同日，吳等人決定“清黨”，他們建立了一個(gè)委員會(huì)研究有關(guān)方案。6日，北京和上海是多事的一天。在上海的所有武裝集團(tuán)接到通知，從今以后他們必須按軍紀(jì)行事，任何反對(duì)行動(dòng)將以叛亂論處。

在北京，張作霖派警察搜查了蘇聯(lián)使館，使蘇使館人員大吃一驚。

他們?cè)谔K使館中發(fā)現(xiàn)的東西，比張本人希望的要多。中共的建黨人之一李大釗和另外35名共產(chǎn)黨員在那里避難。張作霖當(dāng)時(shí)的外交部長(zhǎng)宣布中斷與蘇聯(lián)的關(guān)系，并且通知蘇聯(lián)人回國(guó)。

4月28日，張下令殺死了李大釗及另外19個(gè)共產(chǎn)黨人。

蔣依然面臨著如何使在武漢的敵手潰散的問(wèn)題。

中央執(zhí)行委員會(huì)撤銷(xiāo)他各種職務(wù)的消息，使他感到沮喪。

李宗仁也為來(lái)自上海的消息所震動(dòng)，便離開(kāi)安徽前線來(lái)到上海與蔣會(huì)面。他到達(dá)上海的時(shí)候，正值蔣接到第一軍軍長(zhǎng)何應(yīng)欽要求辭職的電報(bào)。蔣說(shuō)：“如果連第一軍都不能穩(wěn)定的話，那我就無(wú)法維持下去了?！?/p>

李回答說(shuō)：“如果你也不干了，那么事情就糟了。當(dāng)前的危機(jī)主要是共產(chǎn)黨企圖消滅國(guó)民黨?！彼ㄗh蔣馬上通電其他軍界的支持者來(lái)上?！扒妩h”，他自己的第七軍可以召集到南京，授權(quán)在那里“清黨”，蔣接受了他的建議。

4月6日，正是張作霖派警察搜查蘇聯(lián)大使館的那一天，汪精衛(wèi)到了武漢。

第二天，支持蔣介石的軍官到達(dá)上海，他們立即與蔣、李和上海警備區(qū)司令白崇禧秘密商議，討論“清黨”問(wèn)題。

8日，蔣建立了一個(gè)臨時(shí)行政委員會(huì)，以取代共產(chǎn)黨建立的臨時(shí)市政會(huì)。

10日，蔣及其支持者（自稱(chēng)是清查委員會(huì)）舉行正式會(huì)議，以政令形式通過(guò)了各種方案。所有的入黨申請(qǐng)暫時(shí)停止，任何重新登記的黨員必須受到三個(gè)月的調(diào)查，每個(gè)黨員必須每?jī)芍芟蚱渌谥Р繄?bào)告自己的政治活動(dòng)。會(huì)議還決定，取消武漢政府，國(guó)民黨中央總部遷至南京。

隨著為蔣的行為作辯護(hù)的“清查令”的施行，蔣開(kāi)始準(zhǔn)備進(jìn)攻了。1927年4月11日，蔣發(fā)布了一項(xiàng)密令：沒(méi)收2700名共產(chǎn)黨工人糾察隊(duì)員的槍。12日，蔣的支持者采取行動(dòng)，在廣東、廣西、福建、浙江、江蘇、安徽、南京和上海同時(shí)進(jìn)行“清洗”。李宗仁起了很大作用，如果沒(méi)有李的支持，“清洗”是不可能的。

然而，上海的詳細(xì)情況是不清楚的，有關(guān)這一事情的報(bào)道比較混亂。有一種說(shuō)法認(rèn)為，是國(guó)民黨讓當(dāng)?shù)亓髅ゴ┲と酥品?，根?jù)約好的信號(hào)，這些假工人突然襲擊了全市所有工人階級(jí)的組織，并且無(wú)論他們是否抵抗，一律將他們打死。

還有一種說(shuō)法是，蔣在進(jìn)入上海之前，事先與上海有權(quán)勢(shì)的賭場(chǎng)主、鴉片商、秘密社會(huì)的頭目杜月笙達(dá)成了協(xié)議。

據(jù)說(shuō)，青幫流氓屠殺了數(shù)千名工人領(lǐng)袖和富于戰(zhàn)斗精神的工人。共產(chǎn)黨的官方數(shù)字是，300人被打死，5000人失蹤，一些很有前途的青年共產(chǎn)黨干部在那天的戰(zhàn)斗中和在13日的總罷工流產(chǎn)后被處決。

在那些被逮捕或被處決的人當(dāng)中有周恩來(lái)，但他與一個(gè)師長(zhǎng)的兄弟一起逃出來(lái)了，那位師長(zhǎng)的兄弟是周在黃埔的學(xué)生。

蔣介石本人沒(méi)有把這些事件講清楚，他的解釋是委婉和隱晦的。他說(shuō)4月12日，為了防止共產(chǎn)黨暴動(dòng)，國(guó)民軍在當(dāng)?shù)毓?huì)和商會(huì)的配合下，繳了紅色工人糾察隊(duì)的槍支并將共產(chǎn)黨破壞分子置于監(jiān)視之中。對(duì)上海發(fā)生的這種情況，不得不進(jìn)行控制。