辦法一樣。武帝上表進(jìn)行辭讓，晉恭帝已經(jīng)退到瑯笽王府，奏表沒有送到。于是陳留王司馬虔嗣等二百七十人和宋臺(tái)的群臣一齊上表勸武帝即皇帝位，他還是不答應(yīng)。太史令駱達(dá)陳述天文符應(yīng)說：“按晉朝的義熙元年到元熙元年，金星白天出現(xiàn)，共有七次經(jīng)過天空，占卜說：‘金星經(jīng)過天空，人間換主，異姓新興?！x熙七年，有五條虹出現(xiàn)在東方，占卜說：‘五虹出現(xiàn)，天子廢黜，圣人將出?！拍?，土星、木星、金星、火星相聚在井宿。十三年，土星進(jìn)入太微星。占卜說：‘鎮(zhèn)星(土星)守太微，有王新立，有王遷徙?！踉甓欤邶埶拇紊教焐?，《易傳》說：‘冬天，龍出現(xiàn)，天子失去國家，大人接受天命?！街莸廊酸尫ǚQ告訴他的弟子道：‘嵩山之神說，江東有一個(gè)劉將軍，是漢朝皇家的后代，應(yīng)當(dāng)承受天命，我將把玉璧三十二只、鎮(zhèn)金一餅送給他，這是劉家占卜傳國應(yīng)有的世數(shù)啊?！瘽h朝建武到建安末共一百九十六年而禪讓給魏朝，魏朝從黃初到咸熙末共四十六年而禪讓給晉朝，晉朝從泰始到現(xiàn)在共一百五十六年，三代相讓，都是到六結(jié)束。又漢光武帝在南陽建立社宮，漢末而社宮前的樹死亡，劉備建立蜀國，就是和這相應(yīng)而興起；到了晉朝末年，舊根才開始萌發(fā)，到現(xiàn)在已經(jīng)繁盛起來了?！敝T如這些共有幾十條。群臣又堅(jiān)持請求，武帝才依從了。
永初元年(420)夏季六月十四日，武帝即位于南郊，設(shè)立祭壇，燒起木柴祭天。典禮結(jié)束，備好車駕，到了建康宮，坐在太極前殿，宣布大赦，改換年號。賜給每人爵位二級。鰥寡孤獨(dú)不能自己生活的人，每人發(fā)給谷物五斛，拖欠的租稅舊債不再收取。那些因?yàn)槠吩u鄉(xiāng)里人物、發(fā)表公正言論以及隱贓、貪污、淫穢、盜竊而被判罪的，一律免除。長期刑徒，全部寬大遣返。丟官失爵、受到監(jiān)禁、強(qiáng)制勞役的，全都恢復(fù)舊時(shí)的狀況。封晉恭帝為零陵王，可以將全郡作為食邑，懸掛天子的旌旗，乘坐五時(shí)副車，實(shí)行晉朝的歷法，郊外祭祀天地，禮樂制度，都用晉朝的典制，上書不稱作表，答表不稱作詔，宮殿定在原來的秣陵。追尊皇父為孝穆皇帝，母親為穆皇后，尊王太后為皇太后。
永初三年五月，皇上病危，召來太子，告誡他說：“檀道濟(jì)雖然有才干，卻沒有遠(yuǎn)大志向，不像他的哥哥檀韶有難以駕馭的氣概。徐羨之、傅亮看來不會(huì)有異圖。謝晦屢次跟隨征伐，很善于隨機(jī)應(yīng)變，如果有異圖，必定就是這個(gè)人。要縮小他的勢力，可以在會(huì)稽、江州安置他?！庇謱懥耸衷t：“朝廷不需要再有別府，宰相掌管揚(yáng)州，可以設(shè)置鎧甲武士一千人。如果大臣擔(dān)任重要職務(wù)，應(yīng)該派自己的爪牙，以防備居心不良的人，可以把京城留守部隊(duì)交給他。有外出征討，全部撥給京城部隊(duì)，戰(zhàn)爭結(jié)束歸來恢復(fù)原狀。后世如果有幼主，朝中的政事全部委任宰相，母后不要臨朝。儀仗軍隊(duì)不許進(jìn)入宮殿門，重要人物可以多給班劍?！倍蝗眨噬显谖鞯钍攀?，當(dāng)時(shí)年齡六十歲。七月二十五日，埋葬在丹陽建康縣蔣山初寧陵。群臣上謚號為武皇帝，廟號稱高祖。
武帝清心寡欲生活簡單樸素，很少欲望，風(fēng)格嚴(yán)整，具有法度，不曾細(xì)看珠玉車馬這些物品，后庭沒有紈綺絲竹各種音樂。起初，朝廷沒有設(shè)置樂隊(duì)，長史殷仲文因此建言，武帝說：“每天都忙不過來，而且也聽不懂啊。”殷仲文說：“經(jīng)常聽自然就懂了?！蔽涞壅f：“正因?yàn)槎耍蜁?huì)愛好它，所以才不去熟悉它?！睂幹菰?jīng)貢獻(xiàn)琥珀枕，光色十分美麗，價(jià)值百金。當(dāng)時(shí)將要北伐，因?yàn)殓昕梢灾委煒寕噬戏浅８吲d，命令砸碎分別送給各位將軍。平定關(guān)中后，得了姚興的侄女，十分寵愛，因此荒廢了軍政大事，謝晦勸諫，馬上就把她送出去了。財(cái)物都在外府，內(nèi)部沒有一點(diǎn)私人積藏。宋臺(tái)建立以后，有關(guān)部門奏請東西堂中放上曲形高腳的坐榻———局腳床，用鍍金的釘子，皇上不允許。結(jié)果使用了直腳床，釘用鐵釘。廣州曾經(jīng)貢獻(xiàn)入筒細(xì)布，一匹長八丈，武帝討厭它的精美累人，于是就交給了有關(guān)部門彈劾廣州太守，把布還給他們，并且下令嶺南禁止紡織這種布。武帝平時(shí)有一種熱病，并且患有槍傷，晚年尤其厲害，坐臥常常需要冷東西，后來有人獻(xiàn)了一張石床，睡上，覺得極好，于是嘆息說：“木床尚且很費(fèi)錢，何況是石床呢?！本妥屓税阉o毀了。他下令各個(gè)公主出嫁，陪送不超過二十萬，沒有錦繡金玉。朝內(nèi)外的人供給宮中費(fèi)用，無不節(jié)約儉省。性格尤其喜歡簡易，曾經(jīng)穿一雙連齒的木屐，喜歡出來在神武門內(nèi)左右散步，隨從的不過十多人。當(dāng)時(shí)徐羨之住在西州，他曾經(jīng)很想念徐羨之，便步行走出了西掖門，儀仗人員陸續(xù)追隨上來，已經(jīng)出了西明門了。諸位兒子早晨來慰問起居情況，進(jìn)門后脫去公服，只穿戴裙子帽子，就像家庭中的禮節(jié)一樣。
當(dāng)初身份低微的時(shí)候，他曾經(jīng)在丹徒種田，接受天命以后，鋤、鍬等農(nóng)具還有一些被保存下來，他命令把它們都收藏起來，以便留給后人。后來宋文帝視察舊宮，見到后問起來，身旁的人按照實(shí)際情況作了回答，文帝臉上很羞愧。有一個(gè)貼身的侍從進(jìn)言說：“大舜曾經(jīng)住在歷山種田，大禹曾經(jīng)親自從事土木，陛下不看到各位先圣的遺物，怎么知道稼穡的艱難，怎能知道先帝的大德呢？”到了孝武帝大明年間，拆毀了武帝所住的陰暗房子，在原地筑起了玉燭殿，和群臣一起觀看，床頭有土障，墻上掛著葛草制的燈籠，麻繩制的拂塵，侍中袁靑十分稱贊皇上的儉素品德，孝武帝不作回答，獨(dú)自說道：“田舍公得到了這些，已經(jīng)是過分了?！彼运軌蛘加泻凸庹仗煜?，完成大業(yè)，真是太隆盛了！
鄂公網(wǎng)安備 42010302001612號