當前，“阿爾法”部隊的主要任務是打擊恐怖主義。葉利欽在擔任俄羅斯總統(tǒng)期間已經(jīng)發(fā)布命令，在俄聯(lián)邦安全局內(nèi)建立統(tǒng)一的反恐怖中心，負責協(xié)調(diào)各反恐怖特種部隊和機構(gòu)的工作，其主力便是“阿爾法”部隊和另一支特種反恐怖部隊“韋加”，后者主要負責打擊核恐怖主義。在恐怖主義活動頻發(fā)的俄羅斯，“阿爾法”部隊可謂任重而道遠。