蕭會(huì)理字長才，從小聰明靈慧，喜愛文史。十一歲時(shí)，蕭會(huì)理成了孤兒，因此特別受到梁武帝的寵愛，給他的衣服、禮儀和品爵都和正王待遇相同。十五歲時(shí)被任命湘州刺史，他總是相信他身邊的人所出的主意，行事劉納因此而經(jīng)常限制他的行動(dòng)。蕭會(huì)理心里很不高興，他設(shè)法找到劉納收取賄賂的證據(jù)，將他拘禁起來送往建鄴。劉納嘆息著說：“我一見到天子，就會(huì)讓你們知道后果。”蕭會(huì)理厚送給劉納錢糧，幾次派人前往安慰。同時(shí)卻讓心腹到青草湖扮成強(qiáng)盜，將劉納全家百口人全部殺光。后蕭會(huì)理累升而擔(dān)任都督、南兗州刺史。太清元年(547)，蕭會(huì)理總督眾軍北侵魏國，到彭城時(shí)，被魏軍打敗，退回本鎮(zhèn)。

　　太清二年，侯景包圍了京城，蕭會(huì)理領(lǐng)兵入京救援。正值北徐州刺史封山侯蕭正表準(zhǔn)備接應(yīng)他的哥哥蕭正德，表面上聲稱前往救援，實(shí)際上準(zhǔn)備偷襲廣陵。蕭會(huì)理打敗了蕭正表，這才得以沿著道路進(jìn)軍。臺(tái)城陷落以后，蕭會(huì)理回到本鎮(zhèn)。侯景派遣前臨江太守董紹先帶著梁武帝親筆手書來召回蕭會(huì)理。蕭會(huì)理的幕僚們說：“董紹先的書信哪里是皇帝的本意！”都勸蕭會(huì)理拒絕接納。蕭會(huì)理采納了典簽范子鸞的計(jì)謀，便說：“皇上年紀(jì)大了，受制于賊寇，如今既然有親筆信召我入朝，臣子之心，怎么能夠違背呢？況且如今身居江北，功業(yè)也難以成就，不如親自前往京都，在天子身邊再作圖謀?！庇谑墙蛹{了董紹先。

　　董紹先進(jìn)城之后，用一桿黑旗指揮眾軍，將蕭會(huì)理單騎送回京都。侯景讓蕭會(huì)理任司空兼尚書令。蕭會(huì)理雖然在賊寇的控制之中，總是想著恢復(fù)朝廷的大計(jì)，他和西鄉(xiāng)侯蕭勸等人暗中布置了許多心腹，交結(jié)壯士。當(dāng)時(shí)范陽人祖皓斬了董紹先，占領(lǐng)廣陵城起義，打算以蕭會(huì)理作為內(nèi)應(yīng)。祖皓失敗，供辭中提到蕭會(huì)理。侯景假傳詔書免去蕭會(huì)理的官位，但仍讓他以白衣的身份擔(dān)任尚書令。

　　當(dāng)年冬天，侯景前往晉熙，京都兵力虛弱，蕭會(huì)理又和柳敬禮以及北兗州司馬成欽謀議。柳敬禮說：“要辦大事時(shí)必定要有資本，如今身邊沒有寸兵，怎么能夠行動(dòng)？”蕭會(huì)理說：“湖熟有我的故友舊人三千多人，昨天前來告知，準(zhǔn)備確定日期響應(yīng)集合起來。合計(jì)敵人的守軍也不過一千人，如果有大兵從外部進(jìn)攻，我們?cè)趦?nèi)部接應(yīng)，直接拿下王偉，事情必定成功。即使侯景知道后歸來，也無能為力了。”柳敬禮說：“好！”當(dāng)時(shí)京城的百姓都厭惡賊軍，很想為朝廷效命。但建安侯蕭賁把這項(xiàng)計(jì)謀報(bào)告了王偉，王偉便把蕭會(huì)理和他的弟弟通理抓住關(guān)了起來。

　　當(dāng)時(shí)有位錢塘人叫褚冕，是蕭會(huì)理的舊交，也被關(guān)押在京城監(jiān)獄中，賊寇審問他有關(guān)事情的起因，拷打他數(shù)以千次之多，但他始終沒有說出。蕭會(huì)理在隔壁聽到聲音，遠(yuǎn)遠(yuǎn)地說：“褚郎，你不就因?yàn)槲叶掠诖藛?？但你一定不要說話。”王偉殺了蕭會(huì)理等人，而褚冕到底不服罪，王偉便放了他。

　　蕭會(huì)理的弟弟通理字仲宣，任太子洗馬，受封為祈陽侯，到這時(shí)也同時(shí)遇害。