孫惠蔚，武邑武遂人。十五歲時(shí)，就粗略地通曉《詩》、《書》和《孝經(jīng)》、《論語》。十歲那年，跟著董道季學(xué)習(xí)《易》。十九歲時(shí)，又向程玄學(xué)習(xí)《禮經(jīng)》和《春秋三傳》。周游于儒生聚會(huì)之所，聲名傳遍冀州。

　　北魏孝文帝太和初年，郡人舉薦孫惠蔚為孝廉，在中書省應(yīng)詔陳述政事。當(dāng)時(shí)，中書監(jiān)高閭因應(yīng)對(duì)與孫惠蔚談?wù)摱]舉他，孫惠蔚很快任中書博士，轉(zhuǎn)任皇宗博士。高閭受命整理編定雅樂，孫惠蔚參加了這件事情。音樂編定之后，高閭上疏請(qǐng)求將朝中官員聚集在太樂，共同研討是非。秘書令李彪自以為有辯才，一開始就設(shè)置難題。高閭命令孫惠蔚與李彪爭(zhēng)論，李彪不能讓孫惠蔚服輸。黃門侍郎張彝經(jīng)常和孫惠蔚交往，每次上表奏疏議論政事，大都向?qū)O惠蔚征詢意見。太和十七年(493)，孝文帝征伐南方，上書議論類祭的禮儀。太師馮熙死后，孫惠蔚監(jiān)督其喪事禮儀，上書請(qǐng)求讓馮熙未成年的兒子，都穿成年人的衣服。孫惠蔚和李彪因儒家學(xué)問而相互理解，李彪官至尚書之后，孫惠蔚依舊任太廟令。孝文帝曾經(jīng)從容地對(duì)人說：“道固(李彪字)既已升至高位，而孫蔚還沉居卑微的地位，朕常常認(rèn)為有負(fù)孫惠蔚?！睂O惠蔚雖然長久滯居小官，而能深刻體味通達(dá)塞滯的道理，沒有一點(diǎn)怨恨，儒生因此而稱贊他。太和二十二年，孫惠蔚任東宮侍讀。

　　當(dāng)初，魏朝七廟以平文為太祖。孝文帝議祖宗神位，把道武帝作為太祖。祖宗雖然確定了下來，但太祖左右的神位卻沒有改變。孝文帝駕崩，準(zhǔn)備奉孝文神位祭于祖廟，侍中崔光兼領(lǐng)太常卿，認(rèn)為太祖既已改定為道武帝，左右的神位應(yīng)按照次序而改變。兼領(lǐng)御史中尉、黃門侍郎邢巒認(rèn)為太祖雖然改變，左右的神位依然不應(yīng)改變，就立即草撰彈劾奏章，想彈劾崔光。崔光對(duì)孫惠蔚說：“這樣做的禮法，而御史卻要彈劾，我想從你這位大學(xué)問家這里獲得幫助。”孫惠蔚說“：這樣做十分合乎禮法的變化。”很快就寫信給崔光，幫助說明這件事情。崔光把孫惠蔚的信呈遞給宰相，就召見孫惠蔚和邢巒當(dāng)堂議論得失。尚書令王肅又幫助邢巒，而邢巒最終理屈詞窮，彈劾的事情就壓下了。

　　宣武帝即位之后，孫惠蔚仍舊在其身邊，輔導(dǎo)宣武帝學(xué)習(xí)經(jīng)籍典章。自冗從仆射升任秘書丞、武邑郡中正。孫惠蔚進(jìn)入東觀以后，看到典籍不全備，閱讀舊的典籍，原先沒有確定目錄，新的舊的雜揉在一起，首尾不全，有的典籍埋積幾十帙，沒有的成年不加撰刻。有的篇目脫落，首尾殘破，有的文被損壞，字跡脫誤，錯(cuò)訛毀壞的很多。卷目雖然很多，全部刻定的卻很少。孫惠蔚請(qǐng)求按照前任秘書丞盧昶撰著的甲乙兩部新目錄，想添補(bǔ)殘缺，削減合并，校訂文理，加以句讀，作為定本，按照順序加以撰刻，作為永久的格式和制度。秘書省原先沒有的版本，廣泛探究尋找。搜求版本加以補(bǔ)足。然而，經(jīng)籍浩繁廣博，諸子之書紛繁，書籍卷數(shù)既已眾多，文章次序又多謬訛，不是一兩個(gè)校書短時(shí)候能夠完成的。請(qǐng)求命令四門博士和在京城的儒生四十人，在秘書省專門精心地校訂考正，參酌審定字義。詔令批準(zhǔn)孫惠蔚的請(qǐng)求。

　　孫惠蔚后來任黃門侍郎，代替崔光任著作郎。才能在文學(xué)歷史方面，沒有什么著作。改任國子祭酒、秘書監(jiān)，仍兼任著作郎。延昌三年(514)，追賞講論考定典籍的功勞，封爵棗強(qiáng)縣男。明帝初年，出京任濟(jì)州刺史。回京之后，授光祿大夫之職。

　　自北魏初年以來，儒生都是做地位卑下的官，孫惠蔚的官職最為顯赫。原先單名一個(gè)蔚字，宣武帝正始年間，在宮中給皇帝講學(xué)，夜中談?wù)摲鸾?jīng)，很稱皇帝的心意，詔令在其名中加一個(gè)“惠”字，法號(hào)惠蔚法師。死于官任，追贈(zèng)瀛州刺史，謚號(hào)戴。子孫伯禮襲封爵位。