柏拉圖稱他為“心者”（The Mind），學(xué)園的同學(xué)稱他為“讀者”（The Reader），這不見得是恭維，因?yàn)榧词故菫榱俗x書的緣故，哲學(xué)家的手也不應(yīng)該搞臟。在學(xué)園就讀時(shí)，他追隨柏拉圖多年，主張我們所認(rèn)識(shí)的世界只是完美永恒的觀念世界的粗略影像。但是亞里士多德（公元前384年至公元前322年）在快40歲時(shí)離開雅典，回到自己的祖國(guó)馬其頓王國(guó)后，不再只靠哲學(xué)辯論尋找真理，而是通過(guò)耐心地觀察老鷹、蜜蜂、海豚與角鯊，以及在解剖臺(tái)上的血漬與惡臭中，尋找另一類的知識(shí)。在面對(duì)豐富多樣的大自然時(shí)，他率先按照生物本身的特性，來(lái)研究生物的科學(xué)分類與知識(shí)，而不是通過(guò)有成見的觀點(diǎn)。

亞里士多德的父親尼可馬各（Nicomachus）是馬其頓國(guó)王阿敏塔斯二世（Amyntas Ⅱ）的御醫(yī)。因此，亞里士多德可能從小就開始接觸大量知識(shí)并實(shí)地練習(xí)。不過(guò)他的雙親在他年幼時(shí)即已過(guò)世，因此他頂多受過(guò)行醫(yī)的初步訓(xùn)練而已。大約17歲時(shí)，亞里士多德前往雅典，在柏拉圖的學(xué)園學(xué)習(xí)。他在那里待了將近20年，從一位才華橫溢的學(xué)生成長(zhǎng)為頂尖的哲學(xué)家，探索實(shí)在、知識(shí)、邏輯與因果關(guān)系的本質(zhì)。亞里士多德是愛(ài)奧尼亞人，這一點(diǎn)相當(dāng)重要，因?yàn)樗坪鯇W(xué)到當(dāng)?shù)匾恍﹤ゴ蟮淖匀徽軐W(xué)家的精神，他們?cè)谒錾皵?shù)世紀(jì)，于當(dāng)?shù)貜氖卵芯颗c教學(xué)。泰勒斯與他的追隨者試圖通過(guò)自然因果而非神話來(lái)解釋宇宙，并且從自然當(dāng)中而非在眾神一時(shí)的心血來(lái)潮中尋找萬(wàn)物的本質(zhì)。亞里士多德時(shí)代的雅典哲學(xué)家認(rèn)為愛(ài)奧尼亞的哲學(xué)家過(guò)于天真，因?yàn)樗麄兿嘈诺氖亲约貉壑械恼鎸?shí)，而非純粹由推理得到的產(chǎn)物。

亞里士多德于公元前340年離開學(xué)園與雅典，大致與柏拉圖去世的時(shí)間相同。在雄辯家狄摩西尼（Demosthenes）的挑撥下，雅典人的反馬其頓情緒高漲，導(dǎo)致亞里士多德避開雅典達(dá)12年之久。在流亡到小亞細(xì)亞赫梅厄斯（Hermias）的宮廷時(shí)，他娶了統(tǒng)治者的侄女皮西亞斯（Pythias）為妻。這對(duì)夫婦帶著女兒搬到萊斯波島（Lesbos），亞里士多德似乎就是在那里開始研究動(dòng)物王國(guó)，觀察島上與附近生物的。他可能曾經(jīng)接受泰奧弗拉斯托斯（Theophrastus）的幫助，泰奧弗拉斯托斯是該島的本地人，后來(lái)以他對(duì)植物的研究與分類，協(xié)助亞里士多德進(jìn)行動(dòng)物研究。亞里士多德有一件著名的事跡，他曾花了三年的時(shí)間，教導(dǎo)馬其頓國(guó)王腓力（Phillip）的兒子，亦即后來(lái)的亞歷山大大帝。

亞里士多德回到雅典時(shí)，已年屆五旬，當(dāng)時(shí)雅典是由亞歷山大大帝統(tǒng)治。亞里士多德并未回到柏拉圖的學(xué)園，而是在呂刻昂（Lyceum）成立自己的哲學(xué)學(xué)校。他在那里教授許多科目，但仍繼續(xù)研究動(dòng)物。亞里士多德最終寫了一系列的書，為生物學(xué)奠定了基礎(chǔ)。其中最重要的一本是《 動(dòng)物志 》（Historia Animalium），在這本書中他談到數(shù)百種動(dòng)物的身體結(jié)構(gòu)及生活方式，包括它們生長(zhǎng)繁殖的方式、棲息地及互動(dòng)方式。他還寫了一些更專門的書，包括比較動(dòng)物解剖學(xué)與功能生理學(xué)的《 論動(dòng)物解剖 》（De Partibus Animalium），關(guān)于動(dòng)物如何移動(dòng)的《 論動(dòng)物行為 》（De Motu Animalium）與《 論動(dòng)物生態(tài) 》（De Incessu Animalium），追蹤動(dòng)物發(fā)展與成長(zhǎng)的《 論動(dòng)物生成 》（De Generatione Animalium），以及探索生物與非生物之間差異的《 論靈魂 》（De Anima）。