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病毒高通量測序與生物信息學技術

病毒高通量測序與生物信息學技術

定 價:¥68.00

作 者: 陳恒,趙翔,崔侖標
出版社: 四川大學出版社
叢編項:
標 簽: 暫缺

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ISBN: 9787569062731 出版時間: 2023-10-01 包裝: 平裝-膠訂
開本: 16開 頁數(shù): 字數(shù):  

內容簡介

  隨著高通量測序技術在傳染病防控中的廣泛應用,基層工作中亟需具有實操指導性的高通量測序技術專業(yè)書籍。本書兼顧理論與實踐,圖文結合,圍繞基因測序(濕實驗)、數(shù)據分析(干實驗)兩部分核心內容展開論述:前者涵蓋基因發(fā)展概述、測序原理、測序實驗室&儀器、測序操作等內容,覆蓋基因測序重點核心步驟,可為實驗室建設提供指引、為實驗室操作提供參考等;后者包括數(shù)據分析基礎概念、流程與原理、常用數(shù)據庫&軟件等,滿足讀者入門及基礎分析要求。

作者簡介

  陳恒,博士,副主任技師,成都市疾控中心腸道病毒負責人,中國醫(yī)學科學院成都新發(fā)突發(fā)傳染病防治工作站基因測序平臺負責人。趙翔,碩士,博士在讀。世界衛(wèi)生組織全球流感參比和合作研究中心,國家流感中心,測序及新技術平臺負責人。崔侖標,博士,研究員,博士生導師。江蘇省疾病預防控制中心病原微生物研究所所長。

圖書目錄

 
 
目錄
 
 
第一章高通量測序技術的發(fā)展與應用1
 
第一節(jié)測序技術概述2
 
第二節(jié)測序技術的發(fā)展10
 
第三節(jié)高通量測序技術的應用13
 
 
第二章高通量測序原理17
 
第一節(jié)Illumina測序原理17
 
第二節(jié)華大MGI測序原理23
 
第三節(jié)Ion Torrent測序原理27
 
第四節(jié)ONT測序原理31
 
第五節(jié)PacBio單分子實時測序原理33
 
第六節(jié)GenapSys測序原理34
 
 
第三章高通量測序實驗37
 
第一節(jié)DNA測序37
 
第二節(jié)RNA測序46
 
第三節(jié)DNA甲基化測序55
 
第四節(jié)宏基因組測序63
 
 
第四章基因測序流程69
 
第一節(jié)實驗室設計及注意事項69
 
第二節(jié)濕實驗70
 
第三節(jié)干實驗84
 
 
第五章生物信息學分析85
 
第一節(jié)生物信息學概述85
 
第二節(jié)生物信息學分析流程91
 
第三節(jié)新型冠狀病毒NGS的數(shù)據分析99
 
 
第六章生物信息學數(shù)據庫110
 
第一節(jié)生物信息學數(shù)據庫的分類110
 
第二節(jié)生物信息學數(shù)據庫的發(fā)展112
 
第三節(jié)主要數(shù)據庫簡介113
 
 
第七章生物信息學工具包132
 
第一節(jié)商業(yè)軟件及應用指導132
 
第二節(jié)在線分析網站(以新型冠狀病毒為例)154
 

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