還在6月中旬拒簽和約運(yùn)動(dòng)如火如荼地展開(kāi)時(shí)，張國(guó)燾離開(kāi)北京，去了一趟上海。

6月16日全國(guó)學(xué)聯(lián)成立后不久，張國(guó)燾和幾位同學(xué)來(lái)到上海，與先期來(lái)上?；I備全國(guó)學(xué)聯(lián)的北京代表許德珩、黃日葵、段錫朋等人會(huì)合。張國(guó)燾到上海后，成為沒(méi)有表決權(quán)的代表，并被安排擔(dān)任總務(wù)方面的工作。但是，張國(guó)燾對(duì)這項(xiàng)工作并無(wú)興趣。他回憶說(shuō)：

我對(duì)全國(guó)學(xué)生聯(lián)合會(huì)總務(wù)處的工作并不感興趣，事實(shí)上也未正式就職。我所注意的是考察各地學(xué)生運(yùn)動(dòng)的實(shí)況。我發(fā)覺(jué)上海及各地學(xué)生會(huì)講演方面的工作，趕不上我們?cè)诒本┧龅??！暗矫耖g去”的風(fēng)氣很不普遍。為了要給各地同學(xué)一個(gè)榜樣，我親身在上海從事街頭活動(dòng)。我制了一些賣報(bào)的布袋子，發(fā)動(dòng)同學(xué)們一齊去推銷愛(ài)國(guó)書(shū)刊，進(jìn)行像北京學(xué)生聯(lián)合會(huì)講演團(tuán)一樣的工作。我背了一個(gè)裝滿《每周評(píng)論》、《星期評(píng)論》等愛(ài)國(guó)書(shū)刊的袋子，到街上去一面叫賣，一面向市民宣傳，晚間歸來(lái)，有些代表們以驚奇的眼光笑著問(wèn)我：“你這位社會(huì)運(yùn)動(dòng)大家的生意好嗎？”我充滿了自信向他們說(shuō)：“成績(jī)還不錯(cuò)。我們都要有這種到民間去的精神才好！”我這樣做了幾天，終于在南京路永安公司門口，受到一個(gè)外國(guó)巡捕的粗暴干涉，他不加警告的在我背后用力的一推，幾乎使我跌倒。當(dāng)我依然停在那里表示不服的時(shí)候，他竟做出要逮捕我的姿態(tài)。我為了不愿引起糾紛，以免妨礙全國(guó)學(xué)生聯(lián)合會(huì)組織的進(jìn)行，當(dāng)時(shí)沒(méi)有反抗就走了，也未將這件不愉快的事宣揚(yáng)出去。但在我心中留有深刻的印象，是第一次嘗到外國(guó)租界勢(shì)力給予我的侮辱，使我確認(rèn)反日之外，還要反對(duì)租界。

此時(shí)，被北京政府逮捕的陳獨(dú)秀和北京學(xué)生聯(lián)合會(huì)負(fù)責(zé)人尚未出獄。在上海的北京學(xué)生商量后認(rèn)為，這是北京政府有計(jì)劃地摧殘北大的行動(dòng)，并認(rèn)為北京學(xué)聯(lián)的領(lǐng)導(dǎo)也需要加強(qiáng)，于是決定要張國(guó)燾立即趕回北京，號(hào)召同學(xué)們堅(jiān)決反抗。

張國(guó)燾回到北京后，在一次北大學(xué)生干事會(huì)的會(huì)議上被推舉為北京大學(xué)學(xué)生干事會(huì)總務(wù)主任兼聯(lián)合評(píng)議部主任，并被推舉為出席北京學(xué)生聯(lián)合會(huì)的代表。隨后，又被北京學(xué)聯(lián)推舉為總干事。這時(shí)，正值暑假，學(xué)生中很大一部分都離開(kāi)北京了。北京學(xué)聯(lián)的情景也不像五四運(yùn)動(dòng)期間那樣熱烈。張國(guó)燾整天忙得不亦樂(lè)乎。他后來(lái)回憶說(shuō)：

學(xué)生聯(lián)合會(huì)經(jīng)常工作的人員大為減少，并且換了一些生手，這樣我的職責(zé)更加繁重了。我忙得至少有一個(gè)月沒(méi)有回到自己的寢室去，疲倦了就在辦公室的睡椅上躺一會(huì)，吃飯也在辦公室里，日以繼夜，每天工作十六小時(shí)左右。一切工作如主持會(huì)議、指導(dǎo)內(nèi)部工作、對(duì)外通訊聯(lián)絡(luò)、營(yíng)救被捕同學(xué)、溝通各校同學(xué)意見(jiàn)等等，我都做得十分積極，學(xué)生會(huì)的陣容因此又堅(jiān)強(qiáng)起來(lái)了。這對(duì)我個(gè)人言，也可說(shuō)是實(shí)習(xí)了一課領(lǐng)導(dǎo)工作。

為了同北京政府當(dāng)局進(jìn)行斗爭(zhēng)，北京學(xué)聯(lián)還同各校校長(zhǎng)、教職員聯(lián)合行動(dòng)，提出不讓教育受到摧殘、挽留蔡元培校長(zhǎng)、反對(duì)加害陳獨(dú)秀和愛(ài)國(guó)學(xué)生的種種主張。在此期間，張國(guó)燾同李大釗的接觸更加頻繁起來(lái)。李大釗給張國(guó)燾以很大的幫助。他不僅提供了很多建議，而且對(duì)溝通學(xué)生和教職員、新聞界的聯(lián)絡(luò)，更是盡了很大的努力。

8月底，北京地方法院宣布正式開(kāi)庭審訊被捕的北京學(xué)聯(lián)負(fù)責(zé)人。開(kāi)庭的那天，張國(guó)燾等組織了大批學(xué)生去旁聽(tīng)。最后，在各方面的壓力下，法庭宣布各被告無(wú)罪開(kāi)釋。9月16日，被捕83天的陳獨(dú)秀也被釋放。在北大學(xué)生為他舉行的歡迎會(huì)上，張國(guó)燾發(fā)表了熱情洋溢的致辭。

這時(shí)，挽留蔡元培的斗爭(zhēng)也取得了徹底勝利。此前，張國(guó)燾曾再度南下，迎接蔡返校復(fù)職。蔡元培推蔣夢(mèng)麟暫行代理校長(zhǎng)職務(wù)，張國(guó)燾和段錫朋遂拜訪了蔣夢(mèng)麟，表示歡迎。于是蔣即到北大，代理校長(zhǎng)。經(jīng)過(guò)北大師生、社會(huì)各界的不懈斗爭(zhēng)和艱苦努力，蔡元培于9月12日回到北京。9月20日，北京大學(xué)開(kāi)學(xué)這天，師生們?cè)诜贫Y堂先后召開(kāi)了歡迎蔡元培返校的盛大集會(huì)。

在這種情況下，張國(guó)燾認(rèn)為運(yùn)動(dòng)已經(jīng)結(jié)束，準(zhǔn)備開(kāi)始重理學(xué)業(yè)。但是，局勢(shì)的發(fā)展出乎張國(guó)燾的意料，同反動(dòng)當(dāng)局的斗爭(zhēng)遠(yuǎn)沒(méi)有結(jié)束。隨著各地慘案的不斷發(fā)生，群眾運(yùn)動(dòng)又不斷掀起高潮。