他回國不久，麥卡錫主義在美國國內(nèi)掀起了反共浪潮，追究“是誰丟失了中國”，追查國務(wù)院中“通共”的駐華外交官。他和謝偉思、戴維斯、文森特等幾個(gè)駐中國的外交官，都受到了美國非美活動(dòng)委員會(huì)的審查和迫害，蒙受了冤案。

朝鮮戰(zhàn)爭開始后，在中央情報(bào)局未能料到中國軍隊(duì)出兵朝鮮而被指責(zé)失職的情況下，由于柯樂布竟然能準(zhǔn)確地預(yù)測新中國出兵朝鮮，被懷疑有“通共”嫌疑而被列入特別調(diào)查的黑名單。

1951年6月間，美國國務(wù)院的忠誠審查委員會(huì)給了柯樂布一張具體指控清單。清單中開列了多種“通共”的罪行的指控，并都標(biāo)明有“證據(jù)確鑿”的字樣。清單中有這樣的內(nèi)容：

1. 在1931年至1934年間，在中國漢口與共產(chǎn)黨人有交往；

2. 從1932年至1934年間，以贊同的態(tài)度看待共產(chǎn)主義的某些方面；

3. 從1934年至1935年間，在中國北平，有明顯的“粉紅色”傾向；

4. 在30年代初期，對(duì)某些共產(chǎn)主義原則有明顯的偏愛；

5. 從1935年至1937年，對(duì)蘇聯(lián)和共產(chǎn)主義持友好態(tài)度；

6. 1940年，在中國上海，百分之百地親共；

7. 同下述各類人有（或有過）密切的和慣常的交往：安娜?路易絲?斯特朗、史沫特萊、埃德加?斯諾、馬海德、符拉基米爾?米基耶夫、克勞德?巴斯等。

以上說的都是所謂“證據(jù)確鑿”的，他被迫去翻那些發(fā)黃的舊報(bào)紙寫材料，也被迫交出了自己的日記。當(dāng)然，他為此寫了好些文字來進(jìn)行解釋。

這份指控清單中也有一部分是屬于“尚待證實(shí)”的，其中有一條，就是指控他1949年在北平擔(dān)任總領(lǐng)事期間，在“維護(hù)美國的權(quán)利和財(cái)產(chǎn)不受共產(chǎn)黨人侵害方面不力”。

當(dāng)時(shí)新中國中央新聞紀(jì)錄片廠的攝影師拍了一段原美國駐北平總領(lǐng)事館降旗儀式的紀(jì)錄片，鏡頭中有中美雙方有關(guān)人員在場。他的日記中記述了他在離開北平的總領(lǐng)事館時(shí)，“將每個(gè)房間的鑰匙都插在鎖眼里，并事先降下了國旗，拒絕在共產(chǎn)黨提供的移交房產(chǎn)聲明上簽字”等等。

這段紀(jì)錄片與這段文字給問罪者留下了把柄。

他只好在給審查委員會(huì)的解釋中說，北京紀(jì)錄片里“降旗儀式中的柯樂布，不知道是誰扮演的”。他自己并解釋說，在共產(chǎn)黨占領(lǐng)北平后，他在維護(hù)美國權(quán)利和資財(cái)上只是“太缺乏靈活性了”。

他曾經(jīng)請(qǐng)同時(shí)期在北平的武官包瑞德上校作證，看他（柯樂布）是不是一個(gè)可靠的人物。包瑞德雖說已經(jīng)比他提前兩個(gè)月，于1950年2月間離開北京回國，當(dāng)然無法參加總領(lǐng)事館的降旗儀式，就對(duì)審查委員會(huì)作證說：

“我一向認(rèn)為他這個(gè)人可靠，只是可靠到了令人討厭的地步?！?/p>

原美國駐北平總領(lǐng)事埃德蒙?柯樂布先生，一個(gè)曾經(jīng)忠于職守的美國駐華外交官，經(jīng)過了使他戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢而為期半年多的審查，終于在1951年底得到了一件“圣誕禮物”：國務(wù)院忠誠審查委員會(huì)聲稱，雖然沒有理由懷疑他的忠誠，但是委員會(huì)已經(jīng)斷定他是一個(gè)危險(xiǎn)人物，因此須離開駐外處這個(gè)國務(wù)院的重要機(jī)構(gòu)。

柯樂布被迫退休了，但并沒有閑著，經(jīng)歷、學(xué)識(shí)和勤奮使他成為一個(gè)歷史學(xué)家與中國問題專家，并普遍受人尊敬。在華盛頓有評(píng)論說：“他的著作《二十世紀(jì)的中國》以及《中國和俄國》，使一切嚴(yán)肅的學(xué)者所涉足的圖書館的書架都為之生色不少?！?/p>

1972年尼克松總統(tǒng)訪華之后，美國外交學(xué)會(huì)于1973年1月30日，在國務(wù)院八樓莊嚴(yán)的富蘭克林大廳舉行午餐會(huì)，宴請(qǐng)?jiān)?0年代曾經(jīng)如實(shí)地報(bào)告情況的誠實(shí)正直的外交官。有人說：“想想以前，現(xiàn)在在電視與照片上看到尼克松總統(tǒng)和毛澤東主席雙雙坐在一對(duì)沙發(fā)上，怎能不由衷地意識(shí)到，事實(shí)確實(shí)比虛構(gòu)更加不可思議嗎？”

71歲的柯樂布也到會(huì)了，他感慨萬分，在掌聲中說：“到這里來我很高興。我必須坦誠地說，對(duì)這種可能性我以前連想都沒有想過?！?/p>