希金斯炭疽菌G蛋白信號途徑繪制及相關(guān)蛋白生物信息學分析

前言
第一章 希金斯炭疽菌的研究進展
一、經(jīng)濟危害及分布情況
(一)經(jīng)濟危害情況
(二)分布情況
二、形態(tài)特征及分類地位
(一)形態(tài)特征
(二)分類地位
三、生活史及侵染過程
四、遺傳關(guān)系
五、防治措施
第二章 G蛋白信號途徑相關(guān)蛋白介紹
一、GPCR
二、Gα、Gβ、Gγ以及PhiPS
(一)Gα、Gβ、Gγ
2.Gβ
3.Gγ
(二)PhLPS
三、調(diào)控蛋白RGS
四、G蛋白信號下游效應(yīng)分子
(一)cAMP-PKA途徑
1.AC
2.PKA-R及PKA-C
3.PDE
(二)MAPK途徑
1.MAPKKK
2.MAPKK
3 MAPK
(三)IP3-Ca2／DAG-PKC途徑
1.PI-PLC
2.PKC
第三章 希金斯炭疽菌G蛋白信號途徑圖繪制
一、G蛋白信號途徑圖繪制
(一)C蛋白信號途徑相關(guān)蛋白獲取
1.GPCR獲取
2.Gα、Gβ、Gγ以及PhLPS獲取
3.RGS獲取
4.AC獲取
5.PKA-R以及PKA-C獲取
6.PDE獲取
7.MAPK獲取
8.PI-PLC獲取
9.PKC獲取
(二)G蛋白信號途徑繪制
二、問題
三、展望
第四章 希金斯炭疽菌GPCR生物信息學分析
一、GPCR保守結(jié)構(gòu)域分析
二、GPCR理化性質(zhì)分析
三、GPCR疏水性分析
四、GPCR信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、GPCR亞細胞定位分析
六、GPCR二級結(jié)構(gòu)分析
七、GPCR遺傳關(guān)系分析
第五章 希金斯炭疽菌Gα、Gβ、Gγ生物信息學分析
一、Gα、Gβ、Gγ保守結(jié)構(gòu)域分析
二、Gα、Gβ、Gγ理化性質(zhì)分析
三、Gα、Gβ、Gγ疏水性分析
四、Gα、Gβ、Gγ信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、Gα、Gβ、Gγ亞細胞定位分析
六、Gα、Gβ、Gγ二級結(jié)構(gòu)分析
七、Gα、Gβ、Gγ遺傳關(guān)系分析
第六章 希金斯炭疽菌PhLPS生物信息學分析
一、PhLPS保守結(jié)構(gòu)域分析
二、PhLPS理化性質(zhì)分析
三、PhLPS疏水性分析
四、PhLPS信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、PhLPS亞細胞定位分析
六、PhLPS二級結(jié)構(gòu)分析
七、PhLPS遺傳關(guān)系分析
第七章 希金斯炭疽菌RGS生物信息學分析
一、RGS保守結(jié)構(gòu)域分析
二、RGS理化性質(zhì)分析
三、RGS疏水性分析
四、RGS信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、RGS亞細胞定位分析
六、RGS二級結(jié)構(gòu)分析
七、RGS遺傳關(guān)系分析
第八章 希金斯炭疽菌AC生物信息學分析
一、AC保守結(jié)構(gòu)域分析
二、AC理化性質(zhì)分析
三、AC疏水性分析
四、AC信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、AC亞細胞定位分析
六、AC二級結(jié)構(gòu)分析
七、AC遺傳關(guān)系分析
第九章 希金斯炭疽菌PKA-R以及PKA-C生物信息學分析
一、PKA-R以及PKA-C保守結(jié)構(gòu)域分析
二、PKA-R以及PKA-C理化性質(zhì)分析
三、PKA-R以及PKA-C疏水性分析
四、PKA-R以及PKA-C信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、PKA-R以及PKA-C亞細胞定位分析
六、PKA-R以及PKA-C二級結(jié)構(gòu)分析
七、PKA-R以及PKA-C遺傳關(guān)系分析
第十章 希金斯炭疽菌PDE生物信息學分析
一、PDE保守結(jié)構(gòu)域分析
二、PDE理化性質(zhì)分析
三、PDE疏水性分析
四、PDE信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、PDE亞細胞定位分析
六、PDE二級結(jié)構(gòu)分析
七、PDE遺傳關(guān)系分析
第十一章 希金斯炭疽菌MAPK信號通路上蛋白生物信息學分析
一、MAPK信號通路上蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析
二、MAPK信號通路上蛋白理化性質(zhì)分析
三、MAPK信號通路上蛋白疏水性分析
四、MAPK信號通路上蛋白信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、MAPK信號通路上蛋白亞細胞定位分析
六、MAPK信號通路上蛋白二級結(jié)構(gòu)分析
七、MAPK信號通路上蛋白遺傳關(guān)系分析
第十二章 希金斯炭疽菌PI-PLC生物信息學分析
一、PI-PLC保守結(jié)構(gòu)域分析
二、PI-PLC理化性質(zhì)分析
三、PI-PLC疏水性分析
四、PI-PLC信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、PI-PLC亞細胞定位分析
六、PI-PLC二級結(jié)構(gòu)分析
七、PI-PLC遺傳關(guān)系分析
第十三章 希金斯炭疽菌PKC生物信息學分析
一、PKC保守結(jié)構(gòu)域分析
二、PKC理化性質(zhì)分析
三、PKC疏水性分析
四、PKC信號肽、轉(zhuǎn)運肽分析
五、PKC亞細胞定位分析
六、PKC二級結(jié)構(gòu)分析
七、PKC遺傳關(guān)系分析
參考文獻
附錄
附錄1 希金斯炭疽菌PKA-C BLASTP比對結(jié)果
附錄2 希金斯炭疽菌PKCBLASTP比對結(jié)果
附錄3 希金斯炭疽茵G蛋白亞基遺傳關(guān)系分析結(jié)果
致謝