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當(dāng)前位置: 首頁出版圖書科學(xué)技術(shù)計(jì)算機(jī)/網(wǎng)絡(luò)操作系統(tǒng)預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn):基于R、SPSS和Stata

預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn):基于R、SPSS和Stata

預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn):基于R、SPSS和Stata

定 價(jià):¥118.00

作 者: 武松 著
出版社: 清華大學(xué)出版社
叢編項(xiàng): 新時(shí)代·技術(shù)新未來
標(biāo) 簽: 暫缺

ISBN: 9787302639411 出版時(shí)間: 2023-11-01 包裝: 平裝-膠訂
開本: 16開 頁數(shù): 字?jǐn)?shù):  

內(nèi)容簡(jiǎn)介

  本書包括四大塊,一是預(yù)測(cè)模型的基礎(chǔ)知識(shí),二是基于Logistic回歸的臨床預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn), 是預(yù)測(cè)模型中其他 要技術(shù);特色:(1)白話統(tǒng)計(jì):統(tǒng)計(jì)難教難學(xué)難應(yīng)用,講解統(tǒng)計(jì)需要 語言行傳授或表達(dá),本書作者有20年一線統(tǒng)計(jì)教學(xué)的經(jīng)驗(yàn),可以將統(tǒng)計(jì)以為通俗易懂 案例行講解,而非標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù),讓讀者有處理真實(shí)數(shù)據(jù)的感覺;(3)軟件優(yōu)勢(shì):本書撰寫 度 低,非常適合廣大的非統(tǒng)計(jì)學(xué)專業(yè)的從業(yè)人員學(xué)習(xí);(4)自編插件:針對(duì)數(shù)據(jù)處理中 繁瑣的分析過程,可以實(shí)現(xiàn)一鍵實(shí)現(xiàn), 大降低讀者的學(xué)習(xí)難度!

作者簡(jiǎn)介

  武松(松哥統(tǒng)計(jì)),安徽中醫(yī)藥大學(xué)副教授,中國(guó)疾病預(yù)防控制中心流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)博士,世界中聯(lián)臨床科研統(tǒng)計(jì)學(xué)會(huì)理事,國(guó)家高級(jí)統(tǒng)計(jì)分析師,SPSS高級(jí)數(shù)據(jù)分析師。擅長(zhǎng)SPSS、SAS、R、Stata等多種統(tǒng)計(jì)軟件,國(guó)內(nèi)多家雜志編委。目前為止主持課題8項(xiàng),協(xié)作子課題12項(xiàng),出版SPSS統(tǒng)計(jì)軟件專著2部,均為暢銷書,參與編寫了7部圖書,參與過“十一五” “國(guó)家自然基金” “衛(wèi)生部專項(xiàng)基金”等數(shù)十項(xiàng)課題數(shù)據(jù)分析,經(jīng)驗(yàn)豐富。在國(guó)家級(jí)刊物作為第一作者或通訊作者發(fā)表文章40余篇,獲得國(guó)家發(fā)明專利1項(xiàng),獲得計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)5項(xiàng),獲得上海市出入境檢驗(yàn)檢疫局科技興檢三等獎(jiǎng)1項(xiàng)。

圖書目錄

目錄
第1章  臨床預(yù)測(cè)模型基礎(chǔ)  /  1
1.1  三種建模策略解讀  /  1
1.1.1  風(fēng)險(xiǎn)因素發(fā)現(xiàn)模型  /  1
1.1.2  風(fēng)險(xiǎn)因素驗(yàn)證模型  /  2
1.1.3  臨床預(yù)測(cè)模型  /  3
1.2  臨床預(yù)測(cè)模型分類與分型  /  5
1.2.1  預(yù)測(cè)模型目的分類  /  5
1.2.2  預(yù)測(cè)模型數(shù)據(jù)來源分類  /  6
1.2.3  數(shù)據(jù)集分類  /  7
1.3  區(qū)分度-C指數(shù)  /  8
1.4  凈重新分類指數(shù)  /  10
1.5  綜合判別改善指數(shù)  /  12
1.6  校準(zhǔn)度  /  13
1.6.1  Hosmer-Lemeshow檢驗(yàn)  /  13
1.6.2  Calibration plot  /  13
1.7  臨床決策曲線  /  16
1.8  模型可視化(Visualization)  /  18
1.9  交叉驗(yàn)證  /  19
1.9.1  簡(jiǎn)單交叉驗(yàn)證(Simple Cross Validation)  /  20
1.9.2  K折交叉驗(yàn)證(K-Folder Cross Validation)  /  20
1.9.3  留一法交叉驗(yàn)證(Leave-one-out 
       Cross Validation)  /  20
1.10  自助抽樣法  /  20
1.11  LASSO回歸  /  21
1.12  臨床預(yù)測(cè)模型報(bào)告規(guī)范  /  23
第2章  模型構(gòu)建相關(guān)問題  /  26
2.1  單變量進(jìn)入模型的形式  /  26
2.1.1  數(shù)值變量進(jìn)入模型的形式  /  26
2.1.2  等級(jí)變量進(jìn)入模型的形式  /  27
2.1.3  分類變量進(jìn)入模型的形式  /  28
2.2  模型構(gòu)建策略探討  /  29
2.2.1  先單后多法  /  29
2.2.2  全部進(jìn)入法  /  29
2.2.3  百分之十改變量法  /  29
2.2.4  LASSO回歸法  /  29
2.3  統(tǒng)計(jì)建模  /  30
2.3.1  危險(xiǎn)因素篩選模型  /  30
2.3.2  風(fēng)險(xiǎn)因素驗(yàn)證模型  /  30
2.3.3  臨床預(yù)測(cè)模型  /  30
第3章  SPSS臨床預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn)  /  31
3.1  SPSS在診斷模型中的應(yīng)用  /  31
3.1.1  數(shù)據(jù)拆分  /  32
3.1.2  統(tǒng)計(jì)建模  /  33
3.1.3  模型評(píng)價(jià)  /  38
3.2  SPSS在預(yù)后模型中的應(yīng)用  /  42
第4章  Stata診斷模型實(shí)戰(zhàn)  /  46
4.1  Logistic回歸模型構(gòu)建  /  46
4.1.1  先單因素分析  /  46
4.1.2  后多因素分析  /  50
4.1.3  正式后多因素分析  /  51
4.1.4  模型比較  /  54
4.1.5  最終模型  /  56
4.1.6  預(yù)測(cè)概率  /  57
4.2  Logistic回歸模型區(qū)分度評(píng)價(jià)  /  57
4.2.1  訓(xùn)練集的AUC分析  /  58
4.2.2  訓(xùn)練集ROC曲線分析  /  58
4.2.3  驗(yàn)證集AUC 分析  /  59
4.2.4  驗(yàn)證集ROC分析  /  60
4.2.5  多條ROC曲線  /  60
4.3 Logistic回歸模型校準(zhǔn)度評(píng)價(jià):HL檢驗(yàn)
  與校準(zhǔn)曲線  /  61
4.3.1  基于HL函數(shù)的校準(zhǔn)度  /  61
4.3.2  校準(zhǔn)曲線加強(qiáng)版  /  63
4.3.3  Bootstrap校準(zhǔn)曲線  /  67
4.4  Logistic回歸模型臨床適用性評(píng)價(jià):臨
  床決策曲線(DCA)  /  69
4.4.1  訓(xùn)練集臨床決策曲線  /  70
4.4.2  驗(yàn)證集臨床決策曲線  /  70
4.4.3  決策曲線優(yōu)化  /  71
4.4.4  凈減少曲線(Net Reduction)  /  72
4.5  Logistic回歸模型可視化:Nomo圖  /  73
4.6  NRI和IDI  /  75
4.6.1  NRI(凈重新分類指數(shù))  /  75
4.6.2  IDI(綜合判別改善指數(shù))  /  77
4.7  如何利用別人文章的模型  /  78
4.8  交叉驗(yàn)證  /  79
4.9  Bootstrap  /  81
4.10  LASSO-Logit  /  85
4.10.1  LASSO回歸  /  86
4.10.2  路徑圖  /  88
4.10.3  CV-LASSO  /  91
4.11  缺失值處理  /  93
4.11.1  直接刪除法  /  93
4.11.2  單一插補(bǔ)法  /  93
4.11.3  多重插補(bǔ)法  /  93
第5章  Stata預(yù)后臨床預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn)  /  100
5.1  模型構(gòu)建  /  100
5.1.1  建立時(shí)間變量和結(jié)局變量  /  101
5.1.2  單因素分析  /  101
5.1.3  多因素分析  /  102
5.1.4  模型比較  /  104
5.1.5  確定最終模型  /  105
5.2  區(qū)分度  /  106
5.2.1  C-index  /  106
5.2.2  C-index和Somers_D及 95%可信區(qū)間  /  107
5.2.3  時(shí)點(diǎn)ROC曲線(Time ROC)  /  109
5.3  校準(zhǔn)度  /  113
5.3.1  建立模型  /  113
5.3.2  訓(xùn)練集時(shí)點(diǎn)校準(zhǔn)曲線  /  113
5.3.3  驗(yàn)證集時(shí)點(diǎn)校準(zhǔn)曲線  /  114
5.3.4  訓(xùn)練集校準(zhǔn)曲線加強(qiáng)版  /  114
5.3.5  驗(yàn)證集校準(zhǔn)曲線加強(qiáng)版  /  115
5.4  決策曲線  /  117
5.4.1  建立模型  /  117
5.4.2  設(shè)立時(shí)間節(jié)點(diǎn)死亡概率  /  117
5.4.3  模型組與驗(yàn)證組DCA  /  117
5.4.4  多模型DCA曲線  /  119
5.4.5  凈獲益的數(shù)據(jù)  /  120
5.5  Nomo圖  /  120
5.5.1  構(gòu)建模型  /  120
5.5.2  命令繪制Nomo圖  /  120
5.5.3  窗口Nomo繪制  /  122
5.6  NRI與IDI  /  123
5.6.1  NRI  /  123
5.6.2  IDI  /  125
5.7  Bootstrap  /  126
第6章  R語言診斷臨床預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn)  /  129
6.1  Logistic回歸模型構(gòu)建  /  129
6.1.1  單因素分析  /  129
6.1.2  多因素分析  /  138
6.2  Logistic回歸模型區(qū)分度評(píng)價(jià)  /  154
6.2.1  訓(xùn)練集AUC與ROC  /  155
6.2.2  驗(yàn)證集AUC和ROC  /  159
6.2.3  繪制多條ROC曲線  /  163
6.2.4  兩條ROC曲線比較  /  165
6.2.5.  Bootstrap法ROC內(nèi)部驗(yàn)證  /  166
6.3  Logistic回歸校準(zhǔn)度評(píng)價(jià):HL檢驗(yàn)與校
  準(zhǔn)曲線  /  168
6.3.1  calibrate包val.prob函數(shù)校準(zhǔn)曲線實(shí)現(xiàn)  /  168
6.3.2  Hosmer-Lemeshow test檢驗(yàn)  /  170
6.3.3  riskRegression包plotCalibration函數(shù)校準(zhǔn)曲
  線實(shí)現(xiàn)  /  171
6.3.4  lrm calibrate plot校準(zhǔn)曲線實(shí)現(xiàn)  /  172
6.3.5  校準(zhǔn)曲線方法四(Bootstrap法)  /  174
6.4  Logistic回歸模型臨床決策曲線
  (DCA)  /  175
6.4.1  軟件準(zhǔn)備工作  /  176
6.4.2  rmda包決策曲線實(shí)現(xiàn)  /  176
6.4.3  臨床影響曲線(clinical impact curve)  /  180
6.4.4  DCA及可信區(qū)間  /  182
6.4.5  交叉驗(yàn)證DCA  /  182
6.4.6  DCA包臨床決策曲線繪制  /  183
6.5  Logistic回歸模型可視化:Nomo圖  /  185
6.5.1  rms包常規(guī)普通列線圖回歸  /  186
6.5.2  regplot包繪制交互列線圖  /  187
6.5.3  普通列線圖變種  /  189
6.5.4  DynNom包動(dòng)態(tài)列線圖  /  190
6.5.5  制作網(wǎng)絡(luò)版動(dòng)態(tài)列線圖  /  193
6.6  Logistic回歸模型診斷效果評(píng)價(jià)  /  197
6.6.1  診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)  /  198
6.6.2  ROC曲線比較  /  198
6.6.3  Logistic回歸分析  /  199
6.7  NRI和IDI  /  200
6.7.1  凈重新分類指數(shù)  /  200
6.7.2  綜合判別改善指數(shù)  /  202
6.8  如何驗(yàn)證別人已經(jīng)發(fā)表的模型  /  204
6.9  LASSO在Logistic回歸中應(yīng)用  /  205
6.9.1  軟件包準(zhǔn)備  /  205
6.9.2  數(shù)據(jù)準(zhǔn)備  /  205
6.9.3  LASSO-Logit  /  205
6.9.4  CV-LASSO  /  207
6.10  交叉驗(yàn)證與Bootstrap  /  209
6.10.1  簡(jiǎn)單交叉驗(yàn)證  /  210
6.10.2  十重交叉驗(yàn)證  /  211
6.10.3  留一法交叉驗(yàn)證  /  212
6.10.4  Bootstrap CV  /  213
6.10.5  Bootstrap ROC  /  214
第7章  R語言預(yù)后臨床預(yù)測(cè)模型實(shí)戰(zhàn)  /  216
7.1  COX回歸模型構(gòu)建  /  217
7.1.1  數(shù)據(jù)讀取  /  217
7.1.2  軟件包準(zhǔn)備  /  218
7.1.3  先單因素分析  /  218
7.1.4  后多因素分析  /  219
7.1.5  批量單因素分析  /  220
7.1.6  多因素分析  /  222
7.1.7  模型比較  /  226
7.2  預(yù)后模型區(qū)分度分析  /  229
7.2.1  Concordance index  /  229
7.2.2  Time-ROC  /  234
7.2.3  時(shí)間依賴AUC  /  239
7.3  預(yù)后模型校準(zhǔn)度分析  /  244
7.3.1  基于rms包的校準(zhǔn)曲線  /  244
7.3.2  基于pec包的校準(zhǔn)曲線  /  250
7.4  預(yù)后模型決策曲線分析  /  255
7.4.1  基于stdca.R的決策曲線  /  257
7.4.2  基于dcurves包的決策曲線  /  263
7.4.3  基于ggDCA包的決策曲線  /  270
7.5  交叉驗(yàn)證  /  274
7.6  預(yù)后模型Nomo展示  /  277
7.6.1  普通生存概率列線圖  /  277
7.6.2  中位生存時(shí)間列線圖  /  279
7.6.3  網(wǎng)格線列線圖  /  280
7.6.4  動(dòng)態(tài)列線圖  /  280
7.7  NRI和IDI  /  283
7.7.1  NRI(凈重新分類指數(shù))  /  283
7.7.2  IDI  /  285
7.8  LASSO-COX  /  286
7.8.1  數(shù)據(jù)準(zhǔn)備  /  286
7.8.2  LASSO-COX  /  286
7.8.3  CV-LASSO  /  288
7.9  模型效果驗(yàn)證  /  290
7.9.1  風(fēng)險(xiǎn)分組后KM曲線  /  290
7.9.2  風(fēng)險(xiǎn)得分圖  /  293
7.10  生存分析數(shù)值變量分類方法  /  295
7.10.1  Time-ROC  /  295
7.10.2  X-Tile  /  297
參考資料  /  299

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