艾倫?波普只好跳傘，讓守株待兔的印尼軍人捉住了他，他身上的證件證明他是美國中情局人員。蘇加諾強烈譴責美國，中情局局長杜勒斯向行動小組下命令：“我們必須盡快脫身。”5月19日，杜勒斯發(fā)出快電通知印尼、菲律賓、中國臺灣和新加坡的中情局工作人員：解散，不要再燒一分錢，關閉軍火供應線，銷毀證據，撤退。

1958年6月底，由于沒有了中情局的支持，叛軍的軍事政變被蘇加諾徹底粉碎，中情局燒進了那么多錢，但最終都打了水漂。

同年12月16日，艾森豪威爾的情報顧問委員會向他提出了這樣一個問題：應該改組中情局。因為從印尼問題上就可以看出，秘密行動根本就不是中情局擅長的。而且，他們認為中情局“沒有能力就自身的情報信息與業(yè)務作客觀的評估，”他們只知道用錢來打水漂。艾森豪威爾不是沒有這個想法，事實上，在他連任后，他就一直想改變中情局的管理方式。但他自己說過，他知道自己沒有辦法改變艾倫?杜勒斯，也想不到還有誰可以接手中情局。近幾年來，杜勒斯已經對秘密行動情有獨鐘，早已不把心思放在向總統提供情報這個核心任務上了。當艾森豪威爾把情報顧問委員會的想法說給杜勒斯聽后，他極力阻止，他告訴艾森豪威爾，中情局沒有什么不對，因為有成功案例。他沒有說，這些成功的案例都是用錢堆出來的。他把印尼任務的失敗歸到一直負責秘密行動的威斯納身上，最后，他讓艾森豪威爾放心，因為秘密行動的負責人已經有新的人選了。