張國燾投靠國民黨伊始，受到蔣介石的重視，得到軍統(tǒng)特務(wù)頭子戴笠的保護(hù)，戴笠特地在武昌安排了一棟漂亮的小洋樓，供張國燾一家居祝至于工作去向，張國燾已經(jīng)想好，所以當(dāng)陳立夫奉蔣介石之命向他征求意見時，張國燾毫不猶豫地說：

“我想做一份刊物，從思想理論上揭發(fā)共產(chǎn)主義不適宜中國的種種論據(jù)，喚醒一般青年人的幻覺，令他們迷途知返。這是反共基本有效的辦法，但是缺乏資金，需要政府接濟(jì)?！?/p>

但當(dāng)時國民黨人都把張國燾看成了“無價之寶”，紛紛搶著向蔣介石要人，既有中統(tǒng)的陳果夫、陳立夫，又有軍委會政治部的人，還有胡宗南、康澤等人。蔣介石最后還是決定“好鋼使在刀刃上”，以至于蔣介石在親自對張國燾宣布工作安排時，張國燾驚得目瞪口呆。

那是張國燾第二次見蔣介石，蔣介石指著站在他身后的戴笠，禮貌而又嚴(yán)肅地說：

“我想請張先生給他幫幫忙。”

當(dāng)特務(wù)，是文人出身的張國燾做夢都不會想到的事，但縱使他有一百一千個不愿意，也不能一踏進(jìn)國民黨大門就“討價還價”。武漢失守后，張國燾經(jīng)桂林轉(zhuǎn)赴重慶，正式并加入軍統(tǒng)。為表示對張國燾的重視，蔣介石特地委任他為軍事委員會中將委員。盡管是一個空頭銜，但也顯示了他與眾不同的身份。

到軍統(tǒng)后，張國燾主持“特種政治研究室”，任少將主任，為國民黨特務(wù)組織策反中共人員出謀劃策。他還主辦了“特種政治工作人員訓(xùn)練班”，為專門對付共產(chǎn)黨訓(xùn)練特務(wù)。