1966年春天，向達和商鴻逵為北大歷史系制訂了更為龐大的科研計劃，并準備全身心的投入其中，逐步付諸實踐。不料，著手不久，運動來臨，工作遂而中斷。就在這一年的夏天，“文化大革命”開始了，歷史系鄒衡教授記下了向達慘遭批斗的情景：“我永遠不能忘記那個可怕的太陽似火的上午，時在1966年6月，幾個‘造反派’架住被迫剃光了頭的向達在三院二樓外曬得滾燙的房檐瓦上‘坐飛機’，一跪就是幾小時，……向達已是六十六高齡。我看到有的教師嚇得直哆嗦，我也感到他兇多吉少，躲在一邊落淚。果然，從此以后，我再也沒有見到一代巨匠向達?！贝藭r已遭到如此折磨的向達，還暗中囑咐友人“不必耿耿”，將如“鳳凰涅槃，獲得新生”。無奈事與愿違，他身患重病，不但得不到及時治療，還要接受勞改和批斗，自詡身體健康如“鐵漢”的向達，再也無法忍受折磨，終于在1966年11月24日含冤而死?！拔母铩?結束后，向達得到平反，他的藏書和手稿都由家屬獻給北大圖書館收藏，其中有不少珍本、善本，這是他對北大、也是對國家的又一貢獻。