醫(yī)學(xué)知識組織

 第一章　緒論/ 1
第一節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織基本概念 / 1
一、 知識組織概念起源 / 1
二、 醫(yī)學(xué)知識組織內(nèi)涵 / 3
三、 醫(yī)學(xué)知識組織的意義與作用 / 3
第二節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織內(nèi)容 / 4
一、 醫(yī)學(xué)知識組織對象 / 4
二、 醫(yī)學(xué)知識組織內(nèi)容范圍 / 5
三、 醫(yī)學(xué)知識組織層次 / 6
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織發(fā)展 / 7
一、 醫(yī)學(xué)知識組織發(fā)展階段 / 7
二、 醫(yī)學(xué)知識組織發(fā)展特點(diǎn) / 8
三、 國際學(xué)協(xié)會(huì)、學(xué)術(shù)期刊與交流平臺 / 9
第二章　醫(yī)學(xué)知識組織理論與方法/ 12
第一節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織基本理論 / 12
一、 醫(yī)學(xué)知識組織的學(xué)科基礎(chǔ)理論 / 12
二、 有序化理論 / 15
三、 醫(yī)學(xué)知識組織的其他相關(guān)理論 / 16
第二節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織基本方法 / 17
一、 知識組織方法概述 / 17
二、 知識組織的語法學(xué)方法 / 18
三、 知識組織的語義學(xué)方法 / 20
四、 知識組織的語用學(xué)方法 / 27
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織的原則與構(gòu)成要素 / 30
一、 醫(yī)學(xué)知識組織原則 / 30
二、 醫(yī)學(xué)知識組織構(gòu)成要素 / 32
第四節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織過程 / 33
一、 醫(yī)學(xué)知識組織總體流程 / 33
二、 醫(yī)學(xué)知識資源提取 / 34
三、 醫(yī)學(xué)知識規(guī)范化 / 35
四、 醫(yī)學(xué)知識存儲 / 37
五、 醫(yī)學(xué)知識推理及更新 / 38
六、 醫(yī)學(xué)知識服務(wù) / 39
第三章　醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)：術(shù)語與編碼/ 41
第一節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)概述 / 41
一、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)概念 / 41
二、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)類型 / 41
三、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)功能 / 43
四、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)發(fā)展 / 44
第二節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)內(nèi)容結(jié)構(gòu) / 45
一、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)宏觀結(jié)構(gòu) / 45
二、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)微觀結(jié)構(gòu) / 47
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)構(gòu)建與互操作 / 51
一、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)構(gòu)建方法 / 51
二、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)構(gòu)建工具 / 52
三、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)構(gòu)建案例 / 55
四、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)互操作 / 57
第四節(jié)　醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)服務(wù)與應(yīng)用 / 59
一、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)服務(wù) / 59
二、 醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng)應(yīng)用 / 60
第四章　醫(yī)學(xué)知識處理與表示/ 63
第一節(jié)　醫(yī)學(xué)知識抽取 / 63
一、 醫(yī)學(xué)實(shí)體抽取 / 63
二、 醫(yī)學(xué)關(guān)系抽取 / 69
第二節(jié)　醫(yī)學(xué)知識表示 / 77
一、 邏輯表示法 / 77
二、 產(chǎn)生式規(guī)則表示法 / 79
三、 語義網(wǎng)表示法 / 81
四、 框架表示法 / 84
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)知識融合 / 86
一、 數(shù)據(jù)層知識融合 / 87
二、 概念層知識融合 / 89
三、 跨語言知識融合 / 91
第五章　醫(yī)學(xué)知識圖譜/ 94
第一節(jié)　知識圖譜概述 / 94
一、 知識圖譜及相關(guān)概念 / 94
二、 知識圖譜發(fā)展脈絡(luò) / 96
三、 醫(yī)學(xué)知識圖譜及其主要應(yīng)用場景 / 96
第二節(jié)　知識圖譜的構(gòu)建 / 97
一、 知識圖譜的邏輯結(jié)構(gòu) / 97
二、 知識圖譜的構(gòu)建方式 / 98
三、 知識圖譜構(gòu)建的主要流程 / 98
四、 知識圖譜質(zhì)量評估 / 98
五、 知識圖譜的存儲 / 99
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)知識圖譜系統(tǒng)案例 / 99
一、 中文醫(yī)學(xué)知識圖譜 / 99
二、 基于指南的非小細(xì)胞肺癌知識圖譜 / 100
三、 罕見病知識圖譜診斷模型 / 103
四、 醫(yī)學(xué)百科知識圖譜 / 106
第六章　醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)組織/ 108
第一節(jié)　醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)組織概述 / 108
一、 醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)組織的內(nèi)容 / 108
二、 醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)組織的發(fā)展趨勢 / 109
第二節(jié)　醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)描述 / 109
一、 文獻(xiàn)描述的元數(shù)據(jù)方案 / 109
二、 機(jī)讀目錄 / 110
三、 都柏林核心元數(shù)據(jù) / 113
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)分類標(biāo)引 / 114
一、 中國圖書館分類法 / 115
二、 中國圖書館分類法·醫(yī)學(xué)專業(yè)分類表 / 116
三、 分類標(biāo)引的方法與原則 / 118
第四節(jié)　醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)主題標(biāo)引 / 119
一、 醫(yī)學(xué)主題詞表 / 119
二、 一體化語言系統(tǒng) / 122
三、 主題標(biāo)引的方法與原則 / 123
第五節(jié)　醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)組織應(yīng)用案例 / 124
一、 PubMed / 124
二、 中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng) / 126
第七章　醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)組織/ 128
第一節(jié)　醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)及其組織概述 / 128
一、 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的產(chǎn)生 / 128
二、 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的特點(diǎn)和類型 / 129
三、 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)組織的目的和要求 / 131
第二節(jié)　醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)組織過程 / 132
一、 數(shù)據(jù)收集 / 132
二、 數(shù)據(jù)預(yù)處理 / 133
三、 加工整理 / 135
四、 數(shù)據(jù)存儲 / 139
第三節(jié)　醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)組織技術(shù) / 140
一、 數(shù)據(jù)倉庫 / 140
二、 語義網(wǎng) / 142
三、 機(jī)器學(xué)習(xí)與深度學(xué)習(xí) / 144
四、 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)可視化 / 145
第四節(jié)　醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)組織案例 / 146
一、 重癥監(jiān)護(hù)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫 / 146
二、 生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域語義數(shù)據(jù)集成平臺 / 148
三、 人口健康數(shù)據(jù)倉儲 / 149
第八章　網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息組織/ 152
第一節(jié)　網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息概述 / 152
一、 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息的類型及特點(diǎn) / 152
二、 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息描述 / 153
三、 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息的存儲方式 / 154
四、 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息的傳輸與交換 / 154
第二節(jié)　網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息組織方式 / 155
一、 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息組織概述 / 155
二、 網(wǎng)絡(luò)知識組織系統(tǒng) / 156
三、 搜索引擎 / 156
第三節(jié)　網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息組織技術(shù) / 160
一、 索引技術(shù) / 160
二、 網(wǎng)頁排序算法 / 160
三、 推薦算法 / 161
四、 網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)知識映射和聚合 / 162
第四節(jié)　網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)信息組織應(yīng)用案例 / 163
一、 健康在線基金會(huì)醫(yī)學(xué)網(wǎng)站 / 163
二、 智能問答系統(tǒng) / 164
第九章　基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)知識組織/ 167
第一節(jié)　基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域資源及特征 / 167
一、 生物信息資源 / 167
二、 解剖與病理數(shù)據(jù)資源 / 169
三、 生理與生化數(shù)據(jù)資源 / 170
四、 醫(yī)學(xué)微生物數(shù)據(jù)資源 / 171
第二節(jié)　典型基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng) / 171
一、 美國國家生物技術(shù)信息中心分類法 / 172
二、 基因本體 / 172
三、 人類基因組織基因命名表 / 173
四、 人類表型本體 / 173
五、 解剖學(xué)基礎(chǔ)模型本體 / 174
第三節(jié)　基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域知識組織應(yīng)用 / 175
一、 GenBank 數(shù)據(jù)庫 / 175
二、 組學(xué)原始數(shù)據(jù)歸檔庫 / 176
三、 UniProt 數(shù)據(jù)庫 / 178
第十章　臨床醫(yī)學(xué)知識組織/ 181
第一節(jié)　臨床醫(yī)學(xué)信息資源及特征 / 181
一、 臨床醫(yī)學(xué)信息資源概述 / 181
二、 典型臨床醫(yī)學(xué)信息資源 / 182
第二節(jié)　信息標(biāo)準(zhǔn)與典型臨床醫(yī)學(xué)知識組織系統(tǒng) / 185
一、 電子病歷基本數(shù)據(jù)集與共享文檔規(guī)范 / 186
二、 醫(yī)療信息交換與互操作標(biāo)準(zhǔn) / 187
三、 醫(yī)學(xué)數(shù)字成像和通信 / 189
四、 國際疾病分類表 / 190
五、 觀測指標(biāo)標(biāo)識符邏輯命名與編碼系統(tǒng) / 191
六、 系統(tǒng)化臨床醫(yī)學(xué)術(shù)語集 / 192
第三節(jié)　臨床知識組織應(yīng)用實(shí)踐 / 193
一、 臨床知識服務(wù)系統(tǒng)總體框架 / 193
二、 臨床數(shù)據(jù)治理 / 194
三、 臨床案例知識庫 / 197
四、 臨床決策支持系統(tǒng) / 200
第十一章　藥學(xué)知識組織/ 203
第一節(jié)　藥學(xué)信息資源及特征 / 203
一、 藥物研發(fā)與監(jiān)管信息 / 203
二、 藥物生產(chǎn)與流通信息 / 204
三、 臨床用藥與智能用藥信息 / 205
第二節(jié)　典型藥學(xué)知識組織系統(tǒng) / 207
一、 中國藥典 / 207
二、 詞典 / 209
三、 術(shù)語表 / 212
第三節(jié)　藥學(xué)領(lǐng)域知識組織應(yīng)用 / 215
一、 藥物數(shù)據(jù)庫DrugBank / 216
二、 美國食品藥品監(jiān)督管理局不良事件報(bào)告系統(tǒng) / 217
第十二章　公共衛(wèi)生領(lǐng)域知識組織/ 219
第一節(jié)　公共衛(wèi)生信息資源及特征 / 219
一、 公共衛(wèi)生信息資源概述 / 219
二、 主要的公共衛(wèi)生業(yè)務(wù)信息資源 / 220
第二節(jié)　典型的公共衛(wèi)生知識組織系統(tǒng) / 223
一、 中國公共衛(wèi)生信息分類與編碼體系 / 223
二、 電子健康檔案基本數(shù)據(jù)集標(biāo)準(zhǔn) / 226
三、 人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)共享數(shù)據(jù)集分類與編碼標(biāo)準(zhǔn) / 228
四、 MedlinePlus 健康主題詞表 / 230
第三節(jié)　公共衛(wèi)生領(lǐng)域知識組織應(yīng)用 / 231
一、 中國疾病預(yù)防控制中心數(shù)據(jù)資源平臺 / 231
二、 中國公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)資源平臺 / 233
三、 美國國家環(huán)境衛(wèi)生中心數(shù)據(jù)資源系統(tǒng) / 235
第十三章　中醫(yī)藥領(lǐng)域知識組織/ 238
第一節(jié)　中醫(yī)藥信息資源及特征 / 238
一、 中醫(yī)領(lǐng)域 / 238
二、 中藥領(lǐng)域 / 239
三、 針灸領(lǐng)域 / 240
四、 中醫(yī)古籍 / 241
第二節(jié)　中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn) / 242
一、 中醫(yī)藥數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) / 242
二、 中醫(yī)藥術(shù)語系統(tǒng)分類標(biāo)準(zhǔn) / 244
三、 中藥編碼系統(tǒng)系列標(biāo)準(zhǔn) / 247
四、 針灸語義范疇結(jié)構(gòu)標(biāo)準(zhǔn) / 248
五、 中醫(yī)古籍相關(guān)標(biāo)準(zhǔn) / 249
第三節(jié)　典型的中醫(yī)藥知識組織系統(tǒng) / 250
一、 中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng) / 250
二、 中醫(yī)臨床術(shù)語系統(tǒng) / 251
三、 中醫(yī)藥學(xué)主題詞表 / 253
四、 中醫(yī)古籍后控詞表 / 254
第四節(jié)　中醫(yī)藥領(lǐng)域知識組織應(yīng)用 / 254
一、 中國中醫(yī)藥期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 / 255
二、 國醫(yī)典藏古籍文獻(xiàn)資源庫 / 256
三、 中醫(yī)藥語義百科系統(tǒng) / 258
四、 中醫(yī)藥智能問答系統(tǒng) / 260
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中英文名詞對照索引/ 265