表觀遺傳學(xué)

目錄
第1章　表觀遺傳學(xué)概論　1　
參考文獻(xiàn)　3　
第2章　DNA甲基化　5　
2.1　DNA甲基化概述　5　
2.2　DNA甲基化與細(xì)胞記憶機(jī)制　7　
2.3　DNA甲基化模式的建立和維持　8　
2.4　DNA甲基化在基因表達(dá)調(diào)控中的作用　12　
2.5　DNA甲基化在哺乳動(dòng)物中的主要功能　16　
2.6　DNA甲基化與疾病　19　
2.7　DNA甲基化相關(guān)問題與展望　23　
參考文獻(xiàn)　24　
第3章　DNA去甲基化　28　
3.1　DNA去甲基化概述　28　
3.2　TET概述　35　
3.3　DNA去甲基化相關(guān)問題與展望　42　
3.4　DNA去甲基化研究面臨的挑戰(zhàn)　44　
參考文獻(xiàn)　45　
第4章　基因組印記　51　
4.1基因組印記概述　51　
4.2　小鼠的印記基因　56　
4.3　基因組印記的調(diào)控　58　
4.4　印記基因群區(qū)的典型調(diào)控模型　65　
4.5　基因組印記的正常功能　67　
4.6　印記基因失常與人類疾病　69　
4.7　基因組印記的起源與進(jìn)化　70　
4.8　總結(jié)與展望　71　
參考文獻(xiàn)　72　
第5章　基因劑量補(bǔ)償和X染色體失活　76　
5.1　性別決定與基因劑量補(bǔ)償?shù)母攀觥?6　
5.2　哺乳類X染色體失活的發(fā)現(xiàn)與簡介　80　
5.3　X染色體失活的動(dòng)物模型與分子機(jī)制　84　
5.4　X染色體失活與人類疾病　89　
5.5　總結(jié)與展望　92　
參考文獻(xiàn)　93　
第6章　組蛋白甲基化修飾　100　
6.1　蛋白質(zhì)甲基化研究小史　100　
6.2　組蛋白甲基化酶的種類及催化的修飾類型　101　
參考文獻(xiàn)　111
第7章　組蛋白去甲基化　117　
7.1　組蛋白去甲基化動(dòng)態(tài)調(diào)控的研究歷史概述　117　
7.2　組蛋白去甲基化酶的命名　121　
7.3　組蛋白去甲基化酶的生物學(xué)功能　123　
7.4　組蛋白去甲基化酶在制藥領(lǐng)域的潛在應(yīng)用　127　
參考文獻(xiàn)　129　
第8章　組蛋白乙?；?31　
8.1　組蛋白乙?；陌l(fā)現(xiàn)　131　
8.2　組蛋白乙?；讣捌鋸?fù)合物　133　
8.3　組蛋白去乙酰化酶和抑制劑　138　
8.4　乙?；R別蛋白　143　
8.5　組蛋白乙酰化的作用機(jī)制及功能　145　
8.6　組蛋白乙?；c人體生理病理　150　
8.7　組蛋白乙?；揎椗c藥物研發(fā)　152　
8.8　展望　153　
參考文獻(xiàn)　154　
第9章　組蛋白其他修飾與組蛋白變體　162　
9.1　組蛋白其他修飾與組蛋白變體概述　162　
9.2　組蛋白磷酸化修飾　167　
9.3　組蛋白新型酰化修飾　170　
9.4　基于質(zhì)譜檢測的組蛋白修飾鑒定與定量分析　181　
9.5　組蛋白變體　187　
參考文獻(xiàn)　193　
第10章　組蛋白修飾識別　206　
10.1　組蛋白修飾識別概述　206　
10.2　組蛋白修飾識別的分子基礎(chǔ)　207　
10.3　組蛋白修飾識別的調(diào)控機(jī)制　210　
10.4　組蛋白修飾識別的生物學(xué)功能　212　
10.5　組蛋白修飾識別與染色質(zhì)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)　215　
10.6　組蛋白修飾識別因子的鑒定方法與技術(shù)　218　
10.7　組蛋白閱讀器靶向的藥物研發(fā)　220　
參考文獻(xiàn)　222　
第11章　染色質(zhì)重塑　228　
11.1　染色質(zhì)重塑概述　228　
11.2　核小體定位與基因調(diào)控　229　
11.3　組蛋白分子伴侶　233　
11.4　染色質(zhì)重塑復(fù)合體　238　
11.5　染色質(zhì)重塑與疾病　243　
參考文獻(xiàn)　244　
第12章　染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與組蛋白變體　247　
12.1　染色體結(jié)構(gòu)　247　
12.2　組蛋白變體　254　
參考文獻(xiàn)　261　
第13章　CTCF與三維基因組染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)　265　
13.1　CTCF與DNA的相互作用　265　
13.2　CTCF與黏連蛋白協(xié)同架構(gòu)三維基因組染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)　270　
13.3　CTCF與染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)　272　
13.4　CTCF與基因表達(dá)調(diào)控　275　
13.5　總結(jié)與展望　283　
參考文獻(xiàn)　285　
第14章　Polycomb復(fù)合物及Trithorax復(fù)合物　289　
14.1　Polycomb復(fù)合物和Trithorax復(fù)合物概論　290　
14.2　Polycomb復(fù)合物　293　
14.3　Trithorax復(fù)合物　302　
14.4　Polycomb復(fù)合物和Trithorax復(fù)合物相關(guān)抑制劑　308　
14.5　總結(jié)與展望　309　
參考文獻(xiàn)　310　
第15章　DNA甲基化修飾酶的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究　315　
15.1　DNA甲基轉(zhuǎn)移酶　315　
15.2　DNA去甲基化調(diào)控酶　323　
參考文獻(xiàn)　326　
第16章　非編碼RNA　330　
16.1　非編碼RNA概述　330　
16.2　非編碼RNA種類　332　
16.3　非編碼RNA特征、產(chǎn)生及生物學(xué)功能　332　
16.4　非編碼RNA與疾病　340　
16.5　研究非編碼RNA的方法學(xué)　342　
16.6　總結(jié)與展望　344　
參考文獻(xiàn)　345　
第17章　siRNA　348　
17.1　RNAi概述　348　
17.2　siRNA的加工生成　349　
17.3　RNAi的調(diào)控機(jī)制　353　
17.4　RNAi引起的毒副作用　358　
17.5　RNAi藥物的前景與挑戰(zhàn)　360　
參考文獻(xiàn)　362　
第18章　RNAa　365　
18.1　RNAa概述　365　
18.2　外源性RNAa　368　
18.3　內(nèi)源性RNAa　372　
18.4　線蟲中的RNAa　374　
18.5　RNAa的應(yīng)用　375　
18.6　RNAa領(lǐng)域面臨的問題與展望　376　
參考文獻(xiàn)　376　
第19章　microRNA概述　381　
19.1　miRNA的概況　381　
19.2　miRNA的生物合成　384　
19.3　miRNA的作用機(jī)制　392　
19.4　miRNA數(shù)據(jù)庫簡介　397　
19.5　miRNA的功能與疾病　399　
19.6　miRNA與疾病診斷和治療　410　
參考文獻(xiàn)　414　
第20章　NamiRNA　423　
20.1　miRNA概述　423　
20.2　增強(qiáng)子與miRNA的關(guān)系　426　
20.3　NamiRNA通過增強(qiáng)子介導(dǎo)基因的激活　428　
20.4　NamiRNA作用機(jī)制　430　
20.5　NamiRNA研究的展望與挑戰(zhàn)　431　
參考文獻(xiàn)　434　
第21章　piRNA436　
21.1　piRNA的發(fā)現(xiàn)、分類與生成　436　
21.2　piRNA通路的功能及作用機(jī)制　440　
21.3　piRNA機(jī)器的代謝　445　
21.4　piRNA與男性不育　445　
21.5　總結(jié)與展望　446　
參考文獻(xiàn)　446　
第22章　lncRNA　447　
22.1　lncRNA的發(fā)現(xiàn)和定義　447　
22.2　lncRNA的鑒定、種類與特征　448　
22.3　lncRNA的表達(dá)與轉(zhuǎn)錄后加工　451　
22.4　lncRNA的調(diào)控機(jī)制　453　
22.5　lncRNA的生理功能　459　
22.6　lncRNA與腫瘤465　
參考文獻(xiàn)　467　
第23章　環(huán)形RNA　475　
23.1　環(huán)形RNA的發(fā)現(xiàn)　475　
23.2　環(huán)形RNA的基本分類　477　
23.3　環(huán)形RNA的自身代謝　478　
23.4　反向剪接環(huán)形RNA的生物學(xué)特征　481　
23.5　反向剪接環(huán)形RNA的功能　483　
23.6　環(huán)形RNA與疾病　485　
23.7　環(huán)形RNA研究展望　486　
參考文獻(xiàn)　486　
第24章　RNA修飾　490　
24.1　RNA修飾簡介　490　
24.2　RNA修飾分布特征　495　
24.3　RNA修飾的生物學(xué)功能　500　
24.4　RNA修飾與生理病理效應(yīng)　505　
24.5　總結(jié)與展望　510　
參考文獻(xiàn)　511　
第25章　RNA編輯　515　
25.1　RNA編輯概述　515　
25.2　RNA編輯的分類　516　
25.3　RNA編輯的定位和定量　520　
25.4　動(dòng)物中RNA編輯的功能　521　
25.5　植物中RNA編輯的功能和意義　532　
25.6　RNA編輯的應(yīng)用　536　
25.7　總結(jié)　537　
參考文獻(xiàn)　537　
第26章　DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA的互動(dòng)與協(xié)調(diào)　544　
26.1　DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA的相互關(guān)系和調(diào)控概論　544　
26.2　DNA甲基化與組蛋白修飾　546　
26.3　非編碼RNA與DNA甲基化　548　
26.4　非編碼RNA與組蛋白修飾　550　
26.5　DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA三者之間的悖論和挑戰(zhàn)　554　
參考文獻(xiàn)　557　
第27章　表觀遺傳學(xué)與基因可變剪接　561　
27.1　基因可變剪接的功能和生物學(xué)意義　561　
27.2　基因可變剪接的經(jīng)典調(diào)控　565　
27.3　組蛋白修飾與基因可變剪接　568　
27.4　DNA甲基化與基因可變剪接　570　
27.5　研究展望　572　
參考文獻(xiàn)　573　
第28章　染色質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與功能學(xué)意義　576　
28.1　細(xì)胞核與染色質(zhì)的空間組織架構(gòu)　576　
28.2　解析染色質(zhì)　3D結(jié)構(gòu)的方法　581　
28.3　發(fā)育過程中動(dòng)態(tài)變化的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)　584　
28.4　疾病情況下改變的染色質(zhì)形態(tài)　586　
28.5　總結(jié)與展望　589　
參考文獻(xiàn)　590　
第29章　增強(qiáng)子與細(xì)胞身份　595　
29.1　增強(qiáng)子的概念與定義　596　
29.2　增強(qiáng)子的表觀遺傳學(xué)特征　596　
29.3　增強(qiáng)子序列變異及突變與疾病　602　
參考文獻(xiàn)　603　
第30章　表觀遺傳信息的遺傳　607　
30.1　表觀遺傳信息的遺傳概述　607　
30.2　表觀遺傳信息的跨代傳遞　608　
30.3　有絲分裂中的基因書簽　615　
30.4　總結(jié)與展望　623　
參考文獻(xiàn)　625　
第31章　表觀遺傳與遺傳的相互作用　629　
31.1　SNP與基因表觀遺傳調(diào)控區(qū)域的關(guān)系　629　
31.2　表觀遺傳修飾改變與拷貝數(shù)變異　633　
31.3　唐氏綜合征的表觀遺傳異?！?35　
31.4　遺傳與表觀遺傳學(xué)共同決定人的性狀　638　
參考文獻(xiàn)　643　
第32章　表觀遺傳學(xué)與生殖　649　
32.1　生殖過程概述　649　
32.2　精子發(fā)生和成熟的表觀遺傳特征　651　
32.3　卵子發(fā)生和成熟中的表觀遺傳調(diào)控　662