百濟(jì)國(guó)被滅之后，原百濟(jì)王扶余璋的部下福信及浮屠道琛率眾據(jù)守周留城，抗擊唐軍。10月，福信派遣使臣到日本，要求迎回在日本為人質(zhì)的扶余豐王子，并向日本求援，以圖復(fù)國(guó)。為了恢復(fù)并擴(kuò)大在朝鮮半島上的影響，中大兄皇子同意了百濟(jì)遺臣的請(qǐng)求，并于公元12月將都城從內(nèi)地的飛鳥(niǎo)遷至沿海的難波城。公元661年1月，監(jiān)國(guó)的中大兄皇子在與百濟(jì)隔海相望的盤(pán)瀨設(shè)置了行宮。次年，日本向百濟(jì)贈(zèng)送大批物資，日本本土則“修繕兵甲、各具船舶、儲(chǔ)設(shè)軍糧”，隨時(shí)準(zhǔn)備渡海作戰(zhàn)。

公元663年6月，中大兄皇子命令上毛野稚子率領(lǐng)2.7萬(wàn)人向新羅發(fā)起進(jìn)攻，奪取了沙鼻歧，奴江二城，切斷了唐軍與新羅的聯(lián)系。不久，由孫仁師率領(lǐng)的7000名唐朝援軍渡海到達(dá)熊津，與劉仁軌會(huì)師，唐軍軍勢(shì)因此大振。經(jīng)諸將商議之后，制定了進(jìn)攻周留的計(jì)劃--劉仁愿和孫仁師以及新羅王金法敏率軍從陸路進(jìn)攻；劉仁軌、杜爽則率領(lǐng)唐水軍與新羅水軍由熊津江入白村江口，溯江而上，從水上進(jìn)攻。

8月17日，唐新聯(lián)軍從陸路三面圍攻周留城，城外據(jù)點(diǎn)逐一被攻克，百濟(jì)于是又向日本求援，中大兄皇子派廬原君臣領(lǐng)軍萬(wàn)余越海而來(lái)，準(zhǔn)備自白村江口登陸。當(dāng)時(shí)，唐新聯(lián)軍雖已從三面包圍了周留城，但建在白村江河口上游左岸山地上周留城，三面環(huán)山，一面臨水，山峻溪隘，易守難攻。百濟(jì)只要能確保周留至白村江一線安全暢通，就能得到日本從海上的支援，從而據(jù)險(xiǎn)固守。因此，白村江成為維系周留存亡的生命線，也是百濟(jì)得以復(fù)國(guó)的希望所在，兩軍都誓在必爭(zhēng)。

公元663年8月27日，唐朝水軍與日本水軍在海上遭遇。從當(dāng)時(shí)雙方的軍力來(lái)看，大唐水軍7000余人，戰(zhàn)船170艘；日本水軍有萬(wàn)余人，戰(zhàn)船1000多艘。雖然日軍人多、船多，但大唐水軍船堅(jiān)器利，武器裝備遠(yuǎn)勝于日軍。

中日兩軍首次接戰(zhàn)的結(jié)果，據(jù)《舊唐書(shū)．劉仁軌傳》的記載，“四戰(zhàn)捷，焚其舟四百艘，煙焰漲天，海水皆赤，賊眾大潰”。初戰(zhàn)失利后，日軍并沒(méi)有撤軍，而是于第二天聯(lián)合百濟(jì)軍又再次向大唐水軍發(fā)起進(jìn)攻，結(jié)果“大唐便自左右?jiàn)A船繞戰(zhàn)，須臾之際，官軍敗績(jī)，赴水溺死者眾，艫舳不得回旋。樸市田來(lái)津仰天而誓，切齒而嗔殺數(shù)十人，于焉戰(zhàn)死”。

白村江海戰(zhàn)失利后，中大兄皇子深恐唐朝與新羅軍隊(duì)進(jìn)攻日本本土，于是從664年起，花費(fèi)巨資，先后構(gòu)筑了四道防線。尤其是在九州的太宰府建的“水城”規(guī)模最大。所謂“水城”實(shí)際上是一座土壩，壩長(zhǎng)1.2公里，底部寬80米，高十幾米，外側(cè)是一條5米深的水溝。除了在軍事上采取守勢(shì)之外，667年，中大兄皇子還將都城遷往了近江大津?qū)m。

日本在白村江海戰(zhàn)中雖然遭受了慘敗，但是這并沒(méi)有影響它與唐朝的交往，而唐朝也沒(méi)有因?yàn)槿毡驹戎С职贊?jì)國(guó)而對(duì)它疏遠(yuǎn)，相反，兩國(guó)的關(guān)系在海戰(zhàn)之后變得更為密切。公元669年，日本派河內(nèi)鯨為“平高麗慶賀使”前往唐朝都城長(zhǎng)安，祝賀大唐在朝鮮半島的徹底勝利。與此同時(shí)，日本開(kāi)始積極選派遣唐使，政治上發(fā)展與唐朝的睦鄰關(guān)系，文化上積極汲取唐代豐富的典章制度，使得日本社會(huì)進(jìn)入了一個(gè)全新的發(fā)展階段。

自省與危機(jī)意識(shí)，仿佛一直伴隨著日本民族。白村江海戰(zhàn)，于日本而言，不單單是一場(chǎng)失敗的戰(zhàn)爭(zhēng)，同時(shí)還是一場(chǎng)反思的戰(zhàn)爭(zhēng)，畢竟勝敗僅在一時(shí)，但背后實(shí)力的較量卻是無(wú)比漫長(zhǎng)的。戰(zhàn)爭(zhēng)失利的日本人看清了這一點(diǎn)，于是，他們放下一時(shí)的成敗，轉(zhuǎn)而向內(nèi)壯大自我。