就在張學(xué)思被誘捕的當(dāng)天早晨，李作鵬一伙就派人奔到張學(xué)思家里抄家。謝雪萍同志質(zhì)問他們?yōu)槭裁窗褟垖W(xué)思關(guān)起來，他是什么問題，回答是：“有重大政治問題，不能告訴你，你們也不要打聽?！?

張學(xué)思被關(guān)押，到底憑什么？全海軍機(jī)關(guān)除了李作鵬一伙，誰也不知道，就連海軍司令員蕭勁光同志也被蒙在鼓里。

在那個(gè)黑白混淆、人妖顛倒的年代，哪里還講黨委領(lǐng)導(dǎo)和社會(huì)主義法制？人已被抓起來了，卻還沒有立案。9月13日，李作鵬才指使其親信搞了一個(gè)以海軍黨委名義上送的“立案報(bào)告”。報(bào)告說國(guó)民黨特務(wù)機(jī)關(guān)長(zhǎng)期策反張學(xué)思，張可能有重大的政治問題，為此“請(qǐng)示對(duì)張學(xué)思進(jìn)行隔離審查，并向海軍直屬機(jī)關(guān)各級(jí)領(lǐng)導(dǎo)和革命群眾公布張的問題”?？墒?，這個(gè)“立案報(bào)告”還是被周總理看到并壓了下來。當(dāng)時(shí)，周總理的處境已經(jīng)十分困難，但為了保護(hù)張學(xué)思，他仍很策略地批示道：“此事待成武同志回來考慮?！敝芸偫淼倪@句話包含了兩層意思：一是不同意立即抓人；二是把這件事交給當(dāng)時(shí)主持總參工作的楊成武同志來處理，進(jìn)而把張學(xué)思保護(hù)起來。然而，他哪里知道，李作鵬一伙早已秉承了林彪的旨意，先斬后奏，把張學(xué)思已經(jīng)逮捕關(guān)押了。周總理還批示道：“事情沒有查清之前，不要向群眾公布?！比欢直氲囊换镉H信偏偏要反其道而行之。周總理批示之前，他們對(duì)抓張學(xué)思的事一直保密，總理批示剛下，“張學(xué)思是特務(wù)”等謠言就迅速傳遍海軍大院，有個(gè)別的狂妄之徒甚至提出要“揪張學(xué)思的后臺(tái)老板”，想通過整倒張學(xué)思來誣陷栽贓周總理。

張學(xué)思被捕后的一天，有幾個(gè)人鬼鬼祟祟地來到張學(xué)思家中對(duì)他的夫人謝雪萍說：“我們是上級(jí)派來的專案組。你和張學(xué)思1961年參加西安事變25周年招待會(huì)，是哪里通知你們的？什么人主持的會(huì)？講了什么話？有什么活動(dòng)？”謝雪萍一想：“這不是要調(diào)查周總理嗎？”一股怒火涌上她的心頭。

原來，林彪集團(tuán)和“四人幫”一伙要調(diào)查的，是1961年12月12日由周總理主持舉行的西安事變25周年招待會(huì)。張學(xué)思夫婦和楊拯民夫婦應(yīng)周總理邀請(qǐng)而出席，他們就坐在總理的一左一右。席間，周總理代表毛主席和黨中央，表達(dá)了對(duì)西安事變，對(duì)張學(xué)良、楊虎城兩位愛國(guó)將領(lǐng)的懷念之情。張學(xué)思感情異常激動(dòng)，在給周總理敬酒時(shí)竟泣不成聲。總理也難過得流下了熱淚，深情地對(duì)大家說：“25年了，楊先生一家4人犧牲了，張先生還囚禁在臺(tái)灣，沒有自由，怎能使人想起他們不落淚呢？”張學(xué)思因悲傷過度，未能終席。散席時(shí)，周總理還專門去看望了張學(xué)思。

對(duì)于林彪一伙要張學(xué)思夫婦交代的所謂“問題”，謝雪萍憤慨地說：“要調(diào)查，你們到周總理辦公室去，那里有記錄！”說得來人無話可說，只好灰溜溜地走了。

張學(xué)思在被關(guān)押的日子里，非常想念長(zhǎng)期愛護(hù)和保護(hù)他的周總理。1967年10月5日，張學(xué)思向周總理寫信申訴：

我背叛了自己出身的階級(jí)，在黨內(nèi)遵循毛主席指引的道路走了30年，在工作中雖然曾有過這樣那樣的缺點(diǎn)和錯(cuò)誤，但是我以黨性和生命向黨保證，我絕不是叛徒、特務(wù)、反革命分子……我已向海軍黨委寫了三封信，至今無回示也無人與我談話，因此給您寫了這封信。

這封信，周總理沒有收到。林彪一伙早已設(shè)下重重關(guān)卡，嚴(yán)密封鎖消息。張學(xué)思的幾個(gè)子女也向周總理寫了一封信，反映張學(xué)思被關(guān)押的問題，結(jié)果信不僅被沒收了，還因而遭到了一頓訓(xùn)斥，叫他們“不要到處告狀”。謝雪萍同志向毛主席寫了一封信，報(bào)告了張學(xué)思被誘捕和家中被抄的情況并且親自送到中南海門口，可是，信照樣落到了李作鵬一伙的手里，并且又一次受到“警告”。

張學(xué)思駁倒了一條條強(qiáng)加給他的邏輯混亂、令人可笑的罪狀。他剛正不阿，寧折不彎的態(tài)度，給他帶來了日益升級(jí)的批斗

一個(gè)月過去了，李作鵬一伙經(jīng)過一番策劃，成立專案班子，加緊了對(duì)張學(xué)思的折磨和迫害。

10月8日，李作鵬的一個(gè)親信來找張學(xué)思，傳達(dá)了李作鵬的“指示”：“據(jù)有人揭發(fā)，你是敵人長(zhǎng)期進(jìn)行策反對(duì)象之一，在已破案的材料中涉及你，這是什么性質(zhì)的問題，你應(yīng)該清楚。所以你一定要老實(shí)交代，協(xié)助組織把這個(gè)問題搞清楚?！睆垖W(xué)思聽后心里明白了，這是要從政治上陷害他。他抑制住心中怒火，鎮(zhèn)定地回答說：“既然是這個(gè)原因把我抓起來的，這就不是我自己向黨做任何保證可以解決的。我自己也沒有什么可以交代的，你們可以調(diào)查嘛！”一連幾天，張學(xué)思只字未寫。

張學(xué)思的強(qiáng)硬態(tài)度，使林彪反革命集團(tuán)非常惱火，他們決心采取群眾斗爭(zhēng)和專案審訊相結(jié)合的辦法來壓服張學(xué)思。從1967年10月25日開始，連續(xù)十幾天，張學(xué)思天天被拉到海軍大院，進(jìn)行大會(huì)、小會(huì)批斗。批斗以后，專案組又不斷進(jìn)行“提審”，有時(shí)搞所謂連續(xù)作戰(zhàn)。1968年的3月1日到13日，就連續(xù)“提審”了13天。李作鵬一伙慫恿揪斗組說：“你們要有強(qiáng)烈的階級(jí)仇恨，作堅(jiān)決不調(diào)和的階級(jí)斗爭(zhēng)。”

在相當(dāng)長(zhǎng)的日子里，張學(xué)思受到了殘酷的迫害和折磨。然而，他精神上所受到的打擊比肉體上的摧殘更加難以忍受。每次他被拉到海軍大院批斗，發(fā)現(xiàn)以往那一張張親切熟悉的面孔變得陌生而冷酷，他的周圍，到處是憤怒仇視的目光和震耳欲聾的吼叫，時(shí)常還會(huì)夾雜比拳打腳踢更侮辱人格的謾罵……張學(xué)思雖然參加革命幾十年，但由于他特殊的身份和長(zhǎng)期從事軍事工作外很少參加黨內(nèi)的政治運(yùn)動(dòng)，很少有黨內(nèi)斗爭(zhēng)的經(jīng)歷和經(jīng)驗(yàn)。在他的心目中，黨一直是一幅純潔完美的圖畫，一直是一個(gè)高大神圣的形象。他越是堅(jiān)信黨，就越是不理解他目前的處境。

曾與張學(xué)思同期受迫害，就關(guān)押在他隔壁房間里的呂正操將軍，曾回憶到以下一段情節(jié)：