《埃紀(jì)》共十二卷，按故事說(shuō)，可以分為前后兩部分，各六卷。

也有人把它分成三部分，各四卷。分成兩部分的理由是前半仿《奧德修紀(jì)》，寫埃涅阿斯的流浪；后半仿《伊利亞紀(jì)》，寫埃涅阿斯與圖爾努斯的戰(zhàn)爭(zhēng)。分成三部分的理由是第一部分以特洛亞的陷落和狄多的悲劇為中心；第二部分是過(guò)渡，寫埃涅阿斯到達(dá)意大利，結(jié)盟，準(zhǔn)備戰(zhàn)爭(zhēng)；第三部分寫戰(zhàn)爭(zhēng)。從故事結(jié)構(gòu)看，固然可以分成幾塊或幾片，但是中心人物還是一個(gè)，貫串始終，故事本身還是有連續(xù)性的。

故事按史詩(shī)的規(guī)格要求，從中間開(kāi)始（in medias res），而不從開(kāi)天辟地（ab ovo）［1］說(shuō)起。史詩(shī)一開(kāi)始，特洛亞人已經(jīng)過(guò)七年海上漂泊，正離開(kāi)西西里往北向意大利進(jìn)發(fā)。但尤諾同他們作對(duì)，命令風(fēng)神刮起大風(fēng)，把他們吹到了南面的迦太基。迦太基女王狄多熱情款待他們。埃涅阿斯的母親，女神維納斯也不想讓兒子再流浪而希望他在迦太基定居下來(lái)，因此叫自己另一個(gè)兒子小愛(ài)神丘比德促使狄多對(duì)埃涅阿斯產(chǎn)生愛(ài)情。在筵席上，狄多請(qǐng)他講述他七年來(lái)的流浪經(jīng)歷。

卷二卷三倒敘埃涅阿斯從特洛亞失陷到抵達(dá)迦太基的經(jīng)過(guò)。卷二寫特洛亞的淪陷，希臘人用木馬計(jì)進(jìn)了特洛亞，一場(chǎng)血戰(zhàn)，老王見(jiàn)殺，埃涅阿斯背著老父，攜著幼子，妻子跟在后面，逃出城去。中途妻子失散犧牲。這卷寫的是發(fā)生在一夜之間的事。卷三寫他七年漂泊，寫他處處想安家立業(yè)，寫他的迷誤和祈求神的指點(diǎn)，寫他所歷的艱險(xiǎn)以及父親在西西里的去世。他在幾處都遇到特洛亞戰(zhàn)爭(zhēng)的幸存者，勾起他痛苦的回憶，而以他遇到赫克托爾的遺孀安德洛瑪刻和她的丈夫赫勒努斯一段最為動(dòng)人。

卷四寫狄多和埃涅阿斯的戀愛(ài)和結(jié)合。但是尤比特遣神使去警告埃涅阿斯不要忘記建立家國(guó)的偉大使命，要他立刻離開(kāi)迦太基。他決定犧牲個(gè)人的安樂(lè)，向狄多陳述必須離去的理由，并斷然登舟而去。狄多再三設(shè)法想把他留住，但未能成功，她在悲恨之中飲刃自焚而死。狄多之死引起過(guò)歷代讀者的同情之淚（包括青年時(shí)代的圣·奧古士?。?。值得注意的是，詩(shī)人沒(méi)有一處明白地說(shuō)過(guò)埃涅阿斯也同樣愛(ài)狄多。

卷五，特洛亞人又回到西西里，在這里舉行了賽會(huì)，祭奠埃涅阿斯的亡父安奇塞斯。一起流亡的特洛亞婦女因?yàn)殚L(zhǎng)久找不到安身之處，怕再繼續(xù)過(guò)流亡生活，絕望之中，開(kāi)始焚燒船隊(duì)?；鸨挥缺忍?fù)錅?。埃涅阿斯決定讓不愿再流亡的人留下，其余的繼續(xù)跟他去尋找意大利。中途，舵手帕里努魯斯墮海身亡。