后來，陳誠調(diào)任遠征軍司令時，戴笠仍在繼續(xù)追查。不久，軍統(tǒng)云南站又從遠征軍總司令部方面得到了有關(guān)這幾個人的材料，并搞到了他們的組織章程和部分行動計劃，再度引起戴笠的高度重視。經(jīng)查實，戴笠發(fā)現(xiàn)其中有一人竟是陳誠的親戚。戴笠如獲至寶，他一方面上報蔣介石有人欲發(fā)動兵變，另一方面，他又向何應(yīng)欽等暗示說陳誠部將要對許多高級將領(lǐng)進行暗殺活動。

由于戴笠從中作梗，蔣介石下令陳誠立即對那幾個人進行拘捕，并押解至重慶審判。陳誠十分清楚，這是戴笠在搞鬼。但為了在蔣介石面前證明自己的清白，不得不下令讓自己的特務(wù)頭子張振國把人交給軍統(tǒng)局。同時，軍統(tǒng)也把在重慶的幾個有關(guān)人員一并拘押。戴笠一直想通過這件事把陳誠除掉，但幾位當(dāng)事人堅稱此事與陳誠無關(guān)，是由自己發(fā)起的。由于沒有確鑿證據(jù)，無法上報蔣介石，此案也就一直拖延了下來．直至戴笠死后。

戴笠到死都沒能如愿，但與陳誠結(jié)了仇。這下他死了，陳誠是怎么也不會放過這個好機會報復(fù)軍統(tǒng)的。其實陳誠還有一個打算，那就是想在裁減軍統(tǒng)之后，讓自己手下的特務(wù)頭子張振國把軍統(tǒng)部分機構(gòu)和人員接收過來．以擴大自身的特務(wù)系統(tǒng)。

孔祥熙和戴笠結(jié)仇是在1942年。這件事的起因就是當(dāng)初轟動一時的“林世良走私案”。

1942年，日軍侵占仰光。當(dāng)時林世良任國民黨中央信托局運輸處經(jīng)理，為孔祥熙家族斂財聚富。他既是孔門紅人，又是孔二小姐的未婚夫，所以常常是有恃無恐，十分囂張，打著替中央銀行運鈔票的特種物資的旗號，大肆走私各種緊俏物資，大發(fā)國難財。對此，戴笠記恨在心。

這年，在仰光的大成公司，趁林世良在此搶運公物，私下托他夾運價值1600萬元的走私物資。林世良認為此舉油水很大，便同意冒險包運。但此舉被軍統(tǒng)滇緬公路工作人員發(fā)現(xiàn)，檢查時候截留了走私貨車，并迅速向戴笠報告。戴笠以林世良“勾結(jié)私商走私違禁物資，擾亂戰(zhàn)時經(jīng)濟，破壞抗戰(zhàn)大局”為由上書蔣介石。蔣介石聞報大怒，下令將林世良逮捕審訊。

孔樣熙一家知道林世良等人被逮捕后，大為緊張，連忙暗中打通關(guān)節(jié)，進行多方營救。經(jīng)過一系列幕后交易之后，林世良被從輕發(fā)落。